MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus agalactiae GD201008-001 chromosome

Total Repeats: 46207

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1003	NC_018646	GGT	2	6	47028	47033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406708553
1004	NC_018646	ACA	2	6	47152	47157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406708553
1005	NC_018646	ACTA	2	8	47221	47228	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1006	NC_018646	AAT	2	6	47255	47260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_018646	TAA	2	6	47299	47304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_018646	AATGAA	2	12	47326	47337	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	406708554
1009	NC_018646	TAT	2	6	47376	47381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708554
1010	NC_018646	ACG	2	6	47414	47419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406708554
1011	NC_018646	ATC	2	6	47476	47481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406708554
1012	NC_018646	TAA	2	6	47560	47565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708554
1013	NC_018646	TTAT	2	8	47583	47590	25 %	75 %	0 %	0 %	406708554
1014	NC_018646	ACA	2	6	47597	47602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406708554
1015	NC_018646	AGA	2	6	47622	47627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708554
1016	NC_018646	CAA	2	6	47664	47669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406708554
1017	NC_018646	TGC	2	6	47671	47676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406708554
1018	NC_018646	ACA	2	6	47684	47689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406708554
1019	NC_018646	TC	3	6	47741	47746	0 %	50 %	0 %	50 %	406708554
1020	NC_018646	AGC	2	6	47776	47781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406708554
1021	NC_018646	AAC	2	6	47782	47787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406708554
1022	NC_018646	TTC	2	6	47812	47817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406708554
1023	NC_018646	AAG	2	6	47838	47843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708554
1024	NC_018646	AGC	3	9	47872	47880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406708554
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1026	NC_018646	GTCA	4	16	47965	47980	25 %	25 %	25 %	25 %	406708554
1027	NC_018646	ACA	2	6	47981	47986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406708554
1028	NC_018646	AGC	2	6	48055	48060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406708554
1029	NC_018646	AGT	2	6	48082	48087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708554
1030	NC_018646	CAG	2	6	48135	48140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406708554
1031	NC_018646	ACAG	2	8	48167	48174	50 %	0 %	25 %	25 %	406708554
1032	NC_018646	CAA	3	9	48255	48263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406708554
1033	NC_018646	GCA	2	6	48476	48481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406708554
1034	NC_018646	CAA	2	6	48506	48511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406708554
1035	NC_018646	CAAATA	2	12	48522	48533	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	406708554
1036	NC_018646	AATGC	2	10	48560	48569	40 %	20 %	20 %	20 %	406708554
1037	NC_018646	GTG	2	6	48576	48581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406708554
1038	NC_018646	ATA	2	6	48628	48633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708554
1039	NC_018646	A	6	6	48635	48640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_018646	CTT	2	6	48654	48659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_018646	T	6	6	48658	48663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_018646	TTA	2	6	48703	48708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_018646	GAG	2	6	48713	48718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_018646	ACT	2	6	48738	48743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_018646	ATT	2	6	48800	48805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_018646	ATA	2	6	48827	48832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_018646	A	6	6	48855	48860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1056	NC_018646	AG	3	6	49208	49213	50 %	0 %	50 %	0 %	406708555
1057	NC_018646	ATG	2	6	49218	49223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708555
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1060	NC_018646	AAG	3	9	49383	49391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708555
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1062	NC_018646	TGG	2	6	49516	49521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406708555
1063	NC_018646	ATCAAA	2	12	49592	49603	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1064	NC_018646	A	6	6	49606	49611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_018646	A	7	7	49632	49638	100 %	0 %	0 %	0 %	406708556
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1096	NC_018646	TGA	2	6	50864	50869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708556
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1098	NC_018646	AAT	2	6	50935	50940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708556
1099	NC_018646	AGA	2	6	50981	50986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1109	NC_018646	T	6	6	51325	51330	0 %	100 %	0 %	0 %	406708557
1110	NC_018646	TCT	3	9	51352	51360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406708557
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1113	NC_018646	GTCAT	2	10	51454	51463	20 %	40 %	20 %	20 %	406708557
1114	NC_018646	TAT	4	12	51512	51523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708557
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1119	NC_018646	T	6	6	51637	51642	0 %	100 %	0 %	0 %	406708557
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1127	NC_018646	ATG	2	6	51898	51903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708557
1128	NC_018646	AGG	2	6	51913	51918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406708557
1129	NC_018646	TAT	2	6	52049	52054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708558
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1132	NC_018646	A	6	6	52237	52242	100 %	0 %	0 %	0 %	406708558
1133	NC_018646	TGC	2	6	52262	52267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406708558
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1136	NC_018646	TTG	2	6	52363	52368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406708558
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1151	NC_018646	CTA	2	6	52842	52847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406708559
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1153	NC_018646	A	6	6	52962	52967	100 %	0 %	0 %	0 %	406708559
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1157	NC_018646	GA	3	6	53099	53104	50 %	0 %	50 %	0 %	406708559
1158	NC_018646	TA	3	6	53109	53114	50 %	50 %	0 %	0 %	406708559
1159	NC_018646	CTT	2	6	53117	53122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406708559
1160	NC_018646	AGA	2	6	53129	53134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708559
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1163	NC_018646	A	6	6	53233	53238	100 %	0 %	0 %	0 %	406708560
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1168	NC_018646	TGC	2	6	53367	53372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406708560
1169	NC_018646	TA	3	6	53440	53445	50 %	50 %	0 %	0 %	406708560
1170	NC_018646	A	7	7	53454	53460	100 %	0 %	0 %	0 %	406708560
1171	NC_018646	TTC	2	6	53534	53539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406708560
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1173	NC_018646	TGA	2	6	53606	53611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708560
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1175	NC_018646	TAT	2	6	53748	53753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708560
1176	NC_018646	AGTCT	2	10	53759	53768	20 %	40 %	20 %	20 %	406708560
1177	NC_018646	TTAT	2	8	53770	53777	25 %	75 %	0 %	0 %	406708560
1178	NC_018646	TATT	2	8	53795	53802	25 %	75 %	0 %	0 %	406708560
1179	NC_018646	ATT	3	9	53833	53841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708560
1180	NC_018646	ACA	2	6	53871	53876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406708560
1181	NC_018646	ATT	2	6	53916	53921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708561
1182	NC_018646	TGCT	2	8	53933	53940	0 %	50 %	25 %	25 %	406708561
1183	NC_018646	ATG	2	6	53941	53946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708561
1184	NC_018646	ATT	2	6	53989	53994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708561
1185	NC_018646	TCA	2	6	54033	54038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406708561
1186	NC_018646	TAA	2	6	54140	54145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708561
1187	NC_018646	ATGC	2	8	54171	54178	25 %	25 %	25 %	25 %	406708561
1188	NC_018646	GCA	2	6	54204	54209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406708561
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1191	NC_018646	ATT	2	6	54253	54258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708561
1192	NC_018646	AGC	2	6	54275	54280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406708561
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1194	NC_018646	TTC	2	6	54392	54397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406708561
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1197	NC_018646	TGG	2	6	54515	54520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406708561
1198	NC_018646	TTG	2	6	54568	54573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406708561
1199	NC_018646	AACT	2	8	54694	54701	50 %	25 %	0 %	25 %	406708561
1200	NC_018646	AGA	3	9	54737	54745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708561
1201	NC_018646	TAT	2	6	54752	54757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708561
1202	NC_018646	GCA	2	6	54765	54770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406708561
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1209	NC_018646	TGG	2	6	55236	55241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406708562
1210	NC_018646	ATT	2	6	55249	55254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708562
1211	NC_018646	GATGG	2	10	55397	55406	20 %	20 %	60 %	0 %	406708562
1212	NC_018646	CGT	2	6	55408	55413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406708562
1213	NC_018646	AGG	2	6	55421	55426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406708562
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1217	NC_018646	ATT	2	6	55562	55567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708562
1218	NC_018646	A	6	6	55622	55627	100 %	0 %	0 %	0 %	406708562
1219	NC_018646	CAA	2	6	55628	55633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406708562
1220	NC_018646	TAC	2	6	55678	55683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406708562
1221	NC_018646	GA	3	6	55741	55746	50 %	0 %	50 %	0 %	406708563
1222	NC_018646	TGA	2	6	55780	55785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708563
1223	NC_018646	A	6	6	55793	55798	100 %	0 %	0 %	0 %	406708563
1224	NC_018646	A	6	6	55841	55846	100 %	0 %	0 %	0 %	406708563
1225	NC_018646	T	6	6	55959	55964	0 %	100 %	0 %	0 %	406708563
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1231	NC_018646	ATTG	2	8	56185	56192	25 %	50 %	25 %	0 %	406708563
1232	NC_018646	AG	3	6	56209	56214	50 %	0 %	50 %	0 %	406708563
1233	NC_018646	ATG	2	6	56376	56381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708563
1234	NC_018646	AAT	2	6	56429	56434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708563
1235	NC_018646	GTT	2	6	56495	56500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406708563
1236	NC_018646	GAT	2	6	56519	56524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708563
1237	NC_018646	TCC	2	6	56530	56535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406708563
1238	NC_018646	TTA	2	6	56588	56593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708563
1239	NC_018646	A	6	6	56676	56681	100 %	0 %	0 %	0 %	406708563
1240	NC_018646	ATT	2	6	56690	56695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1241	NC_018646	AAT	2	6	56721	56726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708564
1242	NC_018646	TTA	2	6	56758	56763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708564
1243	NC_018646	ATA	2	6	56785	56790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708564
1244	NC_018646	AAT	2	6	56865	56870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708564
1245	NC_018646	TG	3	6	56892	56897	0 %	50 %	50 %	0 %	406708564
1246	NC_018646	GTT	2	6	56900	56905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406708564
1247	NC_018646	ATC	2	6	57048	57053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406708564
1248	NC_018646	CTA	2	6	57107	57112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406708564
1249	NC_018646	TTC	2	6	57186	57191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406708564
1250	NC_018646	AAT	2	6	57195	57200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708564
1251	NC_018646	TTG	2	6	57276	57281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406708564
1252	NC_018646	T	6	6	57345	57350	0 %	100 %	0 %	0 %	406708564
1253	NC_018646	GCT	2	6	57367	57372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406708564
1254	NC_018646	GAA	2	6	57403	57408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708564
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