MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d

Total Repeats: 960

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018303	ACCATC	2	12	25725	25736	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
502	NC_018303	GCG	2	6	25822	25827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_018303	ATT	2	6	25856	25861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_018303	TCA	2	6	25888	25893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995597
505	NC_018303	GCT	2	6	25986	25991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995597
506	NC_018303	TTG	2	6	25998	26003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995597
507	NC_018303	GGCG	2	8	26060	26067	0 %	0 %	75 %	25 %	399995597
508	NC_018303	TCG	2	6	26111	26116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_018303	AC	3	6	26120	26125	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
510	NC_018303	CGG	2	6	26156	26161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_018303	GTT	2	6	26188	26193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_018303	TGCCT	2	10	26217	26226	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
513	NC_018303	AAATC	2	10	26296	26305	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
514	NC_018303	ACG	2	6	26346	26351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995598
515	NC_018303	GC	3	6	26369	26374	0 %	0 %	50 %	50 %	399995598
516	NC_018303	CCG	2	6	26434	26439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995598
517	NC_018303	CTC	2	6	26441	26446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995598
518	NC_018303	GAG	2	6	26468	26473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995598
519	NC_018303	GC	3	6	26479	26484	0 %	0 %	50 %	50 %	399995598
520	NC_018303	CGA	2	6	26488	26493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995598
521	NC_018303	TCCGG	2	10	26504	26513	0 %	20 %	40 %	40 %	399995598
522	NC_018303	TCC	2	6	26514	26519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995598
523	NC_018303	AGA	2	6	26550	26555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995598
524	NC_018303	AGG	2	6	26571	26576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995598
525	NC_018303	CGA	2	6	26626	26631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995598
526	NC_018303	TGGCAA	2	12	26665	26676	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	399995599
527	NC_018303	TGC	2	6	26730	26735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995599
528	NC_018303	CG	3	6	26818	26823	0 %	0 %	50 %	50 %	399995599
529	NC_018303	CGC	2	6	26858	26863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995599
530	NC_018303	CAT	2	6	26888	26893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995599
531	NC_018303	CTTTC	2	10	26943	26952	0 %	60 %	0 %	40 %	399995600
532	NC_018303	CAT	2	6	26971	26976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995600
533	NC_018303	CGC	2	6	27012	27017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995600
534	NC_018303	CCG	2	6	27052	27057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995600
535	NC_018303	CGG	2	6	27090	27095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995600
536	NC_018303	A	7	7	27101	27107	100 %	0 %	0 %	0 %	399995600
537	NC_018303	CCG	2	6	27112	27117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995600
538	NC_018303	GAGC	2	8	27328	27335	25 %	0 %	50 %	25 %	399995600
539	NC_018303	TC	3	6	27357	27362	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
540	NC_018303	TCT	2	6	27366	27371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_018303	CCG	2	6	27375	27380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
542	NC_018303	CA	3	6	27441	27446	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
543	NC_018303	CG	3	6	27608	27613	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
544	NC_018303	CGGA	2	8	27677	27684	25 %	0 %	50 %	25 %	399995601
545	NC_018303	GAT	2	6	27687	27692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995601
546	NC_018303	TTG	2	6	27740	27745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995601
547	NC_018303	TTC	2	6	27760	27765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995601
548	NC_018303	CCA	2	6	27955	27960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995602
549	NC_018303	GAC	2	6	28034	28039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995602
550	NC_018303	GAA	2	6	28298	28303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995602
551	NC_018303	TCC	2	6	28305	28310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995602
552	NC_018303	GGC	3	9	28364	28372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995602
553	NC_018303	TTG	2	6	28389	28394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995602
554	NC_018303	TGC	2	6	28397	28402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995602
555	NC_018303	CCGCTG	2	12	28514	28525	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	399995602
556	NC_018303	GC	3	6	28565	28570	0 %	0 %	50 %	50 %	399995602
557	NC_018303	TTC	2	6	28577	28582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995602
558	NC_018303	CG	4	8	28596	28603	0 %	0 %	50 %	50 %	399995602
559	NC_018303	CGA	2	6	28630	28635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995602
560	NC_018303	GGCG	2	8	28667	28674	0 %	0 %	75 %	25 %	399995602
561	NC_018303	GAT	2	6	28709	28714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995602
562	NC_018303	CGC	2	6	28726	28731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995602
563	NC_018303	TTG	2	6	28788	28793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995602
564	NC_018303	GAC	3	9	28829	28837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995602
565	NC_018303	CGA	2	6	28840	28845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995602
566	NC_018303	ACGATG	2	12	28854	28865	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	399995602
567	NC_018303	CGA	2	6	28867	28872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995602
568	NC_018303	TCT	2	6	28911	28916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995602
569	NC_018303	GGC	2	6	28925	28930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995602
570	NC_018303	ATG	2	6	28979	28984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995603
571	NC_018303	CG	3	6	29063	29068	0 %	0 %	50 %	50 %	399995603
572	NC_018303	TCGA	2	8	29090	29097	25 %	25 %	25 %	25 %	399995603
573	NC_018303	GCC	2	6	29183	29188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995603
574	NC_018303	GC	3	6	29193	29198	0 %	0 %	50 %	50 %	399995603
575	NC_018303	CGA	2	6	29209	29214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995603
576	NC_018303	GTC	3	9	29234	29242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995603
577	NC_018303	CGC	2	6	29299	29304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995603
578	NC_018303	GGT	2	6	29317	29322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995603
579	NC_018303	GTC	2	6	29336	29341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995603
580	NC_018303	CCG	2	6	29425	29430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995604
581	NC_018303	TCT	2	6	29439	29444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995604
582	NC_018303	GCC	2	6	29448	29453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995604
583	NC_018303	ATC	2	6	29501	29506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995604
584	NC_018303	TTC	2	6	29513	29518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995604
585	NC_018303	GCC	2	6	29545	29550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995604
586	NC_018303	GAC	2	6	29554	29559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995604
587	NC_018303	GC	3	6	29652	29657	0 %	0 %	50 %	50 %	399995604
588	NC_018303	GCC	2	6	29710	29715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995604
589	NC_018303	TCG	2	6	29748	29753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995604
590	NC_018303	TCC	2	6	29759	29764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995604
591	NC_018303	GCG	2	6	29830	29835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995604
592	NC_018303	CGT	2	6	29839	29844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995604
593	NC_018303	ACC	2	6	29846	29851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995604
594	NC_018303	CGC	2	6	29982	29987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995604
595	NC_018303	GAC	2	6	30025	30030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995604
596	NC_018303	GTC	2	6	30080	30085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995604
597	NC_018303	TGG	2	6	30141	30146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995604
598	NC_018303	GCG	2	6	30164	30169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995604
599	NC_018303	CGG	2	6	30198	30203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995604
600	NC_018303	GATTG	2	10	30288	30297	20 %	40 %	40 %	0 %	399995605
601	NC_018303	GCG	2	6	30320	30325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995605
602	NC_018303	CCTTGC	2	12	30374	30385	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	399995605
603	NC_018303	TGT	2	6	30443	30448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995605
604	NC_018303	TCT	2	6	30518	30523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995605
605	NC_018303	GATG	2	8	30529	30536	25 %	25 %	50 %	0 %	399995605
606	NC_018303	AT	3	6	30568	30573	50 %	50 %	0 %	0 %	399995605
607	NC_018303	GC	3	6	30637	30642	0 %	0 %	50 %	50 %	399995605
608	NC_018303	CGG	2	6	30821	30826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995605
609	NC_018303	CG	3	6	30865	30870	0 %	0 %	50 %	50 %	399995605
610	NC_018303	TTGGCG	2	12	30993	31004	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	399995606
611	NC_018303	GGC	2	6	31058	31063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995606
612	NC_018303	CAG	2	6	31069	31074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995606
613	NC_018303	CTG	2	6	31077	31082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995606
614	NC_018303	GATCC	2	10	31086	31095	20 %	20 %	20 %	40 %	399995606
615	NC_018303	GCGCC	2	10	31114	31123	0 %	0 %	40 %	60 %	399995606
616	NC_018303	CGC	2	6	31139	31144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995606
617	NC_018303	GCC	2	6	31184	31189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995606
618	NC_018303	CGG	2	6	31207	31212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995606
619	NC_018303	GCC	2	6	31221	31226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995606
620	NC_018303	GCC	2	6	31229	31234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995606
621	NC_018303	C	6	6	31253	31258	0 %	0 %	0 %	100 %	399995606
622	NC_018303	GAT	2	6	31289	31294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995606
623	NC_018303	GAT	2	6	31313	31318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995606
624	NC_018303	ACG	2	6	31326	31331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995606
625	NC_018303	ATC	2	6	31428	31433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995606
626	NC_018303	CCAAGC	2	12	31515	31526	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	399995606
627	NC_018303	ACAT	2	8	31551	31558	50 %	25 %	0 %	25 %	399995606
628	NC_018303	TGC	2	6	31583	31588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995606
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756	NC_018303	CGC	2	6	37759	37764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995614
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