MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus 08BA02176 chromosome

Total Repeats: 1501

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018608	GTTGAA	2	12	3192	3203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404477336
2	NC_018608	ATAAAT	2	12	3293	3304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018608	TTTAAA	2	12	3470	3481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018608	TGGCGG	2	12	5370	5381	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	404477339
5	NC_018608	GTTATC	2	12	7298	7309	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	404477340
6	NC_018608	CAGATA	2	12	8207	8218	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	404477340
7	NC_018608	CAAGCT	2	12	8266	8277	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	404477340
8	NC_018608	GTAATG	2	12	9254	9265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404477340
9	NC_018608	AGATGA	2	12	9657	9668	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	404477340
10	NC_018608	ACAATT	2	12	11257	11268	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	404477342
11	NC_018608	TTAGCA	2	12	11351	11362	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404477342
12	NC_018608	TAAATC	2	12	17165	17176	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_018608	GCTTTA	2	12	17443	17454	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	404477347
14	NC_018608	TTTGAA	2	12	18264	18275	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	404477347
15	NC_018608	TTGGTG	2	12	19108	19119	0 %	50 %	50 %	0 %	404477348
16	NC_018608	TAAAGG	2	12	20311	20322	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	404477349
17	NC_018608	TTGAAG	2	12	20508	20519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404477349
18	NC_018608	TGATTG	2	12	21712	21723	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	404477350
19	NC_018608	TGAAAT	2	12	22043	22054	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	404477350
20	NC_018608	ATTATG	2	12	22188	22199	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018608	AAGGAA	2	12	22482	22493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404477351
22	NC_018608	TGAATT	2	12	25531	25542	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	404477353
23	NC_018608	ATTTCA	2	12	28015	28026	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	404477355
24	NC_018608	GTTCTG	2	12	29314	29325	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	404477356
25	NC_018608	AAAAGA	2	12	33971	33982	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	404477359
26	NC_018608	AAAAAT	2	12	39808	39819	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018608	AATGAA	2	12	41044	41055	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404477367
28	NC_018608	ACAACT	2	12	43109	43120	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	404477368
29	NC_018608	TTAAAC	2	12	43848	43859	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	404477370
30	NC_018608	CATAAC	2	12	44190	44201	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	404477371
31	NC_018608	AATTTA	2	12	45624	45635	50 %	50 %	0 %	0 %	404477373
32	NC_018608	GTAGTG	2	12	45667	45678	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	404477373
33	NC_018608	TAAAAA	2	12	46180	46191	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	404477374
34	NC_018608	AAATTA	2	12	46373	46384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404477374
35	NC_018608	AAAATT	2	12	46762	46773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404477374
36	NC_018608	TGAAGA	2	12	54382	54393	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	404477382
37	NC_018608	AAAATA	2	12	54490	54501	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	404477382
38	NC_018608	ATTAAA	2	12	59096	59107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404477386
39	NC_018608	AAAATT	2	12	60630	60641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404477388
40	NC_018608	ATGAAA	2	12	61463	61474	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404477389
41	NC_018608	TGTAGA	2	12	62762	62773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404477390
42	NC_018608	TATAAA	2	12	64145	64156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404477391
43	NC_018608	ATAAAA	2	12	64338	64349	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	404477391
44	NC_018608	TTAATG	2	12	67407	67418	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	404477393
45	NC_018608	TAAAAA	2	12	69524	69535	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	404477395
46	NC_018608	TGATTT	2	12	70686	70697	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	404477397
47	NC_018608	ATGATT	2	12	71331	71342	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018608	ATTTAA	2	12	71584	71595	50 %	50 %	0 %	0 %	404477398
49	NC_018608	CAGTTA	2	12	73858	73869	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404477401
50	NC_018608	GGGCTT	2	12	75205	75216	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	404477403
51	NC_018608	TAATTC	2	12	78139	78150	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_018608	ACCCTT	2	12	80630	80641	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	404477410
53	NC_018608	TTTAGC	2	12	85755	85766	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	404477416
54	NC_018608	AAATAA	2	12	85806	85817	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	404477416
55	NC_018608	TACAAG	2	12	90286	90297	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	404477421
56	NC_018608	GCTAAA	2	12	90351	90362	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	404477421
57	NC_018608	AACAAA	2	12	90772	90783	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_018608	GTAGAA	2	12	94203	94214	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	404477424
59	NC_018608	AACCAC	2	12	95038	95049	50 %	0 %	0 %	50 %	404477424
60	NC_018608	AATATA	2	12	96740	96751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018608	AACCGA	2	12	98351	98362	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	404477426
62	NC_018608	CATTAC	2	12	100052	100063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404477427
63	NC_018608	TATCAT	2	12	101623	101634	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	404477428
64	NC_018608	TTTATT	2	12	102031	102042	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	404477429
65	NC_018608	TATTTG	2	12	102117	102128	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	404477429
66	NC_018608	TAAATA	2	12	103550	103561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404477429
67	NC_018608	TTTTTC	2	12	105370	105381	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	404477431
68	NC_018608	ATCGCA	2	12	108446	108457	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	404477434
69	NC_018608	TTTGAA	2	12	109477	109488	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	404477435
70	NC_018608	GGCAAT	2	12	118433	118444	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	404477441
71	NC_018608	TGAAGA	2	12	119269	119280	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	404477442
72	NC_018608	TTTCAT	2	12	119950	119961	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	404477443
73	NC_018608	AGAATG	2	12	121919	121930	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	404477446
74	NC_018608	TTGAAA	2	12	121937	121948	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	404477446
75	NC_018608	TGTTTA	2	12	124647	124658	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	404477449
76	NC_018608	TCGAAA	2	12	126145	126156	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	404477451
77	NC_018608	CATATG	2	12	129934	129945	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404477454
78	NC_018608	CAGATT	2	12	135577	135588	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404477459
79	NC_018608	AGATAT	2	12	142976	142987	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	404477466
80	NC_018608	GTTTTT	2	12	143885	143896	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018608	TGAAAG	2	12	144755	144766	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	404477467
82	NC_018608	GATATG	2	12	152258	152269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404477473
83	NC_018608	ATTTGA	2	12	156164	156175	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	404477476
84	NC_018608	GATTTT	2	12	160675	160686	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	404477481
85	NC_018608	AAAGCT	2	12	162680	162691	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	404477483
86	NC_018608	ACAAAG	2	12	165195	165206	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	404477485
87	NC_018608	TGTAAT	2	12	166218	166229	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	404477486
88	NC_018608	AAAGAT	2	12	167207	167218	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404477488
89	NC_018608	CAATAT	2	12	169678	169689	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	404477490
90	NC_018608	AATTAG	2	12	172406	172417	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	404477494
91	NC_018608	TTGGTA	2	12	173533	173544	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	404477495
92	NC_018608	GCGATT	2	12	173553	173564	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	404477495
93	NC_018608	AAATTT	2	12	173651	173662	50 %	50 %	0 %	0 %	404477495
94	NC_018608	ACCTGC	2	12	176553	176564	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	404477498
95	NC_018608	AAGATA	2	12	176699	176710	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404477498
96	NC_018608	CTATTA	2	12	181483	181494	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	404477500
97	NC_018608	TATGAT	2	12	183017	183028	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	404477500
98	NC_018608	ATTGAA	2	12	183468	183479	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	404477500
99	NC_018608	AGCAAC	2	12	189419	189430	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	404477504
100	NC_018608	CGGGTG	2	12	190608	190619	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	404477505
101	NC_018608	CACCTT	2	12	191471	191482	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	404477506
102	NC_018608	CCTTTA	2	12	191977	191988	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	404477506
103	NC_018608	TTTATA	2	12	192074	192085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018608	ATTAAT	2	12	192097	192108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018608	TTATAT	2	12	192371	192382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018608	ATTTCA	2	12	197667	197678	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	404477511
107	NC_018608	GTAAAT	2	12	197698	197709	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	404477511
108	NC_018608	ATTTTA	2	12	199292	199303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404477513
109	NC_018608	TATCTT	2	12	203906	203917	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	404477516
110	NC_018608	ATTTGG	2	12	204919	204930	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	404477517
111	NC_018608	GAGTTT	2	12	208830	208841	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	404477519
112	NC_018608	CCCTGA	2	12	211340	211351	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	404477522
113	NC_018608	TCCTGA	2	12	212159	212170	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	404477522
114	NC_018608	TCAATT	2	12	214310	214321	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	404477523
115	NC_018608	AATATG	2	12	215610	215621	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	404477524
116	NC_018608	AAAAAT	2	12	219117	219128	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	404477526
117	NC_018608	AGGACA	2	12	220978	220989	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	404477528
118	NC_018608	ACATTT	2	12	221314	221325	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	404477528
119	NC_018608	TTCTTG	2	12	226244	226255	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	404477532
120	NC_018608	GGACGT	2	12	236942	236953	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	404477541
121	NC_018608	ATATGA	2	12	239679	239690	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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123	NC_018608	AAAACT	2	12	243127	243138	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	404477546
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126	NC_018608	ATTTTT	2	12	259119	259130	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018608	TGGTAT	2	12	266813	266824	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	404477564
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238	NC_018608	TGATTT	2	12	506414	506425	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	404477833
239	NC_018608	CGATTT	2	12	506771	506782	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	404477834
240	NC_018608	ATGTTG	2	12	507059	507070	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	404477834
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242	NC_018608	AAAATG	2	12	510584	510595	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
243	NC_018608	ATAGTC	2	12	516157	516168	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
244	NC_018608	TGATAT	2	12	518228	518239	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	404477844
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350	NC_018608	GACTCA	2	12	653635	653646	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	404477951
351	NC_018608	TCAGAT	2	12	653656	653667	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404477951
352	NC_018608	GATTCA	2	12	653671	653682	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404477951
353	NC_018608	GATTCA	2	12	653725	653736	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404477951
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