MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Saccharothrix espanaensis DSM 44229 complete genome

Total Repeats: 280209

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_019673	CGG	2	6	101642	101647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601939
3002	NC_019673	GGT	2	6	101724	101729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433601939
3003	NC_019673	TGC	2	6	101741	101746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601939
3004	NC_019673	GCC	3	9	101752	101760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601939
3005	NC_019673	GACGG	2	10	101776	101785	20 %	0 %	60 %	20 %	433601939
3006	NC_019673	TCG	2	6	101789	101794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601939
3007	NC_019673	CG	3	6	101842	101847	0 %	0 %	50 %	50 %	433601939
3008	NC_019673	CCG	2	6	101864	101869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601939
3009	NC_019673	GGT	2	6	101889	101894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433601939
3010	NC_019673	GAC	2	6	101902	101907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601939
3011	NC_019673	CCGG	2	8	101918	101925	0 %	0 %	50 %	50 %	433601939
3012	NC_019673	GACGCG	2	12	101941	101952	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	433601939
3013	NC_019673	GTG	2	6	101985	101990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433601939
3014	NC_019673	GCC	2	6	101994	101999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601939
3015	NC_019673	GCCG	2	8	102009	102016	0 %	0 %	50 %	50 %	433601939
3016	NC_019673	CCGA	2	8	102061	102068	25 %	0 %	25 %	50 %	433601939
3017	NC_019673	GAG	2	6	102154	102159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433601939
3018	NC_019673	GGC	2	6	102168	102173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601939
3019	NC_019673	GCG	2	6	102194	102199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601939
3020	NC_019673	CTG	2	6	102253	102258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601939
3021	NC_019673	CGCC	2	8	102308	102315	0 %	0 %	25 %	75 %	433601939
3022	NC_019673	GAC	2	6	102358	102363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601939
3023	NC_019673	GCG	2	6	102384	102389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601939
3024	NC_019673	CG	4	8	102388	102395	0 %	0 %	50 %	50 %	433601939
3025	NC_019673	TGC	3	9	102514	102522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601940
3026	NC_019673	GC	3	6	102546	102551	0 %	0 %	50 %	50 %	433601940
3027	NC_019673	CGGC	2	8	102647	102654	0 %	0 %	50 %	50 %	433601940
3028	NC_019673	TGC	2	6	102664	102669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601940
3029	NC_019673	GCGACG	2	12	102712	102723	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	433601940
3030	NC_019673	GTG	2	6	102774	102779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433601940
3031	NC_019673	CCGC	2	8	102818	102825	0 %	0 %	25 %	75 %	433601940
3032	NC_019673	CG	3	6	102917	102922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3033	NC_019673	CGA	2	6	102932	102937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_019673	GTC	2	6	102944	102949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_019673	CCG	2	6	102981	102986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601941
3036	NC_019673	ACGCGC	2	12	103053	103064	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	433601941
3037	NC_019673	ACG	2	6	103080	103085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601941
3038	NC_019673	CCG	2	6	103086	103091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601941
3039	NC_019673	TGC	2	6	103140	103145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601941
3040	NC_019673	CG	3	6	103171	103176	0 %	0 %	50 %	50 %	433601941
3041	NC_019673	GGC	3	9	103209	103217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601941
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3043	NC_019673	TGG	2	6	103233	103238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433601941
3044	NC_019673	GTC	2	6	103253	103258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601941
3045	NC_019673	CGGC	2	8	103263	103270	0 %	0 %	50 %	50 %	433601941
3046	NC_019673	GC	4	8	103309	103316	0 %	0 %	50 %	50 %	433601941
3047	NC_019673	GCC	2	6	103318	103323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601941
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3049	NC_019673	CGC	2	6	103381	103386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601941
3050	NC_019673	GCG	2	6	103447	103452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601941
3051	NC_019673	GGCG	2	8	103566	103573	0 %	0 %	75 %	25 %	433601942
3052	NC_019673	CG	3	6	103572	103577	0 %	0 %	50 %	50 %	433601942
3053	NC_019673	CCG	2	6	103578	103583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601942
3054	NC_019673	GCG	2	6	103584	103589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601942
3055	NC_019673	GGCGCG	2	12	103603	103614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601942
3056	NC_019673	GGT	2	6	103620	103625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433601942
3057	NC_019673	CGC	2	6	103691	103696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601942
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3060	NC_019673	GC	4	8	103780	103787	0 %	0 %	50 %	50 %	433601942
3061	NC_019673	TGC	2	6	103796	103801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601942
3062	NC_019673	CCGA	2	8	103876	103883	25 %	0 %	25 %	50 %	433601942
3063	NC_019673	CGT	2	6	103887	103892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601942
3064	NC_019673	GGCG	2	8	103911	103918	0 %	0 %	75 %	25 %	433601942
3065	NC_019673	ACG	2	6	103945	103950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601942
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3069	NC_019673	GCC	2	6	104059	104064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601942
3070	NC_019673	AGG	2	6	104078	104083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433601942
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3075	NC_019673	TGC	3	9	104233	104241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601943
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3077	NC_019673	GGC	2	6	104590	104595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601943
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3080	NC_019673	CGC	2	6	104633	104638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3081	NC_019673	GCG	2	6	104654	104659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_019673	CGGG	2	8	104670	104677	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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3084	NC_019673	CG	4	8	104699	104706	0 %	0 %	50 %	50 %	433601944
3085	NC_019673	GGTCG	2	10	104711	104720	0 %	20 %	60 %	20 %	433601944
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3087	NC_019673	CTCGC	2	10	104733	104742	0 %	20 %	20 %	60 %	433601944
3088	NC_019673	CCT	2	6	104821	104826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433601944
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3090	NC_019673	TCG	2	6	104880	104885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601944
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3095	NC_019673	CG	3	6	105203	105208	0 %	0 %	50 %	50 %	433601944
3096	NC_019673	TAA	2	6	105287	105292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_019673	GGCC	2	8	105319	105326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3098	NC_019673	CT	3	6	105341	105346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3099	NC_019673	CG	3	6	105392	105397	0 %	0 %	50 %	50 %	433601945
3100	NC_019673	GCCC	2	8	105424	105431	0 %	0 %	25 %	75 %	433601945
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3102	NC_019673	GGCCC	2	10	105532	105541	0 %	0 %	40 %	60 %	433601945
3103	NC_019673	GTT	2	6	105554	105559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433601945
3104	NC_019673	CGT	2	6	105562	105567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601945
3105	NC_019673	CGG	2	6	105583	105588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601945
3106	NC_019673	CGG	3	9	105643	105651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601945
3107	NC_019673	GC	3	6	105664	105669	0 %	0 %	50 %	50 %	433601945
3108	NC_019673	ACG	2	6	105681	105686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601945
3109	NC_019673	CCG	2	6	105687	105692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601945
3110	NC_019673	CCG	2	6	105736	105741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601945
3111	NC_019673	CAC	2	6	105749	105754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433601945
3112	NC_019673	GC	3	6	105801	105806	0 %	0 %	50 %	50 %	433601945
3113	NC_019673	CGCC	2	8	105880	105887	0 %	0 %	25 %	75 %	433601945
3114	NC_019673	CGCCGA	2	12	105901	105912	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	433601945
3115	NC_019673	AGC	3	9	105933	105941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601945
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3118	NC_019673	CG	4	8	106048	106055	0 %	0 %	50 %	50 %	433601945
3119	NC_019673	CCCA	2	8	106089	106096	25 %	0 %	0 %	75 %	433601945
3120	NC_019673	CGA	2	6	106100	106105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601945
3121	NC_019673	CAG	2	6	106118	106123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601945
3122	NC_019673	GTG	2	6	106157	106162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433601945
3123	NC_019673	CGG	2	6	106189	106194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601945
3124	NC_019673	CTC	2	6	106202	106207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433601945
3125	NC_019673	TCA	2	6	106222	106227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433601945
3126	NC_019673	GCT	2	6	106240	106245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601945
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3128	NC_019673	GTC	2	6	106346	106351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601945
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3137	NC_019673	GCA	3	9	106528	106536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601945
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3139	NC_019673	GC	3	6	106585	106590	0 %	0 %	50 %	50 %	433601945
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3225	NC_019673	GC	3	6	108875	108880	0 %	0 %	50 %	50 %	433601947
3226	NC_019673	GTCG	2	8	108900	108907	0 %	25 %	50 %	25 %	433601947
3227	NC_019673	CGGCG	2	10	108942	108951	0 %	0 %	60 %	40 %	433601947
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3233	NC_019673	GGCG	2	8	109065	109072	0 %	0 %	75 %	25 %	433601947
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3235	NC_019673	GGCG	2	8	109097	109104	0 %	0 %	75 %	25 %	433601947
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3239	NC_019673	CGG	2	6	109193	109198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601947
3240	NC_019673	CG	3	6	109203	109208	0 %	0 %	50 %	50 %	433601947
3241	NC_019673	CGC	4	12	109218	109229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601947
3242	NC_019673	GC	3	6	109228	109233	0 %	0 %	50 %	50 %	433601947
3243	NC_019673	CTG	2	6	109249	109254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601947
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3245	NC_019673	GAT	2	6	109289	109294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433601948
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3364	NC_019673	TCG	2	6	113388	113393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601952
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3490	NC_019673	TCC	2	6	117163	117168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433601955
3491	NC_019673	GTC	2	6	117183	117188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601955
3492	NC_019673	CGC	2	6	117195	117200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601955
3493	NC_019673	CGAG	2	8	117224	117231	25 %	0 %	50 %	25 %	433601955
3494	NC_019673	CGC	2	6	117254	117259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601955
3495	NC_019673	TCCG	2	8	117270	117277	0 %	25 %	25 %	50 %	433601955
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3497	NC_019673	TCG	2	6	117298	117303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601955
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