MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium meliloti Rm41 plasmid pRM41A

Total Repeats: 4942

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_018682	CTT	2	6	224830	224835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4502	NC_018682	GCC	2	6	224891	224896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4503	NC_018682	CCG	2	6	224979	224984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4504	NC_018682	TCG	2	6	225014	225019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4505	NC_018682	T	6	6	225037	225042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_018682	TCCG	2	8	225046	225053	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4507	NC_018682	GCAC	2	8	225109	225116	25 %	0 %	25 %	50 %	407689982
4508	NC_018682	CGG	2	6	225237	225242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689982
4509	NC_018682	GCC	2	6	225244	225249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689982
4510	NC_018682	CGA	2	6	225255	225260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689982
4511	NC_018682	TTCG	2	8	225271	225278	0 %	50 %	25 %	25 %	407689982
4512	NC_018682	TCG	2	6	225296	225301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689982
4513	NC_018682	CGT	2	6	225327	225332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689982
4514	NC_018682	CGG	2	6	225365	225370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689982
4515	NC_018682	GAG	2	6	225451	225456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689982
4516	NC_018682	CCG	2	6	225620	225625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689982
4517	NC_018682	TCG	2	6	225653	225658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689982
4518	NC_018682	TGA	2	6	225734	225739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689982
4519	NC_018682	CGA	2	6	225759	225764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689982
4520	NC_018682	AAG	2	6	225778	225783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407689982
4521	NC_018682	CTT	2	6	225790	225795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407689982
4522	NC_018682	ACG	2	6	225821	225826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689982
4523	NC_018682	CGA	2	6	225864	225869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689982
4524	NC_018682	TGCC	2	8	225897	225904	0 %	25 %	25 %	50 %	407689982
4525	NC_018682	CCAT	2	8	225989	225996	25 %	25 %	0 %	50 %	407689982
4526	NC_018682	GTC	2	6	226050	226055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689982
4527	NC_018682	AGG	2	6	226091	226096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689982
4528	NC_018682	GCCG	2	8	226130	226137	0 %	0 %	50 %	50 %	407689982
4529	NC_018682	GAT	2	6	226219	226224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689982
4530	NC_018682	GCC	2	6	226225	226230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689982
4531	NC_018682	TGA	2	6	226244	226249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689982
4532	NC_018682	ACG	2	6	226336	226341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689982
4533	NC_018682	CG	3	6	226378	226383	0 %	0 %	50 %	50 %	407689982
4534	NC_018682	CTGG	2	8	226386	226393	0 %	25 %	50 %	25 %	407689982
4535	NC_018682	GC	3	6	226444	226449	0 %	0 %	50 %	50 %	407689982
4536	NC_018682	GGA	2	6	226464	226469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689982
4537	NC_018682	AGA	2	6	226472	226477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407689982
4538	NC_018682	CGCCGG	2	12	226530	226541	0 %	0 %	50 %	50 %	407689982
4539	NC_018682	GAT	2	6	226551	226556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689982
4540	NC_018682	CG	4	8	226563	226570	0 %	0 %	50 %	50 %	407689982
4541	NC_018682	AGC	2	6	226581	226586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689982
4542	NC_018682	GTC	2	6	226597	226602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689982
4543	NC_018682	GC	3	6	226607	226612	0 %	0 %	50 %	50 %	407689982
4544	NC_018682	GAAG	2	8	226641	226648	50 %	0 %	50 %	0 %	407689982
4545	NC_018682	CGA	2	6	226737	226742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689982
4546	NC_018682	GTC	2	6	226755	226760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689982
4547	NC_018682	TCGC	2	8	226955	226962	0 %	25 %	25 %	50 %	407689982
4548	NC_018682	CTAC	2	8	226985	226992	25 %	25 %	0 %	50 %	407689982
4549	NC_018682	GAT	2	6	227007	227012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689982
4550	NC_018682	GAC	2	6	227085	227090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689982
4551	NC_018682	CGGA	2	8	227191	227198	25 %	0 %	50 %	25 %	407689982
4552	NC_018682	GGAC	2	8	227199	227206	25 %	0 %	50 %	25 %	407689982
4553	NC_018682	GAA	2	6	227244	227249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407689982
4554	NC_018682	GCTC	2	8	227255	227262	0 %	25 %	25 %	50 %	407689982
4555	NC_018682	GTC	2	6	227290	227295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689982
4556	NC_018682	GCT	2	6	227299	227304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689982
4557	NC_018682	AGGCGA	2	12	227328	227339	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	407689982
4558	NC_018682	CCG	2	6	227343	227348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689982
4559	NC_018682	AGC	2	6	227363	227368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689982
4560	NC_018682	AAC	2	6	227377	227382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407689982
4561	NC_018682	ACG	2	6	227401	227406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689982
4562	NC_018682	TC	4	8	227455	227462	0 %	50 %	0 %	50 %	407689982
4563	NC_018682	GAT	2	6	227506	227511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689982
4564	NC_018682	CGG	2	6	227550	227555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689982
4565	NC_018682	CGAC	2	8	227694	227701	25 %	0 %	25 %	50 %	407689982
4566	NC_018682	ACCAA	2	10	227791	227800	60 %	0 %	0 %	40 %	407689982
4567	NC_018682	AGC	2	6	227812	227817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689982
4568	NC_018682	GCAG	2	8	227871	227878	25 %	0 %	50 %	25 %	407689982
4569	NC_018682	GAA	2	6	227910	227915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407689982
4570	NC_018682	GCC	2	6	227968	227973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689982
4571	NC_018682	AAC	2	6	228194	228199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407689982
4572	NC_018682	GGA	2	6	228210	228215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689982
4573	NC_018682	GTG	2	6	228217	228222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407689982
4574	NC_018682	CGC	2	6	228226	228231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689982
4575	NC_018682	CT	3	6	228256	228261	0 %	50 %	0 %	50 %	407689982
4576	NC_018682	GC	3	6	228268	228273	0 %	0 %	50 %	50 %	407689982
4577	NC_018682	CGTG	2	8	228288	228295	0 %	25 %	50 %	25 %	407689982
4578	NC_018682	GCC	2	6	228427	228432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689982
4579	NC_018682	GC	3	6	228522	228527	0 %	0 %	50 %	50 %	407689982
4580	NC_018682	GCG	2	6	228642	228647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689983
4581	NC_018682	GAG	2	6	228650	228655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689983
4582	NC_018682	CAA	2	6	228662	228667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407689983
4583	NC_018682	CCA	2	6	228688	228693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407689983
4584	NC_018682	CGG	2	6	228734	228739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689983
4585	NC_018682	CGC	2	6	228809	228814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689983
4586	NC_018682	CGC	2	6	228838	228843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689983
4587	NC_018682	CGGG	2	8	228901	228908	0 %	0 %	75 %	25 %	407689983
4588	NC_018682	CGC	2	6	228913	228918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689983
4589	NC_018682	TCA	2	6	228919	228924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689983
4590	NC_018682	TCGCCG	2	12	228934	228945	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	407689983
4591	NC_018682	TTC	2	6	229223	229228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407689984
4592	NC_018682	CGG	2	6	229268	229273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689984
4593	NC_018682	GGC	2	6	229320	229325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689984
4594	NC_018682	GGC	2	6	229350	229355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689984
4595	NC_018682	CGC	2	6	229380	229385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689984
4596	NC_018682	TTC	2	6	229392	229397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407689984
4597	NC_018682	TTG	2	6	229445	229450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407689984
4598	NC_018682	TCG	2	6	229485	229490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689984
4599	NC_018682	TGG	2	6	229505	229510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407689984
4600	NC_018682	GGATGG	2	12	229591	229602	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	407689984
4601	NC_018682	GGC	2	6	229611	229616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689984
4602	NC_018682	CCG	2	6	229697	229702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689984
4603	NC_018682	GGC	2	6	229834	229839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689984
4604	NC_018682	GGAC	2	8	229922	229929	25 %	0 %	50 %	25 %	407689984
4605	NC_018682	GCG	2	6	229948	229953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689984
4606	NC_018682	CGAT	2	8	229955	229962	25 %	25 %	25 %	25 %	407689984
4607	NC_018682	CGG	3	9	230004	230012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689984
4608	NC_018682	GA	3	6	230026	230031	50 %	0 %	50 %	0 %	407689984
4609	NC_018682	TTC	2	6	230104	230109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407689984
4610	NC_018682	TC	3	6	230144	230149	0 %	50 %	0 %	50 %	407689984
4611	NC_018682	TCG	2	6	230171	230176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689984
4612	NC_018682	TGG	2	6	230239	230244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407689984
4613	NC_018682	CATC	2	8	230255	230262	25 %	25 %	0 %	50 %	407689984
4614	NC_018682	TCCTT	2	10	230321	230330	0 %	60 %	0 %	40 %	407689984
4615	NC_018682	GAG	2	6	230346	230351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_018682	CGT	2	6	230353	230358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689985
4617	NC_018682	CGT	2	6	230394	230399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689985
4618	NC_018682	TCG	2	6	230412	230417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689985
4619	NC_018682	TCG	2	6	230424	230429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689985
4620	NC_018682	GGC	2	6	230474	230479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689985
4621	NC_018682	GGCGAT	2	12	230518	230529	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407689985
4622	NC_018682	CGTC	2	8	230530	230537	0 %	25 %	25 %	50 %	407689985
4623	NC_018682	GGT	2	6	230554	230559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407689985
4624	NC_018682	GC	3	6	230595	230600	0 %	0 %	50 %	50 %	407689985
4625	NC_018682	CGC	2	6	230605	230610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689985
4626	NC_018682	CGA	2	6	230743	230748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689985
4627	NC_018682	GCA	2	6	230833	230838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689985
4628	NC_018682	AGC	2	6	230869	230874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689985
4629	NC_018682	GATC	2	8	230935	230942	25 %	25 %	25 %	25 %	407689985
4630	NC_018682	TC	3	6	230941	230946	0 %	50 %	0 %	50 %	407689985
4631	NC_018682	CGG	2	6	230953	230958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689985
4632	NC_018682	ACC	2	6	231027	231032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4633	NC_018682	AGGC	2	8	231132	231139	25 %	0 %	50 %	25 %	407689986
4634	NC_018682	GCC	2	6	231185	231190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689986
4635	NC_018682	GCC	2	6	231208	231213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689986
4636	NC_018682	CCA	2	6	231230	231235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407689986
4637	NC_018682	GC	3	6	231237	231242	0 %	0 %	50 %	50 %	407689986
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4639	NC_018682	GCT	2	6	231276	231281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689986
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4641	NC_018682	GC	4	8	231403	231410	0 %	0 %	50 %	50 %	407689986
4642	NC_018682	GTC	2	6	231453	231458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689986
4643	NC_018682	CGG	2	6	231521	231526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689986
4644	NC_018682	GATC	2	8	231531	231538	25 %	25 %	25 %	25 %	407689986
4645	NC_018682	GAT	2	6	231615	231620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689986
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4647	NC_018682	CTT	2	6	231809	231814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4648	NC_018682	GCC	2	6	231819	231824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4649	NC_018682	AGT	2	6	231917	231922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4650	NC_018682	TGC	2	6	231934	231939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4651	NC_018682	TA	3	6	231953	231958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4652	NC_018682	T	6	6	231959	231964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4653	NC_018682	CCG	2	6	232046	232051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689987
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4655	NC_018682	TCG	2	6	232140	232145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689987
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4658	NC_018682	CG	3	6	232314	232319	0 %	0 %	50 %	50 %	407689987
4659	NC_018682	CGA	2	6	232322	232327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689987
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4661	NC_018682	GAACG	2	10	232383	232392	40 %	0 %	40 %	20 %	407689987
4662	NC_018682	ATC	2	6	232573	232578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689987
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4664	NC_018682	CCTC	2	8	232649	232656	0 %	25 %	0 %	75 %	407689987
4665	NC_018682	ATC	2	6	232659	232664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689987
4666	NC_018682	GACC	2	8	232837	232844	25 %	0 %	25 %	50 %	407689988
4667	NC_018682	GGC	2	6	232865	232870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689988
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4672	NC_018682	CGA	2	6	233023	233028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689988
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4674	NC_018682	ACA	2	6	233107	233112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407689988
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4679	NC_018682	TGA	2	6	233343	233348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689988
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4685	NC_018682	ACCC	2	8	233706	233713	25 %	0 %	0 %	75 %	407689988
4686	NC_018682	ATGTGG	2	12	233763	233774	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	407689988
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4690	NC_018682	GCTG	2	8	233940	233947	0 %	25 %	50 %	25 %	407689989
4691	NC_018682	TCC	2	6	233969	233974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407689989
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4694	NC_018682	CCTTC	2	10	234107	234116	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
4695	NC_018682	AGA	2	6	234233	234238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4696	NC_018682	ACG	2	6	234248	234253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689990
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4700	NC_018682	TGGCAA	2	12	234585	234596	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407689991
4701	NC_018682	TGC	2	6	234650	234655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689991
4702	NC_018682	ATC	2	6	234785	234790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689991
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4705	NC_018682	CAT	2	6	234889	234894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689991
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4718	NC_018682	TCT	2	6	235283	235288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4719	NC_018682	G	6	6	235295	235300	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4720	NC_018682	TGG	2	6	235308	235313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4721	NC_018682	AGCTG	2	10	235466	235475	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4722	NC_018682	GTC	2	6	235581	235586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689992
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4734	NC_018682	TCC	2	6	236231	236236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407689992
4735	NC_018682	GCT	2	6	236291	236296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689992
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4737	NC_018682	GCTGTC	2	12	236321	236332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689992
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4740	NC_018682	CTC	2	6	236503	236508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407689992
4741	NC_018682	CGT	2	6	236528	236533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689992
4742	NC_018682	CGCGG	2	10	236545	236554	0 %	0 %	60 %	40 %	407689992
4743	NC_018682	CGC	2	6	236655	236660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689992
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4745	NC_018682	TGC	2	6	236718	236723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689992
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4866	NC_018682	CCA	2	6	242467	242472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407689999
4867	NC_018682	CGAC	2	8	242491	242498	25 %	0 %	25 %	50 %	407689999
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4871	NC_018682	CGA	2	6	242612	242617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689999
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4874	NC_018682	TCA	2	6	242844	242849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689999
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4882	NC_018682	CG	4	8	243134	243141	0 %	0 %	50 %	50 %	407689999
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4910	NC_018682	AGC	2	6	244476	244481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690002
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4932	NC_018682	CGC	2	6	245543	245548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690003
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