MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d

Total Repeats: 5311

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_018299	GC	3	6	138711	138716	0 %	0 %	50 %	50 %	399995458
3002	NC_018299	TCGG	2	8	138722	138729	0 %	25 %	50 %	25 %	399995458
3003	NC_018299	GGC	2	6	138733	138738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995458
3004	NC_018299	CTG	2	6	138744	138749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995458
3005	NC_018299	CTC	2	6	138753	138758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995458
3006	NC_018299	CTC	2	6	138964	138969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995459
3007	NC_018299	ACG	2	6	139004	139009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995459
3008	NC_018299	CGT	2	6	139066	139071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995459
3009	NC_018299	CGA	2	6	139110	139115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995459
3010	NC_018299	GGCC	2	8	139148	139155	0 %	0 %	50 %	50 %	399995459
3011	NC_018299	GAG	2	6	139181	139186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995459
3012	NC_018299	TGC	2	6	139195	139200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995459
3013	NC_018299	CGTC	2	8	139203	139210	0 %	25 %	25 %	50 %	399995459
3014	NC_018299	TCA	3	9	139251	139259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995459
3015	NC_018299	ATCA	2	8	139289	139296	50 %	25 %	0 %	25 %	399995459
3016	NC_018299	CTGG	2	8	139315	139322	0 %	25 %	50 %	25 %	399995459
3017	NC_018299	CG	3	6	139323	139328	0 %	0 %	50 %	50 %	399995459
3018	NC_018299	CCT	2	6	139399	139404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995459
3019	NC_018299	AAG	2	6	139432	139437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995459
3020	NC_018299	CGA	2	6	139498	139503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995459
3021	NC_018299	CGA	2	6	139555	139560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995459
3022	NC_018299	CTCGC	2	10	139584	139593	0 %	20 %	20 %	60 %	399995459
3023	NC_018299	TCG	2	6	139602	139607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995459
3024	NC_018299	TCG	2	6	139716	139721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995459
3025	NC_018299	GCC	2	6	139754	139759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995459
3026	NC_018299	CTC	2	6	139796	139801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995459
3027	NC_018299	CGC	2	6	139856	139861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995459
3028	NC_018299	TGG	2	6	139866	139871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995459
3029	NC_018299	ATC	2	6	139874	139879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995459
3030	NC_018299	GCG	2	6	139889	139894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995459
3031	NC_018299	CCT	2	6	139981	139986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995459
3032	NC_018299	GCG	2	6	140093	140098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995459
3033	NC_018299	GC	3	6	140159	140164	0 %	0 %	50 %	50 %	399995459
3034	NC_018299	GCTC	2	8	140200	140207	0 %	25 %	25 %	50 %	399995459
3035	NC_018299	AGC	2	6	140279	140284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995459
3036	NC_018299	GCT	2	6	140335	140340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995459
3037	NC_018299	CGG	2	6	140388	140393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995459
3038	NC_018299	GC	3	6	140434	140439	0 %	0 %	50 %	50 %	399995459
3039	NC_018299	GGC	2	6	140471	140476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3040	NC_018299	CAG	2	6	140665	140670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995460
3041	NC_018299	CAA	2	6	140734	140739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995460
3042	NC_018299	CGGA	2	8	140820	140827	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3043	NC_018299	CGTC	2	8	140943	140950	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3044	NC_018299	GGT	2	6	140992	140997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_018299	GGC	2	6	141012	141017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_018299	ATC	2	6	141117	141122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_018299	TCT	2	6	141139	141144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_018299	ACCG	2	8	141216	141223	25 %	0 %	25 %	50 %	399995461
3049	NC_018299	TCGA	2	8	141251	141258	25 %	25 %	25 %	25 %	399995461
3050	NC_018299	CAA	2	6	141265	141270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995461
3051	NC_018299	TCGA	2	8	141271	141278	25 %	25 %	25 %	25 %	399995461
3052	NC_018299	TCC	2	6	141301	141306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995461
3053	NC_018299	AGC	2	6	141323	141328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995461
3054	NC_018299	TAG	2	6	141413	141418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995461
3055	NC_018299	GCA	2	6	141444	141449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995461
3056	NC_018299	AGT	2	6	141485	141490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995461
3057	NC_018299	GGGC	2	8	141497	141504	0 %	0 %	75 %	25 %	399995461
3058	NC_018299	TCGA	2	8	141584	141591	25 %	25 %	25 %	25 %	399995461
3059	NC_018299	CGT	2	6	141640	141645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995461
3060	NC_018299	GAT	3	9	141670	141678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995461
3061	NC_018299	CGGTA	2	10	141726	141735	20 %	20 %	40 %	20 %	399995461
3062	NC_018299	GTC	2	6	141817	141822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995461
3063	NC_018299	GTG	2	6	141878	141883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995461
3064	NC_018299	TTCG	2	8	141906	141913	0 %	50 %	25 %	25 %	399995461
3065	NC_018299	TTGG	2	8	141961	141968	0 %	50 %	50 %	0 %	399995461
3066	NC_018299	CCG	2	6	142043	142048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995461
3067	NC_018299	GA	3	6	142128	142133	50 %	0 %	50 %	0 %	399995461
3068	NC_018299	ACGA	2	8	142141	142148	50 %	0 %	25 %	25 %	399995461
3069	NC_018299	CGTCG	2	10	142150	142159	0 %	20 %	40 %	40 %	399995461
3070	NC_018299	CTCGG	2	10	142251	142260	0 %	20 %	40 %	40 %	399995462
3071	NC_018299	CG	3	6	142297	142302	0 %	0 %	50 %	50 %	399995462
3072	NC_018299	TGTT	2	8	142332	142339	0 %	75 %	25 %	0 %	399995462
3073	NC_018299	CGG	2	6	142346	142351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995462
3074	NC_018299	CGC	2	6	142379	142384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995462
3075	NC_018299	CTG	2	6	142388	142393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995462
3076	NC_018299	TCG	2	6	142402	142407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995462
3077	NC_018299	CCA	2	6	142505	142510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995462
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3079	NC_018299	GCC	2	6	142646	142651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995462
3080	NC_018299	GC	3	6	142836	142841	0 %	0 %	50 %	50 %	399995462
3081	NC_018299	GGTC	2	8	142856	142863	0 %	25 %	50 %	25 %	399995462
3082	NC_018299	CAT	2	6	142913	142918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995462
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3084	NC_018299	GGA	2	6	142959	142964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995462
3085	NC_018299	CCG	2	6	143001	143006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995462
3086	NC_018299	CGC	2	6	143028	143033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995462
3087	NC_018299	TCC	2	6	143055	143060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995462
3088	NC_018299	CCT	2	6	143065	143070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995462
3089	NC_018299	TCG	2	6	143149	143154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995462
3090	NC_018299	ACC	2	6	143166	143171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995462
3091	NC_018299	TTCCC	2	10	143199	143208	0 %	40 %	0 %	60 %	399995462
3092	NC_018299	CGA	2	6	143242	143247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_018299	CCGCG	2	10	143260	143269	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3094	NC_018299	TTG	2	6	143283	143288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_018299	TCC	2	6	143293	143298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3096	NC_018299	CCT	2	6	143362	143367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995463
3097	NC_018299	CGAC	2	8	143404	143411	25 %	0 %	25 %	50 %	399995463
3098	NC_018299	TCCCC	2	10	143481	143490	0 %	20 %	0 %	80 %	399995463
3099	NC_018299	CCT	2	6	143743	143748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995463
3100	NC_018299	TCGC	2	8	143764	143771	0 %	25 %	25 %	50 %	399995463
3101	NC_018299	GCC	4	12	143772	143783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995463
3102	NC_018299	CGT	2	6	143800	143805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995463
3103	NC_018299	CGG	2	6	143806	143811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995463
3104	NC_018299	CGG	2	6	143910	143915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995463
3105	NC_018299	ACG	2	6	143922	143927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995463
3106	NC_018299	CCT	2	6	144031	144036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995463
3107	NC_018299	GAG	2	6	144063	144068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995463
3108	NC_018299	GAT	2	6	144080	144085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995463
3109	NC_018299	TGT	2	6	144094	144099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995463
3110	NC_018299	CGA	2	6	144112	144117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995463
3111	NC_018299	CGCGC	2	10	144140	144149	0 %	0 %	40 %	60 %	399995463
3112	NC_018299	AGG	2	6	144189	144194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995463
3113	NC_018299	CTT	2	6	144354	144359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995464
3114	NC_018299	CGGA	2	8	144386	144393	25 %	0 %	50 %	25 %	399995464
3115	NC_018299	CG	3	6	144437	144442	0 %	0 %	50 %	50 %	399995464
3116	NC_018299	GCGCC	2	10	144446	144455	0 %	0 %	40 %	60 %	399995464
3117	NC_018299	GCG	2	6	144468	144473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995464
3118	NC_018299	TGC	2	6	144483	144488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995464
3119	NC_018299	ACA	2	6	144531	144536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995464
3120	NC_018299	TCC	2	6	144557	144562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995464
3121	NC_018299	TCG	2	6	144629	144634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995464
3122	NC_018299	GCCG	2	8	144640	144647	0 %	0 %	50 %	50 %	399995464
3123	NC_018299	GAC	2	6	144664	144669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995464
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3242	NC_018299	CAGC	2	8	149928	149935	25 %	0 %	25 %	50 %	399995471
3243	NC_018299	CGA	2	6	149964	149969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995471
3244	NC_018299	GCA	2	6	149976	149981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995471
3245	NC_018299	CGG	2	6	149994	149999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995471
3246	NC_018299	ACC	2	6	150029	150034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995471
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3248	NC_018299	CGC	2	6	150168	150173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995472
3249	NC_018299	GCC	2	6	150178	150183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995472
3250	NC_018299	TCG	2	6	150184	150189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995472
3251	NC_018299	GTC	2	6	150198	150203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995472
3252	NC_018299	CT	3	6	150235	150240	0 %	50 %	0 %	50 %	399995472
3253	NC_018299	CCCCT	2	10	150250	150259	0 %	20 %	0 %	80 %	399995472
3254	NC_018299	TCG	2	6	150328	150333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995472
3255	NC_018299	CGTCC	2	10	150362	150371	0 %	20 %	20 %	60 %	399995472
3256	NC_018299	GTA	2	6	150372	150377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995472
3257	NC_018299	GCA	2	6	150383	150388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995472
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3262	NC_018299	GCT	2	6	150620	150625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995472
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3264	NC_018299	GAC	2	6	150687	150692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995472
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3266	NC_018299	GCGG	2	8	150824	150831	0 %	0 %	75 %	25 %	399995473
3267	NC_018299	CGT	2	6	150843	150848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995473
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3269	NC_018299	CCG	2	6	150882	150887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995473
3270	NC_018299	TTG	2	6	150913	150918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995473
3271	NC_018299	TCA	2	6	150928	150933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995473
3272	NC_018299	CGT	2	6	151013	151018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995473
3273	NC_018299	CGC	2	6	151064	151069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995473
3274	NC_018299	GC	4	8	151100	151107	0 %	0 %	50 %	50 %	399995473
3275	NC_018299	CGG	2	6	151122	151127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995473
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3278	NC_018299	GCTG	2	8	151242	151249	0 %	25 %	50 %	25 %	399995473
3279	NC_018299	CTGC	2	8	151259	151266	0 %	25 %	25 %	50 %	399995473
3280	NC_018299	GA	3	6	151269	151274	50 %	0 %	50 %	0 %	399995473
3281	NC_018299	ACC	3	9	151285	151293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3282	NC_018299	GC	3	6	151310	151315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3283	NC_018299	GA	3	6	151465	151470	50 %	0 %	50 %	0 %	399995474
3284	NC_018299	AGC	2	6	151489	151494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995474
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3288	NC_018299	GAGCA	2	10	151720	151729	40 %	0 %	40 %	20 %	399995474
3289	NC_018299	CGT	2	6	151821	151826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3290	NC_018299	TTC	2	6	151844	151849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3292	NC_018299	CGC	2	6	151884	151889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3293	NC_018299	TCC	2	6	151929	151934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3294	NC_018299	CGCT	2	8	151957	151964	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3295	NC_018299	CCA	2	6	152011	152016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3305	NC_018299	TCG	2	6	152654	152659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3310	NC_018299	CAG	2	6	152955	152960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3311	NC_018299	A	6	6	153028	153033	100 %	0 %	0 %	0 %	399995476
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3332	NC_018299	GCG	2	6	154205	154210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995476
3333	NC_018299	T	7	7	154245	154251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3334	NC_018299	GA	3	6	154349	154354	50 %	0 %	50 %	0 %	399995477
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3341	NC_018299	GC	3	6	154745	154750	0 %	0 %	50 %	50 %	399995477
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3343	NC_018299	GTCA	2	8	154870	154877	25 %	25 %	25 %	25 %	399995477
3344	NC_018299	CGC	2	6	155039	155044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995477
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3346	NC_018299	TCG	2	6	155313	155318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3347	NC_018299	CT	3	6	155326	155331	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3348	NC_018299	GGCG	2	8	155397	155404	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3349	NC_018299	GAA	2	6	155429	155434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3350	NC_018299	GAC	2	6	155454	155459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995478
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3352	NC_018299	CGA	2	6	155510	155515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995478
3353	NC_018299	AGGAC	2	10	155816	155825	40 %	0 %	40 %	20 %	399995478
3354	NC_018299	CAC	2	6	155861	155866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995478
3355	NC_018299	GCA	2	6	155901	155906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995478
3356	NC_018299	GCC	2	6	155960	155965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995478
3357	NC_018299	GAG	2	6	156031	156036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995478
3358	NC_018299	ACGTC	2	10	156086	156095	20 %	20 %	20 %	40 %	399995478
3359	NC_018299	GTC	2	6	156130	156135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995478
3360	NC_018299	ATG	2	6	156179	156184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995478
3361	NC_018299	TCCA	2	8	156223	156230	25 %	25 %	0 %	50 %	399995478
3362	NC_018299	CGG	2	6	156272	156277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995478
3363	NC_018299	ATG	2	6	156278	156283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995478
3364	NC_018299	GGC	2	6	156367	156372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995478
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3489	NC_018299	CAT	2	6	161893	161898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995484
3490	NC_018299	CCG	2	6	161922	161927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995484
3491	NC_018299	GCC	3	9	161932	161940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995484
3492	NC_018299	GCG	2	6	161974	161979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995484
3493	NC_018299	GC	3	6	162035	162040	0 %	0 %	50 %	50 %	399995484
3494	NC_018299	CAG	2	6	162154	162159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995484
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3497	NC_018299	GCC	2	6	162215	162220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995484
3498	NC_018299	TCA	2	6	162251	162256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995484
3499	NC_018299	GA	3	6	162272	162277	50 %	0 %	50 %	0 %	399995484
3500	NC_018299	CGCGT	2	10	162312	162321	0 %	20 %	40 %	40 %	399995484

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