MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus agalactiae GD201008-001 chromosome

Total Repeats: 46207

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_018646	CAC	2	6	180055	180060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4002	NC_018646	AGCC	2	8	180103	180110	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4003	NC_018646	GAT	2	6	180126	180131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_018646	CCT	2	6	180182	180187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4005	NC_018646	TAAGGA	2	12	180191	180202	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_018646	AGG	2	6	180284	180289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_018646	TAA	2	6	180465	180470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_018646	GTTAA	2	10	180472	180481	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_018646	GAA	2	6	180518	180523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_018646	ACG	2	6	180535	180540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_018646	GTAA	2	8	180558	180565	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_018646	GAAG	2	8	180640	180647	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_018646	TAG	2	6	180706	180711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_018646	GCGA	2	8	180714	180721	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4015	NC_018646	AGG	2	6	180728	180733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_018646	AGA	2	6	180793	180798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_018646	AG	3	6	180821	180826	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_018646	TCG	2	6	180897	180902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_018646	GGA	2	6	180910	180915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_018646	CT	3	6	180936	180941	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4021	NC_018646	GGGAG	2	10	180991	181000	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_018646	ACA	2	6	181028	181033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_018646	ATG	2	6	181095	181100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_018646	TGT	2	6	181165	181170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_018646	GGA	2	6	181228	181233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_018646	TC	3	6	181314	181319	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4027	NC_018646	ACC	2	6	181493	181498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4028	NC_018646	AT	3	6	181514	181519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_018646	AGC	2	6	181573	181578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_018646	ATTC	2	8	181580	181587	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4031	NC_018646	TG	3	6	181704	181709	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_018646	AAG	2	6	181710	181715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_018646	GAG	2	6	181725	181730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_018646	GA	3	6	181855	181860	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_018646	ACA	2	6	181881	181886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_018646	TA	3	6	181909	181914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_018646	CTAA	2	8	181936	181943	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4038	NC_018646	GAG	2	6	182025	182030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_018646	TAG	2	6	182038	182043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_018646	GA	3	6	182150	182155	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_018646	CT	3	6	182266	182271	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4042	NC_018646	GAT	2	6	182284	182289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_018646	CGG	2	6	182375	182380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_018646	GA	3	6	182473	182478	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_018646	TAGG	2	8	182591	182598	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_018646	GTT	2	6	182635	182640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_018646	TAC	2	6	182645	182650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_018646	CCT	2	6	182733	182738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4049	NC_018646	GGT	2	6	182869	182874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_018646	TCG	2	6	182984	182989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_018646	CGT	2	6	183064	183069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_018646	AGGGA	2	10	183202	183211	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_018646	GA	3	6	183288	183293	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_018646	ACTAAT	2	12	183343	183354	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4055	NC_018646	AGT	2	6	183520	183525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_018646	GTA	2	6	183587	183592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_018646	ATG	2	6	183610	183615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_018646	T	7	7	183673	183679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_018646	ATT	2	6	183686	183691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_018646	TGTTA	2	10	183736	183745	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_018646	TTA	2	6	183766	183771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_018646	ATTGT	2	10	183927	183936	20 %	60 %	20 %	0 %	406708685
4063	NC_018646	TAG	2	6	183949	183954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708685
4064	NC_018646	ATAATG	2	12	183969	183980	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	406708685
4065	NC_018646	TAA	2	6	184024	184029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708685
4066	NC_018646	ATTAG	2	10	184040	184049	40 %	40 %	20 %	0 %	406708685
4067	NC_018646	CTGT	2	8	184062	184069	0 %	50 %	25 %	25 %	406708685
4068	NC_018646	G	6	6	184078	184083	0 %	0 %	100 %	0 %	406708685
4069	NC_018646	TGC	3	9	184096	184104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406708685
4070	NC_018646	TGG	2	6	184204	184209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406708685
4071	NC_018646	ATTG	2	8	184331	184338	25 %	50 %	25 %	0 %	406708685
4072	NC_018646	TTA	2	6	184367	184372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708685
4073	NC_018646	TCA	2	6	184388	184393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406708685
4074	NC_018646	T	6	6	184536	184541	0 %	100 %	0 %	0 %	406708685
4075	NC_018646	A	6	6	184559	184564	100 %	0 %	0 %	0 %	406708685
4076	NC_018646	AAG	2	6	184602	184607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708685
4077	NC_018646	GTT	2	6	184621	184626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406708685
4078	NC_018646	TCT	2	6	184643	184648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4079	NC_018646	CTAT	2	8	184653	184660	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4080	NC_018646	GATT	2	8	184661	184668	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_018646	A	6	6	184704	184709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_018646	TA	3	6	184714	184719	50 %	50 %	0 %	0 %	406708686
4083	NC_018646	ATT	2	6	184790	184795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708686
4084	NC_018646	AAG	2	6	184893	184898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708686
4085	NC_018646	AC	4	8	185039	185046	50 %	0 %	0 %	50 %	406708686
4086	NC_018646	ATC	2	6	185047	185052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406708686
4087	NC_018646	AT	3	6	185170	185175	50 %	50 %	0 %	0 %	406708687
4088	NC_018646	GCT	2	6	185282	185287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406708687
4089	NC_018646	TAA	2	6	185298	185303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708687
4090	NC_018646	A	7	7	185371	185377	100 %	0 %	0 %	0 %	406708687
4091	NC_018646	TGGT	2	8	185476	185483	0 %	50 %	50 %	0 %	406708687
4092	NC_018646	AGA	2	6	185486	185491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708687
4093	NC_018646	ATG	2	6	185502	185507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708687
4094	NC_018646	CAA	2	6	185655	185660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406708687
4095	NC_018646	ACT	2	6	185678	185683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406708687
4096	NC_018646	CAT	2	6	185705	185710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406708687
4097	NC_018646	TGA	2	6	185739	185744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708687
4098	NC_018646	TGA	2	6	185758	185763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708687
4099	NC_018646	GTT	2	6	185823	185828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406708687
4100	NC_018646	CGT	2	6	185967	185972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406708688
4101	NC_018646	TGA	2	6	185980	185985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708688
4102	NC_018646	GTT	2	6	186030	186035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406708688
4103	NC_018646	GTT	2	6	186069	186074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406708688
4104	NC_018646	GGC	2	6	186080	186085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406708688
4105	NC_018646	TATT	2	8	186225	186232	25 %	75 %	0 %	0 %	406708688
4106	NC_018646	TAT	2	6	186239	186244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708688
4107	NC_018646	GGAA	2	8	186253	186260	50 %	0 %	50 %	0 %	406708688
4108	NC_018646	TTTG	2	8	186272	186279	0 %	75 %	25 %	0 %	406708688
4109	NC_018646	TTTTA	2	10	186296	186305	20 %	80 %	0 %	0 %	406708688
4110	NC_018646	TATT	2	8	186313	186320	25 %	75 %	0 %	0 %	406708688
4111	NC_018646	TA	3	6	186330	186335	50 %	50 %	0 %	0 %	406708688
4112	NC_018646	TGA	2	6	186344	186349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708688
4113	NC_018646	TGT	2	6	186404	186409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406708688
4114	NC_018646	TATTGC	2	12	186416	186427	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	406708688
4115	NC_018646	TAT	2	6	186467	186472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708688
4116	NC_018646	TAT	2	6	186582	186587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708688
4117	NC_018646	CAA	2	6	186607	186612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406708688
4118	NC_018646	GAT	2	6	186617	186622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708688
4119	NC_018646	TTAG	2	8	186642	186649	25 %	50 %	25 %	0 %	406708688
4120	NC_018646	TAG	2	6	186652	186657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708688
4121	NC_018646	GCTT	2	8	186658	186665	0 %	50 %	25 %	25 %	406708688
4122	NC_018646	TAAA	2	8	186675	186682	75 %	25 %	0 %	0 %	406708688
4123	NC_018646	A	7	7	186680	186686	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_018646	T	6	6	186708	186713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_018646	T	7	7	186727	186733	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_018646	AT	3	6	186737	186742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_018646	CTA	2	6	186783	186788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_018646	A	6	6	186848	186853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_018646	TAC	2	6	186854	186859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4130	NC_018646	ATT	2	6	186887	186892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708689
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