MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus agalactiae SA20-06 chromosome

Total Repeats: 40897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_019048	AACAA	2	10	228562	228571	80 %	0 %	0 %	20 %	410593914
5002	NC_019048	GTT	2	6	228613	228618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410593914
5003	NC_019048	AGT	2	6	228654	228659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593914
5004	NC_019048	A	6	6	228678	228683	100 %	0 %	0 %	0 %	410593914
5005	NC_019048	CACAC	2	10	228696	228705	40 %	0 %	0 %	60 %	410593914
5006	NC_019048	A	6	6	228763	228768	100 %	0 %	0 %	0 %	410593914
5007	NC_019048	CTA	2	6	228783	228788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410593914
5008	NC_019048	CACT	2	8	228789	228796	25 %	25 %	0 %	50 %	410593914
5009	NC_019048	GGT	2	6	228808	228813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410593914
5010	NC_019048	CAG	2	6	228827	228832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410593914
5011	NC_019048	TTGA	2	8	228862	228869	25 %	50 %	25 %	0 %	410593914
5012	NC_019048	TTG	2	6	228938	228943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410593914
5013	NC_019048	TGC	2	6	228960	228965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593914
5014	NC_019048	ACA	2	6	228966	228971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410593914
5015	NC_019048	TA	3	6	229020	229025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_019048	GCACAA	2	12	229029	229040	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	410593915
5017	NC_019048	CGTT	2	8	229079	229086	0 %	50 %	25 %	25 %	410593915
5018	NC_019048	CAAT	2	8	229111	229118	50 %	25 %	0 %	25 %	410593915
5019	NC_019048	A	6	6	229119	229124	100 %	0 %	0 %	0 %	410593915
5020	NC_019048	AGA	2	6	229130	229135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593915
5021	NC_019048	CAAC	2	8	229169	229176	50 %	0 %	0 %	50 %	410593915
5022	NC_019048	GGT	2	6	229230	229235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410593915
5023	NC_019048	CTT	2	6	229332	229337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410593915
5024	NC_019048	A	6	6	229365	229370	100 %	0 %	0 %	0 %	410593915
5025	NC_019048	T	7	7	229469	229475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_019048	AAAGT	2	10	229504	229513	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_019048	TAT	2	6	229557	229562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_019048	A	7	7	229609	229615	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_019048	GAA	2	6	229653	229658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593916
5030	NC_019048	ACA	2	6	229683	229688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410593916
5031	NC_019048	CAAT	2	8	229695	229702	50 %	25 %	0 %	25 %	410593916
5032	NC_019048	TGA	2	6	229745	229750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593916
5033	NC_019048	CA	3	6	229814	229819	50 %	0 %	0 %	50 %	410593916
5034	NC_019048	ATT	2	6	229829	229834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593916
5035	NC_019048	AGA	2	6	229835	229840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593916
5036	NC_019048	CAA	2	6	229848	229853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410593916
5037	NC_019048	TGT	2	6	229871	229876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410593916
5038	NC_019048	AACA	2	8	229879	229886	75 %	0 %	0 %	25 %	410593916
5039	NC_019048	TAA	2	6	229910	229915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410593916
5040	NC_019048	AGG	2	6	229950	229955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_019048	AT	3	6	229976	229981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_019048	GAT	2	6	229990	229995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_019048	ATA	2	6	230039	230044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_019048	CTA	2	6	230045	230050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_019048	ATT	2	6	230059	230064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_019048	CAA	2	6	230102	230107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410593917
5047	NC_019048	AGA	2	6	230113	230118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593917
5048	NC_019048	TAGTC	2	10	230146	230155	20 %	40 %	20 %	20 %	410593917
5049	NC_019048	AGA	2	6	230185	230190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593917
5050	NC_019048	CA	3	6	230200	230205	50 %	0 %	0 %	50 %	410593917
5051	NC_019048	A	6	6	230267	230272	100 %	0 %	0 %	0 %	410593917
5052	NC_019048	A	8	8	230309	230316	100 %	0 %	0 %	0 %	410593917
5053	NC_019048	T	6	6	230350	230355	0 %	100 %	0 %	0 %	410593917
5054	NC_019048	TAC	2	6	230371	230376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410593917
5055	NC_019048	AC	3	6	230375	230380	50 %	0 %	0 %	50 %	410593917
5056	NC_019048	T	6	6	230397	230402	0 %	100 %	0 %	0 %	410593917
5057	NC_019048	AAT	2	6	230424	230429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410593917
5058	NC_019048	A	8	8	230508	230515	100 %	0 %	0 %	0 %	410593918
5059	NC_019048	TTA	2	6	230528	230533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593918
5060	NC_019048	AGA	2	6	230549	230554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593918
5061	NC_019048	ATT	2	6	230566	230571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593918
5062	NC_019048	ACA	2	6	230572	230577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410593918
5063	NC_019048	CCG	2	6	230699	230704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410593918
5064	NC_019048	AT	3	6	230865	230870	50 %	50 %	0 %	0 %	410593918
5065	NC_019048	ATATC	2	10	230889	230898	40 %	40 %	0 %	20 %	410593918
5066	NC_019048	ATGG	2	8	230915	230922	25 %	25 %	50 %	0 %	410593918
5067	NC_019048	A	7	7	230951	230957	100 %	0 %	0 %	0 %	410593918
5068	NC_019048	TGG	2	6	231018	231023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_019048	TAA	2	6	231032	231037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_019048	GAT	2	6	231042	231047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_019048	AG	3	6	231095	231100	50 %	0 %	50 %	0 %	410593919
5072	NC_019048	TGA	2	6	231113	231118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593919
5073	NC_019048	GAA	2	6	231189	231194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593919
5074	NC_019048	AGCTAA	2	12	231209	231220	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410593919
5075	NC_019048	A	7	7	231224	231230	100 %	0 %	0 %	0 %	410593919
5076	NC_019048	TGA	2	6	231329	231334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593919
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5078	NC_019048	GAA	2	6	231429	231434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593919
5079	NC_019048	AG	3	6	231465	231470	50 %	0 %	50 %	0 %	410593919
5080	NC_019048	CTTT	2	8	231496	231503	0 %	75 %	0 %	25 %	410593919
5081	NC_019048	AGA	2	6	231590	231595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593919
5082	NC_019048	ATC	2	6	231702	231707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410593920
5083	NC_019048	AGA	2	6	231724	231729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593920
5084	NC_019048	TA	3	6	231735	231740	50 %	50 %	0 %	0 %	410593920
5085	NC_019048	AAG	2	6	231780	231785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593920
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5087	NC_019048	AATT	2	8	231879	231886	50 %	50 %	0 %	0 %	410593920
5088	NC_019048	GAAG	2	8	231992	231999	50 %	0 %	50 %	0 %	410593920
5089	NC_019048	TAC	2	6	232004	232009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410593920
5090	NC_019048	AGA	2	6	232081	232086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593921
5091	NC_019048	A	6	6	232096	232101	100 %	0 %	0 %	0 %	410593921
5092	NC_019048	TAG	2	6	232146	232151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593921
5093	NC_019048	AAG	2	6	232152	232157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593921
5094	NC_019048	GAC	2	6	232171	232176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410593921
5095	NC_019048	TGA	2	6	232192	232197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593921
5096	NC_019048	ATC	2	6	232216	232221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410593921
5097	NC_019048	A	6	6	232234	232239	100 %	0 %	0 %	0 %	410593921
5098	NC_019048	TAAA	2	8	232299	232306	75 %	25 %	0 %	0 %	410593921
5099	NC_019048	ATG	2	6	232314	232319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593921
5100	NC_019048	TTA	2	6	232366	232371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593921
5101	NC_019048	AAT	2	6	232382	232387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410593921
5102	NC_019048	AGA	2	6	232399	232404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593921
5103	NC_019048	TAT	2	6	232436	232441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593921
5104	NC_019048	TCAA	2	8	232494	232501	50 %	25 %	0 %	25 %	410593921
5105	NC_019048	TAAT	2	8	232510	232517	50 %	50 %	0 %	0 %	410593921
5106	NC_019048	TTTAT	2	10	232521	232530	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_019048	T	6	6	232547	232552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_019048	TTG	2	6	232617	232622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_019048	AT	3	6	232653	232658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_019048	ACT	2	6	232860	232865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_019048	AGATG	2	10	232895	232904	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_019048	A	6	6	232927	232932	100 %	0 %	0 %	0 %	410593923
5113	NC_019048	GAA	2	6	232945	232950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593923
5114	NC_019048	AT	3	6	232971	232976	50 %	50 %	0 %	0 %	410593923
5115	NC_019048	AGA	2	6	233028	233033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593923
5116	NC_019048	TGATA	2	10	233039	233048	40 %	40 %	20 %	0 %	410593923
5117	NC_019048	TA	3	6	233070	233075	50 %	50 %	0 %	0 %	410593924
5118	NC_019048	AT	3	6	233083	233088	50 %	50 %	0 %	0 %	410593924
5119	NC_019048	ATT	2	6	233111	233116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593924
5120	NC_019048	TA	3	6	233173	233178	50 %	50 %	0 %	0 %	410593925
5121	NC_019048	TAAA	2	8	233361	233368	75 %	25 %	0 %	0 %	410593925
5122	NC_019048	GAT	2	6	233449	233454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593925
5123	NC_019048	GAA	2	6	233462	233467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593925
5124	NC_019048	A	6	6	233476	233481	100 %	0 %	0 %	0 %	410593925
5125	NC_019048	ATGTGA	2	12	233536	233547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593925
5126	NC_019048	CTC	2	6	233548	233553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410593925
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5380	NC_019048	TAAA	2	8	245201	245208	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5381	NC_019048	TAA	2	6	245246	245251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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