MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptococcus pneumoniae gamPNI0373 chromosome

Total Repeats: 1551

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018630	AAAAG	2	10	541	550	80 %	0 %	20 %	0 %	410475458
2	NC_018630	GAAAT	2	10	702	711	60 %	20 %	20 %	0 %	410475458
3	NC_018630	AAAAT	2	10	1484	1493	80 %	20 %	0 %	0 %	410475458
4	NC_018630	GTAAA	2	10	2642	2651	60 %	20 %	20 %	0 %	410475459
5	NC_018630	AAAAT	2	10	3029	3038	80 %	20 %	0 %	0 %	410475460
6	NC_018630	TGAAA	2	10	3170	3179	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018630	AAACA	2	10	4431	4440	80 %	0 %	0 %	20 %	410475462
8	NC_018630	TCAAT	2	10	6058	6067	40 %	40 %	0 %	20 %	410475463
9	NC_018630	TTTTC	2	10	6098	6107	0 %	80 %	0 %	20 %	410475463
10	NC_018630	TAAAT	2	10	6616	6625	60 %	40 %	0 %	0 %	410475463
11	NC_018630	ACTCT	2	10	6697	6706	20 %	40 %	0 %	40 %	410475463
12	NC_018630	AAACG	2	10	7940	7949	60 %	0 %	20 %	20 %	410475463
13	NC_018630	TTGGT	2	10	8169	8178	0 %	60 %	40 %	0 %	410475463
14	NC_018630	CAATT	2	10	8238	8247	40 %	40 %	0 %	20 %	410475463
15	NC_018630	AGGAA	2	10	9254	9263	60 %	0 %	40 %	0 %	410475466
16	NC_018630	ATTGA	2	10	10672	10681	40 %	40 %	20 %	0 %	410475468
17	NC_018630	ATTCT	2	10	12805	12814	20 %	60 %	0 %	20 %	410475470
18	NC_018630	TCGTG	2	10	16422	16431	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_018630	GTTAA	2	10	17143	17152	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018630	GGGAG	2	10	17661	17670	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018630	AGGGA	2	10	19872	19881	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018630	TTGAA	2	10	20076	20085	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018630	ATGGT	2	10	23039	23048	20 %	40 %	40 %	0 %	410475477
24	NC_018630	CTTTT	2	10	24207	24216	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_018630	GGTAA	2	10	26023	26032	40 %	20 %	40 %	0 %	410475479
26	NC_018630	AGGAT	2	10	27097	27106	40 %	20 %	40 %	0 %	410475482
27	NC_018630	TTTTA	2	10	27753	27762	20 %	80 %	0 %	0 %	410475484
28	NC_018630	TTTTA	2	10	27986	27995	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018630	TTTTA	2	10	29647	29656	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018630	CTTAT	2	10	32374	32383	20 %	60 %	0 %	20 %	410475497
31	NC_018630	GAAGA	2	10	33889	33898	60 %	0 %	40 %	0 %	410475501
32	NC_018630	TTTAG	2	10	34650	34659	20 %	60 %	20 %	0 %	410475503
33	NC_018630	ATTAC	2	10	35386	35395	40 %	40 %	0 %	20 %	410475504
34	NC_018630	CAGAA	2	10	36573	36582	60 %	0 %	20 %	20 %	410475507
35	NC_018630	TTTTG	2	10	36824	36833	0 %	80 %	20 %	0 %	410475508
36	NC_018630	GAATG	2	10	36913	36922	40 %	20 %	40 %	0 %	410475508
37	NC_018630	GAAAC	2	10	40707	40716	60 %	0 %	20 %	20 %	410475514
38	NC_018630	TCTAA	2	10	41050	41059	40 %	40 %	0 %	20 %	410475514
39	NC_018630	CTCTT	2	10	41671	41680	0 %	60 %	0 %	40 %	410475514
40	NC_018630	TGATT	2	10	41929	41938	20 %	60 %	20 %	0 %	410475515
41	NC_018630	AAATC	2	10	42997	43006	60 %	20 %	0 %	20 %	410475516
42	NC_018630	GGGTG	2	10	44110	44119	0 %	20 %	80 %	0 %	410475518
43	NC_018630	CCTAT	2	10	44431	44440	20 %	40 %	0 %	40 %	410475519
44	NC_018630	ATGAC	2	10	45157	45166	40 %	20 %	20 %	20 %	410475522
45	NC_018630	GGTCA	2	10	49718	49727	20 %	20 %	40 %	20 %	410475525
46	NC_018630	CTAGG	2	10	53838	53847	20 %	20 %	40 %	20 %	410475527
47	NC_018630	CTCAA	2	10	54829	54838	40 %	20 %	0 %	40 %	410475527
48	NC_018630	TTTTG	2	10	59411	59420	0 %	80 %	20 %	0 %	410475535
49	NC_018630	ATTAT	2	10	59552	59561	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018630	TTTTA	2	10	59690	59699	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018630	CTTCC	2	10	65955	65964	0 %	40 %	0 %	60 %	410475542
52	NC_018630	AATCA	2	10	66711	66720	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_018630	AGCAG	2	10	67382	67391	40 %	0 %	40 %	20 %	410475544
54	NC_018630	CAGAT	2	10	76925	76934	40 %	20 %	20 %	20 %	410475556
55	NC_018630	TTTAC	2	10	77627	77636	20 %	60 %	0 %	20 %	410475556
56	NC_018630	AGAGG	2	10	78489	78498	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018630	GTGAC	2	10	81258	81267	20 %	20 %	40 %	20 %	410475559
58	NC_018630	GTGAT	2	10	82248	82257	20 %	40 %	40 %	0 %	410475559
59	NC_018630	GTTTG	2	10	85065	85074	0 %	60 %	40 %	0 %	410475560
60	NC_018630	AAATG	2	10	85674	85683	60 %	20 %	20 %	0 %	410475560
61	NC_018630	AGCTA	2	10	86568	86577	40 %	20 %	20 %	20 %	410475561
62	NC_018630	CCTTG	2	10	89458	89467	0 %	40 %	20 %	40 %	410475564
63	NC_018630	TCAAA	2	10	89652	89661	60 %	20 %	0 %	20 %	410475564
64	NC_018630	AGTGG	2	10	92019	92028	20 %	20 %	60 %	0 %	410475567
65	NC_018630	GGGTG	2	10	92057	92066	0 %	20 %	80 %	0 %	410475567
66	NC_018630	AAGCA	2	10	93215	93224	60 %	0 %	20 %	20 %	410475568
67	NC_018630	GCTTG	2	10	93669	93678	0 %	40 %	40 %	20 %	410475570
68	NC_018630	GCTTT	2	10	95098	95107	0 %	60 %	20 %	20 %	410475571
69	NC_018630	TCTGG	2	10	95704	95713	0 %	40 %	40 %	20 %	410475571
70	NC_018630	AGCAT	2	10	96658	96667	40 %	20 %	20 %	20 %	410475571
71	NC_018630	TACCA	2	10	97356	97365	40 %	20 %	0 %	40 %	410475571
72	NC_018630	TTCCT	2	10	98373	98382	0 %	60 %	0 %	40 %	410475571
73	NC_018630	TTTAT	2	10	98950	98959	20 %	80 %	0 %	0 %	410475571
74	NC_018630	TTGGT	2	10	102326	102335	0 %	60 %	40 %	0 %	410475574
75	NC_018630	CTTCA	2	10	103381	103390	20 %	40 %	0 %	40 %	410475575
76	NC_018630	AATCA	2	10	103493	103502	60 %	20 %	0 %	20 %	410475576
77	NC_018630	ATTCA	2	10	104872	104881	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_018630	AGCTC	2	10	105716	105725	20 %	20 %	20 %	40 %	410475578
79	NC_018630	GCTGT	2	10	110316	110325	0 %	40 %	40 %	20 %	410475585
80	NC_018630	TATCA	2	10	110640	110649	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_018630	TCTAT	2	10	111519	111528	20 %	60 %	0 %	20 %	410475587
82	NC_018630	AGAAA	2	10	112444	112453	80 %	0 %	20 %	0 %	410475587
83	NC_018630	GAAAG	2	10	112496	112505	60 %	0 %	40 %	0 %	410475588
84	NC_018630	GCGGT	2	10	113737	113746	0 %	20 %	60 %	20 %	410475590
85	NC_018630	TGACT	2	10	115491	115500	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_018630	AGGGC	2	10	120747	120756	20 %	0 %	60 %	20 %	410475593
87	NC_018630	ATAAA	2	10	122908	122917	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018630	TAACC	2	10	123006	123015	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_018630	ATTCT	2	10	123181	123190	20 %	60 %	0 %	20 %	410475598
90	NC_018630	TTACT	2	10	126823	126832	20 %	60 %	0 %	20 %	410475601
91	NC_018630	TGGGA	2	10	127477	127486	20 %	20 %	60 %	0 %	410475601
92	NC_018630	TGCTT	2	10	128197	128206	0 %	60 %	20 %	20 %	410475602
93	NC_018630	TGGCT	2	10	128380	128389	0 %	40 %	40 %	20 %	410475602
94	NC_018630	AGATA	2	10	132452	132461	60 %	20 %	20 %	0 %	410475607
95	NC_018630	GTTTG	2	10	132619	132628	0 %	60 %	40 %	0 %	410475607
96	NC_018630	TATTT	2	10	134576	134585	20 %	80 %	0 %	0 %	410475609
97	NC_018630	AAAGC	2	10	137439	137448	60 %	0 %	20 %	20 %	410475612
98	NC_018630	GGCTT	2	10	138863	138872	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_018630	CACAA	2	10	139202	139211	60 %	0 %	0 %	40 %	410475614
100	NC_018630	GGAAT	2	10	140683	140692	40 %	20 %	40 %	0 %	410475616
101	NC_018630	AGGAT	2	10	141248	141257	40 %	20 %	40 %	0 %	410475617
102	NC_018630	CTTTG	2	10	142557	142566	0 %	60 %	20 %	20 %	410475617
103	NC_018630	TCCTC	2	10	142683	142692	0 %	40 %	0 %	60 %	410475617
104	NC_018630	TGACT	2	10	144124	144133	20 %	40 %	20 %	20 %	410475619
105	NC_018630	GCTTT	2	10	147008	147017	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_018630	TATTG	2	10	147045	147054	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018630	ATTTT	2	10	147143	147152	20 %	80 %	0 %	0 %	410475624
108	NC_018630	TTGGA	2	10	147590	147599	20 %	40 %	40 %	0 %	410475624
109	NC_018630	TAAAA	2	10	152867	152876	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018630	AACTA	2	10	155071	155080	60 %	20 %	0 %	20 %	410475635
111	NC_018630	ATTAA	2	10	156312	156321	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018630	CGTGG	2	10	157137	157146	0 %	20 %	60 %	20 %	410475636
113	NC_018630	CCAGG	2	10	157731	157740	20 %	0 %	40 %	40 %	410475636
114	NC_018630	GTGAA	2	10	158139	158148	40 %	20 %	40 %	0 %	410475637
115	NC_018630	AAGCA	2	10	161829	161838	60 %	0 %	20 %	20 %	410475640
116	NC_018630	GTTTG	2	10	163101	163110	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018630	ACATG	2	10	163234	163243	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_018630	GAAAA	2	10	163826	163835	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018630	TGGAC	2	10	164112	164121	20 %	20 %	40 %	20 %	410475644
120	NC_018630	TATAC	2	10	173655	173664	40 %	40 %	0 %	20 %	410475654
121	NC_018630	ATGTT	2	10	176239	176248	20 %	60 %	20 %	0 %	410475658
122	NC_018630	GATCT	2	10	177751	177760	20 %	40 %	20 %	20 %	410475659
123	NC_018630	AGCTG	2	10	177900	177909	20 %	20 %	40 %	20 %	410475659
124	NC_018630	GAAAT	2	10	179650	179659	60 %	20 %	20 %	0 %	410475662
125	NC_018630	TTAGT	2	10	180522	180531	20 %	60 %	20 %	0 %	410475663
126	NC_018630	CTTGC	2	10	180878	180887	0 %	40 %	20 %	40 %	410475663
127	NC_018630	GGCCT	2	10	181787	181796	0 %	20 %	40 %	40 %	410475664
128	NC_018630	AGAAA	2	10	183536	183545	80 %	0 %	20 %	0 %	410475666
129	NC_018630	TATAC	2	10	185497	185506	40 %	40 %	0 %	20 %	410475667
130	NC_018630	AGATC	2	10	185802	185811	40 %	20 %	20 %	20 %	410475668
131	NC_018630	TTTGT	2	10	187811	187820	0 %	80 %	20 %	0 %	410475670
132	NC_018630	ACTAT	2	10	191817	191826	40 %	40 %	0 %	20 %	410475673
133	NC_018630	TGAAA	2	10	193218	193227	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018630	TTGAG	2	10	194397	194406	20 %	40 %	40 %	0 %	410475676
135	NC_018630	GCCTT	2	10	196221	196230	0 %	40 %	20 %	40 %	410475679
136	NC_018630	AAGTA	2	10	199003	199012	60 %	20 %	20 %	0 %	410475682
137	NC_018630	TTGAT	2	10	200162	200171	20 %	60 %	20 %	0 %	410475683
138	NC_018630	TCACT	2	10	200537	200546	20 %	40 %	0 %	40 %	410475684
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