MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d

Total Repeats: 5311

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_018299	GCC	2	6	117224	117229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995437
2502	NC_018299	CG	3	6	117246	117251	0 %	0 %	50 %	50 %	399995437
2503	NC_018299	GAC	2	6	117263	117268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995437
2504	NC_018299	TCG	2	6	117276	117281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995437
2505	NC_018299	TGC	2	6	117313	117318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995437
2506	NC_018299	CGAT	2	8	117423	117430	25 %	25 %	25 %	25 %	399995437
2507	NC_018299	CTC	3	9	117437	117445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995437
2508	NC_018299	CG	3	6	117466	117471	0 %	0 %	50 %	50 %	399995437
2509	NC_018299	CGGC	2	8	117532	117539	0 %	0 %	50 %	50 %	399995437
2510	NC_018299	TCG	2	6	117546	117551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995437
2511	NC_018299	GCAA	2	8	117607	117614	50 %	0 %	25 %	25 %	399995437
2512	NC_018299	CA	3	6	117626	117631	50 %	0 %	0 %	50 %	399995437
2513	NC_018299	CGA	2	6	117661	117666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995437
2514	NC_018299	CGG	2	6	117678	117683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995437
2515	NC_018299	GGT	2	6	117724	117729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995437
2516	NC_018299	GAA	2	6	117737	117742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995437
2517	NC_018299	TCG	2	6	117870	117875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995437
2518	NC_018299	ATG	2	6	117897	117902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995437
2519	NC_018299	TCA	2	6	117984	117989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995437
2520	NC_018299	CGA	2	6	117991	117996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995437
2521	NC_018299	TGC	2	6	118087	118092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995437
2522	NC_018299	CTG	3	9	118097	118105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995437
2523	NC_018299	CTG	2	6	118109	118114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995437
2524	NC_018299	CTT	2	6	118142	118147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995437
2525	NC_018299	CGA	2	6	118225	118230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995437
2526	NC_018299	CG	3	6	118238	118243	0 %	0 %	50 %	50 %	399995437
2527	NC_018299	GCCG	2	8	118248	118255	0 %	0 %	50 %	50 %	399995437
2528	NC_018299	CTG	2	6	118346	118351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995437
2529	NC_018299	CTG	3	9	118385	118393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995437
2530	NC_018299	TTG	2	6	118394	118399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995437
2531	NC_018299	CGC	2	6	118525	118530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995437
2532	NC_018299	GCT	2	6	118579	118584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995437
2533	NC_018299	TGC	2	6	118596	118601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995437
2534	NC_018299	TCT	2	6	118620	118625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995437
2535	NC_018299	GCA	2	6	118656	118661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995437
2536	NC_018299	CCG	2	6	118665	118670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995437
2537	NC_018299	GC	3	6	118675	118680	0 %	0 %	50 %	50 %	399995437
2538	NC_018299	CAC	2	6	118694	118699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2539	NC_018299	CGA	2	6	118731	118736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995438
2540	NC_018299	TGT	2	6	118737	118742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995438
2541	NC_018299	CCG	2	6	118743	118748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995438
2542	NC_018299	CATC	2	8	118758	118765	25 %	25 %	0 %	50 %	399995438
2543	NC_018299	CGT	2	6	118788	118793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995438
2544	NC_018299	CCAG	2	8	118887	118894	25 %	0 %	25 %	50 %	399995438
2545	NC_018299	CTCG	2	8	118918	118925	0 %	25 %	25 %	50 %	399995438
2546	NC_018299	GCC	2	6	118928	118933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995438
2547	NC_018299	TCC	2	6	118987	118992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995438
2548	NC_018299	GC	3	6	118994	118999	0 %	0 %	50 %	50 %	399995438
2549	NC_018299	AG	3	6	119071	119076	50 %	0 %	50 %	0 %	399995438
2550	NC_018299	CAG	2	6	119242	119247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995438
2551	NC_018299	CGC	2	6	119304	119309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995438
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2553	NC_018299	GCA	3	9	119373	119381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995438
2554	NC_018299	TCG	2	6	119393	119398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995438
2555	NC_018299	TCG	2	6	119405	119410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995438
2556	NC_018299	CAG	2	6	119470	119475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995438
2557	NC_018299	CGG	2	6	119721	119726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995438
2558	NC_018299	CGG	2	6	119742	119747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995438
2559	NC_018299	TGA	2	6	119771	119776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995438
2560	NC_018299	GCC	2	6	119848	119853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995438
2561	NC_018299	AAC	2	6	119870	119875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995438
2562	NC_018299	GCC	2	6	119876	119881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995438
2563	NC_018299	TCG	2	6	119921	119926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995438
2564	NC_018299	GAAA	2	8	119935	119942	75 %	0 %	25 %	0 %	399995438
2565	NC_018299	CCG	2	6	119968	119973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995438
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2567	NC_018299	CCG	2	6	120048	120053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995438
2568	NC_018299	CGCT	2	8	120082	120089	0 %	25 %	25 %	50 %	399995438
2569	NC_018299	GAT	2	6	120142	120147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995438
2570	NC_018299	CACG	2	8	120165	120172	25 %	0 %	25 %	50 %	399995438
2571	NC_018299	GC	3	6	120177	120182	0 %	0 %	50 %	50 %	399995438
2572	NC_018299	CGA	2	6	120192	120197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995438
2573	NC_018299	TCG	2	6	120293	120298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2574	NC_018299	GAT	2	6	120315	120320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2575	NC_018299	TGA	2	6	120345	120350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2576	NC_018299	GGA	2	6	120402	120407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995439
2577	NC_018299	TCT	2	6	120452	120457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995439
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2579	NC_018299	CGC	2	6	120505	120510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995439
2580	NC_018299	ACG	2	6	120529	120534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995439
2581	NC_018299	GAA	2	6	120624	120629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995439
2582	NC_018299	TTCC	2	8	120655	120662	0 %	50 %	0 %	50 %	399995439
2583	NC_018299	CCT	2	6	120668	120673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995439
2584	NC_018299	ATC	2	6	120771	120776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995439
2585	NC_018299	TTC	2	6	120801	120806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995439
2586	NC_018299	TCG	2	6	120826	120831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995439
2587	NC_018299	CGG	2	6	120863	120868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995439
2588	NC_018299	TGG	2	6	120871	120876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995439
2589	NC_018299	CG	3	6	120885	120890	0 %	0 %	50 %	50 %	399995439
2590	NC_018299	CA	3	6	120930	120935	50 %	0 %	0 %	50 %	399995439
2591	NC_018299	GTT	2	6	120942	120947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995439
2592	NC_018299	CGC	2	6	121007	121012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995439
2593	NC_018299	CGA	2	6	121045	121050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995439
2594	NC_018299	GCC	2	6	121065	121070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995439
2595	NC_018299	CGT	2	6	121100	121105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995439
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2597	NC_018299	TCG	2	6	121162	121167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995439
2598	NC_018299	TC	3	6	121182	121187	0 %	50 %	0 %	50 %	399995439
2599	NC_018299	GCG	2	6	121257	121262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2600	NC_018299	GCG	2	6	121362	121367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2601	NC_018299	GA	3	6	121388	121393	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_018299	TGAG	2	8	121400	121407	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_018299	GAA	2	6	121477	121482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995440
2604	NC_018299	GCG	2	6	121505	121510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995440
2605	NC_018299	GCGA	2	8	121526	121533	25 %	0 %	50 %	25 %	399995440
2606	NC_018299	CGA	2	6	121602	121607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995440
2607	NC_018299	CCG	3	9	121643	121651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995440
2608	NC_018299	TAT	2	6	121722	121727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	399995440
2609	NC_018299	TCA	2	6	121740	121745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995440
2610	NC_018299	AAG	2	6	121792	121797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995440
2611	NC_018299	TCG	2	6	121835	121840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995440
2612	NC_018299	TCA	2	6	121860	121865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995440
2613	NC_018299	CAC	2	6	121872	121877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995440
2614	NC_018299	CGG	2	6	121878	121883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995440
2615	NC_018299	GAT	2	6	121903	121908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995440
2616	NC_018299	CG	3	6	121932	121937	0 %	0 %	50 %	50 %	399995440
2617	NC_018299	GAC	2	6	121951	121956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995440
2618	NC_018299	ACG	2	6	121979	121984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995440
2619	NC_018299	GCT	2	6	121985	121990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995440
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2621	NC_018299	CGA	2	6	122068	122073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995440
2622	NC_018299	AAC	2	6	122074	122079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995440
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2638	NC_018299	GC	3	6	122891	122896	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2645	NC_018299	CTC	2	6	123569	123574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2727	NC_018299	GA	4	8	127255	127262	50 %	0 %	50 %	0 %	399995444
2728	NC_018299	CAG	2	6	127263	127268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2729	NC_018299	GCA	2	6	127316	127321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995445
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2732	NC_018299	GCT	2	6	127415	127420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995445
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2736	NC_018299	GGC	2	6	127605	127610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995445
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2739	NC_018299	CTT	2	6	127674	127679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995445
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2741	NC_018299	GTA	2	6	127723	127728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995445
2742	NC_018299	CGA	2	6	127787	127792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995445
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2988	NC_018299	GCA	2	6	138257	138262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995456
2989	NC_018299	CTT	2	6	138298	138303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995456
2990	NC_018299	ATG	2	6	138308	138313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995456
2991	NC_018299	GCATC	2	10	138324	138333	20 %	20 %	20 %	40 %	399995456
2992	NC_018299	GCA	2	6	138352	138357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2993	NC_018299	GGC	2	6	138402	138407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2994	NC_018299	CCT	2	6	138452	138457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2995	NC_018299	CGC	2	6	138482	138487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2996	NC_018299	GA	3	6	138528	138533	50 %	0 %	50 %	0 %	399995457
2997	NC_018299	CCGT	2	8	138561	138568	0 %	25 %	25 %	50 %	399995457
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