MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae gamPNI0373 chromosome

Total Repeats: 42066

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_018630	A	6	6	192422	192427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_018630	T	6	6	192457	192462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_018630	AAGG	2	8	192623	192630	50 %	0 %	50 %	0 %	410475675
4004	NC_018630	T	6	6	192667	192672	0 %	100 %	0 %	0 %	410475675
4005	NC_018630	ACA	2	6	192728	192733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410475675
4006	NC_018630	TAA	2	6	192811	192816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410475675
4007	NC_018630	TAT	2	6	192922	192927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410475675
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4009	NC_018630	GTT	2	6	193099	193104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_018630	T	6	6	193111	193116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_018630	A	6	6	193142	193147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_018630	TGAAA	2	10	193218	193227	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_018630	AGA	2	6	193289	193294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475676
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4015	NC_018630	AAG	2	6	193346	193351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475676
4016	NC_018630	AAAG	2	8	193398	193405	75 %	0 %	25 %	0 %	410475676
4017	NC_018630	GAA	2	6	193464	193469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475676
4018	NC_018630	GAT	2	6	193488	193493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475676
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4020	NC_018630	GA	3	6	193694	193699	50 %	0 %	50 %	0 %	410475676
4021	NC_018630	AGC	2	6	193713	193718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410475676
4022	NC_018630	AGA	2	6	193769	193774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475676
4023	NC_018630	TCT	2	6	193825	193830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410475676
4024	NC_018630	CATC	2	8	193905	193912	25 %	25 %	0 %	50 %	410475676
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4030	NC_018630	GCTT	2	8	194471	194478	0 %	50 %	25 %	25 %	410475676
4031	NC_018630	TTGA	2	8	194486	194493	25 %	50 %	25 %	0 %	410475676
4032	NC_018630	AAT	2	6	194544	194549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_018630	A	6	6	194574	194579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_018630	A	6	6	194606	194611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_018630	GCA	2	6	194767	194772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_018630	TTTC	2	8	194794	194801	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4037	NC_018630	TTA	2	6	194812	194817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_018630	TTGA	2	8	194847	194854	25 %	50 %	25 %	0 %	410475677
4039	NC_018630	T	6	6	194865	194870	0 %	100 %	0 %	0 %	410475677
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4043	NC_018630	AGCC	2	8	194993	195000	25 %	0 %	25 %	50 %	410475677
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4046	NC_018630	GTG	2	6	195182	195187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410475677
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4048	NC_018630	GA	3	6	195391	195396	50 %	0 %	50 %	0 %	410475678
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4051	NC_018630	TAGA	2	8	195563	195570	50 %	25 %	25 %	0 %	410475678
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4054	NC_018630	TCC	2	6	195681	195686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410475678
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4056	NC_018630	TTA	2	6	195774	195779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_018630	TGG	2	6	195841	195846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_018630	TTCT	2	8	195857	195864	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4059	NC_018630	TAAT	2	8	195885	195892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_018630	ATT	2	6	195936	195941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410475679
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4064	NC_018630	TTCGGA	2	12	196189	196200	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410475679
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4092	NC_018630	CAT	2	6	198449	198454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410475681
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4106	NC_018630	ATA	2	6	199159	199164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410475682
4107	NC_018630	GAT	2	6	199172	199177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475682
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4109	NC_018630	TAG	2	6	199229	199234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475682
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4112	NC_018630	ATC	2	6	199347	199352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410475682
4113	NC_018630	TCA	2	6	199358	199363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410475682
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4120	NC_018630	T	7	7	199476	199482	0 %	100 %	0 %	0 %	410475682
4121	NC_018630	AC	3	6	199543	199548	50 %	0 %	0 %	50 %	410475682
4122	NC_018630	TGT	2	6	199749	199754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410475682
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4124	NC_018630	GTC	2	6	199803	199808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410475682
4125	NC_018630	AACAAG	2	12	199812	199823	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	410475682
4126	NC_018630	CTT	2	6	199850	199855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410475682
4127	NC_018630	ATA	2	6	199911	199916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410475683
4128	NC_018630	TG	3	6	200156	200161	0 %	50 %	50 %	0 %	410475683
4129	NC_018630	TTGAT	2	10	200162	200171	20 %	60 %	20 %	0 %	410475683
4130	NC_018630	ATC	2	6	200185	200190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410475683
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4132	NC_018630	ACG	2	6	200237	200242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410475683
4133	NC_018630	TCAT	2	8	200336	200343	25 %	50 %	0 %	25 %	410475683
4134	NC_018630	TGA	2	6	200363	200368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475683
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4136	NC_018630	TCACT	2	10	200537	200546	20 %	40 %	0 %	40 %	410475684
4137	NC_018630	AT	4	8	200674	200681	50 %	50 %	0 %	0 %	410475684
4138	NC_018630	TCA	2	6	200689	200694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410475684
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4140	NC_018630	T	6	6	200811	200816	0 %	100 %	0 %	0 %	410475684
4141	NC_018630	ATTTT	2	10	200860	200869	20 %	80 %	0 %	0 %	410475684
4142	NC_018630	TCC	2	6	200986	200991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410475684
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4145	NC_018630	GATT	2	8	201112	201119	25 %	50 %	25 %	0 %	410475684
4146	NC_018630	TCCA	2	8	201138	201145	25 %	25 %	0 %	50 %	410475684
4147	NC_018630	TTAAG	2	10	201212	201221	40 %	40 %	20 %	0 %	410475684
4148	NC_018630	ATT	2	6	201258	201263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410475684
4149	NC_018630	ACT	2	6	201325	201330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410475684
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4151	NC_018630	TC	3	6	201456	201461	0 %	50 %	0 %	50 %	410475684
4152	NC_018630	CCA	2	6	201472	201477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410475684
4153	NC_018630	A	6	6	201477	201482	100 %	0 %	0 %	0 %	410475684
4154	NC_018630	AAT	2	6	201522	201527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410475684
4155	NC_018630	GGATTG	2	12	201541	201552	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	410475684
4156	NC_018630	AT	3	6	201595	201600	50 %	50 %	0 %	0 %	410475684
4157	NC_018630	A	7	7	201627	201633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4158	NC_018630	ACT	2	6	201651	201656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4159	NC_018630	TCT	2	6	201753	201758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4160	NC_018630	ACC	2	6	201824	201829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4161	NC_018630	CCCTG	2	10	201844	201853	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4162	NC_018630	GAT	2	6	201874	201879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4163	NC_018630	CTC	2	6	201960	201965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4164	NC_018630	AG	3	6	202003	202008	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4165	NC_018630	TCAGG	2	10	202127	202136	20 %	20 %	40 %	20 %	410475685
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4174	NC_018630	ATG	2	6	202677	202682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475686
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4182	NC_018630	TGA	2	6	203143	203148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475686
4183	NC_018630	ATG	2	6	203182	203187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475686
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4200	NC_018630	TGA	2	6	203941	203946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4201	NC_018630	A	6	6	203969	203974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4202	NC_018630	GTC	2	6	204152	204157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410475688
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4212	NC_018630	TTC	2	6	204553	204558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410475688
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4218	NC_018630	TCC	2	6	205034	205039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4219	NC_018630	AGA	2	6	205098	205103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4220	NC_018630	AGCT	2	8	205186	205193	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4221	NC_018630	A	6	6	205231	205236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4222	NC_018630	TGCACT	2	12	205306	205317	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	410475689
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4231	NC_018630	AATC	2	8	205600	205607	50 %	25 %	0 %	25 %	410475689
4232	NC_018630	AAG	2	6	205634	205639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475689
4233	NC_018630	TGA	2	6	205674	205679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475689
4234	NC_018630	ATC	2	6	205697	205702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410475689
4235	NC_018630	TCA	2	6	205712	205717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410475689
4236	NC_018630	CTC	2	6	205822	205827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410475689
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4238	NC_018630	TTG	2	6	205897	205902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410475689
4239	NC_018630	CTC	2	6	205971	205976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410475689
4240	NC_018630	T	6	6	205986	205991	0 %	100 %	0 %	0 %	410475689
4241	NC_018630	AG	3	6	206003	206008	50 %	0 %	50 %	0 %	410475690
4242	NC_018630	ATG	2	6	206167	206172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475690
4243	NC_018630	GTT	2	6	206181	206186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410475690
4244	NC_018630	GAGG	2	8	206367	206374	25 %	0 %	75 %	0 %	410475690
4245	NC_018630	T	6	6	206393	206398	0 %	100 %	0 %	0 %	410475690
4246	NC_018630	TCAA	2	8	206413	206420	50 %	25 %	0 %	25 %	410475690
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4248	NC_018630	TTGA	2	8	206435	206442	25 %	50 %	25 %	0 %	410475690
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4331	NC_018630	A	8	8	210980	210987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4360	NC_018630	AAAT	2	8	212111	212118	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4363	NC_018630	TAA	2	6	212360	212365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410475695
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4370	NC_018630	AGA	2	6	212708	212713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475696
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4496	NC_018630	AAC	2	6	218642	218647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410475702
4497	NC_018630	GGT	2	6	218673	218678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410475702
4498	NC_018630	GTCTG	2	10	218680	218689	0 %	40 %	40 %	20 %	410475702
4499	NC_018630	CAA	2	6	218719	218724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410475702
4500	NC_018630	AGAA	2	8	218859	218866	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

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