MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium meliloti Rm41 plasmid pRM41A

Total Repeats: 4942

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018682	CAGG	2	8	26905	26912	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
502	NC_018682	CTG	2	6	26920	26925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_018682	CCT	2	6	26982	26987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
504	NC_018682	AC	3	6	27048	27053	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
505	NC_018682	AGGC	2	8	27062	27069	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
506	NC_018682	CAA	2	6	27072	27077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_018682	GCG	2	6	27103	27108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_018682	CAC	2	6	27281	27286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407689790
509	NC_018682	CGA	2	6	27376	27381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689790
510	NC_018682	GAG	2	6	27396	27401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689790
511	NC_018682	CG	4	8	27462	27469	0 %	0 %	50 %	50 %	407689790
512	NC_018682	TAGA	2	8	27539	27546	50 %	25 %	25 %	0 %	407689790
513	NC_018682	CAG	2	6	27566	27571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689790
514	NC_018682	CGT	2	6	27739	27744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689791
515	NC_018682	GT	3	6	27829	27834	0 %	50 %	50 %	0 %	407689791
516	NC_018682	GCG	2	6	27885	27890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689791
517	NC_018682	GAG	2	6	27903	27908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689791
518	NC_018682	GCG	2	6	27972	27977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689791
519	NC_018682	GGC	2	6	28079	28084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689791
520	NC_018682	CGT	2	6	28108	28113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689791
521	NC_018682	CCG	2	6	28146	28151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689791
522	NC_018682	GCT	2	6	28152	28157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689791
523	NC_018682	GCA	2	6	28159	28164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689791
524	NC_018682	GCA	2	6	28170	28175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689791
525	NC_018682	T	6	6	28179	28184	0 %	100 %	0 %	0 %	407689791
526	NC_018682	TGA	2	6	28209	28214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689791
527	NC_018682	CT	4	8	28263	28270	0 %	50 %	0 %	50 %	407689791
528	NC_018682	TCGA	2	8	28337	28344	25 %	25 %	25 %	25 %	407689791
529	NC_018682	T	6	6	28359	28364	0 %	100 %	0 %	0 %	407689791
530	NC_018682	CAA	2	6	28450	28455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_018682	AGG	2	6	28519	28524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
532	NC_018682	AATG	2	8	28574	28581	50 %	25 %	25 %	0 %	407689792
533	NC_018682	TGGGG	2	10	28612	28621	0 %	20 %	80 %	0 %	407689792
534	NC_018682	GCC	2	6	28635	28640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689792
535	NC_018682	GCC	2	6	28669	28674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689792
536	NC_018682	CTG	2	6	28689	28694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689792
537	NC_018682	AGC	2	6	28761	28766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689792
538	NC_018682	ATT	2	6	28782	28787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407689792
539	NC_018682	CGC	2	6	28844	28849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
540	NC_018682	CG	3	6	28990	28995	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
541	NC_018682	TGT	2	6	29015	29020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_018682	AAG	2	6	29024	29029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_018682	GAA	2	6	29072	29077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_018682	AGG	2	6	29184	29189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689793
545	NC_018682	CCG	2	6	29232	29237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689793
546	NC_018682	GA	3	6	29245	29250	50 %	0 %	50 %	0 %	407689793
547	NC_018682	TGCTG	2	10	29316	29325	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
548	NC_018682	TGC	2	6	29334	29339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_018682	TGA	2	6	29355	29360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_018682	GAG	2	6	29494	29499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
551	NC_018682	GCC	2	6	29520	29525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
552	NC_018682	TCC	2	6	29531	29536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
553	NC_018682	CCT	2	6	29635	29640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
554	NC_018682	GCT	2	6	29789	29794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689794
555	NC_018682	CAT	2	6	29816	29821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689794
556	NC_018682	CGA	2	6	29863	29868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689794
557	NC_018682	CAG	2	6	29882	29887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689794
558	NC_018682	TCC	2	6	29938	29943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407689794
559	NC_018682	CGA	2	6	29953	29958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689794
560	NC_018682	CAG	2	6	30044	30049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689794
561	NC_018682	GC	3	6	30053	30058	0 %	0 %	50 %	50 %	407689794
562	NC_018682	CGGC	2	8	30064	30071	0 %	0 %	50 %	50 %	407689794
563	NC_018682	TCA	2	6	30102	30107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689794
564	NC_018682	GAG	2	6	30110	30115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689794
565	NC_018682	GGGC	2	8	30161	30168	0 %	0 %	75 %	25 %	407689794
566	NC_018682	GCC	2	6	30194	30199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689794
567	NC_018682	GCTG	2	8	30232	30239	0 %	25 %	50 %	25 %	407689794
568	NC_018682	CGA	2	6	30240	30245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689794
569	NC_018682	AGC	2	6	30283	30288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689794
570	NC_018682	GAT	2	6	30321	30326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689794
571	NC_018682	CG	3	6	30327	30332	0 %	0 %	50 %	50 %	407689794
572	NC_018682	GCG	2	6	30350	30355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_018682	ACG	2	6	30357	30362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_018682	ACG	2	6	30515	30520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689795
575	NC_018682	TCG	2	6	30529	30534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689795
576	NC_018682	TCG	2	6	30634	30639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689795
577	NC_018682	TGA	2	6	30686	30691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689795
578	NC_018682	GCA	2	6	30728	30733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689795
579	NC_018682	CCG	2	6	30735	30740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689795
580	NC_018682	CGG	2	6	30856	30861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689796
581	NC_018682	CGC	2	6	30874	30879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689796
582	NC_018682	CG	3	6	30889	30894	0 %	0 %	50 %	50 %	407689796
583	NC_018682	CGAG	2	8	30916	30923	25 %	0 %	50 %	25 %	407689796
584	NC_018682	GCT	2	6	30970	30975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689796
585	NC_018682	TGT	2	6	30997	31002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407689796
586	NC_018682	TCG	2	6	31008	31013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689796
587	NC_018682	ATG	2	6	31044	31049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689796
588	NC_018682	GCC	2	6	31056	31061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
589	NC_018682	GCG	2	6	31096	31101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_018682	CAG	2	6	31115	31120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_018682	CCG	2	6	31133	31138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
592	NC_018682	GCCGG	2	10	31142	31151	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
593	NC_018682	ATC	2	6	31241	31246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689797
594	NC_018682	AGC	2	6	31313	31318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_018682	GCTT	2	8	31337	31344	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
596	NC_018682	GC	3	6	31346	31351	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
597	NC_018682	GCG	2	6	31365	31370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_018682	CAGC	2	8	31406	31413	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
599	NC_018682	GTT	2	6	31449	31454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
600	NC_018682	CGTT	2	8	31540	31547	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
601	NC_018682	CGT	2	6	31569	31574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_018682	TGCGC	2	10	31612	31621	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
603	NC_018682	CGA	2	6	31633	31638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_018682	GCC	2	6	31686	31691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
605	NC_018682	CTGG	2	8	31766	31773	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
606	NC_018682	GAGGTC	2	12	31788	31799	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
607	NC_018682	CGAT	2	8	31816	31823	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
608	NC_018682	CAT	2	6	31911	31916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_018682	TGT	2	6	31923	31928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_018682	GGC	2	6	31965	31970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689798
611	NC_018682	CGC	2	6	32034	32039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689798
612	NC_018682	GC	3	6	32067	32072	0 %	0 %	50 %	50 %	407689798
613	NC_018682	GACTG	2	10	32077	32086	20 %	20 %	40 %	20 %	407689798
614	NC_018682	CGA	2	6	32109	32114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689798
615	NC_018682	GCG	2	6	32195	32200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689798
616	NC_018682	CGTC	2	8	32208	32215	0 %	25 %	25 %	50 %	407689798
617	NC_018682	CGA	2	6	32265	32270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689798
618	NC_018682	GA	3	6	32281	32286	50 %	0 %	50 %	0 %	407689798
619	NC_018682	ATT	2	6	32360	32365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407689798
620	NC_018682	GAC	2	6	32383	32388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689798
621	NC_018682	TCGT	2	8	32425	32432	0 %	50 %	25 %	25 %	407689798
622	NC_018682	GCA	3	9	32458	32466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689798
623	NC_018682	CA	3	6	32522	32527	50 %	0 %	0 %	50 %	407689798
624	NC_018682	CAC	2	6	32653	32658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407689798
625	NC_018682	AGC	2	6	32680	32685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689798
626	NC_018682	TCA	2	6	32692	32697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689798
627	NC_018682	TCG	2	6	32704	32709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689798
628	NC_018682	CGGC	2	8	32731	32738	0 %	0 %	50 %	50 %	407689798
629	NC_018682	TCGT	2	8	32739	32746	0 %	50 %	25 %	25 %	407689798
630	NC_018682	GAG	2	6	32786	32791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689798
631	NC_018682	TCA	3	9	32820	32828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689798
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759	NC_018682	GAA	2	6	39382	39387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407689806
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761	NC_018682	GTC	2	6	39451	39456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689806
762	NC_018682	GCT	2	6	39492	39497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689806
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772	NC_018682	GCA	2	6	40236	40241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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851	NC_018682	GACATG	2	12	45280	45291	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407689812
852	NC_018682	TTC	2	6	45316	45321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407689812
853	NC_018682	GCT	2	6	45379	45384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689812
854	NC_018682	GCG	2	6	45407	45412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689812
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871	NC_018682	ATC	2	6	45994	45999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689812
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873	NC_018682	CTG	2	6	46108	46113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689812
874	NC_018682	G	6	6	46156	46161	0 %	0 %	100 %	0 %	407689812
875	NC_018682	GC	5	10	46235	46244	0 %	0 %	50 %	50 %	407689812
876	NC_018682	CGA	2	6	46266	46271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689812
877	NC_018682	GAC	2	6	46405	46410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689812
878	NC_018682	CGA	2	6	46421	46426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689812
879	NC_018682	ATC	2	6	46451	46456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689812
880	NC_018682	GGC	2	6	46476	46481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689812
881	NC_018682	GAT	2	6	46527	46532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689812
882	NC_018682	GCG	2	6	46578	46583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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