MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Streptococcus agalactiae GD201008-001 chromosome

Total Repeats: 29616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018646	TTG	2	6	8	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018646	TTC	2	6	20	25	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018646	AAT	2	6	68	73	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708524
4	NC_018646	GAA	2	6	92	97	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708524
5	NC_018646	AAC	2	6	114	119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406708524
6	NC_018646	CAG	2	6	165	170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406708524
7	NC_018646	CTC	2	6	200	205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406708524
8	NC_018646	TTA	2	6	228	233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708524
9	NC_018646	CTA	2	6	587	592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406708524
10	NC_018646	CTG	2	6	651	656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406708524
11	NC_018646	TTA	2	6	663	668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708524
12	NC_018646	GAA	2	6	704	709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708524
13	NC_018646	TTC	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406708524
14	NC_018646	AGA	2	6	886	891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708524
15	NC_018646	CAC	2	6	936	941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406708524
16	NC_018646	ATG	2	6	1158	1163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708524
17	NC_018646	AGA	2	6	1189	1194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708524
18	NC_018646	TAA	2	6	1384	1389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708524
19	NC_018646	CTA	2	6	1573	1578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018646	TAC	2	6	1580	1585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_018646	TCT	2	6	1645	1650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406708525
22	NC_018646	TTA	2	6	1842	1847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708525
23	NC_018646	ATT	2	6	1869	1874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708525
24	NC_018646	AAC	2	6	1915	1920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406708525
25	NC_018646	ACA	2	6	2004	2009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406708525
26	NC_018646	ATT	2	6	2049	2054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708525
27	NC_018646	TGC	2	6	2069	2074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406708525
28	NC_018646	CAA	2	6	2079	2084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406708525
29	NC_018646	TAA	2	6	2204	2209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708525
30	NC_018646	GTT	2	6	2220	2225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406708525
31	NC_018646	GAT	2	6	2265	2270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708525
32	NC_018646	TCT	2	6	2290	2295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406708525
33	NC_018646	CCT	2	6	2378	2383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406708525
34	NC_018646	TAA	2	6	2728	2733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708525
35	NC_018646	ATG	2	6	2811	2816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708526
36	NC_018646	TAA	2	6	2858	2863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708526
37	NC_018646	TTG	2	6	2878	2883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406708526
38	NC_018646	GAT	2	6	2943	2948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708526
39	NC_018646	ATC	2	6	2995	3000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406708526
40	NC_018646	AGG	2	6	3011	3016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406708526
41	NC_018646	TTA	2	6	3071	3076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708526
42	NC_018646	ATT	2	6	3329	3334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708526
43	NC_018646	TTC	2	6	3338	3343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406708526
44	NC_018646	CAG	2	6	3378	3383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406708526
45	NC_018646	TAT	2	6	3535	3540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708526
46	NC_018646	TAC	2	6	3560	3565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406708526
47	NC_018646	TTG	2	6	3733	3738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406708527
48	NC_018646	ATG	2	6	3858	3863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708527
49	NC_018646	AAT	2	6	3927	3932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018646	AAT	2	6	3964	3969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018646	AGA	2	6	4013	4018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018646	GTT	2	6	4055	4060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018646	ATA	2	6	4234	4239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018646	TAG	2	6	4256	4261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018646	ATT	2	6	4266	4271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018646	CTA	2	6	4278	4283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018646	CAT	2	6	4403	4408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_018646	TCT	2	6	4418	4423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018646	ATA	2	6	4434	4439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018646	CAG	2	6	4483	4488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406708529
61	NC_018646	GCT	2	6	4557	4562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406708529
62	NC_018646	TGA	3	9	4793	4801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708529
63	NC_018646	AGA	2	6	5039	5044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708529
64	NC_018646	GTT	2	6	5055	5060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406708529
65	NC_018646	AAC	2	6	5078	5083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406708529
66	NC_018646	TGA	2	6	5111	5116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708529
67	NC_018646	TGA	2	6	5135	5140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708529
68	NC_018646	AGT	2	6	5192	5197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708529
69	NC_018646	GAA	3	9	5217	5225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708529
70	NC_018646	TGA	3	9	5237	5245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708529
71	NC_018646	ATC	2	6	5317	5322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406708529
72	NC_018646	CTG	2	6	5347	5352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406708529
73	NC_018646	GCT	2	6	5406	5411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406708529
74	NC_018646	TAT	2	6	5414	5419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708529
75	NC_018646	ATG	2	6	5467	5472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708529
76	NC_018646	AAG	2	6	5506	5511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708529
77	NC_018646	GAA	2	6	5526	5531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708529
78	NC_018646	TAG	2	6	5586	5591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708529
79	NC_018646	AAT	2	6	5594	5599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018646	TTA	2	6	5631	5636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018646	TTG	2	6	5685	5690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406708530
82	NC_018646	ATA	2	6	5730	5735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708530
83	NC_018646	AGA	2	6	5788	5793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708530
84	NC_018646	ACT	2	6	5861	5866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406708530
85	NC_018646	ACA	2	6	5913	5918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406708530
86	NC_018646	GAT	2	6	5948	5953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708530
87	NC_018646	CTG	2	6	5997	6002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406708530
88	NC_018646	TAT	2	6	6025	6030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708530
89	NC_018646	TTA	2	6	6102	6107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708530
90	NC_018646	ATG	2	6	6135	6140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708530
91	NC_018646	TAT	2	6	6188	6193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708530
92	NC_018646	ATT	2	6	6258	6263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708531
93	NC_018646	GTG	2	6	6277	6282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406708531
94	NC_018646	TGA	2	6	6489	6494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708531
95	NC_018646	GCA	2	6	6502	6507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406708531
96	NC_018646	TTC	2	6	6826	6831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406708531
97	NC_018646	CAG	2	6	6914	6919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406708531
98	NC_018646	ATT	2	6	6925	6930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708531
99	NC_018646	TCG	2	6	7062	7067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406708531
100	NC_018646	TGA	2	6	7140	7145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708531
101	NC_018646	ACA	2	6	7215	7220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406708531
102	NC_018646	CTT	2	6	7293	7298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406708531
103	NC_018646	TCA	2	6	7344	7349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406708531
104	NC_018646	TTG	2	6	7393	7398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406708531
105	NC_018646	TTG	2	6	7559	7564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406708531
106	NC_018646	TGT	2	6	7722	7727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406708531
107	NC_018646	ATG	2	6	7913	7918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708531
108	NC_018646	AGA	2	6	7959	7964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708531
109	NC_018646	TGA	2	6	7971	7976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708531
110	NC_018646	TTG	2	6	7978	7983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406708531
111	NC_018646	ATA	2	6	8036	8041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708531
112	NC_018646	ATT	2	6	8148	8153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708531
113	NC_018646	CAA	2	6	8246	8251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406708531
114	NC_018646	CAG	2	6	8263	8268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406708531
115	NC_018646	ATT	3	9	8392	8400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708531
116	NC_018646	TGT	2	6	8427	8432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406708531
117	NC_018646	TGA	2	6	8460	8465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708531
118	NC_018646	TAT	2	6	8679	8684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708531
119	NC_018646	AGG	2	6	8700	8705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406708531
120	NC_018646	AAT	2	6	8883	8888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708531
121	NC_018646	TTG	2	6	8927	8932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406708531
122	NC_018646	GTG	2	6	9134	9139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406708531
123	NC_018646	CCA	2	6	9227	9232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406708531
124	NC_018646	CAG	2	6	9302	9307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406708531
125	NC_018646	TAG	2	6	9494	9499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708531
126	NC_018646	ATT	2	6	9566	9571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708531
127	NC_018646	GTT	2	6	9634	9639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406708531
128	NC_018646	ATT	2	6	9670	9675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708531
129	NC_018646	GAA	2	6	9676	9681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708531
130	NC_018646	AGA	2	6	9732	9737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708531
131	NC_018646	AAG	2	6	9796	9801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018646	TTA	2	6	9872	9877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018646	TAG	2	6	9995	10000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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242	NC_018646	CTT	2	6	15674	15679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406708538
243	NC_018646	TAA	2	6	15691	15696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708538
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248	NC_018646	AAG	2	6	16007	16012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
249	NC_018646	ATA	2	6	16082	16087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
250	NC_018646	TAG	2	6	16186	16191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
251	NC_018646	AAC	2	6	16201	16206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
252	NC_018646	GGC	2	6	16430	16435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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254	NC_018646	CGA	2	6	16675	16680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
255	NC_018646	GCA	2	6	16749	16754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
256	NC_018646	CGC	2	6	16796	16801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
257	NC_018646	TGT	2	6	16835	16840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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259	NC_018646	CAG	2	6	16918	16923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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