MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Saccharothrix espanaensis DSM 44229 complete genome

Total Repeats: 280209

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_019673	GGT	2	6	201922	201927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_019673	CGT	2	6	201941	201946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_019673	CTA	2	6	201964	201969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_019673	AAAC	2	8	201998	202005	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6005	NC_019673	CGG	2	6	202087	202092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NC_019673	CAC	2	6	202120	202125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6007	NC_019673	C	6	6	202143	202148	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6008	NC_019673	CG	3	6	202157	202162	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6009	NC_019673	TAG	2	6	202166	202171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_019673	CCT	2	6	202185	202190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6011	NC_019673	CAC	2	6	202277	202282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6012	NC_019673	CGG	2	6	202309	202314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6013	NC_019673	CCCG	2	8	202329	202336	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6014	NC_019673	CCGA	2	8	202347	202354	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6015	NC_019673	GAT	2	6	202363	202368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433602032
6016	NC_019673	GCTG	2	8	202371	202378	0 %	25 %	50 %	25 %	433602032
6017	NC_019673	CAG	2	6	202381	202386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602032
6018	NC_019673	TGC	2	6	202403	202408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602032
6019	NC_019673	CTC	2	6	202467	202472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433602032
6020	NC_019673	AG	3	6	202489	202494	50 %	0 %	50 %	0 %	433602032
6021	NC_019673	CGC	5	15	202517	202531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602032
6022	NC_019673	GTA	2	6	202533	202538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433602032
6023	NC_019673	GGGC	2	8	202592	202599	0 %	0 %	75 %	25 %	433602032
6024	NC_019673	CACCG	2	10	202620	202629	20 %	0 %	20 %	60 %	433602032
6025	NC_019673	GCG	2	6	202630	202635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602032
6026	NC_019673	CGG	2	6	202643	202648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602032
6027	NC_019673	CAC	2	6	202754	202759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433602032
6028	NC_019673	GCG	2	6	202786	202791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602032
6029	NC_019673	ATCC	2	8	202794	202801	25 %	25 %	0 %	50 %	433602032
6030	NC_019673	CAC	3	9	202815	202823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6031	NC_019673	CACGG	2	10	202843	202852	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6032	NC_019673	CCGGA	2	10	202914	202923	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6033	NC_019673	GCA	2	6	202997	203002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_019673	CGGG	2	8	203007	203014	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6035	NC_019673	CCCG	2	8	203035	203042	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6036	NC_019673	CGG	2	6	203081	203086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6037	NC_019673	CA	3	6	203097	203102	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6038	NC_019673	GCA	2	6	203192	203197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_019673	GC	3	6	203294	203299	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6040	NC_019673	CGG	2	6	203369	203374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602033
6041	NC_019673	TCC	2	6	203459	203464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433602033
6042	NC_019673	GCG	2	6	203479	203484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602033
6043	NC_019673	TG	3	6	203490	203495	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_019673	GTT	2	6	203497	203502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_019673	G	6	6	203552	203557	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_019673	CGG	3	9	203593	203601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602034
6047	NC_019673	CGG	2	6	203618	203623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602034
6048	NC_019673	CG	3	6	203658	203663	0 %	0 %	50 %	50 %	433602034
6049	NC_019673	GCA	2	6	203690	203695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602034
6050	NC_019673	GGC	2	6	203727	203732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602034
6051	NC_019673	CGA	2	6	203816	203821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602034
6052	NC_019673	CGA	2	6	203861	203866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602034
6053	NC_019673	CCA	2	6	203996	204001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433602034
6054	NC_019673	GCG	2	6	204075	204080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602034
6055	NC_019673	AGC	2	6	204091	204096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602034
6056	NC_019673	CAG	2	6	204105	204110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602034
6057	NC_019673	CGGC	2	8	204128	204135	0 %	0 %	50 %	50 %	433602034
6058	NC_019673	CGG	2	6	204173	204178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602034
6059	NC_019673	GCG	2	6	204274	204279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602034
6060	NC_019673	CGG	2	6	204287	204292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602034
6061	NC_019673	CTTGGC	2	12	204327	204338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602034
6062	NC_019673	CCA	2	6	204371	204376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433602034
6063	NC_019673	CCG	2	6	204409	204414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602034
6064	NC_019673	GCA	2	6	204465	204470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602034
6065	NC_019673	AGCCGG	2	12	204481	204492	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	433602034
6066	NC_019673	TCG	3	9	204493	204501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602034
6067	NC_019673	GGGTG	2	10	204519	204528	0 %	20 %	80 %	0 %	433602034
6068	NC_019673	TCG	2	6	204529	204534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602034
6069	NC_019673	GCA	2	6	204536	204541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602034
6070	NC_019673	CCT	2	6	204548	204553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433602034
6071	NC_019673	GTC	2	6	204561	204566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602034
6072	NC_019673	GGT	3	9	204612	204620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433602034
6073	NC_019673	CAGC	2	8	204621	204628	25 %	0 %	25 %	50 %	433602034
6074	NC_019673	CGGC	2	8	204653	204660	0 %	0 %	50 %	50 %	433602034
6075	NC_019673	CGG	2	6	204671	204676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602034
6076	NC_019673	CGG	3	9	204689	204697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602034
6077	NC_019673	CCT	2	6	204698	204703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433602034
6078	NC_019673	CGA	2	6	204743	204748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6079	NC_019673	CTC	2	6	204759	204764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6080	NC_019673	GTG	2	6	204765	204770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_019673	CCGC	2	8	204946	204953	0 %	0 %	25 %	75 %	433602035
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6084	NC_019673	CGTT	2	8	205035	205042	0 %	50 %	25 %	25 %	433602035
6085	NC_019673	TGC	2	6	205072	205077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602035
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6088	NC_019673	CCGG	3	12	205196	205207	0 %	0 %	50 %	50 %	433602036
6089	NC_019673	ATC	2	6	205217	205222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433602036
6090	NC_019673	CG	3	6	205292	205297	0 %	0 %	50 %	50 %	433602036
6091	NC_019673	ACC	2	6	205310	205315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433602036
6092	NC_019673	TCG	2	6	205337	205342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602036
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6098	NC_019673	GTC	3	9	205663	205671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602036
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6105	NC_019673	GGC	2	6	205825	205830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6106	NC_019673	CCT	2	6	205837	205842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6107	NC_019673	CGC	3	9	205848	205856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6108	NC_019673	CTT	2	6	205871	205876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6109	NC_019673	GAA	2	6	205878	205883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_019673	GC	4	8	205909	205916	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6111	NC_019673	ACG	3	9	205923	205931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_019673	CGG	2	6	205943	205948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NC_019673	GCC	2	6	205965	205970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6114	NC_019673	TCCCG	2	10	205973	205982	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6115	NC_019673	GTC	2	6	205985	205990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6116	NC_019673	GCG	2	6	205992	205997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6117	NC_019673	GCC	2	6	206017	206022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6118	NC_019673	CGG	2	6	206106	206111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6119	NC_019673	CGC	3	9	206142	206150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6120	NC_019673	TGGGC	2	10	206151	206160	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6121	NC_019673	TGC	2	6	206165	206170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6123	NC_019673	GGT	2	6	206193	206198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_019673	CGC	2	6	206210	206215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6125	NC_019673	GCC	2	6	206235	206240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6127	NC_019673	CGC	2	6	206298	206303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6253	NC_019673	CGC	2	6	210612	210617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602041
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6289	NC_019673	GCCG	2	8	212074	212081	0 %	0 %	50 %	50 %	433602042
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6303	NC_019673	GGT	2	6	212348	212353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6361	NC_019673	GAG	2	6	214206	214211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433602046
6362	NC_019673	CGG	2	6	214213	214218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602046
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6369	NC_019673	CGGC	2	8	214423	214430	0 %	0 %	50 %	50 %	433602046
6370	NC_019673	GTCCG	2	10	214457	214466	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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6373	NC_019673	TGG	2	6	214580	214585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433602047
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6398	NC_019673	GAC	2	6	215353	215358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6452	NC_019673	CGC	2	6	217277	217282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6482	NC_019673	ATC	2	6	218119	218124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6485	NC_019673	CGT	2	6	218214	218219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602051
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6490	NC_019673	TGC	2	6	218348	218353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602051
6491	NC_019673	GCG	2	6	218370	218375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602051
6492	NC_019673	TGG	2	6	218393	218398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433602051
6493	NC_019673	CCG	2	6	218404	218409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602051
6494	NC_019673	CCG	2	6	218432	218437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602051
6495	NC_019673	ACC	2	6	218441	218446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433602051
6496	NC_019673	CGA	2	6	218451	218456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602051
6497	NC_019673	CGGG	2	8	218475	218482	0 %	0 %	75 %	25 %	433602051
6498	NC_019673	TGC	2	6	218519	218524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602051
6499	NC_019673	AGC	2	6	218555	218560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602051
6500	NC_019673	CAC	2	6	218563	218568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433602051

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