MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Sinorhizobium meliloti Rm41

Total Repeats: 2796

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018700	CCGCG	2	10	1225	1234	0 %	0 %	40 %	60 %	407719210
2	NC_018700	CACGG	2	10	3962	3971	20 %	0 %	40 %	40 %	407719214
3	NC_018700	GCAGC	2	10	4794	4803	20 %	0 %	40 %	40 %	407719215
4	NC_018700	AGGCA	2	10	6169	6178	40 %	0 %	40 %	20 %	407719216
5	NC_018700	TTCCG	2	10	6581	6590	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_018700	CGACC	2	10	7233	7242	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
7	NC_018700	CGACC	2	10	10290	10299	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
8	NC_018700	GTCGT	2	10	10455	10464	0 %	40 %	40 %	20 %	407719221
9	NC_018700	GGGCA	2	10	12514	12523	20 %	0 %	60 %	20 %	407719223
10	NC_018700	GGTCG	2	10	13904	13913	0 %	20 %	60 %	20 %	407719224
11	NC_018700	CGATC	2	10	14717	14726	20 %	20 %	20 %	40 %	407719225
12	NC_018700	GCCGC	2	10	15654	15663	0 %	0 %	40 %	60 %	407719226
13	NC_018700	ATTCC	2	10	15884	15893	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_018700	GATCG	2	10	16469	16478	20 %	20 %	40 %	20 %	407719227
15	NC_018700	CGAGC	2	10	18096	18105	20 %	0 %	40 %	40 %	407719230
16	NC_018700	CACGG	2	10	19806	19815	20 %	0 %	40 %	40 %	407719232
17	NC_018700	GCACG	2	10	19816	19825	20 %	0 %	40 %	40 %	407719232
18	NC_018700	GGCGC	2	10	20612	20621	0 %	0 %	60 %	40 %	407719232
19	NC_018700	GGCAT	2	10	21815	21824	20 %	20 %	40 %	20 %	407719234
20	NC_018700	ACGCG	2	10	23283	23292	20 %	0 %	40 %	40 %	407719234
21	NC_018700	CCGCC	2	10	23489	23498	0 %	0 %	20 %	80 %	407719234
22	NC_018700	CCGGG	2	10	23764	23773	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
23	NC_018700	CGATG	2	10	24387	24396	20 %	20 %	40 %	20 %	407719235
24	NC_018700	CGCGC	2	10	26018	26027	0 %	0 %	40 %	60 %	407719236
25	NC_018700	CGAAG	2	10	27776	27785	40 %	0 %	40 %	20 %	407719237
26	NC_018700	TCGAT	2	10	28486	28495	20 %	40 %	20 %	20 %	407719237
27	NC_018700	GCCCG	2	10	35129	35138	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
28	NC_018700	TGACC	2	10	36804	36813	20 %	20 %	20 %	40 %	407719242
29	NC_018700	CGGCT	2	10	37097	37106	0 %	20 %	40 %	40 %	407719243
30	NC_018700	CGGCG	2	10	38276	38285	0 %	0 %	60 %	40 %	407719244
31	NC_018700	CGGAC	2	10	38381	38390	20 %	0 %	40 %	40 %	407719244
32	NC_018700	GGCCG	2	10	41396	41405	0 %	0 %	60 %	40 %	407719247
33	NC_018700	CGCGT	2	10	44064	44073	0 %	20 %	40 %	40 %	407719250
34	NC_018700	CGCAG	2	10	46035	46044	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
35	NC_018700	CCGGG	2	10	46350	46359	0 %	0 %	60 %	40 %	407719252
36	NC_018700	GCACG	2	10	47872	47881	20 %	0 %	40 %	40 %	407719253
37	NC_018700	GCTCG	2	10	48266	48275	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
38	NC_018700	CGCGG	2	10	53935	53944	0 %	0 %	60 %	40 %	407719259
39	NC_018700	CGGCG	2	10	54606	54615	0 %	0 %	60 %	40 %	407719259
40	NC_018700	GGCGC	2	10	58123	58132	0 %	0 %	60 %	40 %	407719263
41	NC_018700	GCCCA	2	10	59090	59099	20 %	0 %	20 %	60 %	407719264
42	NC_018700	AGGTC	2	10	61188	61197	20 %	20 %	40 %	20 %	407719266
43	NC_018700	GCGCC	2	10	65279	65288	0 %	0 %	40 %	60 %	407719268
44	NC_018700	AGGAG	2	10	70364	70373	40 %	0 %	60 %	0 %	407719273
45	NC_018700	CCGCG	2	10	70487	70496	0 %	0 %	40 %	60 %	407719273
46	NC_018700	GAAAC	2	10	70862	70871	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_018700	TCGCC	2	10	72228	72237	0 %	20 %	20 %	60 %	407719275
48	NC_018700	TCCGC	2	10	72702	72711	0 %	20 %	20 %	60 %	407719276
49	NC_018700	TCATC	2	10	74255	74264	20 %	40 %	0 %	40 %	407719277
50	NC_018700	TGCCA	2	10	74587	74596	20 %	20 %	20 %	40 %	407719277
51	NC_018700	CCGTC	2	10	76060	76069	0 %	20 %	20 %	60 %	407719279
52	NC_018700	AGGGC	2	10	76571	76580	20 %	0 %	60 %	20 %	407719279
53	NC_018700	GCCGC	3	15	77107	77121	0 %	0 %	40 %	60 %	407719280
54	NC_018700	GCGCA	2	10	77208	77217	20 %	0 %	40 %	40 %	407719280
55	NC_018700	TCGAA	2	10	78810	78819	40 %	20 %	20 %	20 %	407719282
56	NC_018700	AAAAG	2	10	79829	79838	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018700	GGGTC	2	10	80180	80189	0 %	20 %	60 %	20 %	407719285
58	NC_018700	ATCCG	2	10	81336	81345	20 %	20 %	20 %	40 %	407719285
59	NC_018700	CAGCG	2	10	83927	83936	20 %	0 %	40 %	40 %	407719287
60	NC_018700	CGACG	2	10	84786	84795	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
61	NC_018700	CTTTC	2	10	85381	85390	0 %	60 %	0 %	40 %	407719288
62	NC_018700	ATTGG	2	10	92182	92191	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018700	CTGGC	2	10	92851	92860	0 %	20 %	40 %	40 %	407719296
64	NC_018700	ATGAC	2	10	92984	92993	40 %	20 %	20 %	20 %	407719296
65	NC_018700	CCGGC	2	10	93306	93315	0 %	0 %	40 %	60 %	407719297
66	NC_018700	GCGAG	2	10	94670	94679	20 %	0 %	60 %	20 %	407719298
67	NC_018700	CAGCG	2	10	97393	97402	20 %	0 %	40 %	40 %	407719301
68	NC_018700	TCCTT	2	10	99872	99881	0 %	60 %	0 %	40 %	407719304
69	NC_018700	CGAAG	2	10	100014	100023	40 %	0 %	40 %	20 %	407719304
70	NC_018700	CCGAG	2	10	101948	101957	20 %	0 %	40 %	40 %	407719306
71	NC_018700	CGGCG	2	10	102721	102730	0 %	0 %	60 %	40 %	407719307
72	NC_018700	GGCTC	2	10	103270	103279	0 %	20 %	40 %	40 %	407719308
73	NC_018700	AAACA	2	10	105236	105245	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_018700	ACAAG	2	10	106999	107008	60 %	0 %	20 %	20 %	407719311
75	NC_018700	GGTCC	2	10	109345	109354	0 %	20 %	40 %	40 %	407719313
76	NC_018700	CGGAG	2	10	109801	109810	20 %	0 %	60 %	20 %	407719313
77	NC_018700	CGGGC	2	10	111257	111266	0 %	0 %	60 %	40 %	407719313
78	NC_018700	ACGGT	2	10	112279	112288	20 %	20 %	40 %	20 %	407719314
79	NC_018700	CGAGG	2	10	114651	114660	20 %	0 %	60 %	20 %	407719317
80	NC_018700	GGCCG	2	10	115073	115082	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
81	NC_018700	TCGTC	2	10	119385	119394	0 %	40 %	20 %	40 %	407719323
82	NC_018700	GCACA	2	10	119776	119785	40 %	0 %	20 %	40 %	407719323
83	NC_018700	GATGC	2	10	120820	120829	20 %	20 %	40 %	20 %	407719323
84	NC_018700	CGAGC	2	10	124893	124902	20 %	0 %	40 %	40 %	407719327
85	NC_018700	AGAGG	2	10	125215	125224	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018700	CGGCC	2	10	126919	126928	0 %	0 %	40 %	60 %	407719328
87	NC_018700	TCGCG	2	10	129271	129280	0 %	20 %	40 %	40 %	407719332
88	NC_018700	GTCGA	2	10	131677	131686	20 %	20 %	40 %	20 %	407719333
89	NC_018700	GAAGG	2	10	131746	131755	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018700	GGGCG	2	10	131826	131835	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
91	NC_018700	TGGGG	2	10	132413	132422	0 %	20 %	80 %	0 %	407719334
92	NC_018700	ACCGC	2	10	132682	132691	20 %	0 %	20 %	60 %	407719334
93	NC_018700	ATCGA	2	10	132873	132882	40 %	20 %	20 %	20 %	407719334
94	NC_018700	GAGGC	2	10	133316	133325	20 %	0 %	60 %	20 %	407719335
95	NC_018700	CCGGT	2	10	135659	135668	0 %	20 %	40 %	40 %	407719337
96	NC_018700	CGCGG	2	10	137144	137153	0 %	0 %	60 %	40 %	407719339
97	NC_018700	CGGTG	2	10	137819	137828	0 %	20 %	60 %	20 %	407719340
98	NC_018700	ACTGC	2	10	141423	141432	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_018700	AGCGG	2	10	142896	142905	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
100	NC_018700	AGACA	2	10	143907	143916	60 %	0 %	20 %	20 %	407719343
101	NC_018700	GAAGC	2	10	147756	147765	40 %	0 %	40 %	20 %	407719348
102	NC_018700	TGCCG	2	10	147899	147908	0 %	20 %	40 %	40 %	407719348
103	NC_018700	GATCG	2	10	149151	149160	20 %	20 %	40 %	20 %	407719349
104	NC_018700	GCGTC	2	10	150911	150920	0 %	20 %	40 %	40 %	407719350
105	NC_018700	TCATG	2	10	151266	151275	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_018700	TCGCG	2	10	151899	151908	0 %	20 %	40 %	40 %	407719351
107	NC_018700	GCACG	2	10	153383	153392	20 %	0 %	40 %	40 %	407719352
108	NC_018700	GAAGA	2	10	153405	153414	60 %	0 %	40 %	0 %	407719352
109	NC_018700	GGTCA	2	10	154270	154279	20 %	20 %	40 %	20 %	407719353
110	NC_018700	ATGCG	2	10	154433	154442	20 %	20 %	40 %	20 %	407719353
111	NC_018700	GCTCG	2	10	154563	154572	0 %	20 %	40 %	40 %	407719353
112	NC_018700	TCCGC	2	10	156439	156448	0 %	20 %	20 %	60 %	407719354
113	NC_018700	CTGCG	2	10	158924	158933	0 %	20 %	40 %	40 %	407719357
114	NC_018700	GCGCG	2	10	159184	159193	0 %	0 %	60 %	40 %	407719357
115	NC_018700	CGGCG	2	10	160567	160576	0 %	0 %	60 %	40 %	407719359
116	NC_018700	AATGG	2	10	162618	162627	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018700	CCGGA	2	10	163414	163423	20 %	0 %	40 %	40 %	407719361
118	NC_018700	GGCCG	2	10	165496	165505	0 %	0 %	60 %	40 %	407719364
119	NC_018700	GAGCG	2	10	166163	166172	20 %	0 %	60 %	20 %	407719364
120	NC_018700	GCCCG	2	10	166577	166586	0 %	0 %	40 %	60 %	407719365
121	NC_018700	CGTCT	2	10	167400	167409	0 %	40 %	20 %	40 %	407719365
122	NC_018700	CGGCG	2	10	169959	169968	0 %	0 %	60 %	40 %	407719369
123	NC_018700	TTCGC	2	10	170281	170290	0 %	40 %	20 %	40 %	407719369
124	NC_018700	CCGGA	2	10	170344	170353	20 %	0 %	40 %	40 %	407719369
125	NC_018700	GGAGC	2	10	173383	173392	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
126	NC_018700	CTGGC	2	10	174040	174049	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
127	NC_018700	GGATC	2	10	176280	176289	20 %	20 %	40 %	20 %	407719375
128	NC_018700	TCGAC	2	10	177136	177145	20 %	20 %	20 %	40 %	407719375
129	NC_018700	ATCGG	2	10	178381	178390	20 %	20 %	40 %	20 %	407719376
130	NC_018700	GCCGC	2	10	179428	179437	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
131	NC_018700	ATCGG	2	10	179633	179642	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_018700	ACCGC	2	10	181454	181463	20 %	0 %	20 %	60 %	407719377
133	NC_018700	CGCAG	2	10	184834	184843	20 %	0 %	40 %	40 %	407719379
134	NC_018700	CGGCG	2	10	188806	188815	0 %	0 %	60 %	40 %	407719384
135	NC_018700	ATCGG	2	10	189972	189981	20 %	20 %	40 %	20 %	407719384
136	NC_018700	CGGCG	2	10	193384	193393	0 %	0 %	60 %	40 %	407719388
137	NC_018700	CGACG	2	10	193986	193995	20 %	0 %	40 %	40 %	407719390
138	NC_018700	AGCTG	2	10	194350	194359	20 %	20 %	40 %	20 %	407719390
139	NC_018700	CCGGC	2	10	194859	194868	0 %	0 %	40 %	60 %	407719391
140	NC_018700	CCGGC	2	10	195847	195856	0 %	0 %	40 %	60 %	407719392
141	NC_018700	AGCCG	2	10	196491	196500	20 %	0 %	40 %	40 %	407719392
142	NC_018700	CGTCG	2	10	196983	196992	0 %	20 %	40 %	40 %	407719393
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150	NC_018700	CGGCG	2	10	206029	206038	0 %	0 %	60 %	40 %	407719402
151	NC_018700	CCGGC	2	10	208033	208042	0 %	0 %	40 %	60 %	407719403
152	NC_018700	GATCG	2	10	209069	209078	20 %	20 %	40 %	20 %	407719404
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162	NC_018700	ATCAC	2	10	213862	213871	40 %	20 %	0 %	40 %	407719410
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166	NC_018700	GAATG	2	10	215399	215408	40 %	20 %	40 %	0 %	407719411
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179	NC_018700	GCCGG	2	10	233214	233223	0 %	0 %	60 %	40 %	407719421
180	NC_018700	TCGGA	2	10	236544	236553	20 %	20 %	40 %	20 %	407719422
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182	NC_018700	CGATC	2	10	237996	238005	20 %	20 %	20 %	40 %	407719424
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200	NC_018700	TCCAT	2	10	272718	272727	20 %	40 %	0 %	40 %	407719464
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202	NC_018700	GCTTC	2	10	278834	278843	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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233	NC_018700	TGCCG	2	10	321181	321190	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
234	NC_018700	GTCGC	2	10	321405	321414	0 %	20 %	40 %	40 %	407719517
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240	NC_018700	CGCGG	2	10	333369	333378	0 %	0 %	60 %	40 %	407719526
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265	NC_018700	GGCAT	2	10	366296	366305	20 %	20 %	40 %	20 %	407719552
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269	NC_018700	CGCTT	2	10	372150	372159	0 %	40 %	20 %	40 %	407719555
270	NC_018700	GCGAA	2	10	374181	374190	40 %	0 %	40 %	20 %	407719555
271	NC_018700	TGCAC	2	10	374518	374527	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
272	NC_018700	CGACC	2	10	374661	374670	20 %	0 %	20 %	60 %	407719556
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282	NC_018700	CTGCG	2	10	383885	383894	0 %	20 %	40 %	40 %	407719564
283	NC_018700	ACAGC	2	10	384518	384527	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
284	NC_018700	ATTGC	2	10	384672	384681	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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292	NC_018700	CGGCT	2	10	393372	393381	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
293	NC_018700	CGCGC	2	10	394267	394276	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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381	NC_018700	GCCGC	2	10	522355	522364	0 %	0 %	40 %	60 %	407719708
382	NC_018700	AGAAT	2	10	522482	522491	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
383	NC_018700	AAGGC	2	10	523013	523022	40 %	0 %	40 %	20 %	407719709
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391	NC_018700	CTGCA	2	10	532557	532566	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
392	NC_018700	TCGCC	2	10	533949	533958	0 %	20 %	20 %	60 %	407719721
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