MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Saccharothrix espanaensis DSM 44229 complete genome

Total Repeats: 280209

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_019673	CGT	2	6	236037	236042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602068
7003	NC_019673	CCG	2	6	236156	236161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602068
7004	NC_019673	CCGG	2	8	236205	236212	0 %	0 %	50 %	50 %	433602068
7005	NC_019673	CGG	2	6	236222	236227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602068
7006	NC_019673	CCG	2	6	236320	236325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602068
7007	NC_019673	GCG	2	6	236348	236353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602068
7008	NC_019673	GCA	2	6	236354	236359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602068
7009	NC_019673	ACT	2	6	236399	236404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433602068
7010	NC_019673	GAC	2	6	236437	236442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602068
7011	NC_019673	GTG	2	6	236449	236454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433602068
7012	NC_019673	CAC	2	6	236487	236492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433602068
7013	NC_019673	CG	4	8	236513	236520	0 %	0 %	50 %	50 %	433602068
7014	NC_019673	TCAAGG	2	12	236566	236577	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	433602068
7015	NC_019673	CGC	2	6	236590	236595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602068
7016	NC_019673	GGCGC	2	10	236620	236629	0 %	0 %	60 %	40 %	433602068
7017	NC_019673	CGG	2	6	236660	236665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602068
7018	NC_019673	GACG	2	8	236726	236733	25 %	0 %	50 %	25 %	433602068
7019	NC_019673	GC	3	6	236736	236741	0 %	0 %	50 %	50 %	433602068
7020	NC_019673	CGT	2	6	236756	236761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602068
7021	NC_019673	GTG	2	6	236829	236834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433602068
7022	NC_019673	CGT	2	6	236855	236860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602068
7023	NC_019673	GGA	2	6	236867	236872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433602068
7024	NC_019673	ACA	2	6	236881	236886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433602068
7025	NC_019673	CGAC	2	8	236893	236900	25 %	0 %	25 %	50 %	433602068
7026	NC_019673	GCC	2	6	236913	236918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602068
7027	NC_019673	GGC	2	6	236961	236966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602068
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7029	NC_019673	CGG	2	6	237011	237016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602068
7030	NC_019673	GGC	2	6	237024	237029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602068
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7032	NC_019673	CGACG	2	10	237092	237101	20 %	0 %	40 %	40 %	433602068
7033	NC_019673	GTG	2	6	237114	237119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433602068
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7036	NC_019673	CAG	2	6	237188	237193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602069
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7040	NC_019673	GTC	2	6	237314	237319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602069
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7042	NC_019673	GC	3	6	237353	237358	0 %	0 %	50 %	50 %	433602069
7043	NC_019673	GTCG	2	8	237377	237384	0 %	25 %	50 %	25 %	433602069
7044	NC_019673	CGT	2	6	237398	237403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602069
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7046	NC_019673	ACG	2	6	237586	237591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602069
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7048	NC_019673	CTG	2	6	237711	237716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602069
7049	NC_019673	CCCG	2	8	237757	237764	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7050	NC_019673	CGGG	2	8	237772	237779	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7051	NC_019673	TCT	2	6	237781	237786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7052	NC_019673	GGA	2	6	237793	237798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7053	NC_019673	TCC	2	6	237871	237876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7054	NC_019673	CGC	2	6	238048	238053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602070
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7057	NC_019673	GTCGCG	2	12	238151	238162	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433602070
7058	NC_019673	GGCG	2	8	238212	238219	0 %	0 %	75 %	25 %	433602070
7059	NC_019673	CGGC	2	8	238251	238258	0 %	0 %	50 %	50 %	433602070
7060	NC_019673	GGT	2	6	238267	238272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433602070
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7063	NC_019673	CGG	2	6	238347	238352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602070
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7067	NC_019673	CAG	2	6	238447	238452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602070
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7077	NC_019673	GGT	2	6	238768	238773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7078	NC_019673	TGCG	2	8	238780	238787	0 %	25 %	50 %	25 %	433602072
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7081	NC_019673	GGCC	2	8	238931	238938	0 %	0 %	50 %	50 %	433602072
7082	NC_019673	AGTC	2	8	238970	238977	25 %	25 %	25 %	25 %	433602072
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7093	NC_019673	CG	3	6	239289	239294	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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7107	NC_019673	TGC	2	6	239644	239649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602073
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7109	NC_019673	GCCCG	2	10	239720	239729	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
7110	NC_019673	ACG	2	6	239746	239751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7112	NC_019673	GGC	2	6	239795	239800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7113	NC_019673	TGC	2	6	239813	239818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7118	NC_019673	GCA	2	6	239954	239959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7119	NC_019673	TGG	2	6	239975	239980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7122	NC_019673	CGGGG	2	10	240123	240132	0 %	0 %	80 %	20 %	433602074
7123	NC_019673	CG	3	6	240164	240169	0 %	0 %	50 %	50 %	433602074
7124	NC_019673	CGCT	2	8	240205	240212	0 %	25 %	25 %	50 %	433602074
7125	NC_019673	GCG	2	6	240245	240250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602074
7126	NC_019673	GTG	2	6	240301	240306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433602074
7127	NC_019673	CGC	2	6	240315	240320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602074
7128	NC_019673	GGT	2	6	240328	240333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433602074
7129	NC_019673	GAC	2	6	240337	240342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602074
7130	NC_019673	GC	3	6	240343	240348	0 %	0 %	50 %	50 %	433602074
7131	NC_019673	CGG	2	6	240377	240382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602074
7132	NC_019673	TCA	2	6	240401	240406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433602074
7133	NC_019673	CGA	2	6	240408	240413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602074
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7137	NC_019673	ATCTTC	2	12	240484	240495	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	433602074
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7143	NC_019673	CGGG	2	8	240655	240662	0 %	0 %	75 %	25 %	433602074
7144	NC_019673	TGG	2	6	240663	240668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433602074
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7152	NC_019673	GAC	2	6	240967	240972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602074
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7190	NC_019673	GTG	2	6	242044	242049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433602074
7191	NC_019673	GCT	2	6	242055	242060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602074
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7194	NC_019673	CGAG	2	8	242127	242134	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7195	NC_019673	GCA	2	6	242169	242174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602075
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7223	NC_019673	GCA	2	6	243076	243081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602076
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7229	NC_019673	GC	3	6	243266	243271	0 %	0 %	50 %	50 %	433602077
7230	NC_019673	CGG	2	6	243291	243296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602077
7231	NC_019673	CGA	2	6	243313	243318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602077
7232	NC_019673	CGG	2	6	243363	243368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602077
7233	NC_019673	CCG	2	6	243370	243375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602077
7234	NC_019673	ACCCGG	2	12	243417	243428	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	433602077
7235	NC_019673	AGC	2	6	243429	243434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602077
7236	NC_019673	GCGG	2	8	243442	243449	0 %	0 %	75 %	25 %	433602077
7237	NC_019673	CCCGCG	2	12	243531	243542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602077
7238	NC_019673	GTC	2	6	243551	243556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602077
7239	NC_019673	GGCC	2	8	243593	243600	0 %	0 %	50 %	50 %	433602078
7240	NC_019673	CG	4	8	243650	243657	0 %	0 %	50 %	50 %	433602078
7241	NC_019673	GCC	3	9	243676	243684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602078
7242	NC_019673	CGCC	2	8	243689	243696	0 %	0 %	25 %	75 %	433602078
7243	NC_019673	CCAG	2	8	243797	243804	25 %	0 %	25 %	50 %	433602078
7244	NC_019673	CCAGCG	2	12	243815	243826	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	433602078
7245	NC_019673	CAGCCG	2	12	243840	243851	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	433602078
7246	NC_019673	CCGG	2	8	243902	243909	0 %	0 %	50 %	50 %	433602078
7247	NC_019673	CGC	2	6	243912	243917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602078
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7251	NC_019673	CG	4	8	244202	244209	0 %	0 %	50 %	50 %	433602078
7252	NC_019673	CGG	2	6	244250	244255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602078
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7267	NC_019673	G	6	6	244904	244909	0 %	0 %	100 %	0 %	433602078
7268	NC_019673	CG	3	6	244931	244936	0 %	0 %	50 %	50 %	433602078
7269	NC_019673	GCA	2	6	244943	244948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602078
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7310	NC_019673	CTG	2	6	246099	246104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602078
7311	NC_019673	TCG	2	6	246121	246126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602078
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7323	NC_019673	CCG	2	6	246473	246478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602078
7324	NC_019673	CTC	2	6	246495	246500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433602078
7325	NC_019673	GCT	2	6	246506	246511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602078
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7327	NC_019673	CG	3	6	246635	246640	0 %	0 %	50 %	50 %	433602078
7328	NC_019673	CG	3	6	246643	246648	0 %	0 %	50 %	50 %	433602078
7329	NC_019673	AGC	2	6	246715	246720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602078
7330	NC_019673	AGC	2	6	246727	246732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602078
7331	NC_019673	GAC	2	6	246740	246745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602078
7332	NC_019673	ACC	3	9	246754	246762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433602078
7333	NC_019673	CCTCC	2	10	246831	246840	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
7334	NC_019673	TGCG	2	8	246844	246851	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7335	NC_019673	TGT	2	6	246858	246863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7336	NC_019673	GTC	3	9	246899	246907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7337	NC_019673	CGC	2	6	247115	247120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602079
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7339	NC_019673	CGG	2	6	247181	247186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602079
7340	NC_019673	ACGG	2	8	247242	247249	25 %	0 %	50 %	25 %	433602079
7341	NC_019673	CCG	2	6	247309	247314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602079
7342	NC_019673	GCCC	2	8	247322	247329	0 %	0 %	25 %	75 %	433602079
7343	NC_019673	CGA	2	6	247333	247338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602079
7344	NC_019673	GTC	2	6	247346	247351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602079
7345	NC_019673	ACG	2	6	247402	247407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602079
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7347	NC_019673	CGG	2	6	247514	247519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602079
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7349	NC_019673	CGT	2	6	247639	247644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602079
7350	NC_019673	AAG	2	6	247671	247676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433602079
7351	NC_019673	ACG	2	6	247678	247683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602079
7352	NC_019673	CGT	2	6	247691	247696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602079
7353	NC_019673	GGC	2	6	247697	247702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602079
7354	NC_019673	CAA	2	6	247787	247792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433602079
7355	NC_019673	GTG	2	6	247794	247799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433602079
7356	NC_019673	ACG	2	6	247813	247818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602079
7357	NC_019673	GTC	2	6	247851	247856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602079
7358	NC_019673	ATC	2	6	247863	247868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433602079
7359	NC_019673	CGA	2	6	247871	247876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602079
7360	NC_019673	CCGC	2	8	247879	247886	0 %	0 %	25 %	75 %	433602079
7361	NC_019673	CGC	2	6	247934	247939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602079
7362	NC_019673	CCG	2	6	247986	247991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602079
7363	NC_019673	CAA	2	6	248024	248029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433602079
7364	NC_019673	AGC	2	6	248086	248091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602079
7365	NC_019673	GCC	2	6	248141	248146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602079
7366	NC_019673	ACG	2	6	248188	248193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602079
7367	NC_019673	GCT	2	6	248210	248215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602079
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7369	NC_019673	GAC	2	6	248351	248356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602079
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7386	NC_019673	CG	3	6	248979	248984	0 %	0 %	50 %	50 %	433602080
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7454	NC_019673	GCCG	2	8	251241	251248	0 %	0 %	50 %	50 %	433602082
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7461	NC_019673	CGA	2	6	251395	251400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602082
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7463	NC_019673	GCT	2	6	251488	251493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602082
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7471	NC_019673	CGGG	2	8	251961	251968	0 %	0 %	75 %	25 %	433602083
7472	NC_019673	CCG	2	6	251993	251998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602083
7473	NC_019673	GTG	2	6	252004	252009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433602083
7474	NC_019673	GCG	3	9	252060	252068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602083
7475	NC_019673	GTC	2	6	252096	252101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602083
7476	NC_019673	CGG	2	6	252261	252266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602083
7477	NC_019673	GCAGCG	2	12	252267	252278	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	433602083
7478	NC_019673	CG	3	6	252292	252297	0 %	0 %	50 %	50 %	433602083
7479	NC_019673	ATC	2	6	252319	252324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433602083
7480	NC_019673	CGA	2	6	252327	252332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602083
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7482	NC_019673	CTG	2	6	252379	252384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602083
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