MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium meliloti Rm41 plasmid pSYMA

Total Repeats: 33384

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018683	CGTT	2	8	23030	23037	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
502	NC_018683	GGT	2	6	23121	23126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
503	NC_018683	GAA	2	6	23154	23159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407690027
504	NC_018683	CTT	2	6	23247	23252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407690027
505	NC_018683	GCC	2	6	23264	23269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690027
506	NC_018683	GGCGTC	2	12	23276	23287	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	407690027
507	NC_018683	GCG	2	6	23295	23300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690027
508	NC_018683	CAC	2	6	23309	23314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407690027
509	NC_018683	GGC	2	6	23371	23376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690027
510	NC_018683	GTG	2	6	23418	23423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407690027
511	NC_018683	GCT	2	6	23489	23494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690027
512	NC_018683	TGG	2	6	23585	23590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407690027
513	NC_018683	CGG	2	6	23591	23596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690027
514	NC_018683	ACC	2	6	23613	23618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407690027
515	NC_018683	GCGA	2	8	23670	23677	25 %	0 %	50 %	25 %	407690027
516	NC_018683	ATC	2	6	23761	23766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407690027
517	NC_018683	GCG	2	6	23794	23799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690027
518	NC_018683	GGC	2	6	23804	23809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690027
519	NC_018683	GGT	2	6	23825	23830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407690027
520	NC_018683	TCG	2	6	23863	23868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690027
521	NC_018683	GCC	2	6	24003	24008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690028
522	NC_018683	GC	4	8	24019	24026	0 %	0 %	50 %	50 %	407690028
523	NC_018683	CGG	3	9	24064	24072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690028
524	NC_018683	CGATGC	2	12	24166	24177	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	407690028
525	NC_018683	CG	3	6	24261	24266	0 %	0 %	50 %	50 %	407690028
526	NC_018683	GC	3	6	24276	24281	0 %	0 %	50 %	50 %	407690028
527	NC_018683	TGG	2	6	24294	24299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407690028
528	NC_018683	AAG	2	6	24350	24355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407690028
529	NC_018683	CGC	2	6	24374	24379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690028
530	NC_018683	ATC	2	6	24398	24403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407690028
531	NC_018683	CAG	2	6	24404	24409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690028
532	NC_018683	CGA	2	6	24410	24415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690028
533	NC_018683	TCA	2	6	24508	24513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407690028
534	NC_018683	CG	3	6	24514	24519	0 %	0 %	50 %	50 %	407690028
535	NC_018683	GCC	3	9	24674	24682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_018683	AT	3	6	24712	24717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_018683	CAA	2	6	24721	24726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_018683	GTT	2	6	24790	24795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_018683	ATT	2	6	24830	24835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_018683	CT	3	6	24930	24935	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
541	NC_018683	GTT	2	6	24946	24951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_018683	TGCC	2	8	25027	25034	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
543	NC_018683	CGG	2	6	25039	25044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_018683	CCA	2	6	25148	25153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407690029
545	NC_018683	CAG	2	6	25171	25176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690029
546	NC_018683	CAG	3	9	25201	25209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690029
547	NC_018683	GCA	2	6	25317	25322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_018683	ACCG	2	8	25443	25450	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
549	NC_018683	CCTA	2	8	25453	25460	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
550	NC_018683	ACTC	2	8	25529	25536	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
551	NC_018683	CGT	2	6	25561	25566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690030
552	NC_018683	TAA	2	6	25573	25578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407690030
553	NC_018683	CTG	2	6	25600	25605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690030
554	NC_018683	TCC	2	6	25683	25688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
555	NC_018683	TCCG	2	8	25751	25758	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
556	NC_018683	CGCT	2	8	25762	25769	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
557	NC_018683	GCA	2	6	25831	25836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_018683	GCC	2	6	25846	25851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_018683	CAG	3	9	25866	25874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_018683	GAG	2	6	25892	25897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
561	NC_018683	TGA	2	6	26010	26015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_018683	T	7	7	26038	26044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_018683	ATTTT	2	10	26137	26146	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_018683	CCG	2	6	26164	26169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_018683	TGC	2	6	26204	26209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_018683	TGT	2	6	26251	26256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_018683	CCT	2	6	26282	26287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
568	NC_018683	GCGA	2	8	26306	26313	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
569	NC_018683	TCC	3	9	26318	26326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
570	NC_018683	CTC	3	9	26353	26361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
571	NC_018683	CCT	2	6	26401	26406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
572	NC_018683	GCTC	2	8	26473	26480	0 %	25 %	25 %	50 %	407690031
573	NC_018683	GA	3	6	26498	26503	50 %	0 %	50 %	0 %	407690031
574	NC_018683	AGC	2	6	26562	26567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690031
575	NC_018683	CGCT	2	8	26593	26600	0 %	25 %	25 %	50 %	407690031
576	NC_018683	CGA	2	6	26608	26613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690031
577	NC_018683	CG	3	6	26735	26740	0 %	0 %	50 %	50 %	407690031
578	NC_018683	TCC	2	6	26763	26768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407690031
579	NC_018683	CGAT	2	8	26788	26795	25 %	25 %	25 %	25 %	407690031
580	NC_018683	TGC	2	6	26877	26882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690031
581	NC_018683	GAAG	2	8	26884	26891	50 %	0 %	50 %	0 %	407690031
582	NC_018683	TCT	2	6	26944	26949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407690031
583	NC_018683	TGA	2	6	27025	27030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407690031
584	NC_018683	TTG	2	6	27081	27086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407690031
585	NC_018683	CGG	2	6	27097	27102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690031
586	NC_018683	GC	3	6	27371	27376	0 %	0 %	50 %	50 %	407690031
587	NC_018683	GCC	2	6	27390	27395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690031
588	NC_018683	ACC	2	6	27396	27401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407690031
589	NC_018683	CG	3	6	27403	27408	0 %	0 %	50 %	50 %	407690031
590	NC_018683	GCT	2	6	27460	27465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690031
591	NC_018683	GAT	2	6	27500	27505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407690031
592	NC_018683	GCC	2	6	27518	27523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690031
593	NC_018683	CATT	2	8	27584	27591	25 %	50 %	0 %	25 %	407690031
594	NC_018683	CTT	2	6	27636	27641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_018683	GAC	2	6	27670	27675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_018683	CAC	2	6	27716	27721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
597	NC_018683	GGTC	2	8	27905	27912	0 %	25 %	50 %	25 %	407690032
598	NC_018683	GAC	2	6	27924	27929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690032
599	NC_018683	GCG	2	6	27970	27975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690032
600	NC_018683	GAA	2	6	27990	27995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407690032
601	NC_018683	CGA	3	9	28010	28018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690032
602	NC_018683	CTC	2	6	28020	28025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407690032
603	NC_018683	GCC	2	6	28035	28040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690032
604	NC_018683	TGCG	2	8	28073	28080	0 %	25 %	50 %	25 %	407690032
605	NC_018683	CCGG	2	8	28098	28105	0 %	0 %	50 %	50 %	407690032
606	NC_018683	TC	3	6	28139	28144	0 %	50 %	0 %	50 %	407690032
607	NC_018683	CGA	2	6	28169	28174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690032
608	NC_018683	TCC	2	6	28234	28239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407690032
609	NC_018683	GTC	2	6	28323	28328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690032
610	NC_018683	CGG	2	6	28394	28399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690032
611	NC_018683	TCC	2	6	28410	28415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407690032
612	NC_018683	GCCC	2	8	28421	28428	0 %	0 %	25 %	75 %	407690032
613	NC_018683	GCC	2	6	28504	28509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690032
614	NC_018683	GAT	2	6	28518	28523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407690032
615	NC_018683	TTG	2	6	28621	28626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407690032
616	NC_018683	TTGC	2	8	28686	28693	0 %	50 %	25 %	25 %	407690032
617	NC_018683	GCAG	2	8	28730	28737	25 %	0 %	50 %	25 %	407690032
618	NC_018683	CGA	2	6	28739	28744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690032
619	NC_018683	TGA	2	6	28799	28804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407690032
620	NC_018683	TCG	2	6	28846	28851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690032
621	NC_018683	CAT	2	6	28869	28874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407690032
622	NC_018683	GC	3	6	28894	28899	0 %	0 %	50 %	50 %	407690032
623	NC_018683	CTG	2	6	28980	28985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690032
624	NC_018683	ACC	2	6	29001	29006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407690032
625	NC_018683	TCG	2	6	29090	29095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690032
626	NC_018683	TG	3	6	29104	29109	0 %	50 %	50 %	0 %	407690032
627	NC_018683	GTT	2	6	29112	29117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407690032
628	NC_018683	CG	3	6	29167	29172	0 %	0 %	50 %	50 %	407690032
629	NC_018683	GCC	2	6	29179	29184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690032
630	NC_018683	CG	3	6	29196	29201	0 %	0 %	50 %	50 %	407690032
631	NC_018683	CCA	2	6	29227	29232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407690032
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783	NC_018683	CAT	2	6	35423	35428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
784	NC_018683	TTTTC	2	10	35467	35476	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
785	NC_018683	GCC	2	6	35480	35485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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788	NC_018683	GC	4	8	35519	35526	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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