MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d

Total Repeats: 681

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018303	TCG	2	6	48	53	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018303	CGG	2	6	77	82	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018303	CGA	2	6	118	123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018303	GCG	2	6	191	196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018303	GCC	2	6	225	230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_018303	CGT	2	6	251	256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018303	CGG	2	6	263	268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018303	CCA	2	6	286	291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_018303	GCG	2	6	316	321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_018303	CAG	2	6	461	466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018303	GAT	2	6	467	472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018303	GCG	2	6	496	501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_018303	TGA	2	6	514	519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018303	ATC	2	6	693	698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995568
15	NC_018303	GCT	2	6	839	844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995568
16	NC_018303	ATC	2	6	1179	1184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995568
17	NC_018303	ACG	2	6	1513	1518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995568
18	NC_018303	GTC	2	6	1545	1550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995568
19	NC_018303	TCA	2	6	1637	1642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995568
20	NC_018303	CCG	2	6	1827	1832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995569
21	NC_018303	GAA	2	6	1878	1883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995569
22	NC_018303	TGA	2	6	1908	1913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995569
23	NC_018303	TCT	2	6	2101	2106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995569
24	NC_018303	CCG	2	6	2212	2217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995570
25	NC_018303	CGT	2	6	2244	2249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995570
26	NC_018303	CGA	2	6	2379	2384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995570
27	NC_018303	TCG	2	6	2521	2526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995570
28	NC_018303	TCT	2	6	2529	2534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995570
29	NC_018303	GAG	3	9	2635	2643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995570
30	NC_018303	ATC	2	6	2644	2649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995570
31	NC_018303	TGT	2	6	2717	2722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995570
32	NC_018303	TCT	2	6	2802	2807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995570
33	NC_018303	CGA	2	6	2862	2867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995570
34	NC_018303	AGG	2	6	2879	2884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995570
35	NC_018303	TCC	2	6	2956	2961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995570
36	NC_018303	CAT	2	6	2973	2978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995570
37	NC_018303	TCT	2	6	3042	3047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995570
38	NC_018303	AGG	2	6	3125	3130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995570
39	NC_018303	GAC	2	6	3258	3263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995570
40	NC_018303	CGC	2	6	3270	3275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995570
41	NC_018303	AGA	2	6	3379	3384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995570
42	NC_018303	CAA	2	6	3528	3533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995570
43	NC_018303	CTC	2	6	3782	3787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995570
44	NC_018303	CAT	2	6	3894	3899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995570
45	NC_018303	CCG	2	6	3916	3921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995570
46	NC_018303	TGA	2	6	3969	3974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995570
47	NC_018303	GCC	2	6	4007	4012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_018303	GAT	2	6	4063	4068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018303	TGA	2	6	4164	4169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995571
50	NC_018303	GGC	2	6	4234	4239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995571
51	NC_018303	GAT	2	6	4258	4263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995571
52	NC_018303	GCG	3	9	4310	4318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995571
53	NC_018303	CGT	2	6	4497	4502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995571
54	NC_018303	CGC	2	6	4584	4589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995571
55	NC_018303	CGC	2	6	4677	4682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995572
56	NC_018303	GAT	2	6	4736	4741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995572
57	NC_018303	CTC	2	6	4964	4969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_018303	GTC	2	6	4972	4977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018303	TCT	2	6	5027	5032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995573
60	NC_018303	GAA	2	6	5051	5056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995573
61	NC_018303	CCG	2	6	5272	5277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995573
62	NC_018303	GAC	2	6	5296	5301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995573
63	NC_018303	GAT	2	6	5349	5354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995573
64	NC_018303	CCT	2	6	5414	5419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995573
65	NC_018303	CGG	3	9	5528	5536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995573
66	NC_018303	CGT	2	6	5639	5644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995573
67	NC_018303	GCC	2	6	5708	5713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995573
68	NC_018303	GCC	2	6	5769	5774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_018303	CAG	2	6	5781	5786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_018303	CCA	2	6	6011	6016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995574
71	NC_018303	TCT	2	6	6141	6146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995574
72	NC_018303	AGT	2	6	6162	6167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995574
73	NC_018303	CAG	2	6	6229	6234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995574
74	NC_018303	GCG	2	6	6300	6305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995574
75	NC_018303	GGC	2	6	6335	6340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995574
76	NC_018303	CGT	2	6	6470	6475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995574
77	NC_018303	ATT	2	6	6505	6510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	399995574
78	NC_018303	GGC	2	6	6559	6564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995574
79	NC_018303	GTG	2	6	6600	6605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995574
80	NC_018303	GCC	2	6	6647	6652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995574
81	NC_018303	CGG	2	6	6662	6667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995574
82	NC_018303	CTT	2	6	6727	6732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995574
83	NC_018303	CCA	2	6	6744	6749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995574
84	NC_018303	TCG	2	6	6755	6760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995574
85	NC_018303	GAT	2	6	6865	6870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995574
86	NC_018303	CGA	2	6	6971	6976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995574
87	NC_018303	AGG	2	6	7066	7071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018303	AAG	2	6	7076	7081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018303	TCA	2	6	7129	7134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_018303	CGG	2	6	7213	7218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_018303	GTC	2	6	7433	7438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995576
92	NC_018303	CGG	2	6	7457	7462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995576
93	NC_018303	CAG	2	6	7473	7478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995576
94	NC_018303	ATC	2	6	7490	7495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995576
95	NC_018303	TCG	2	6	7530	7535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995576
96	NC_018303	GTT	2	6	7564	7569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995576
97	NC_018303	AGG	2	6	7623	7628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995576
98	NC_018303	AAG	2	6	7694	7699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995576
99	NC_018303	CGC	2	6	7842	7847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_018303	TGG	2	6	7908	7913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995577
101	NC_018303	TGA	2	6	8037	8042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995577
102	NC_018303	CTG	3	9	8054	8062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995577
103	NC_018303	GAT	2	6	8084	8089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995577
104	NC_018303	ACG	2	6	8097	8102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995577
105	NC_018303	ACA	2	6	8166	8171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995577
106	NC_018303	CTG	2	6	8203	8208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995577
107	NC_018303	CCA	2	6	8235	8240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995577
108	NC_018303	TGC	2	6	8385	8390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995577
109	NC_018303	ACG	2	6	8414	8419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995577
110	NC_018303	CCG	2	6	8432	8437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995577
111	NC_018303	ACA	2	6	8537	8542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995577
112	NC_018303	CGC	2	6	8576	8581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_018303	TCA	2	6	8588	8593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_018303	AAT	2	6	8724	8729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018303	TGG	2	6	8744	8749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018303	GCT	2	6	8752	8757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_018303	TGA	2	6	8825	8830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018303	CGA	2	6	8956	8961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995578
119	NC_018303	GCA	2	6	8978	8983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995578
120	NC_018303	CGA	2	6	8989	8994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995578
121	NC_018303	GTC	2	6	8996	9001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995578
122	NC_018303	GGC	2	6	9087	9092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995578
123	NC_018303	TGT	2	6	9109	9114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995578
124	NC_018303	TGC	3	9	9213	9221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995578
125	NC_018303	CCG	2	6	9356	9361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_018303	TTC	2	6	9372	9377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_018303	TCG	2	6	9393	9398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995579
128	NC_018303	CCA	2	6	9401	9406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995579
129	NC_018303	GCG	2	6	9456	9461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995579
130	NC_018303	GTC	2	6	9566	9571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995579
131	NC_018303	GCC	2	6	9624	9629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995579
132	NC_018303	CGA	2	6	9669	9674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995579
133	NC_018303	GCC	2	6	9718	9723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995579
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261	NC_018303	TAT	2	6	18243	18248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	399995588
262	NC_018303	CCG	2	6	18274	18279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995588
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269	NC_018303	ACT	2	6	19061	19066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995589
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273	NC_018303	CTG	2	6	19544	19549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995590
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281	NC_018303	TGT	2	6	19897	19902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995590
282	NC_018303	CTT	2	6	20090	20095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995590
283	NC_018303	TGC	2	6	20239	20244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
284	NC_018303	AGC	2	6	20276	20281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
285	NC_018303	CGC	2	6	20552	20557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
286	NC_018303	TGA	2	6	20784	20789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
287	NC_018303	TTG	2	6	20918	20923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
288	NC_018303	TTC	2	6	20970	20975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_018303	CGT	2	6	21059	21064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
290	NC_018303	AAG	2	6	21184	21189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
291	NC_018303	AAC	2	6	21272	21277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995591
292	NC_018303	TGA	2	6	21279	21284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995591
293	NC_018303	ACC	2	6	21332	21337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995591
294	NC_018303	CAA	2	6	21364	21369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995591
295	NC_018303	GAT	2	6	21571	21576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995591
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302	NC_018303	GGT	2	6	22153	22158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995591
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310	NC_018303	TGC	2	6	22582	22587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995591
311	NC_018303	CAG	2	6	22652	22657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995591
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322	NC_018303	GCC	2	6	23285	23290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995591
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334	NC_018303	CTT	2	6	24078	24083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995592
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341	NC_018303	GAT	4	12	24595	24606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995593
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362	NC_018303	GCG	2	6	25822	25827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
363	NC_018303	ATT	2	6	25856	25861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
364	NC_018303	TCA	2	6	25888	25893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995597
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368	NC_018303	CGG	2	6	26156	26161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
369	NC_018303	GTT	2	6	26188	26193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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383	NC_018303	CGC	2	6	27012	27017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995600
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