MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Streptococcus agalactiae SA20-06 chromosome

Total Repeats: 4953

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019048	GTCA	2	8	677	684	25 %	25 %	25 %	25 %	410593713
2	NC_019048	TGAT	2	8	744	751	25 %	50 %	25 %	0 %	410593713
3	NC_019048	TACA	2	8	822	829	50 %	25 %	0 %	25 %	410593713
4	NC_019048	ACGT	2	8	1047	1054	25 %	25 %	25 %	25 %	410593713
5	NC_019048	AATA	2	8	1631	1638	75 %	25 %	0 %	0 %	410593714
6	NC_019048	AAAT	2	8	2129	2136	75 %	25 %	0 %	0 %	410593714
7	NC_019048	ACTA	2	8	2745	2752	50 %	25 %	0 %	25 %	410593714
8	NC_019048	AAAG	2	8	2986	2993	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019048	CAGA	2	8	3151	3158	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_019048	TTTA	2	8	3181	3188	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019048	TTGA	2	8	3627	3634	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019048	TTGA	2	8	4408	4415	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019048	TTTA	2	8	4488	4495	25 %	75 %	0 %	0 %	410593716
14	NC_019048	TCAA	2	8	4864	4871	50 %	25 %	0 %	25 %	410593716
15	NC_019048	ACTT	2	8	5302	5309	25 %	50 %	0 %	25 %	410593716
16	NC_019048	CTTA	2	8	5868	5875	25 %	50 %	0 %	25 %	410593717
17	NC_019048	TAGC	2	8	7155	7162	25 %	25 %	25 %	25 %	410593718
18	NC_019048	ACCA	2	8	7245	7252	50 %	0 %	0 %	50 %	410593718
19	NC_019048	AATC	2	8	7372	7379	50 %	25 %	0 %	25 %	410593718
20	NC_019048	TGCG	2	8	8157	8164	0 %	25 %	50 %	25 %	410593718
21	NC_019048	AACA	2	8	8313	8320	75 %	0 %	0 %	25 %	410593718
22	NC_019048	TTAG	2	8	8630	8637	25 %	50 %	25 %	0 %	410593718
23	NC_019048	TAGA	2	8	9969	9976	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019048	AAGA	2	8	10193	10200	75 %	0 %	25 %	0 %	410593720
25	NC_019048	TATT	2	8	10384	10391	25 %	75 %	0 %	0 %	410593721
26	NC_019048	AATT	2	8	11019	11026	50 %	50 %	0 %	0 %	410593723
27	NC_019048	TATT	2	8	11259	11266	25 %	75 %	0 %	0 %	410593723
28	NC_019048	ACAG	2	8	11403	11410	50 %	0 %	25 %	25 %	410593723
29	NC_019048	AGTG	2	8	12481	12488	25 %	25 %	50 %	0 %	410593724
30	NC_019048	ATCC	2	8	12941	12948	25 %	25 %	0 %	50 %	410593724
31	NC_019048	ATTT	2	8	13014	13021	25 %	75 %	0 %	0 %	410593724
32	NC_019048	TATT	2	8	13152	13159	25 %	75 %	0 %	0 %	410593724
33	NC_019048	GAAG	2	8	13596	13603	50 %	0 %	50 %	0 %	410593725
34	NC_019048	ACCT	2	8	13822	13829	25 %	25 %	0 %	50 %	410593725
35	NC_019048	TTTA	2	8	13930	13937	25 %	75 %	0 %	0 %	410593726
36	NC_019048	TTTG	2	8	14697	14704	0 %	75 %	25 %	0 %	410593726
37	NC_019048	CAAC	2	8	14817	14824	50 %	0 %	0 %	50 %	410593726
38	NC_019048	ATGG	2	8	14836	14843	25 %	25 %	50 %	0 %	410593726
39	NC_019048	AATT	2	8	15695	15702	50 %	50 %	0 %	0 %	410593726
40	NC_019048	GTTA	2	8	16027	16034	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019048	ACGA	2	8	16256	16263	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_019048	GTTA	2	8	16548	16555	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019048	GTGA	2	8	16761	16768	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019048	TAAC	2	8	16844	16851	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_019048	AGCG	2	8	16932	16939	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_019048	TGGT	2	8	17597	17604	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019048	AGCC	2	8	17814	17821	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_019048	GTAA	2	8	18269	18276	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019048	GAAG	2	8	18351	18358	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019048	GCGA	2	8	18425	18432	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_019048	ATTC	2	8	19291	19298	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_019048	CTAA	2	8	19647	19654	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_019048	TAGG	2	8	20302	20309	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019048	ACGA	2	8	22081	22088	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_019048	GTTA	2	8	22373	22380	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019048	GTGA	2	8	22586	22593	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019048	TAAC	2	8	22669	22676	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_019048	AGCG	2	8	22757	22764	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_019048	TGGT	2	8	23422	23429	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019048	AGCC	2	8	23639	23646	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_019048	GTAA	2	8	24094	24101	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019048	GAAG	2	8	24176	24183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019048	GCGA	2	8	24250	24257	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_019048	ATTC	2	8	25116	25123	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_019048	CTAA	2	8	25472	25479	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_019048	TAGG	2	8	26127	26134	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019048	TATT	2	8	27950	27957	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019048	GCGT	2	8	28119	28126	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_019048	ACTA	2	8	29186	29193	50 %	25 %	0 %	25 %	410593727
70	NC_019048	CAAG	2	8	29368	29375	50 %	0 %	25 %	25 %	410593727
71	NC_019048	ATTA	2	8	30185	30192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019048	TGAT	2	8	30945	30952	25 %	50 %	25 %	0 %	410593728
73	NC_019048	AATT	2	8	31083	31090	50 %	50 %	0 %	0 %	410593728
74	NC_019048	TGAT	2	8	31125	31132	25 %	50 %	25 %	0 %	410593728
75	NC_019048	ATTG	2	8	31159	31166	25 %	50 %	25 %	0 %	410593728
76	NC_019048	TAGA	2	8	31376	31383	50 %	25 %	25 %	0 %	410593729
77	NC_019048	AATC	2	8	31519	31526	50 %	25 %	0 %	25 %	410593729
78	NC_019048	CTTA	2	8	31600	31607	25 %	50 %	0 %	25 %	410593729
79	NC_019048	TTAA	2	8	32035	32042	50 %	50 %	0 %	0 %	410593729
80	NC_019048	TCTT	2	8	32439	32446	0 %	75 %	0 %	25 %	410593729
81	NC_019048	TCTT	2	8	32704	32711	0 %	75 %	0 %	25 %	410593730
82	NC_019048	ATTG	2	8	32869	32876	25 %	50 %	25 %	0 %	410593730
83	NC_019048	AATC	2	8	33088	33095	50 %	25 %	0 %	25 %	410593730
84	NC_019048	AATT	2	8	33340	33347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019048	ATTT	2	8	33922	33929	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019048	TTCA	2	8	34285	34292	25 %	50 %	0 %	25 %	410593731
87	NC_019048	GTTT	2	8	34614	34621	0 %	75 %	25 %	0 %	410593731
88	NC_019048	TAAA	2	8	35582	35589	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019048	TTAT	2	8	35672	35679	25 %	75 %	0 %	0 %	410593733
90	NC_019048	TTGA	2	8	36172	36179	25 %	50 %	25 %	0 %	410593733
91	NC_019048	GGAA	2	8	36372	36379	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019048	AATC	2	8	37095	37102	50 %	25 %	0 %	25 %	410593734
93	NC_019048	TGGT	2	8	37755	37762	0 %	50 %	50 %	0 %	410593734
94	NC_019048	GCAC	2	8	38363	38370	25 %	0 %	25 %	50 %	410593734
95	NC_019048	TTGG	2	8	39874	39881	0 %	50 %	50 %	0 %	410593734
96	NC_019048	ACTT	2	8	40522	40529	25 %	50 %	0 %	25 %	410593735
97	NC_019048	AATC	2	8	40642	40649	50 %	25 %	0 %	25 %	410593735
98	NC_019048	AATT	2	8	41657	41664	50 %	50 %	0 %	0 %	410593735
99	NC_019048	TATC	2	8	41722	41729	25 %	50 %	0 %	25 %	410593735
100	NC_019048	TTGA	2	8	41740	41747	25 %	50 %	25 %	0 %	410593735
101	NC_019048	TGCT	2	8	42137	42144	0 %	50 %	25 %	25 %	410593736
102	NC_019048	AAGG	2	8	42448	42455	50 %	0 %	50 %	0 %	410593736
103	NC_019048	TAGT	2	8	42978	42985	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019048	AGTT	2	8	43181	43188	25 %	50 %	25 %	0 %	410593737
105	NC_019048	GTCT	2	8	43341	43348	0 %	50 %	25 %	25 %	410593737
106	NC_019048	CCTG	2	8	43427	43434	0 %	25 %	25 %	50 %	410593737
107	NC_019048	ACCA	2	8	43802	43809	50 %	0 %	0 %	50 %	410593738
108	NC_019048	TTGA	2	8	43942	43949	25 %	50 %	25 %	0 %	410593738
109	NC_019048	TTTG	2	8	44007	44014	0 %	75 %	25 %	0 %	410593738
110	NC_019048	TTGA	2	8	44738	44745	25 %	50 %	25 %	0 %	410593739
111	NC_019048	GCTA	2	8	45472	45479	25 %	25 %	25 %	25 %	410593739
112	NC_019048	GCCA	2	8	45645	45652	25 %	0 %	25 %	50 %	410593739
113	NC_019048	AACC	2	8	45766	45773	50 %	0 %	0 %	50 %	410593739
114	NC_019048	CAAA	2	8	45951	45958	75 %	0 %	0 %	25 %	410593739
115	NC_019048	GTTA	2	8	46210	46217	25 %	50 %	25 %	0 %	410593740
116	NC_019048	GTCC	2	8	46289	46296	0 %	25 %	25 %	50 %	410593740
117	NC_019048	AATC	2	8	46760	46767	50 %	25 %	0 %	25 %	410593740
118	NC_019048	ACTA	2	8	47139	47146	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_019048	TTAT	2	8	47501	47508	25 %	75 %	0 %	0 %	410593741
120	NC_019048	GTCA	4	16	47883	47898	25 %	25 %	25 %	25 %	410593741
121	NC_019048	ATTT	2	8	49911	49918	25 %	75 %	0 %	0 %	410593743
122	NC_019048	AATT	2	8	51609	51616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019048	TTAG	2	8	52210	52217	25 %	50 %	25 %	0 %	410593744
124	NC_019048	TAGG	2	8	52660	52667	25 %	25 %	50 %	0 %	410593744
125	NC_019048	GATT	2	8	52740	52747	25 %	50 %	25 %	0 %	410593745
126	NC_019048	TCTT	2	8	53471	53478	0 %	75 %	0 %	25 %	410593746
127	NC_019048	TTAT	2	8	53678	53685	25 %	75 %	0 %	0 %	410593746
128	NC_019048	TATT	2	8	53703	53710	25 %	75 %	0 %	0 %	410593746
129	NC_019048	TGCT	2	8	53841	53848	0 %	50 %	25 %	25 %	410593747
130	NC_019048	ATGC	2	8	54079	54086	25 %	25 %	25 %	25 %	410593747
131	NC_019048	ATTT	2	8	54127	54134	25 %	75 %	0 %	0 %	410593747
132	NC_019048	AACT	2	8	54602	54609	50 %	25 %	0 %	25 %	410593747
133	NC_019048	ATTG	2	8	56093	56100	25 %	50 %	25 %	0 %	410593749
134	NC_019048	CCAA	2	8	57981	57988	50 %	0 %	0 %	50 %	410593751
135	NC_019048	AGAA	2	8	59026	59033	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019048	TTAT	2	8	59243	59250	25 %	75 %	0 %	0 %	410593752
137	NC_019048	CCTG	2	8	59491	59498	0 %	25 %	25 %	50 %	410593752
138	NC_019048	ATGA	2	8	61137	61144	50 %	25 %	25 %	0 %	410593754
139	NC_019048	CTTT	2	8	61179	61186	0 %	75 %	0 %	25 %	410593754
140	NC_019048	CTGT	2	8	62247	62254	0 %	50 %	25 %	25 %	410593755
141	NC_019048	AAAT	2	8	62621	62628	75 %	25 %	0 %	0 %	410593756
142	NC_019048	TTGG	2	8	62636	62643	0 %	50 %	50 %	0 %	410593756
143	NC_019048	CAAG	2	8	62888	62895	50 %	0 %	25 %	25 %	410593756
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145	NC_019048	TTGA	2	8	63525	63532	25 %	50 %	25 %	0 %	410593756
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