MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Saccharothrix espanaensis DSM 44229 complete genome

Total Repeats: 280209

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_019673	CGG	2	6	182063	182068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5502	NC_019673	GCC	2	6	182071	182076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5503	NC_019673	GTC	2	6	182096	182101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_019673	CGT	2	6	182123	182128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5505	NC_019673	CGT	2	6	182144	182149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_019673	CG	3	6	182166	182171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5507	NC_019673	TCG	2	6	182173	182178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5508	NC_019673	CCCG	2	8	182228	182235	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5509	NC_019673	GCACC	2	10	182280	182289	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5510	NC_019673	GCCG	2	8	182309	182316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5511	NC_019673	CGG	2	6	182339	182344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5512	NC_019673	CGGA	2	8	182419	182426	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5513	NC_019673	GGT	2	6	182442	182447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_019673	CG	3	6	182448	182453	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5515	NC_019673	GC	3	6	182481	182486	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5516	NC_019673	GTC	2	6	182488	182493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602018
5517	NC_019673	CGG	2	6	182522	182527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602018
5518	NC_019673	GC	3	6	182542	182547	0 %	0 %	50 %	50 %	433602018
5519	NC_019673	GCC	2	6	182579	182584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602018
5520	NC_019673	GCC	2	6	182600	182605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602018
5521	NC_019673	CCG	2	6	182628	182633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602018
5522	NC_019673	GCG	2	6	182683	182688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602018
5523	NC_019673	GCCGAC	2	12	182730	182741	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	433602018
5524	NC_019673	GGA	2	6	182770	182775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433602018
5525	NC_019673	GC	3	6	182788	182793	0 %	0 %	50 %	50 %	433602018
5526	NC_019673	GAC	2	6	182798	182803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602018
5527	NC_019673	CTG	2	6	182810	182815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602018
5528	NC_019673	GGA	2	6	182860	182865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433602018
5529	NC_019673	GAG	2	6	182934	182939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433602018
5530	NC_019673	CGC	2	6	182962	182967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602018
5531	NC_019673	TCA	2	6	182974	182979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433602018
5532	NC_019673	GGC	2	6	183008	183013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602018
5533	NC_019673	GCG	2	6	183043	183048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602018
5534	NC_019673	CAC	2	6	183185	183190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433602018
5535	NC_019673	GAC	2	6	183218	183223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602018
5536	NC_019673	CCA	2	6	183253	183258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433602018
5537	NC_019673	TGG	2	6	183342	183347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433602018
5538	NC_019673	GTC	2	6	183434	183439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602018
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5540	NC_019673	GTG	2	6	183453	183458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433602018
5541	NC_019673	CAG	2	6	183476	183481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602018
5542	NC_019673	CCAG	2	8	183499	183506	25 %	0 %	25 %	50 %	433602018
5543	NC_019673	GGC	2	6	183530	183535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602018
5544	NC_019673	TCG	2	6	183543	183548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602018
5545	NC_019673	CGG	2	6	183656	183661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602018
5546	NC_019673	CGT	2	6	183724	183729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602018
5547	NC_019673	GTCG	2	8	183752	183759	0 %	25 %	50 %	25 %	433602018
5548	NC_019673	GCC	2	6	183767	183772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602018
5549	NC_019673	TGC	2	6	183774	183779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602018
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5551	NC_019673	TCG	2	6	183804	183809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602018
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5553	NC_019673	TCG	2	6	183873	183878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602018
5554	NC_019673	CGA	2	6	183928	183933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602018
5555	NC_019673	GCCGC	2	10	183987	183996	0 %	0 %	40 %	60 %	433602018
5556	NC_019673	GTC	2	6	184118	184123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602018
5557	NC_019673	TCC	2	6	184221	184226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5558	NC_019673	AGG	2	6	184245	184250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_019673	CAGGG	2	10	184257	184266	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5560	NC_019673	GAG	2	6	184343	184348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_019673	CGA	2	6	184375	184380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602019
5562	NC_019673	GGA	2	6	184429	184434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433602019
5563	NC_019673	TGCGGA	2	12	184521	184532	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	433602019
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5566	NC_019673	CTG	2	6	184610	184615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602019
5567	NC_019673	CGC	3	9	184616	184624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602019
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5571	NC_019673	TCA	2	6	184788	184793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433602019
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5573	NC_019673	TGG	2	6	185064	185069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_019673	GCA	2	6	185124	185129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5575	NC_019673	GT	3	6	185218	185223	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_019673	GCA	2	6	185225	185230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5577	NC_019673	CCG	2	6	185264	185269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602020
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5583	NC_019673	CG	3	6	185463	185468	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5586	NC_019673	GGT	2	6	185687	185692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_019673	GCA	2	6	185750	185755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5588	NC_019673	CGA	2	6	185829	185834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5589	NC_019673	CGAT	2	8	185858	185865	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5590	NC_019673	TGC	2	6	185894	185899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5591	NC_019673	ACC	2	6	185969	185974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5592	NC_019673	GTC	2	6	186047	186052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5593	NC_019673	GGT	2	6	186054	186059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_019673	CGG	2	6	186158	186163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5595	NC_019673	G	6	6	186197	186202	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_019673	CG	3	6	186228	186233	0 %	0 %	50 %	50 %	433602021
5597	NC_019673	CG	3	6	186238	186243	0 %	0 %	50 %	50 %	433602021
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5603	NC_019673	GCC	2	6	186372	186377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602021
5604	NC_019673	GCCG	2	8	186468	186475	0 %	0 %	50 %	50 %	433602021
5605	NC_019673	ACC	2	6	186486	186491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433602021
5606	NC_019673	CGGA	2	8	186547	186554	25 %	0 %	50 %	25 %	433602021
5607	NC_019673	GC	3	6	186575	186580	0 %	0 %	50 %	50 %	433602021
5608	NC_019673	CCG	2	6	186608	186613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602021
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5616	NC_019673	GCG	2	6	186921	186926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602021
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5619	NC_019673	CGG	3	9	187017	187025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602021
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5622	NC_019673	CGACG	2	10	187119	187128	20 %	0 %	40 %	40 %	433602021
5623	NC_019673	GTG	2	6	187132	187137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433602021
5624	NC_019673	CGA	2	6	187175	187180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602021
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5626	NC_019673	CG	3	6	187227	187232	0 %	0 %	50 %	50 %	433602021
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5663	NC_019673	CGGT	2	8	189029	189036	0 %	25 %	50 %	25 %	433602021
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5737	NC_019673	GC	3	6	191723	191728	0 %	0 %	50 %	50 %	433602024
5738	NC_019673	CGC	2	6	191767	191772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602024
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5740	NC_019673	CGC	2	6	191793	191798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602024
5741	NC_019673	CGCGG	2	10	191807	191816	0 %	0 %	60 %	40 %	433602024
5742	NC_019673	CAG	2	6	191909	191914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602024
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5991	NC_019673	CGG	2	6	201619	201624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5992	NC_019673	CG	3	6	201670	201675	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5993	NC_019673	GCC	2	6	201686	201691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5994	NC_019673	CAGG	2	8	201697	201704	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5995	NC_019673	GGA	2	6	201705	201710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5996	NC_019673	GGT	2	6	201800	201805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5997	NC_019673	GGA	2	6	201825	201830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6000	NC_019673	CCCG	2	8	201903	201910	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding

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