MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium meliloti Rm41 plasmid pRM41A

Total Repeats: 4942

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_018682	CATG	2	8	174033	174040	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3502	NC_018682	GCC	2	6	174070	174075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3503	NC_018682	TCA	2	6	174134	174139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689931
3504	NC_018682	CCG	2	6	174165	174170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689931
3505	NC_018682	GAG	2	6	174175	174180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689931
3506	NC_018682	AAGC	2	8	174245	174252	50 %	0 %	25 %	25 %	407689931
3507	NC_018682	GTCT	2	8	174262	174269	0 %	50 %	25 %	25 %	407689931
3508	NC_018682	CGA	3	9	174279	174287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689931
3509	NC_018682	CGGTCA	2	12	174309	174320	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	407689931
3510	NC_018682	ATG	2	6	174352	174357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689931
3511	NC_018682	GCG	2	6	174389	174394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689931
3512	NC_018682	GGC	2	6	174459	174464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689931
3513	NC_018682	GCG	2	6	174482	174487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689931
3514	NC_018682	GCT	2	6	174504	174509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689931
3515	NC_018682	ATGA	2	8	174553	174560	50 %	25 %	25 %	0 %	407689931
3516	NC_018682	TGC	2	6	174602	174607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689931
3517	NC_018682	ATC	2	6	174610	174615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689931
3518	NC_018682	GGCGA	2	10	174640	174649	20 %	0 %	60 %	20 %	407689931
3519	NC_018682	CGGC	2	8	174668	174675	0 %	0 %	50 %	50 %	407689931
3520	NC_018682	CCG	2	6	174684	174689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689931
3521	NC_018682	GCG	3	9	174751	174759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689931
3522	NC_018682	GC	3	6	174774	174779	0 %	0 %	50 %	50 %	407689931
3523	NC_018682	CGGG	2	8	174781	174788	0 %	0 %	75 %	25 %	407689931
3524	NC_018682	CGG	2	6	174789	174794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689931
3525	NC_018682	TGC	2	6	174803	174808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689931
3526	NC_018682	TACC	2	8	174855	174862	25 %	25 %	0 %	50 %	407689931
3527	NC_018682	GGC	2	6	174879	174884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689931
3528	NC_018682	AGG	2	6	174932	174937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689931
3529	NC_018682	CGA	2	6	174972	174977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689931
3530	NC_018682	GATC	2	8	174993	175000	25 %	25 %	25 %	25 %	407689931
3531	NC_018682	GCG	2	6	175021	175026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689931
3532	NC_018682	CGC	2	6	175034	175039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689931
3533	NC_018682	CAC	2	6	175050	175055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407689931
3534	NC_018682	CGA	2	6	175088	175093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689932
3535	NC_018682	ATG	2	6	175168	175173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689932
3536	NC_018682	CGG	2	6	175188	175193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689932
3537	NC_018682	GCT	2	6	175251	175256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689932
3538	NC_018682	GGC	2	6	175302	175307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689932
3539	NC_018682	TCG	2	6	175370	175375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689932
3540	NC_018682	GGC	2	6	175413	175418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689932
3541	NC_018682	CGG	2	6	175437	175442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689932
3542	NC_018682	GGT	2	6	175554	175559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407689932
3543	NC_018682	CTG	3	9	175591	175599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689932
3544	NC_018682	CGA	3	9	175611	175619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689932
3545	NC_018682	TCG	2	6	175739	175744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689932
3546	NC_018682	GCC	2	6	175777	175782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689932
3547	NC_018682	GGC	2	6	175791	175796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689932
3548	NC_018682	CAT	2	6	175815	175820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689932
3549	NC_018682	CGC	2	6	175838	175843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689932
3550	NC_018682	CGA	2	6	175845	175850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689932
3551	NC_018682	GCT	2	6	175857	175862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689932
3552	NC_018682	GTC	2	6	175888	175893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689932
3553	NC_018682	TCG	2	6	175895	175900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689932
3554	NC_018682	GCC	2	6	175927	175932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689932
3555	NC_018682	GTC	2	6	176109	176114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689933
3556	NC_018682	CG	3	6	176204	176209	0 %	0 %	50 %	50 %	407689933
3557	NC_018682	GTC	2	6	176251	176256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689933
3558	NC_018682	GCC	3	9	176260	176268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689933
3559	NC_018682	GC	3	6	176321	176326	0 %	0 %	50 %	50 %	407689933
3560	NC_018682	CGA	2	6	176343	176348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689933
3561	NC_018682	CGA	2	6	176412	176417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689933
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3563	NC_018682	GGC	2	6	176461	176466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689933
3564	NC_018682	GGT	2	6	176508	176513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407689933
3565	NC_018682	GCT	2	6	176514	176519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689933
3566	NC_018682	GGC	2	6	176530	176535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689933
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3568	NC_018682	CGT	2	6	176618	176623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689933
3569	NC_018682	GCG	2	6	176636	176641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689933
3570	NC_018682	GCG	2	6	176674	176679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689933
3571	NC_018682	CGG	2	6	176727	176732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689933
3572	NC_018682	CGC	2	6	176751	176756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689933
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3574	NC_018682	CGCTGA	2	12	176780	176791	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	407689933
3575	NC_018682	TCG	2	6	176834	176839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689933
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3577	NC_018682	CGCTT	2	10	176936	176945	0 %	40 %	20 %	40 %	407689933
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3586	NC_018682	ATG	2	6	177703	177708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689934
3587	NC_018682	TCG	2	6	177709	177714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689934
3588	NC_018682	TGGC	2	8	177716	177723	0 %	25 %	50 %	25 %	407689934
3589	NC_018682	GCC	2	6	177766	177771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689934
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3591	NC_018682	TG	3	6	177834	177839	0 %	50 %	50 %	0 %	407689934
3592	NC_018682	GGAT	2	8	177844	177851	25 %	25 %	50 %	0 %	407689934
3593	NC_018682	CGG	2	6	177888	177893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689934
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3599	NC_018682	TCT	2	6	178155	178160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407689935
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3603	NC_018682	TCG	2	6	178357	178362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689935
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3608	NC_018682	GCA	3	9	178478	178486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689935
3609	NC_018682	CAA	2	6	178546	178551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_018682	ACGCC	2	10	178667	178676	20 %	0 %	20 %	60 %	407689936
3611	NC_018682	CTTG	2	8	178721	178728	0 %	50 %	25 %	25 %	407689936
3612	NC_018682	CT	3	6	178845	178850	0 %	50 %	0 %	50 %	407689936
3613	NC_018682	CAAC	2	8	178975	178982	50 %	0 %	0 %	50 %	407689936
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3620	NC_018682	CAG	2	6	179241	179246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689936
3621	NC_018682	CCG	2	6	179305	179310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689936
3622	NC_018682	CAGC	2	8	179350	179357	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3623	NC_018682	CGG	2	6	179359	179364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3624	NC_018682	CCG	2	6	179375	179380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3625	NC_018682	ACC	2	6	179398	179403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3626	NC_018682	TACA	2	8	179465	179472	50 %	25 %	0 %	25 %	407689937
3627	NC_018682	ATC	2	6	179490	179495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689937
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3629	NC_018682	CGA	2	6	179657	179662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689937
3630	NC_018682	TTTC	2	8	179734	179741	0 %	75 %	0 %	25 %	407689937
3631	NC_018682	CG	3	6	179790	179795	0 %	0 %	50 %	50 %	407689937
3632	NC_018682	TCGA	2	8	179838	179845	25 %	25 %	25 %	25 %	407689937
3633	NC_018682	CTG	2	6	179861	179866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3634	NC_018682	TCG	2	6	179925	179930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689938
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3640	NC_018682	GCA	2	6	180413	180418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3641	NC_018682	CGA	2	6	180689	180694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3642	NC_018682	ACGA	2	8	180726	180733	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3643	NC_018682	ATC	2	6	180825	180830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3644	NC_018682	CGG	2	6	180878	180883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3645	NC_018682	CA	3	6	180894	180899	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3646	NC_018682	CG	3	6	180957	180962	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3647	NC_018682	ACCA	2	8	180968	180975	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3648	NC_018682	TAAGC	2	10	181060	181069	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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3651	NC_018682	GTT	2	6	181129	181134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3652	NC_018682	GCG	2	6	181217	181222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689939
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3656	NC_018682	CA	3	6	181833	181838	50 %	0 %	0 %	50 %	407689939
3657	NC_018682	TGT	2	6	181929	181934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3658	NC_018682	TC	3	6	181947	181952	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3659	NC_018682	TCA	2	6	182119	182124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689940
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3684	NC_018682	CGTTC	2	10	183621	183630	0 %	40 %	20 %	40 %	407689941
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3729	NC_018682	GCT	2	6	186475	186480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3730	NC_018682	AGGG	2	8	186547	186554	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3731	NC_018682	GAC	2	6	186567	186572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3732	NC_018682	CTG	2	6	186587	186592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3736	NC_018682	TGA	2	6	186734	186739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689945
3737	NC_018682	GCC	2	6	186753	186758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689945
3738	NC_018682	CGT	2	6	186821	186826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689945
3739	NC_018682	GATGC	2	10	186840	186849	20 %	20 %	40 %	20 %	407689945
3740	NC_018682	CACT	2	8	186913	186920	25 %	25 %	0 %	50 %	407689945
3741	NC_018682	GTC	2	6	186939	186944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689945
3742	NC_018682	GCG	2	6	186992	186997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689945
3743	NC_018682	CGG	2	6	187026	187031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689945
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3991	NC_018682	ACA	2	6	200289	200294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407689955
3992	NC_018682	ACC	2	6	200357	200362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407689955
3993	NC_018682	GATC	2	8	200392	200399	25 %	25 %	25 %	25 %	407689955
3994	NC_018682	GC	3	6	200402	200407	0 %	0 %	50 %	50 %	407689955
3995	NC_018682	GA	3	6	200444	200449	50 %	0 %	50 %	0 %	407689955
3996	NC_018682	GCCC	2	8	200525	200532	0 %	0 %	25 %	75 %	407689955
3997	NC_018682	ACT	2	6	200542	200547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689955
3998	NC_018682	C	6	6	200583	200588	0 %	0 %	0 %	100 %	407689955
3999	NC_018682	CGG	2	6	200634	200639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689955
4000	NC_018682	CTA	2	6	200726	200731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689955

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