MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptococcus pneumoniae SPNA45

Total Repeats: 1618

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018594	AAAAG	2	10	530	539	80 %	0 %	20 %	0 %	405759924
2	NC_018594	GAAAT	2	10	691	700	60 %	20 %	20 %	0 %	405759924
3	NC_018594	AAAAT	2	10	1473	1482	80 %	20 %	0 %	0 %	405759924
4	NC_018594	GTAAA	2	10	2640	2649	60 %	20 %	20 %	0 %	405759925
5	NC_018594	AAAAT	2	10	3027	3036	80 %	20 %	0 %	0 %	405759926
6	NC_018594	TGAAA	2	10	3168	3177	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018594	GAATT	2	10	5524	5533	40 %	40 %	20 %	0 %	405759929
8	NC_018594	TCAAT	2	10	6056	6065	40 %	40 %	0 %	20 %	405759929
9	NC_018594	TTTTC	2	10	6096	6105	0 %	80 %	0 %	20 %	405759929
10	NC_018594	TAAAT	2	10	6614	6623	60 %	40 %	0 %	0 %	405759929
11	NC_018594	ACTCT	2	10	6695	6704	20 %	40 %	0 %	40 %	405759929
12	NC_018594	AAACG	2	10	7938	7947	60 %	0 %	20 %	20 %	405759929
13	NC_018594	TTGGT	2	10	8173	8182	0 %	60 %	40 %	0 %	405759929
14	NC_018594	CAATT	2	10	8242	8251	40 %	40 %	0 %	20 %	405759929
15	NC_018594	AGGAA	2	10	9268	9277	60 %	0 %	40 %	0 %	405759932
16	NC_018594	ATTGA	2	10	10686	10695	40 %	40 %	20 %	0 %	405759934
17	NC_018594	ATTCT	2	10	12819	12828	20 %	60 %	0 %	20 %	405759936
18	NC_018594	ATGCT	2	10	14047	14056	20 %	40 %	20 %	20 %	405759936
19	NC_018594	TCGTG	2	10	16433	16442	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_018594	GTTAA	2	10	17154	17163	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018594	GGGAG	2	10	17672	17681	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018594	AGGGA	2	10	19883	19892	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018594	ATGGT	2	10	23052	23061	20 %	40 %	40 %	0 %	405759938
24	NC_018594	CTTTT	2	10	24220	24229	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_018594	CTATC	2	10	25715	25724	20 %	40 %	0 %	40 %	405759940
26	NC_018594	TATTT	2	10	27806	27815	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018594	TTATA	2	10	29054	29063	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018594	CTTAT	2	10	32763	32772	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_018594	GAAGA	2	10	34636	34645	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018594	CAGAA	2	10	35465	35474	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_018594	TTTTG	2	10	35715	35724	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018594	GAATG	2	10	35804	35813	40 %	20 %	40 %	0 %	405759957
33	NC_018594	GAAAC	2	10	39598	39607	60 %	0 %	20 %	20 %	405759963
34	NC_018594	TCTAA	2	10	39941	39950	40 %	40 %	0 %	20 %	405759963
35	NC_018594	CTCTT	2	10	40562	40571	0 %	60 %	0 %	40 %	405759963
36	NC_018594	TGATT	2	10	40820	40829	20 %	60 %	20 %	0 %	405759964
37	NC_018594	AGTTG	2	10	41386	41395	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018594	TTGAT	2	10	41736	41745	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018594	GGGTG	2	10	42973	42982	0 %	20 %	80 %	0 %	405759965
40	NC_018594	CCTAT	2	10	43294	43303	20 %	40 %	0 %	40 %	405759966
41	NC_018594	ATGAC	2	10	44032	44041	40 %	20 %	20 %	20 %	405759968
42	NC_018594	ACGTC	2	10	44402	44411	20 %	20 %	20 %	40 %	405759969
43	NC_018594	AGCTG	2	10	46784	46793	20 %	20 %	40 %	20 %	405759971
44	NC_018594	GGTCA	2	10	48593	48602	20 %	20 %	40 %	20 %	405759972
45	NC_018594	CTCAA	2	10	54697	54706	40 %	20 %	0 %	40 %	405759973
46	NC_018594	ATTTT	2	10	59427	59436	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018594	AGAGG	2	10	61615	61624	40 %	0 %	60 %	0 %	405759982
48	NC_018594	TTTGG	2	10	71689	71698	0 %	60 %	40 %	0 %	405759987
49	NC_018594	GAATT	2	10	73619	73628	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018594	GTTTT	2	10	74649	74658	0 %	80 %	20 %	0 %	405759990
51	NC_018594	ACTTC	2	10	76306	76315	20 %	40 %	0 %	40 %	405759991
52	NC_018594	GTAAA	2	10	76732	76741	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018594	AAGAT	2	10	79888	79897	60 %	20 %	20 %	0 %	405759995
54	NC_018594	AGGGA	2	10	79961	79970	40 %	0 %	60 %	0 %	405759995
55	NC_018594	ATTAC	2	10	83709	83718	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_018594	TGACA	2	10	84431	84440	40 %	20 %	20 %	20 %	405760000
57	NC_018594	ATACT	2	10	86909	86918	40 %	40 %	0 %	20 %	405760004
58	NC_018594	TGGTT	2	10	89557	89566	0 %	60 %	40 %	0 %	405760006
59	NC_018594	AAAAG	2	10	90259	90268	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018594	TACTC	2	10	91918	91927	20 %	40 %	0 %	40 %	405760012
61	NC_018594	TTGGT	2	10	92036	92045	0 %	60 %	40 %	0 %	405760012
62	NC_018594	GGTCT	2	10	92366	92375	0 %	40 %	40 %	20 %	405760012
63	NC_018594	GCTTG	2	10	94221	94230	0 %	40 %	40 %	20 %	405760014
64	NC_018594	TGGTT	2	10	94973	94982	0 %	60 %	40 %	0 %	405760015
65	NC_018594	AAGGA	2	10	99384	99393	60 %	0 %	40 %	0 %	405760020
66	NC_018594	GATTT	2	10	100275	100284	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018594	TTGAT	2	10	101700	101709	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018594	TCTCT	2	10	102150	102159	0 %	60 %	0 %	40 %	405760022
69	NC_018594	CTTGA	2	10	103574	103583	20 %	40 %	20 %	20 %	405760022
70	NC_018594	ACTTT	2	10	104161	104170	20 %	60 %	0 %	20 %	405760023
71	NC_018594	GATAA	2	10	106894	106903	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018594	TCGAA	2	10	107803	107812	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_018594	AGAGG	2	10	108242	108251	40 %	0 %	60 %	0 %	405760025
74	NC_018594	AGAGA	2	10	109694	109703	60 %	0 %	40 %	0 %	405760027
75	NC_018594	GAAAT	2	10	110103	110112	60 %	20 %	20 %	0 %	405760027
76	NC_018594	GGGCT	2	10	110388	110397	0 %	20 %	60 %	20 %	405760027
77	NC_018594	AAGCT	2	10	111569	111578	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_018594	GGACG	2	10	114779	114788	20 %	0 %	60 %	20 %	405760029
79	NC_018594	GATTG	2	10	116385	116394	20 %	40 %	40 %	0 %	405760029
80	NC_018594	GCTTT	2	10	116593	116602	0 %	60 %	20 %	20 %	405760029
81	NC_018594	TAGTG	2	10	116609	116618	20 %	40 %	40 %	0 %	405760029
82	NC_018594	GAAAA	2	10	118172	118181	80 %	0 %	20 %	0 %	405760031
83	NC_018594	ATGAA	2	10	120057	120066	60 %	20 %	20 %	0 %	405760032
84	NC_018594	GGATA	2	10	120411	120420	40 %	20 %	40 %	0 %	405760032
85	NC_018594	TTTTA	2	10	121286	121295	20 %	80 %	0 %	0 %	405760035
86	NC_018594	ATTTC	2	10	121495	121504	20 %	60 %	0 %	20 %	405760035
87	NC_018594	ATGAA	2	10	121888	121897	60 %	20 %	20 %	0 %	405760035
88	NC_018594	CTTTC	2	10	124331	124340	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_018594	CTCTT	2	10	124463	124472	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
90	NC_018594	AAAGG	2	10	124724	124733	60 %	0 %	40 %	0 %	405760038
91	NC_018594	TGGCA	2	10	126175	126184	20 %	20 %	40 %	20 %	405760040
92	NC_018594	AACCA	2	10	132878	132887	60 %	0 %	0 %	40 %	405760046
93	NC_018594	GCAGA	2	10	134869	134878	40 %	0 %	40 %	20 %	405760048
94	NC_018594	ATCCT	2	10	137045	137054	20 %	40 %	0 %	40 %	405760048
95	NC_018594	ACCTT	2	10	137727	137736	20 %	40 %	0 %	40 %	405760049
96	NC_018594	GGGAA	2	10	138558	138567	40 %	0 %	60 %	0 %	405760049
97	NC_018594	CTGAC	2	10	139349	139358	20 %	20 %	20 %	40 %	405760050
98	NC_018594	TCCAG	2	10	139374	139383	20 %	20 %	20 %	40 %	405760050
99	NC_018594	ATATA	2	10	139732	139741	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018594	CAGAT	2	10	141402	141411	40 %	20 %	20 %	20 %	405760051
101	NC_018594	TGATA	2	10	141616	141625	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018594	ATATA	2	10	143942	143951	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018594	TATAA	2	10	145813	145822	60 %	40 %	0 %	0 %	405760055
104	NC_018594	TCGTG	2	10	147417	147426	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
105	NC_018594	GTTAA	2	10	148138	148147	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018594	GGGAG	2	10	148656	148665	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018594	AGGGA	2	10	150867	150876	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018594	AATAA	2	10	152445	152454	80 %	20 %	0 %	0 %	405760056
109	NC_018594	ATTTC	2	10	152737	152746	20 %	60 %	0 %	20 %	405760056
110	NC_018594	TAGTT	2	10	153532	153541	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018594	AAGAA	2	10	155894	155903	80 %	0 %	20 %	0 %	405760061
112	NC_018594	CCGCT	2	10	156264	156273	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
113	NC_018594	TCTCT	2	10	157469	157478	0 %	60 %	0 %	40 %	405760063
114	NC_018594	TTTTA	2	10	159426	159435	20 %	80 %	0 %	0 %	405760064
115	NC_018594	GATTT	2	10	160199	160208	20 %	60 %	20 %	0 %	405760065
116	NC_018594	AGCTT	2	10	160616	160625	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_018594	ATCTA	2	10	160885	160894	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_018594	GTATA	2	10	161071	161080	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018594	GTATA	2	10	161849	161858	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018594	TATTT	2	10	162197	162206	20 %	80 %	0 %	0 %	405760068
121	NC_018594	AATCA	2	10	162316	162325	60 %	20 %	0 %	20 %	405760068
122	NC_018594	ATTGC	2	10	164886	164895	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_018594	GCAGT	2	10	167486	167495	20 %	20 %	40 %	20 %	405760071
124	NC_018594	AGAAA	2	10	169731	169740	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018594	CAACT	2	10	171644	171653	40 %	20 %	0 %	40 %	405760074
126	NC_018594	AGGAA	2	10	176996	177005	60 %	0 %	40 %	0 %	405760078
127	NC_018594	CTTTC	2	10	181017	181026	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
128	NC_018594	AATAT	2	10	181595	181604	60 %	40 %	0 %	0 %	405760086
129	NC_018594	TGGGA	2	10	183530	183539	20 %	20 %	60 %	0 %	405760087
130	NC_018594	TGGTT	2	10	185225	185234	0 %	60 %	40 %	0 %	405760088
131	NC_018594	GAGTT	2	10	185510	185519	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018594	ATAAG	2	10	187753	187762	60 %	20 %	20 %	0 %	405760092
133	NC_018594	TCCTT	2	10	189695	189704	0 %	60 %	0 %	40 %	405760093
134	NC_018594	GGATT	2	10	190803	190812	20 %	40 %	40 %	0 %	405760095
135	NC_018594	AACAA	2	10	194344	194353	80 %	0 %	0 %	20 %	405760099
136	NC_018594	ATCCT	2	10	194715	194724	20 %	40 %	0 %	40 %	405760099
137	NC_018594	TGGCT	2	10	195652	195661	0 %	40 %	40 %	20 %	405760100
138	NC_018594	TATAA	2	10	196125	196134	60 %	40 %	0 %	0 %	405760100
139	NC_018594	TGAAG	2	10	196959	196968	40 %	20 %	40 %	0 %	405760101
140	NC_018594	TCAAG	2	10	197308	197317	40 %	20 %	20 %	20 %	405760101
141	NC_018594	ATTAT	2	10	198914	198923	40 %	60 %	0 %	0 %	405760103
142	NC_018594	AAGAT	2	10	198980	198989	60 %	20 %	20 %	0 %	405760103
143	NC_018594	AAGAA	2	10	199671	199680	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018594	ATTCA	2	10	201263	201272	40 %	40 %	0 %	20 %	405760105
145	NC_018594	CCATG	2	10	201321	201330	20 %	20 %	20 %	40 %	405760105
146	NC_018594	TAGAA	2	10	202625	202634	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018594	TTTAA	2	10	202751	202760	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018594	TAGTA	2	10	203098	203107	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018594	AAAAG	2	10	203218	203227	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018594	CCTTT	2	10	206113	206122	0 %	60 %	0 %	40 %	405760109
151	NC_018594	ATTTC	2	10	208307	208316	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
152	NC_018594	CCAAA	2	10	209189	209198	60 %	0 %	0 %	40 %	405760113
153	NC_018594	TCCCA	2	10	209391	209400	20 %	20 %	0 %	60 %	405760113
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158	NC_018594	TCGTG	2	10	220497	220506	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
159	NC_018594	GTTAA	2	10	221218	221227	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_018594	AGGGA	2	10	223947	223956	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
162	NC_018594	AAGCT	2	10	225175	225184	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
163	NC_018594	TCTTT	2	10	227947	227956	0 %	80 %	0 %	20 %	405760124
164	NC_018594	GCTTT	2	10	230125	230134	0 %	60 %	20 %	20 %	405760126
165	NC_018594	CCTGT	2	10	232575	232584	0 %	40 %	20 %	40 %	405760130
166	NC_018594	ATAAA	2	10	235568	235577	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_018594	ATGTG	2	10	235902	235911	20 %	40 %	40 %	0 %	405760133
168	NC_018594	TTTTA	2	10	237748	237757	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_018594	ATTCT	2	10	238752	238761	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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179	NC_018594	GTCAT	2	10	249736	249745	20 %	40 %	20 %	20 %	405760145
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186	NC_018594	CTTCT	2	10	255813	255822	0 %	60 %	0 %	40 %	405760152
187	NC_018594	TCGCC	2	10	256019	256028	0 %	20 %	20 %	60 %	405760152
188	NC_018594	TCTTT	2	10	256199	256208	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
189	NC_018594	CTTGG	2	10	262564	262573	0 %	40 %	40 %	20 %	405760161
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192	NC_018594	TAGAA	2	10	267921	267930	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
193	NC_018594	TAAAA	2	10	271695	271704	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_018594	TCCCA	2	10	273539	273548	20 %	20 %	0 %	60 %	405760166
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196	NC_018594	CTTTT	2	10	275219	275228	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
197	NC_018594	GAAAA	2	10	275426	275435	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
198	NC_018594	TGCTA	2	10	277044	277053	20 %	40 %	20 %	20 %	405760168
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203	NC_018594	ATATT	2	10	285208	285217	40 %	60 %	0 %	0 %	405760175
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212	NC_018594	TCCAT	2	10	299193	299202	20 %	40 %	0 %	40 %	405760195
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228	NC_018594	AAGGA	2	10	324256	324265	60 %	0 %	40 %	0 %	405760236
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232	NC_018594	TGAAA	2	10	336656	336665	60 %	20 %	20 %	0 %	405760246
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234	NC_018594	TCGTG	2	10	342278	342287	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
235	NC_018594	GTTAA	2	10	342999	343008	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
236	NC_018594	GGGAG	2	10	343517	343526	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
237	NC_018594	AGGGA	2	10	345728	345737	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
238	NC_018594	TTCTT	2	10	350104	350113	0 %	80 %	0 %	20 %	405760252
239	NC_018594	GTAAT	2	10	350795	350804	40 %	40 %	20 %	0 %	405760252
240	NC_018594	TTTAG	2	10	351222	351231	20 %	60 %	20 %	0 %	405760253
241	NC_018594	TTATC	2	10	353140	353149	20 %	60 %	0 %	20 %	405760253
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244	NC_018594	TGTCT	2	10	355610	355619	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
245	NC_018594	AAAAG	2	10	355680	355689	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
246	NC_018594	ATTTA	2	10	356913	356922	40 %	60 %	0 %	0 %	405760256
247	NC_018594	TGATT	2	10	357088	357097	20 %	60 %	20 %	0 %	405760256
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249	NC_018594	TAATT	2	10	361428	361437	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
250	NC_018594	CTATT	2	10	362252	362261	20 %	60 %	0 %	20 %	405760259
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254	NC_018594	GTCTT	2	10	365128	365137	0 %	60 %	20 %	20 %	405760260
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259	NC_018594	GAGAA	2	10	371228	371237	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
260	NC_018594	ATCAA	2	10	372213	372222	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
261	NC_018594	CCAAG	2	10	373867	373876	40 %	0 %	20 %	40 %	405760266
262	NC_018594	GCAAA	2	10	378475	378484	60 %	0 %	20 %	20 %	405760270
263	NC_018594	ATTAA	2	10	380188	380197	60 %	40 %	0 %	0 %	405760274
264	NC_018594	AATCA	2	10	383277	383286	60 %	20 %	0 %	20 %	405760278
265	NC_018594	GAGAG	2	10	384357	384366	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
266	NC_018594	GGATA	2	10	385541	385550	40 %	20 %	40 %	0 %	405760281
267	NC_018594	GTTTG	2	10	385594	385603	0 %	60 %	40 %	0 %	405760281
268	NC_018594	CCTTT	2	10	385991	386000	0 %	60 %	0 %	40 %	405760281
269	NC_018594	TTGAT	2	10	388956	388965	20 %	60 %	20 %	0 %	405760283
270	NC_018594	AGTGA	2	10	389421	389430	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
271	NC_018594	TAATT	2	10	391930	391939	40 %	60 %	0 %	0 %	405760287
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273	NC_018594	AAGAG	2	10	396403	396412	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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403	NC_018594	AAATC	2	10	562515	562524	60 %	20 %	0 %	20 %	405760455
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