MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Streptococcus suis S735 chromosome

Total Repeats: 25969

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018526	AAC	2	6	11	16	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403060704
2	NC_018526	TAC	2	6	267	272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060704
3	NC_018526	AAG	2	6	279	284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060704
4	NC_018526	CTC	2	6	323	328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403060704
5	NC_018526	AAT	2	6	400	405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403060704
6	NC_018526	ATT	2	6	465	470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060704
7	NC_018526	TGG	2	6	477	482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403060704
8	NC_018526	TCA	2	6	581	586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060704
9	NC_018526	TGA	2	6	666	671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060704
10	NC_018526	TAA	2	6	687	692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403060704
11	NC_018526	CAA	2	6	695	700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403060704
12	NC_018526	GAA	2	6	706	711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060704
13	NC_018526	GAA	2	6	799	804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060704
14	NC_018526	TGC	2	6	1041	1046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060704
15	NC_018526	CTC	2	6	1312	1317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403060704
16	NC_018526	GAT	2	6	1321	1326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060704
17	NC_018526	TCA	2	6	1454	1459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018526	ACT	2	6	1482	1487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018526	ATA	2	6	1507	1512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018526	TAA	2	6	1545	1550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403060705
21	NC_018526	TTA	2	6	1772	1777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060705
22	NC_018526	AAG	2	6	1880	1885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060705
23	NC_018526	GTC	2	6	2000	2005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060705
24	NC_018526	TGA	2	6	2115	2120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060705
25	NC_018526	TGT	2	6	2127	2132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060705
26	NC_018526	GAT	2	6	2176	2181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060705
27	NC_018526	TCT	2	6	2198	2203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403060705
28	NC_018526	AAT	2	6	2209	2214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403060705
29	NC_018526	TTA	2	6	2257	2262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060705
30	NC_018526	AAC	2	6	2310	2315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403060705
31	NC_018526	TCT	2	6	2364	2369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403060705
32	NC_018526	TAA	2	6	2412	2417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403060705
33	NC_018526	TGT	2	6	2418	2423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060705
34	NC_018526	TCT	2	6	2581	2586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403060705
35	NC_018526	AAT	2	6	2611	2616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403060705
36	NC_018526	ATA	2	6	2665	2670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018526	CTG	2	6	2799	2804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060706
38	NC_018526	AGT	2	6	2921	2926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060706
39	NC_018526	TTA	2	6	3007	3012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060706
40	NC_018526	ATT	2	6	3265	3270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060706
41	NC_018526	TGA	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060706
42	NC_018526	TGG	2	6	3367	3372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403060706
43	NC_018526	TTA	2	6	3476	3481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060706
44	NC_018526	TCT	2	6	3497	3502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403060706
45	NC_018526	ATT	3	9	3556	3564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060706
46	NC_018526	AGG	2	6	3637	3642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403060706
47	NC_018526	TCA	2	6	3696	3701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060707
48	NC_018526	TAA	2	6	3721	3726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403060707
49	NC_018526	ATG	2	6	3791	3796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060707
50	NC_018526	ACT	2	6	3864	3869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_018526	GAG	2	6	3939	3944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018526	TGG	2	6	4171	4176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403060708
53	NC_018526	AAC	2	6	4177	4182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403060708
54	NC_018526	GAA	2	6	4215	4220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060708
55	NC_018526	TGT	2	6	4247	4252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060708
56	NC_018526	ATT	2	6	4289	4294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060708
57	NC_018526	ATT	2	6	4303	4308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060708
58	NC_018526	CAG	2	6	4409	4414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403060709
59	NC_018526	TCG	2	6	4418	4423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060709
60	NC_018526	TCA	2	6	4568	4573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060709
61	NC_018526	CAA	2	6	4830	4835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403060709
62	NC_018526	AGA	2	6	4929	4934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060709
63	NC_018526	GAA	2	6	4969	4974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060709
64	NC_018526	TGA	2	6	5037	5042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060709
65	NC_018526	GCA	2	6	5098	5103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403060709
66	NC_018526	GTG	3	9	5119	5127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403060709
67	NC_018526	GAA	3	9	5143	5151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060709
68	NC_018526	CGA	2	6	5163	5168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403060709
69	NC_018526	CAG	2	6	5273	5278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403060709
70	NC_018526	AGG	2	6	5285	5290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403060709
71	NC_018526	CTC	2	6	5324	5329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403060709
72	NC_018526	GAT	2	6	5395	5400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060709
73	NC_018526	AAG	2	6	5432	5437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060709
74	NC_018526	GAA	2	6	5452	5457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060709
75	NC_018526	CAT	2	6	5487	5492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060709
76	NC_018526	TTC	2	6	5532	5537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_018526	GTT	2	6	5538	5543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018526	GAT	2	6	5617	5622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018526	TGC	2	6	5745	5750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060710
80	NC_018526	TTA	2	6	5908	5913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060710
81	NC_018526	TAG	2	6	5937	5942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060710
82	NC_018526	GAC	2	6	5948	5953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403060710
83	NC_018526	TGG	2	6	6001	6006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403060710
84	NC_018526	GAA	2	6	6197	6202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060710
85	NC_018526	GAT	2	6	6203	6208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060710
86	NC_018526	TTA	3	9	6319	6327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060711
87	NC_018526	ATG	2	6	6416	6421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060711
88	NC_018526	ATT	2	6	6451	6456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060711
89	NC_018526	GAT	2	6	6487	6492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060711
90	NC_018526	AGA	2	6	6936	6941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060711
91	NC_018526	TAG	2	6	6945	6950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060711
92	NC_018526	TTG	2	6	7102	7107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060711
93	NC_018526	GAT	2	6	7141	7146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060711
94	NC_018526	TTG	2	6	7198	7203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060711
95	NC_018526	GAT	2	6	7207	7212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060711
96	NC_018526	CTT	2	6	7293	7298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403060711
97	NC_018526	CCA	2	6	7380	7385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403060711
98	NC_018526	GTT	2	6	7438	7443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060711
99	NC_018526	GCA	2	6	7522	7527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403060711
100	NC_018526	TAG	2	6	7535	7540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060711
101	NC_018526	TCA	2	6	7610	7615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060711
102	NC_018526	TGT	2	6	7722	7727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060711
103	NC_018526	ATT	2	6	7796	7801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060711
104	NC_018526	TCT	2	6	7857	7862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403060711
105	NC_018526	TAA	2	6	7902	7907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403060711
106	NC_018526	GGA	2	6	7959	7964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403060711
107	NC_018526	GAT	2	6	7972	7977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060711
108	NC_018526	TGA	3	9	8031	8039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060711
109	NC_018526	ACT	2	6	8060	8065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060711
110	NC_018526	TGA	2	6	8103	8108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060711
111	NC_018526	TAG	2	6	8153	8158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060711
112	NC_018526	ATG	2	6	8216	8221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060711
113	NC_018526	TGT	2	6	8427	8432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060711
114	NC_018526	CTA	2	6	8783	8788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060711
115	NC_018526	CAA	2	6	8879	8884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403060711
116	NC_018526	GTG	2	6	9134	9139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403060711
117	NC_018526	TGC	2	6	9156	9161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060711
118	NC_018526	AGA	2	6	9257	9262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060711
119	NC_018526	AAG	2	6	9392	9397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060711
120	NC_018526	GTA	2	6	9430	9435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060711
121	NC_018526	GAC	2	6	9503	9508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403060711
122	NC_018526	TGT	2	6	9633	9638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060711
123	NC_018526	AAT	2	6	9764	9769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018526	TAA	2	6	9940	9945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403060712
125	NC_018526	ACT	2	6	9946	9951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060712
126	NC_018526	GAA	2	6	10046	10051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060712
127	NC_018526	AAT	2	6	10071	10076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403060713
128	NC_018526	CAA	2	6	10128	10133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403060713
129	NC_018526	TTG	2	6	10201	10206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060713
130	NC_018526	CAG	3	9	10224	10232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403060713
131	NC_018526	GAA	2	6	10266	10271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060713
132	NC_018526	GCA	2	6	10332	10337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403060713
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135	NC_018526	AGA	2	6	10468	10473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060714
136	NC_018526	AGA	2	6	10504	10509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060714
137	NC_018526	AGG	2	6	10525	10530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018526	GGT	2	6	10585	10590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403060715
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249	NC_018526	GTC	2	6	18037	18042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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253	NC_018526	ATC	2	6	18173	18178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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255	NC_018526	CAC	2	6	18384	18389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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258	NC_018526	TCT	2	6	18546	18551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
259	NC_018526	AGG	2	6	18612	18617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_018526	AGT	2	6	21979	21984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
293	NC_018526	ACC	2	6	22502	22507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
294	NC_018526	CGT	2	6	22539	22544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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382	NC_018526	TAT	2	6	27366	27371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
383	NC_018526	TAA	2	6	27422	27427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403060724
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387	NC_018526	TTA	2	6	27584	27589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060724
388	NC_018526	TTC	2	6	27754	27759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403060724
389	NC_018526	TGG	2	6	27802	27807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403060724
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400	NC_018526	TGA	2	6	29172	29177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060725
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498	NC_018526	CTT	2	6	36267	36272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403060730
499	NC_018526	AAG	2	6	36289	36294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060730
500	NC_018526	ATT	2	6	36408	36413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060730

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