MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 64980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_019680	TGC	2	6	256970	256975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711406
4502	NC_019680	TCT	2	6	257056	257061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711406
4503	NC_019680	CAC	2	6	257151	257156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711406
4504	NC_019680	GGC	2	6	257283	257288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711406
4505	NC_019680	GCG	2	6	257295	257300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711406
4506	NC_019680	CGG	2	6	257303	257308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711406
4507	NC_019680	GCGA	2	8	257438	257445	25 %	0 %	50 %	25 %	427711406
4508	NC_019680	GTA	2	6	257541	257546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711406
4509	NC_019680	CAG	2	6	257811	257816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711406
4510	NC_019680	TGA	2	6	257868	257873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_019680	TCC	2	6	257963	257968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4512	NC_019680	AG	3	6	258003	258008	50 %	0 %	50 %	0 %	427711407
4513	NC_019680	TGGC	2	8	258016	258023	0 %	25 %	50 %	25 %	427711407
4514	NC_019680	CAG	2	6	258214	258219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711407
4515	NC_019680	CCG	3	9	258286	258294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711407
4516	NC_019680	TTA	2	6	258300	258305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711407
4517	NC_019680	TGG	2	6	258350	258355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711407
4518	NC_019680	G	6	6	258498	258503	0 %	0 %	100 %	0 %	427711407
4519	NC_019680	CCCGC	2	10	258549	258558	0 %	0 %	20 %	80 %	427711407
4520	NC_019680	ATT	2	6	258580	258585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711407
4521	NC_019680	CCG	2	6	258648	258653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711407
4522	NC_019680	ATT	2	6	258661	258666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711407
4523	NC_019680	CGG	2	6	258728	258733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711407
4524	NC_019680	CGGG	2	8	258750	258757	0 %	0 %	75 %	25 %	427711407
4525	NC_019680	GGGA	2	8	258845	258852	25 %	0 %	75 %	0 %	427711407
4526	NC_019680	C	7	7	258880	258886	0 %	0 %	0 %	100 %	427711407
4527	NC_019680	CCA	2	6	258917	258922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711407
4528	NC_019680	TGC	2	6	258977	258982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711407
4529	NC_019680	TTTGA	2	10	259015	259024	20 %	60 %	20 %	0 %	427711407
4530	NC_019680	CTG	2	6	259084	259089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711407
4531	NC_019680	CAAC	2	8	259098	259105	50 %	0 %	0 %	50 %	427711407
4532	NC_019680	TGC	2	6	259129	259134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711407
4533	NC_019680	GAC	2	6	259140	259145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711407
4534	NC_019680	CAT	2	6	259151	259156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711407
4535	NC_019680	TCT	2	6	259215	259220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711408
4536	NC_019680	CAT	2	6	259275	259280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711408
4537	NC_019680	CTG	2	6	259281	259286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711408
4538	NC_019680	CAT	2	6	259290	259295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711408
4539	NC_019680	AGT	2	6	259297	259302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711408
4540	NC_019680	TTA	2	6	259324	259329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711408
4541	NC_019680	TGG	2	6	259481	259486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711408
4542	NC_019680	ATT	2	6	259514	259519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711408
4543	NC_019680	CGG	2	6	259574	259579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711408
4544	NC_019680	A	6	6	259730	259735	100 %	0 %	0 %	0 %	427711408
4545	NC_019680	TTGG	2	8	259815	259822	0 %	50 %	50 %	0 %	427711408
4546	NC_019680	AAT	2	6	259898	259903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_019680	GATT	2	8	259904	259911	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_019680	C	6	6	260068	260073	0 %	0 %	0 %	100 %	427711409
4549	NC_019680	GCG	2	6	260076	260081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711409
4550	NC_019680	TGA	2	6	260093	260098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711409
4551	NC_019680	GAC	2	6	260102	260107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711409
4552	NC_019680	CTT	2	6	260161	260166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711409
4553	NC_019680	CCG	2	6	260216	260221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711409
4554	NC_019680	ACA	2	6	260222	260227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711409
4555	NC_019680	CCA	2	6	260264	260269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711409
4556	NC_019680	ATA	2	6	260287	260292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711409
4557	NC_019680	TAG	2	6	260301	260306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711409
4558	NC_019680	CTG	2	6	260407	260412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711409
4559	NC_019680	ATG	2	6	260424	260429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711409
4560	NC_019680	TCA	2	6	260430	260435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711409
4561	NC_019680	AG	3	6	260531	260536	50 %	0 %	50 %	0 %	427711409
4562	NC_019680	ATA	2	6	260607	260612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711409
4563	NC_019680	G	6	6	260620	260625	0 %	0 %	100 %	0 %	427711409
4564	NC_019680	CCA	2	6	260733	260738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711410
4565	NC_019680	TGGGT	2	10	260791	260800	0 %	40 %	60 %	0 %	427711410
4566	NC_019680	TGAG	2	8	260808	260815	25 %	25 %	50 %	0 %	427711410
4567	NC_019680	GAG	2	6	260975	260980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711410
4568	NC_019680	CTG	2	6	261017	261022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711410
4569	NC_019680	TTG	2	6	261045	261050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711410
4570	NC_019680	CTG	2	6	261202	261207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711410
4571	NC_019680	T	6	6	261236	261241	0 %	100 %	0 %	0 %	427711410
4572	NC_019680	TCA	2	6	261264	261269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711410
4573	NC_019680	CAT	2	6	261344	261349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711410
4574	NC_019680	CAA	2	6	261356	261361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711410
4575	NC_019680	T	6	6	261392	261397	0 %	100 %	0 %	0 %	427711410
4576	NC_019680	GC	3	6	261451	261456	0 %	0 %	50 %	50 %	427711410
4577	NC_019680	GTT	2	6	261474	261479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711410
4578	NC_019680	GCGT	2	8	261480	261487	0 %	25 %	50 %	25 %	427711410
4579	NC_019680	TGCG	2	8	261540	261547	0 %	25 %	50 %	25 %	427711410
4580	NC_019680	AGGTT	2	10	261580	261589	20 %	40 %	40 %	0 %	427711410
4581	NC_019680	GCT	2	6	261657	261662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711410
4582	NC_019680	TGA	2	6	261684	261689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711410
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4585	NC_019680	TGC	2	6	261751	261756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711410
4586	NC_019680	GAC	2	6	261762	261767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711410
4587	NC_019680	GAT	2	6	261949	261954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711411
4588	NC_019680	GAC	2	6	261987	261992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711411
4589	NC_019680	CCG	2	6	262099	262104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711411
4590	NC_019680	TGT	2	6	262118	262123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711411
4591	NC_019680	GCC	3	9	262137	262145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711411
4592	NC_019680	TCA	2	6	262164	262169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711411
4593	NC_019680	GA	3	6	262211	262216	50 %	0 %	50 %	0 %	427711411
4594	NC_019680	CTG	2	6	262218	262223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711411
4595	NC_019680	GCC	3	9	262377	262385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711411
4596	NC_019680	ACCA	2	8	262386	262393	50 %	0 %	0 %	50 %	427711411
4597	NC_019680	GCT	2	6	262398	262403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711411
4598	NC_019680	CCA	3	9	262486	262494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711411
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4600	NC_019680	TTG	2	6	262705	262710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711411
4601	NC_019680	CGGC	2	8	262748	262755	0 %	0 %	50 %	50 %	427711411
4602	NC_019680	ATC	2	6	262970	262975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711411
4603	NC_019680	GGTG	2	8	263118	263125	0 %	25 %	75 %	0 %	427711411
4604	NC_019680	AGG	2	6	263341	263346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_019680	G	6	6	263345	263350	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_019680	CCAGG	2	10	263426	263435	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4607	NC_019680	CA	3	6	263442	263447	50 %	0 %	0 %	50 %	427711412
4608	NC_019680	CTTGG	2	10	263461	263470	0 %	40 %	40 %	20 %	427711412
4609	NC_019680	GCG	2	6	263479	263484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711412
4610	NC_019680	GAT	2	6	263497	263502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711412
4611	NC_019680	CCCT	2	8	263597	263604	0 %	25 %	0 %	75 %	427711412
4612	NC_019680	CT	3	6	263609	263614	0 %	50 %	0 %	50 %	427711412
4613	NC_019680	T	7	7	263631	263637	0 %	100 %	0 %	0 %	427711412
4614	NC_019680	TTG	2	6	263655	263660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711412
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4618	NC_019680	T	6	6	263857	263862	0 %	100 %	0 %	0 %	427711412
4619	NC_019680	TGG	2	6	263876	263881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711412
4620	NC_019680	TTA	2	6	263892	263897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711412
4621	NC_019680	TCC	2	6	263976	263981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711412
4622	NC_019680	TGA	3	9	263983	263991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711412
4623	NC_019680	TGAT	2	8	264012	264019	25 %	50 %	25 %	0 %	427711412
4624	NC_019680	TGGCC	2	10	264187	264196	0 %	20 %	40 %	40 %	427711412
4625	NC_019680	TGGCC	2	10	264319	264328	0 %	20 %	40 %	40 %	427711412
4626	NC_019680	TTG	2	6	264338	264343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711412
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4632	NC_019680	TTGG	2	8	264638	264645	0 %	50 %	50 %	0 %	427711412
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4748	NC_019680	GAA	2	6	271200	271205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711418
4749	NC_019680	TGAT	2	8	271453	271460	25 %	50 %	25 %	0 %	427711418
4750	NC_019680	ATT	2	6	271467	271472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711418
4751	NC_019680	TCA	2	6	271479	271484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711418
4752	NC_019680	ATGT	2	8	271525	271532	25 %	50 %	25 %	0 %	427711418
4753	NC_019680	AT	3	6	271631	271636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4754	NC_019680	TGAT	2	8	271662	271669	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4755	NC_019680	AAT	2	6	271738	271743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4756	NC_019680	TCA	2	6	271809	271814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4757	NC_019680	GAC	2	6	271833	271838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4759	NC_019680	A	6	6	271971	271976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4761	NC_019680	AAT	2	6	272019	272024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4762	NC_019680	CAG	2	6	272326	272331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711419
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4766	NC_019680	ACA	2	6	272548	272553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4769	NC_019680	CATTT	2	10	272668	272677	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4770	NC_019680	AG	4	8	272718	272725	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4832	NC_019680	GATT	2	8	275494	275501	25 %	50 %	25 %	0 %	427711423
4833	NC_019680	G	6	6	275518	275523	0 %	0 %	100 %	0 %	427711423
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4835	NC_019680	CAAT	2	8	275641	275648	50 %	25 %	0 %	25 %	427711423
4836	NC_019680	GGCGGG	2	12	275664	275675	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	427711423
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4840	NC_019680	TGA	2	6	276022	276027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711424
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4843	NC_019680	ACCCG	2	10	276113	276122	20 %	0 %	20 %	60 %	427711424
4844	NC_019680	CT	3	6	276124	276129	0 %	50 %	0 %	50 %	427711424
4845	NC_019680	ATC	3	9	276180	276188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711424
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4849	NC_019680	GTCT	2	8	276451	276458	0 %	50 %	25 %	25 %	427711424
4850	NC_019680	A	6	6	276471	276476	100 %	0 %	0 %	0 %	427711424
4851	NC_019680	CCA	2	6	276559	276564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711424
4852	NC_019680	CCGA	2	8	276580	276587	25 %	0 %	25 %	50 %	427711424
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4855	NC_019680	CAT	2	6	276679	276684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711424
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4857	NC_019680	GCT	2	6	276891	276896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711424
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4860	NC_019680	GCG	2	6	276925	276930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711424
4861	NC_019680	ATTT	2	8	276933	276940	25 %	75 %	0 %	0 %	427711424
4862	NC_019680	CGG	2	6	276965	276970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711424
4863	NC_019680	T	7	7	277149	277155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4864	NC_019680	TC	3	6	277234	277239	0 %	50 %	0 %	50 %	427711425
4865	NC_019680	TCC	2	6	277398	277403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711425
4866	NC_019680	CCAGGC	2	12	277411	277422	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	427711425
4867	NC_019680	CTC	2	6	277559	277564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711425
4868	NC_019680	ATCCC	2	10	277594	277603	20 %	20 %	0 %	60 %	427711425
4869	NC_019680	G	6	6	277721	277726	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4870	NC_019680	TCAA	2	8	277744	277751	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4871	NC_019680	CAT	2	6	277812	277817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711426
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4873	NC_019680	CTC	2	6	277929	277934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711426
4874	NC_019680	TC	3	6	277957	277962	0 %	50 %	0 %	50 %	427711426
4875	NC_019680	CTC	2	6	278022	278027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711426
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4882	NC_019680	CTG	2	6	278394	278399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711426
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4884	NC_019680	CCTC	2	8	278458	278465	0 %	25 %	0 %	75 %	427711426
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4993	NC_019680	CAT	2	6	285328	285333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711433
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4995	NC_019680	CGG	2	6	285563	285568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711433
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4997	NC_019680	GAC	2	6	285610	285615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711433
4998	NC_019680	CAT	2	6	285616	285621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711433
4999	NC_019680	TGA	2	6	285637	285642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711433
5000	NC_019680	GAA	2	6	285671	285676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711433

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