MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium meliloti Rm41 plasmid pRM41A

Total Repeats: 4942

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_018682	CGG	2	6	99895	99900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689861
2002	NC_018682	CTG	2	6	99911	99916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689861
2003	NC_018682	TCG	2	6	99918	99923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689861
2004	NC_018682	ATG	2	6	99956	99961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689861
2005	NC_018682	CTT	2	6	99976	99981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407689861
2006	NC_018682	GGC	2	6	99995	100000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689861
2007	NC_018682	TCG	2	6	100038	100043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689861
2008	NC_018682	ATC	2	6	100046	100051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689861
2009	NC_018682	TCT	2	6	100110	100115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407689861
2010	NC_018682	CCA	2	6	100161	100166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407689861
2011	NC_018682	ATG	2	6	100186	100191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689861
2012	NC_018682	CGC	2	6	100232	100237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689862
2013	NC_018682	ATC	2	6	100243	100248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689862
2014	NC_018682	CAG	2	6	100261	100266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689862
2015	NC_018682	TTC	2	6	100272	100277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407689862
2016	NC_018682	CAT	2	6	100359	100364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689862
2017	NC_018682	CTG	2	6	100422	100427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689862
2018	NC_018682	ACA	2	6	100478	100483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407689862
2019	NC_018682	GCG	2	6	100531	100536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689862
2020	NC_018682	CGT	2	6	100620	100625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689862
2021	NC_018682	ATC	2	6	100726	100731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689862
2022	NC_018682	CG	3	6	100781	100786	0 %	0 %	50 %	50 %	407689862
2023	NC_018682	CGGCGT	2	12	100799	100810	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	407689862
2024	NC_018682	CTT	2	6	100923	100928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407689862
2025	NC_018682	TTG	2	6	100961	100966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407689862
2026	NC_018682	TCA	2	6	101012	101017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689862
2027	NC_018682	CGT	2	6	101019	101024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689862
2028	NC_018682	AGGC	2	8	101048	101055	25 %	0 %	50 %	25 %	407689862
2029	NC_018682	GGC	2	6	101065	101070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689862
2030	NC_018682	GGC	2	6	101112	101117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689862
2031	NC_018682	GGGC	2	8	101160	101167	0 %	0 %	75 %	25 %	407689862
2032	NC_018682	GAA	2	6	101190	101195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407689862
2033	NC_018682	GCA	2	6	101228	101233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689862
2034	NC_018682	GACC	2	8	101238	101245	25 %	0 %	25 %	50 %	407689862
2035	NC_018682	TCC	2	6	101248	101253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407689862
2036	NC_018682	GGC	3	9	101295	101303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2037	NC_018682	CGG	2	6	101330	101335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2038	NC_018682	GA	3	6	101405	101410	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2039	NC_018682	GAAA	2	8	101434	101441	75 %	0 %	25 %	0 %	407689863
2040	NC_018682	GTC	2	6	101458	101463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689863
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2042	NC_018682	TTC	2	6	101591	101596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407689863
2043	NC_018682	GGCC	2	8	101635	101642	0 %	0 %	50 %	50 %	407689863
2044	NC_018682	TG	4	8	101649	101656	0 %	50 %	50 %	0 %	407689863
2045	NC_018682	GCA	2	6	101865	101870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689863
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2051	NC_018682	ACG	2	6	102349	102354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2052	NC_018682	TTC	2	6	102372	102377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2053	NC_018682	AGT	2	6	102417	102422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2054	NC_018682	GGA	2	6	102536	102541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2055	NC_018682	AGC	2	6	102558	102563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689864
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2059	NC_018682	CTT	2	6	102699	102704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407689864
2060	NC_018682	CGTT	2	8	102859	102866	0 %	50 %	25 %	25 %	407689864
2061	NC_018682	GAG	2	6	102868	102873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689864
2062	NC_018682	CGA	2	6	102975	102980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689864
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2064	NC_018682	CTG	2	6	103057	103062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689864
2065	NC_018682	GCT	2	6	103107	103112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689864
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2102	NC_018682	CAA	2	6	105420	105425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2103	NC_018682	GAA	2	6	105429	105434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2104	NC_018682	GAG	2	6	105500	105505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689868
2105	NC_018682	ATC	2	6	105519	105524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689868
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2107	NC_018682	GTTCG	2	10	105655	105664	0 %	40 %	40 %	20 %	407689868
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2116	NC_018682	CG	3	6	106244	106249	0 %	0 %	50 %	50 %	407689869
2117	NC_018682	CTGC	2	8	106257	106264	0 %	25 %	25 %	50 %	407689869
2118	NC_018682	GTG	2	6	106267	106272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407689869
2119	NC_018682	GCTCG	2	10	106339	106348	0 %	20 %	40 %	40 %	407689869
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2121	NC_018682	GAT	2	6	106356	106361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689869
2122	NC_018682	ATG	2	6	106375	106380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689869
2123	NC_018682	GC	4	8	106440	106447	0 %	0 %	50 %	50 %	407689869
2124	NC_018682	TGC	2	6	106479	106484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689869
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2233	NC_018682	CGT	2	6	111275	111280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689873
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2236	NC_018682	CGGC	2	8	111400	111407	0 %	0 %	50 %	50 %	407689873
2237	NC_018682	G	6	6	111442	111447	0 %	0 %	100 %	0 %	407689873
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2239	NC_018682	GCG	2	6	111586	111591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689874
2240	NC_018682	CGCC	2	8	111631	111638	0 %	0 %	25 %	75 %	407689874
2241	NC_018682	CAT	2	6	111764	111769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2242	NC_018682	GGC	2	6	111823	111828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2243	NC_018682	G	7	7	111846	111852	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2244	NC_018682	GCG	2	6	111936	111941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2245	NC_018682	GCC	2	6	112025	112030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689875
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2247	NC_018682	CGG	2	6	112145	112150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689875
2248	NC_018682	GCC	2	6	112233	112238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689875
2249	NC_018682	GCA	2	6	112360	112365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2250	NC_018682	GCA	2	6	112368	112373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2251	NC_018682	GTA	2	6	112398	112403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2252	NC_018682	CCT	2	6	112446	112451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2253	NC_018682	GCGATG	2	12	112478	112489	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2254	NC_018682	GAT	2	6	112496	112501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2255	NC_018682	CAGC	2	8	112549	112556	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2256	NC_018682	ATCT	2	8	112612	112619	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2257	NC_018682	CAT	2	6	112802	112807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2258	NC_018682	CAT	2	6	112819	112824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2259	NC_018682	GTC	2	6	112835	112840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2262	NC_018682	CGG	3	9	112972	112980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2263	NC_018682	TAC	2	6	113025	113030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689876
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2269	NC_018682	GCA	2	6	113320	113325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689877
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2272	NC_018682	CGG	2	6	113437	113442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689877
2273	NC_018682	CGC	2	6	113446	113451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689877
2274	NC_018682	AT	3	6	113532	113537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2275	NC_018682	GATG	2	8	113616	113623	25 %	25 %	50 %	0 %	407689878
2276	NC_018682	GCA	2	6	113691	113696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689878
2277	NC_018682	CGA	2	6	113775	113780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689878
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2348	NC_018682	CCT	2	6	117421	117426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407689882
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2351	NC_018682	CGAT	2	8	117588	117595	25 %	25 %	25 %	25 %	407689882
2352	NC_018682	CTCA	2	8	117662	117669	25 %	25 %	0 %	50 %	407689882
2353	NC_018682	GA	4	8	117731	117738	50 %	0 %	50 %	0 %	407689882
2354	NC_018682	CGC	2	6	117750	117755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689882
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2357	NC_018682	GAGGC	2	10	117876	117885	20 %	0 %	60 %	20 %	407689882
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2362	NC_018682	GCC	2	6	118085	118090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689882
2363	NC_018682	GGT	2	6	118313	118318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407689883
2364	NC_018682	GATC	2	8	118351	118358	25 %	25 %	25 %	25 %	407689883
2365	NC_018682	CAT	2	6	118378	118383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689883
2366	NC_018682	AAC	2	6	118388	118393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407689883
2367	NC_018682	GAT	2	6	118423	118428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689883
2368	NC_018682	GAT	2	6	118450	118455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689883
2369	NC_018682	TCC	2	6	118472	118477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407689883
2370	NC_018682	CGG	2	6	118567	118572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689883
2371	NC_018682	CGG	2	6	118638	118643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689883
2372	NC_018682	CAA	2	6	118741	118746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407689883
2373	NC_018682	GGC	2	6	118780	118785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689883
2374	NC_018682	GAC	2	6	118789	118794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689883
2375	NC_018682	TGCC	2	8	118818	118825	0 %	25 %	25 %	50 %	407689883
2376	NC_018682	TCA	2	6	118848	118853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689883
2377	NC_018682	GTC	2	6	118877	118882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689883
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2380	NC_018682	GCC	2	6	119064	119069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689884
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2382	NC_018682	TCG	2	6	119194	119199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689884
2383	NC_018682	G	6	6	119236	119241	0 %	0 %	100 %	0 %	407689884
2384	NC_018682	GGA	2	6	119335	119340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689884
2385	NC_018682	TTG	2	6	119417	119422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407689884
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2388	NC_018682	GTC	2	6	119696	119701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689885
2389	NC_018682	CGA	2	6	119780	119785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689885
2390	NC_018682	GCT	3	9	119846	119854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689885
2391	NC_018682	ACG	2	6	119883	119888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689885
2392	NC_018682	CGC	2	6	119927	119932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689885
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2395	NC_018682	TACGA	2	10	120054	120063	40 %	20 %	20 %	20 %	407689885
2396	NC_018682	TGA	2	6	120091	120096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689885
2397	NC_018682	CG	3	6	120209	120214	0 %	0 %	50 %	50 %	407689885
2398	NC_018682	TCG	2	6	120286	120291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689885
2399	NC_018682	CG	3	6	120312	120317	0 %	0 %	50 %	50 %	407689885
2400	NC_018682	GGT	2	6	120363	120368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407689885
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2402	NC_018682	GGCC	2	8	120523	120530	0 %	0 %	50 %	50 %	407689885
2403	NC_018682	GAC	3	9	120651	120659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689885
2404	NC_018682	GGA	2	6	120678	120683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689885
2405	NC_018682	TGG	2	6	120761	120766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407689885
2406	NC_018682	ACT	2	6	120846	120851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2407	NC_018682	AC	3	6	120931	120936	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2408	NC_018682	TTC	2	6	120949	120954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2409	NC_018682	AGT	2	6	121017	121022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2410	NC_018682	GGC	2	6	121085	121090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2425	NC_018682	CG	3	6	122032	122037	0 %	0 %	50 %	50 %	407689886
2426	NC_018682	TCG	2	6	122107	122112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2440	NC_018682	CTG	2	6	122808	122813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689887
2441	NC_018682	GAC	2	6	122927	122932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689887
2442	NC_018682	ATG	2	6	123030	123035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689887
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2444	NC_018682	CTC	2	6	123157	123162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2445	NC_018682	GCGGA	2	10	123172	123181	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2446	NC_018682	CTGC	2	8	123202	123209	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2447	NC_018682	AAG	2	6	123338	123343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407689888
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2452	NC_018682	CCCA	2	8	123540	123547	25 %	0 %	0 %	75 %	407689888
2453	NC_018682	CGGC	2	8	123561	123568	0 %	0 %	50 %	50 %	407689888
2454	NC_018682	CGG	2	6	123572	123577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689888
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2463	NC_018682	CTCG	2	8	123876	123883	0 %	25 %	25 %	50 %	407689888
2464	NC_018682	GC	3	6	123884	123889	0 %	0 %	50 %	50 %	407689888
2465	NC_018682	CAG	2	6	123991	123996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689888
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2473	NC_018682	AGA	2	6	124238	124243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407689888
2474	NC_018682	CGTCAT	2	12	124260	124271	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407689888
2475	NC_018682	GGC	2	6	124299	124304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689888
2476	NC_018682	CCA	2	6	124325	124330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407689888
2477	NC_018682	GGA	2	6	124392	124397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689888
2478	NC_018682	CCG	5	15	124447	124461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689888
2479	NC_018682	GGA	2	6	124518	124523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689888
2480	NC_018682	GCC	2	6	124531	124536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689888
2481	NC_018682	GAA	2	6	124563	124568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407689888
2482	NC_018682	TGC	2	6	124601	124606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689888
2483	NC_018682	GTC	2	6	124609	124614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689888
2484	NC_018682	CAC	2	6	124625	124630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407689888
2485	NC_018682	TCG	2	6	124649	124654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689888
2486	NC_018682	TCG	2	6	124673	124678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689888
2487	NC_018682	CGC	2	6	124718	124723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689888
2488	NC_018682	GCT	2	6	124770	124775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689888
2489	NC_018682	CTGG	2	8	124794	124801	0 %	25 %	50 %	25 %	407689888
2490	NC_018682	TGC	2	6	124805	124810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689888
2491	NC_018682	GCG	2	6	124813	124818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689888
2492	NC_018682	CGG	2	6	124851	124856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689888
2493	NC_018682	ATG	2	6	124922	124927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689889
2494	NC_018682	GTATC	2	10	124932	124941	20 %	40 %	20 %	20 %	407689889
2495	NC_018682	CTCG	2	8	124978	124985	0 %	25 %	25 %	50 %	407689889
2496	NC_018682	TGA	2	6	125106	125111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689889
2497	NC_018682	CGG	2	6	125116	125121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689889
2498	NC_018682	TCG	2	6	125139	125144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689889
2499	NC_018682	TTG	2	6	125178	125183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407689889
2500	NC_018682	CTGCA	2	10	125184	125193	20 %	20 %	20 %	40 %	407689889

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