MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d

Total Repeats: 5311

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018299	CA	3	6	46777	46782	50 %	0 %	0 %	50 %	399995371
1002	NC_018299	CGT	2	6	46801	46806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995371
1003	NC_018299	AG	3	6	46808	46813	50 %	0 %	50 %	0 %	399995371
1004	NC_018299	CGT	2	6	46824	46829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995371
1005	NC_018299	CAGC	2	8	46830	46837	25 %	0 %	25 %	50 %	399995371
1006	NC_018299	CGAC	2	8	46847	46854	25 %	0 %	25 %	50 %	399995371
1007	NC_018299	GCT	2	6	46900	46905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995371
1008	NC_018299	GC	3	6	46954	46959	0 %	0 %	50 %	50 %	399995371
1009	NC_018299	GTC	2	6	46996	47001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995371
1010	NC_018299	CGA	2	6	47019	47024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995371
1011	NC_018299	CGA	2	6	47031	47036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995371
1012	NC_018299	CGT	2	6	47037	47042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995371
1013	NC_018299	AGG	2	6	47076	47081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995371
1014	NC_018299	CG	3	6	47091	47096	0 %	0 %	50 %	50 %	399995371
1015	NC_018299	ATG	2	6	47141	47146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995371
1016	NC_018299	CTG	2	6	47179	47184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_018299	CTT	2	6	47217	47222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_018299	CGAG	2	8	47231	47238	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1019	NC_018299	TCG	2	6	47261	47266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_018299	ACG	2	6	47267	47272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_018299	GGC	2	6	47285	47290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_018299	CGAA	2	8	47349	47356	50 %	0 %	25 %	25 %	399995372
1023	NC_018299	CGC	2	6	47372	47377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995372
1024	NC_018299	TTC	2	6	47390	47395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995372
1025	NC_018299	CCAG	2	8	47432	47439	25 %	0 %	25 %	50 %	399995372
1026	NC_018299	GC	3	6	47453	47458	0 %	0 %	50 %	50 %	399995372
1027	NC_018299	CGG	2	6	47477	47482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995372
1028	NC_018299	CA	3	6	47483	47488	50 %	0 %	0 %	50 %	399995372
1029	NC_018299	CGA	2	6	47511	47516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_018299	TAC	2	6	47532	47537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_018299	GAG	2	6	47570	47575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_018299	ATG	2	6	47576	47581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995373
1033	NC_018299	GAAC	2	8	47614	47621	50 %	0 %	25 %	25 %	399995373
1034	NC_018299	TGC	2	6	47644	47649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995373
1035	NC_018299	CGC	2	6	47722	47727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995373
1036	NC_018299	GGA	2	6	47770	47775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995373
1037	NC_018299	GC	3	6	47853	47858	0 %	0 %	50 %	50 %	399995374
1038	NC_018299	GTG	2	6	47908	47913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995374
1039	NC_018299	CGG	3	9	47938	47946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995374
1040	NC_018299	CGGCA	2	10	48033	48042	20 %	0 %	40 %	40 %	399995374
1041	NC_018299	AACGC	2	10	48058	48067	40 %	0 %	20 %	40 %	399995374
1042	NC_018299	TCGACG	2	12	48088	48099	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	399995374
1043	NC_018299	CGG	2	6	48104	48109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995374
1044	NC_018299	TGG	2	6	48157	48162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995374
1045	NC_018299	CGC	2	6	48167	48172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995374
1046	NC_018299	CCG	2	6	48193	48198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995374
1047	NC_018299	ATC	2	6	48205	48210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995374
1048	NC_018299	CG	3	6	48256	48261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1049	NC_018299	GCA	2	6	48339	48344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_018299	CGCA	2	8	48424	48431	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1051	NC_018299	ATG	2	6	48465	48470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_018299	TCCA	2	8	48474	48481	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1053	NC_018299	TGAG	2	8	48602	48609	25 %	25 %	50 %	0 %	399995375
1054	NC_018299	TCA	3	9	48650	48658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995375
1055	NC_018299	CGA	2	6	48720	48725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995375
1056	NC_018299	ATG	2	6	48727	48732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995375
1057	NC_018299	GAC	2	6	48757	48762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995375
1058	NC_018299	CGA	2	6	48864	48869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995375
1059	NC_018299	GCT	2	6	48895	48900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995375
1060	NC_018299	GGA	2	6	48960	48965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995375
1061	NC_018299	TCG	2	6	49186	49191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995376
1062	NC_018299	CGG	2	6	49207	49212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995376
1063	NC_018299	AAG	2	6	49213	49218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995376
1064	NC_018299	TGA	2	6	49241	49246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995376
1065	NC_018299	CG	3	6	49273	49278	0 %	0 %	50 %	50 %	399995376
1066	NC_018299	GCC	2	6	49349	49354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995376
1067	NC_018299	TCC	2	6	49414	49419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995376
1068	NC_018299	CGA	3	9	49430	49438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995376
1069	NC_018299	CGA	2	6	49514	49519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995376
1070	NC_018299	AGG	2	6	49529	49534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995376
1071	NC_018299	CG	3	6	49561	49566	0 %	0 %	50 %	50 %	399995376
1072	NC_018299	GAT	2	6	49632	49637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995376
1073	NC_018299	GCCT	2	8	49677	49684	0 %	25 %	25 %	50 %	399995377
1074	NC_018299	AAT	2	6	49740	49745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	399995377
1075	NC_018299	CGG	2	6	49754	49759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995377
1076	NC_018299	CCTG	2	8	49801	49808	0 %	25 %	25 %	50 %	399995377
1077	NC_018299	CGTG	2	8	49909	49916	0 %	25 %	50 %	25 %	399995377
1078	NC_018299	CCGCT	2	10	49980	49989	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1079	NC_018299	TG	3	6	49997	50002	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_018299	GAA	2	6	50027	50032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_018299	CG	3	6	50039	50044	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1082	NC_018299	TC	3	6	50154	50159	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1083	NC_018299	CCG	2	6	50175	50180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1084	NC_018299	TGAC	2	8	50197	50204	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1085	NC_018299	GGA	2	6	50209	50214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_018299	ATG	2	6	50273	50278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_018299	CGC	2	6	50279	50284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1088	NC_018299	TCCGGC	2	12	50333	50344	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1089	NC_018299	TTC	2	6	50360	50365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995378
1090	NC_018299	CCG	2	6	50403	50408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995378
1091	NC_018299	TTC	2	6	50427	50432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995378
1092	NC_018299	CAC	2	6	50446	50451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995378
1093	NC_018299	CGC	2	6	50498	50503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1094	NC_018299	GCT	2	6	50516	50521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_018299	CCGA	2	8	50537	50544	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1096	NC_018299	GC	3	6	50630	50635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1097	NC_018299	TGAGA	2	10	50637	50646	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_018299	CGC	2	6	50647	50652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1099	NC_018299	AAG	2	6	50737	50742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_018299	GGGC	2	8	50786	50793	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1101	NC_018299	GCA	2	6	50798	50803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_018299	TGC	2	6	50920	50925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_018299	GCCA	2	8	50954	50961	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1104	NC_018299	AGAT	2	8	51029	51036	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_018299	TCT	2	6	51044	51049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_018299	CTG	2	6	51088	51093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_018299	GAT	2	6	51100	51105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_018299	T	6	6	51123	51128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_018299	AGC	2	6	51209	51214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_018299	ACG	2	6	51239	51244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_018299	GCT	2	6	51272	51277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_018299	CTC	2	6	51316	51321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1113	NC_018299	GCC	2	6	51491	51496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1114	NC_018299	AGAA	2	8	51506	51513	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_018299	GC	3	6	51553	51558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1116	NC_018299	CG	3	6	51634	51639	0 %	0 %	50 %	50 %	399995379
1117	NC_018299	CGA	2	6	51823	51828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995380
1118	NC_018299	CGC	3	9	51923	51931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995380
1119	NC_018299	GCT	2	6	51948	51953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995380
1120	NC_018299	CTG	2	6	51959	51964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995380
1121	NC_018299	GAC	2	6	52016	52021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995380
1122	NC_018299	GTCA	2	8	52022	52029	25 %	25 %	25 %	25 %	399995380
1123	NC_018299	TTC	3	9	52091	52099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995380
1124	NC_018299	CTT	2	6	52132	52137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995380
1125	NC_018299	GCC	3	9	52140	52148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995380
1126	NC_018299	GCC	2	6	52157	52162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995380
1127	NC_018299	GGC	2	6	52256	52261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_018299	CAT	2	6	52276	52281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1130	NC_018299	CGTG	2	8	52372	52379	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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