MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus agalactiae GD201008-001 chromosome

Total Repeats: 46207

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_018646	AAC	2	6	135532	135537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406708643
3002	NC_018646	A	6	6	135549	135554	100 %	0 %	0 %	0 %	406708643
3003	NC_018646	TAT	2	6	135557	135562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708643
3004	NC_018646	TGAT	2	8	135610	135617	25 %	50 %	25 %	0 %	406708643
3005	NC_018646	TCA	2	6	135621	135626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406708643
3006	NC_018646	ATA	2	6	135658	135663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708643
3007	NC_018646	GTAT	2	8	135664	135671	25 %	50 %	25 %	0 %	406708643
3008	NC_018646	TAA	2	6	135719	135724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708643
3009	NC_018646	A	6	6	135822	135827	100 %	0 %	0 %	0 %	406708643
3010	NC_018646	CAT	2	6	135935	135940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406708643
3011	NC_018646	AGTCA	2	10	136020	136029	40 %	20 %	20 %	20 %	406708643
3012	NC_018646	TTG	2	6	136054	136059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406708643
3013	NC_018646	CT	4	8	136078	136085	0 %	50 %	0 %	50 %	406708643
3014	NC_018646	TTA	2	6	136114	136119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708643
3015	NC_018646	ATT	2	6	136131	136136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708643
3016	NC_018646	TAG	2	6	136172	136177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708643
3017	NC_018646	TTA	2	6	136222	136227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708643
3018	NC_018646	GAG	2	6	136234	136239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406708643
3019	NC_018646	AAT	2	6	136240	136245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708643
3020	NC_018646	TCAGGT	2	12	136370	136381	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	406708644
3021	NC_018646	CTT	2	6	136412	136417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406708644
3022	NC_018646	CAAAGA	2	12	136472	136483	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	406708644
3023	NC_018646	TCA	2	6	136525	136530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406708644
3024	NC_018646	CAA	2	6	136565	136570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406708644
3025	NC_018646	GAA	2	6	136613	136618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708644
3026	NC_018646	TAA	2	6	136621	136626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708644
3027	NC_018646	ATT	2	6	136627	136632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708644
3028	NC_018646	GGA	2	6	136685	136690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406708644
3029	NC_018646	GCA	2	6	136703	136708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406708644
3030	NC_018646	ATC	2	6	136728	136733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406708644
3031	NC_018646	TGA	2	6	136771	136776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708644
3032	NC_018646	ATA	2	6	136827	136832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708644
3033	NC_018646	TAT	2	6	136840	136845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708644
3034	NC_018646	AC	3	6	136850	136855	50 %	0 %	0 %	50 %	406708644
3035	NC_018646	TAG	2	6	136875	136880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708644
3036	NC_018646	CAA	2	6	136997	137002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406708645
3037	NC_018646	A	6	6	137001	137006	100 %	0 %	0 %	0 %	406708645
3038	NC_018646	AAG	2	6	137064	137069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708645
3039	NC_018646	AGA	2	6	137089	137094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708645
3040	NC_018646	ATG	2	6	137120	137125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708645
3041	NC_018646	ATG	2	6	137129	137134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708645
3042	NC_018646	AATT	2	8	137145	137152	50 %	50 %	0 %	0 %	406708645
3043	NC_018646	GCT	2	6	137168	137173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406708645
3044	NC_018646	GAT	2	6	137249	137254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708645
3045	NC_018646	GAG	2	6	137311	137316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406708645
3046	NC_018646	ATT	2	6	137345	137350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708645
3047	NC_018646	AGAA	2	8	137418	137425	75 %	0 %	25 %	0 %	406708645
3048	NC_018646	ACTT	2	8	137442	137449	25 %	50 %	0 %	25 %	406708645
3049	NC_018646	GGT	2	6	137527	137532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406708645
3050	NC_018646	GGGTA	2	10	137604	137613	20 %	20 %	60 %	0 %	406708645
3051	NC_018646	A	6	6	137620	137625	100 %	0 %	0 %	0 %	406708645
3052	NC_018646	CTAAG	2	10	137629	137638	40 %	20 %	20 %	20 %	406708645
3053	NC_018646	GCA	2	6	137727	137732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406708646
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3055	NC_018646	ACT	2	6	137763	137768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406708646
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3057	NC_018646	T	7	7	137800	137806	0 %	100 %	0 %	0 %	406708646
3058	NC_018646	TAGTAT	2	12	137822	137833	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	406708646
3059	NC_018646	TCG	2	6	137939	137944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406708646
3060	NC_018646	TAT	2	6	137958	137963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708646
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3062	NC_018646	TGC	2	6	138080	138085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406708646
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3066	NC_018646	CG	3	6	138214	138219	0 %	0 %	50 %	50 %	406708646
3067	NC_018646	GAT	2	6	138423	138428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708646
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3070	NC_018646	TTA	2	6	138481	138486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708646
3071	NC_018646	ATG	2	6	138517	138522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708646
3072	NC_018646	AT	3	6	138529	138534	50 %	50 %	0 %	0 %	406708646
3073	NC_018646	CAA	2	6	138570	138575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406708646
3074	NC_018646	CAGT	2	8	138644	138651	25 %	25 %	25 %	25 %	406708646
3075	NC_018646	ATT	2	6	138695	138700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708646
3076	NC_018646	TATT	2	8	138735	138742	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_018646	AAAT	2	8	138746	138753	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_018646	AATA	2	8	138791	138798	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_018646	ATA	2	6	138809	138814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_018646	T	6	6	138843	138848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_018646	GAAAA	2	10	138853	138862	80 %	0 %	20 %	0 %	406708647
3082	NC_018646	TGG	2	6	138881	138886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406708647
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3084	NC_018646	CTGT	2	8	138940	138947	0 %	50 %	25 %	25 %	406708647
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3089	NC_018646	AATG	2	8	139395	139402	50 %	25 %	25 %	0 %	406708647
3090	NC_018646	AGA	2	6	139436	139441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708647
3091	NC_018646	AGA	2	6	139466	139471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708647
3092	NC_018646	AT	3	6	139490	139495	50 %	50 %	0 %	0 %	406708647
3093	NC_018646	GATTT	2	10	139557	139566	20 %	60 %	20 %	0 %	406708647
3094	NC_018646	TTAT	2	8	139771	139778	25 %	75 %	0 %	0 %	406708647
3095	NC_018646	TAC	2	6	139853	139858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406708647
3096	NC_018646	AGTTA	2	10	139862	139871	40 %	40 %	20 %	0 %	406708647
3097	NC_018646	TA	3	6	139870	139875	50 %	50 %	0 %	0 %	406708647
3098	NC_018646	ATG	2	6	139921	139926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708647
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3101	NC_018646	ATAA	2	8	140036	140043	75 %	25 %	0 %	0 %	406708647
3102	NC_018646	A	6	6	140063	140068	100 %	0 %	0 %	0 %	406708648
3103	NC_018646	GGT	2	6	140082	140087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406708648
3104	NC_018646	AGT	2	6	140097	140102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708648
3105	NC_018646	ATCA	2	8	140132	140139	50 %	25 %	0 %	25 %	406708648
3106	NC_018646	TATGA	2	10	140163	140172	40 %	40 %	20 %	0 %	406708648
3107	NC_018646	ATT	2	6	140214	140219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708648
3108	NC_018646	AAG	3	9	140224	140232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708648
3109	NC_018646	AG	3	6	140330	140335	50 %	0 %	50 %	0 %	406708648
3110	NC_018646	TTA	2	6	140337	140342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708648
3111	NC_018646	ATG	2	6	140448	140453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708648
3112	NC_018646	ACA	2	6	140537	140542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406708648
3113	NC_018646	CAT	2	6	140565	140570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406708648
3114	NC_018646	AC	3	6	140630	140635	50 %	0 %	0 %	50 %	406708648
3115	NC_018646	GCT	3	9	140655	140663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406708648
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3118	NC_018646	GAA	2	6	140826	140831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708648
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3120	NC_018646	ATC	2	6	140894	140899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406708648
3121	NC_018646	TAT	2	6	140900	140905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708648
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3123	NC_018646	ATTT	2	8	140971	140978	25 %	75 %	0 %	0 %	406708648
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3497	NC_018646	AATA	2	8	158141	158148	75 %	25 %	0 %	0 %	406708668
3498	NC_018646	GCT	2	6	158151	158156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406708668
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3500	NC_018646	ATTG	2	8	158211	158218	25 %	50 %	25 %	0 %	406708668

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