MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Secondary endosymbiont of Heteropsylla cubana chromosome

Total Repeats: 33128

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018420	TTA	2	6	17525	17530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406016
502	NC_018420	AGAT	2	8	17593	17600	50 %	25 %	25 %	0 %	400406016
503	NC_018420	CTT	2	6	17608	17613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400406016
504	NC_018420	ATT	2	6	17676	17681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406016
505	NC_018420	CGT	2	6	17730	17735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400406016
506	NC_018420	TAA	2	6	17834	17839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406016
507	NC_018420	GTT	2	6	17853	17858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400406016
508	NC_018420	TGA	2	6	17903	17908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406016
509	NC_018420	AAG	2	6	17940	17945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406016
510	NC_018420	ACT	2	6	18011	18016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406016
511	NC_018420	AGA	2	6	18017	18022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406016
512	NC_018420	GTAC	2	8	18045	18052	25 %	25 %	25 %	25 %	400406016
513	NC_018420	T	8	8	18076	18083	0 %	100 %	0 %	0 %	400406016
514	NC_018420	TAAT	2	8	18103	18110	50 %	50 %	0 %	0 %	400406016
515	NC_018420	TTG	2	6	18190	18195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400406016
516	NC_018420	AGA	2	6	18212	18217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406016
517	NC_018420	ACTC	2	8	18230	18237	25 %	25 %	0 %	50 %	400406016
518	NC_018420	A	6	6	18263	18268	100 %	0 %	0 %	0 %	400406016
519	NC_018420	A	6	6	18388	18393	100 %	0 %	0 %	0 %	400406016
520	NC_018420	CAA	2	6	18429	18434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400406016
521	NC_018420	A	8	8	18433	18440	100 %	0 %	0 %	0 %	400406016
522	NC_018420	TAA	2	6	18536	18541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406016
523	NC_018420	GCA	3	9	18576	18584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400406016
524	NC_018420	GGT	2	6	18681	18686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
525	NC_018420	ATT	2	6	18746	18751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_018420	ATT	2	6	18807	18812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_018420	TATAA	2	10	18885	18894	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_018420	AATATT	2	12	18898	18909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_018420	TAA	2	6	18919	18924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_018420	TAA	2	6	18958	18963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_018420	T	6	6	18972	18977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_018420	AAT	2	6	18990	18995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_018420	ATTT	2	8	19058	19065	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_018420	T	6	6	19063	19068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_018420	TAAA	2	8	19111	19118	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_018420	TAA	2	6	19146	19151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_018420	TG	3	6	19187	19192	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
538	NC_018420	T	7	7	19228	19234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_018420	AAAAG	2	10	19271	19280	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
540	NC_018420	TAAA	2	8	19287	19294	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_018420	AAT	2	6	19325	19330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_018420	ACA	2	6	19336	19341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_018420	AAAT	2	8	19360	19367	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_018420	ATA	2	6	19372	19377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_018420	TAA	2	6	19385	19390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_018420	AT	5	10	19437	19446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_018420	A	6	6	19476	19481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_018420	CAAT	2	8	19586	19593	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
549	NC_018420	AT	3	6	19626	19631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_018420	T	11	11	19636	19646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_018420	T	6	6	19682	19687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_018420	TA	3	6	19698	19703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_018420	TTTA	2	8	19704	19711	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_018420	GGA	2	6	19739	19744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
555	NC_018420	CTC	2	6	19816	19821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_018420	ATA	2	6	19823	19828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_018420	T	6	6	19876	19881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_018420	T	7	7	19909	19915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_018420	TTA	2	6	19930	19935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_018420	ATT	2	6	19940	19945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_018420	CAC	2	6	19965	19970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
562	NC_018420	AGAA	2	8	20001	20008	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
563	NC_018420	TAA	2	6	20016	20021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_018420	ATTTT	2	10	20024	20033	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_018420	TA	3	6	20034	20039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_018420	T	6	6	20042	20047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_018420	ATT	2	6	20048	20053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_018420	TTA	2	6	20067	20072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_018420	TAAA	2	8	20076	20083	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_018420	A	6	6	20081	20086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_018420	TC	3	6	20096	20101	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
572	NC_018420	A	9	9	20103	20111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_018420	TAAA	2	8	20145	20152	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_018420	ATT	2	6	20154	20159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_018420	T	9	9	20158	20166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_018420	A	8	8	20174	20181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_018420	A	8	8	20198	20205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_018420	ATTCA	2	10	20215	20224	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
579	NC_018420	A	6	6	20272	20277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_018420	TTA	2	6	20284	20289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_018420	TTA	2	6	20302	20307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_018420	ATT	2	6	20315	20320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_018420	TA	3	6	20334	20339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_018420	TAA	2	6	20453	20458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_018420	AATAT	2	10	20487	20496	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_018420	CAAAA	2	10	20567	20576	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
587	NC_018420	ATTTT	2	10	20641	20650	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_018420	ATT	2	6	20699	20704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_018420	T	6	6	20714	20719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_018420	TAA	2	6	20731	20736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_018420	AAT	2	6	20745	20750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_018420	TAA	2	6	20761	20766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_018420	A	8	8	20773	20780	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_018420	TAT	2	6	20784	20789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_018420	ACTAT	2	10	20805	20814	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
596	NC_018420	CTA	2	6	20818	20823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_018420	AT	3	6	20873	20878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_018420	AT	3	6	20909	20914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_018420	ATTT	2	8	20918	20925	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_018420	TTTC	2	8	20926	20933	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
601	NC_018420	AAT	2	6	20934	20939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_018420	ATA	2	6	20956	20961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_018420	TCT	2	6	20992	20997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_018420	TAA	2	6	21022	21027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_018420	CAAA	2	8	21044	21051	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
606	NC_018420	GTT	2	6	21068	21073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_018420	TAT	2	6	21106	21111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_018420	ATA	2	6	21137	21142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_018420	A	6	6	21147	21152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_018420	TTA	2	6	21172	21177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_018420	CTT	2	6	21198	21203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_018420	GAA	2	6	21220	21225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_018420	AGA	2	6	21238	21243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_018420	TTA	2	6	21267	21272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_018420	TTA	2	6	21279	21284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_018420	GAA	2	6	21368	21373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_018420	A	6	6	21402	21407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_018420	A	6	6	21428	21433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_018420	TAT	2	6	21437	21442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_018420	A	6	6	21461	21466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_018420	A	6	6	21498	21503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_018420	TAA	2	6	21515	21520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_018420	ATA	2	6	21592	21597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_018420	A	6	6	21617	21622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_018420	TA	3	6	21715	21720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_018420	A	6	6	21750	21755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_018420	ATA	2	6	21870	21875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_018420	TAA	2	6	21893	21898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_018420	ATAAA	2	10	21918	21927	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_018420	T	6	6	21934	21939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_018420	TCA	2	6	21972	21977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_018420	TTA	2	6	21978	21983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_018420	ATA	2	6	21984	21989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_018420	TAA	2	6	21999	22004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_018420	TAT	2	6	22012	22017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_018420	TAA	2	6	22021	22026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_018420	TGTT	2	8	22034	22041	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
638	NC_018420	T	8	8	22040	22047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_018420	ATA	2	6	22083	22088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_018420	ACTA	2	8	22148	22155	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
641	NC_018420	AAGAAA	2	12	22164	22175	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
642	NC_018420	AAT	2	6	22187	22192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
643	NC_018420	AT	3	6	22208	22213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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645	NC_018420	TAAA	2	8	22260	22267	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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