MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d

Total Repeats: 5311

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018299	GATC	2	8	23062	23069	25 %	25 %	25 %	25 %	399995344
502	NC_018299	CATC	2	8	23140	23147	25 %	25 %	0 %	50 %	399995344
503	NC_018299	GAG	2	6	23155	23160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995344
504	NC_018299	CGTC	2	8	23206	23213	0 %	25 %	25 %	50 %	399995344
505	NC_018299	GC	3	6	23272	23277	0 %	0 %	50 %	50 %	399995344
506	NC_018299	TCC	2	6	23292	23297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995344
507	NC_018299	GC	3	6	23338	23343	0 %	0 %	50 %	50 %	399995344
508	NC_018299	TCC	2	6	23454	23459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
509	NC_018299	CGC	2	6	23522	23527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
510	NC_018299	GCC	2	6	23564	23569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
511	NC_018299	CGCC	2	8	23607	23614	0 %	0 %	25 %	75 %	399995345
512	NC_018299	GTC	2	6	23664	23669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995345
513	NC_018299	AGC	3	9	23736	23744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995345
514	NC_018299	CGT	2	6	23806	23811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995345
515	NC_018299	CG	4	8	23842	23849	0 %	0 %	50 %	50 %	399995345
516	NC_018299	AAT	2	6	23860	23865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	399995345
517	NC_018299	ACG	2	6	23961	23966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995345
518	NC_018299	CCG	2	6	24004	24009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995345
519	NC_018299	ATAA	2	8	24029	24036	75 %	25 %	0 %	0 %	399995345
520	NC_018299	GCC	2	6	24045	24050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995345
521	NC_018299	CGGC	2	8	24051	24058	0 %	0 %	50 %	50 %	399995345
522	NC_018299	TGA	2	6	24097	24102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995345
523	NC_018299	TCG	2	6	24252	24257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995345
524	NC_018299	CGA	2	6	24292	24297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995345
525	NC_018299	GTT	2	6	24311	24316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995345
526	NC_018299	CGCGT	2	10	24346	24355	0 %	20 %	40 %	40 %	399995345
527	NC_018299	CGA	2	6	24358	24363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995345
528	NC_018299	TCC	2	6	24429	24434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995345
529	NC_018299	CGCGAT	2	12	24449	24460	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	399995345
530	NC_018299	TGC	2	6	24485	24490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995345
531	NC_018299	ACC	2	6	24519	24524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995345
532	NC_018299	GC	3	6	24543	24548	0 %	0 %	50 %	50 %	399995345
533	NC_018299	TGG	2	6	24580	24585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995345
534	NC_018299	CG	3	6	24607	24612	0 %	0 %	50 %	50 %	399995345
535	NC_018299	ATTG	2	8	24640	24647	25 %	50 %	25 %	0 %	399995345
536	NC_018299	TCG	2	6	24663	24668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995345
537	NC_018299	CCG	2	6	24669	24674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995345
538	NC_018299	GAT	2	6	24731	24736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995345
539	NC_018299	GCG	2	6	24783	24788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995345
540	NC_018299	CGA	2	6	24808	24813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995345
541	NC_018299	GAA	2	6	24833	24838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995345
542	NC_018299	CG	4	8	24863	24870	0 %	0 %	50 %	50 %	399995345
543	NC_018299	CGA	2	6	24901	24906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995345
544	NC_018299	GGA	2	6	24907	24912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995345
545	NC_018299	GC	3	6	24928	24933	0 %	0 %	50 %	50 %	399995345
546	NC_018299	GGC	2	6	24937	24942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995345
547	NC_018299	ACC	2	6	24972	24977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995345
548	NC_018299	TCG	2	6	24999	25004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995345
549	NC_018299	GCCA	2	8	25007	25014	25 %	0 %	25 %	50 %	399995345
550	NC_018299	GCC	2	6	25085	25090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995345
551	NC_018299	ACAA	2	8	25137	25144	75 %	0 %	0 %	25 %	399995345
552	NC_018299	AGC	2	6	25161	25166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995345
553	NC_018299	CCG	2	6	25191	25196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995345
554	NC_018299	CGA	2	6	25255	25260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995345
555	NC_018299	CTT	2	6	25265	25270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995345
556	NC_018299	CTC	2	6	25274	25279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995345
557	NC_018299	GCT	2	6	25282	25287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995345
558	NC_018299	TCAA	2	8	25299	25306	50 %	25 %	0 %	25 %	399995345
559	NC_018299	ACG	2	6	25317	25322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995345
560	NC_018299	GCC	2	6	25347	25352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995345
561	NC_018299	AGCTG	2	10	25369	25378	20 %	20 %	40 %	20 %	399995345
562	NC_018299	CAA	2	6	25421	25426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995345
563	NC_018299	CGA	2	6	25432	25437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995345
564	NC_018299	CGGC	2	8	25475	25482	0 %	0 %	50 %	50 %	399995345
565	NC_018299	TTCG	2	8	25490	25497	0 %	50 %	25 %	25 %	399995345
566	NC_018299	CG	3	6	25524	25529	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
567	NC_018299	GGC	2	6	25717	25722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995346
568	NC_018299	GAG	2	6	25790	25795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995346
569	NC_018299	GCC	2	6	25800	25805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995346
570	NC_018299	TG	3	6	25832	25837	0 %	50 %	50 %	0 %	399995346
571	NC_018299	TGC	2	6	25957	25962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995346
572	NC_018299	CAG	2	6	25987	25992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995346
573	NC_018299	CG	3	6	26001	26006	0 %	0 %	50 %	50 %	399995346
574	NC_018299	TCG	3	9	26070	26078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995346
575	NC_018299	ATC	2	6	26135	26140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995346
576	NC_018299	TGG	2	6	26163	26168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995346
577	NC_018299	AGCCAT	2	12	26217	26228	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_018299	GA	3	6	26392	26397	50 %	0 %	50 %	0 %	399995347
579	NC_018299	CGA	2	6	26457	26462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995347
580	NC_018299	GAT	2	6	26464	26469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995347
581	NC_018299	AGC	2	6	26685	26690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995347
582	NC_018299	TCG	2	6	26696	26701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995347
583	NC_018299	CGT	2	6	26721	26726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995347
584	NC_018299	GC	3	6	26742	26747	0 %	0 %	50 %	50 %	399995347
585	NC_018299	CGC	2	6	26760	26765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995347
586	NC_018299	TGC	2	6	26781	26786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995347
587	NC_018299	AGGC	2	8	26822	26829	25 %	0 %	50 %	25 %	399995347
588	NC_018299	ACA	2	6	26935	26940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995347
589	NC_018299	GGGC	2	8	27093	27100	0 %	0 %	75 %	25 %	399995347
590	NC_018299	GTG	2	6	27125	27130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995347
591	NC_018299	GC	3	6	27170	27175	0 %	0 %	50 %	50 %	399995347
592	NC_018299	ATG	2	6	27205	27210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995347
593	NC_018299	GCC	2	6	27226	27231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995347
594	NC_018299	GAC	2	6	27392	27397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995347
595	NC_018299	CTT	2	6	27400	27405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995347
596	NC_018299	GC	4	8	27437	27444	0 %	0 %	50 %	50 %	399995347
597	NC_018299	TGG	2	6	27461	27466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995347
598	NC_018299	TGCG	2	8	27506	27513	0 %	25 %	50 %	25 %	399995347
599	NC_018299	CAG	2	6	27549	27554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995347
600	NC_018299	CGT	2	6	27586	27591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995347
601	NC_018299	TGC	2	6	27594	27599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995347
602	NC_018299	GTT	2	6	27606	27611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995347
603	NC_018299	ACCA	2	8	27617	27624	50 %	0 %	0 %	50 %	399995347
604	NC_018299	CG	3	6	27738	27743	0 %	0 %	50 %	50 %	399995348
605	NC_018299	CTC	2	6	27754	27759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995348
606	NC_018299	AAGG	2	8	27763	27770	50 %	0 %	50 %	0 %	399995348
607	NC_018299	TCG	2	6	27783	27788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_018299	AGC	2	6	27882	27887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_018299	GCC	2	6	27920	27925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
610	NC_018299	TCG	2	6	27972	27977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_018299	CCA	2	6	28002	28007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995349
612	NC_018299	ACG	2	6	28161	28166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995349
613	NC_018299	CG	3	6	28165	28170	0 %	0 %	50 %	50 %	399995349
614	NC_018299	CAC	2	6	28260	28265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
615	NC_018299	AGA	2	6	28268	28273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_018299	TCT	2	6	28367	28372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995350
617	NC_018299	ATA	2	6	28515	28520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	399995350
618	NC_018299	TCC	2	6	28534	28539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995350
619	NC_018299	TCC	2	6	28543	28548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995350
620	NC_018299	TTC	2	6	28600	28605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995350
621	NC_018299	CGA	2	6	28655	28660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995350
622	NC_018299	CGGC	2	8	28751	28758	0 %	0 %	50 %	50 %	399995350
623	NC_018299	GCG	2	6	28788	28793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995350
624	NC_018299	CT	3	6	28821	28826	0 %	50 %	0 %	50 %	399995350
625	NC_018299	CTC	2	6	28890	28895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995350
626	NC_018299	TGG	2	6	28904	28909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995350
627	NC_018299	CGC	2	6	28918	28923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995350
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