MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d

Total Repeats: 572

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018294	GC	3	6	224	229	0 %	0 %	50 %	50 %	399995010
2	NC_018294	CG	3	6	262	267	0 %	0 %	50 %	50 %	399995010
3	NC_018294	CG	3	6	594	599	0 %	0 %	50 %	50 %	399995010
4	NC_018294	GC	3	6	908	913	0 %	0 %	50 %	50 %	399995011
5	NC_018294	GC	3	6	1619	1624	0 %	0 %	50 %	50 %	399995011
6	NC_018294	TG	3	6	2063	2068	0 %	50 %	50 %	0 %	399995012
7	NC_018294	GC	3	6	2081	2086	0 %	0 %	50 %	50 %	399995012
8	NC_018294	CG	3	6	2129	2134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_018294	GA	3	6	2446	2451	50 %	0 %	50 %	0 %	399995013
10	NC_018294	GC	3	6	2546	2551	0 %	0 %	50 %	50 %	399995013
11	NC_018294	GA	3	6	3337	3342	50 %	0 %	50 %	0 %	399995013
12	NC_018294	TC	3	6	3950	3955	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_018294	TG	3	6	4240	4245	0 %	50 %	50 %	0 %	399995014
14	NC_018294	GC	3	6	4440	4445	0 %	0 %	50 %	50 %	399995014
15	NC_018294	GC	3	6	4728	4733	0 %	0 %	50 %	50 %	399995015
16	NC_018294	CG	3	6	5532	5537	0 %	0 %	50 %	50 %	399995016
17	NC_018294	TG	3	6	5814	5819	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018294	CG	3	6	6027	6032	0 %	0 %	50 %	50 %	399995017
19	NC_018294	GC	3	6	6043	6048	0 %	0 %	50 %	50 %	399995017
20	NC_018294	CG	3	6	6111	6116	0 %	0 %	50 %	50 %	399995017
21	NC_018294	GC	3	6	6190	6195	0 %	0 %	50 %	50 %	399995017
22	NC_018294	GC	3	6	6544	6549	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_018294	CT	3	6	7116	7121	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_018294	AC	3	6	8736	8741	50 %	0 %	0 %	50 %	399995021
25	NC_018294	CA	3	6	9182	9187	50 %	0 %	0 %	50 %	399995022
26	NC_018294	GC	3	6	10586	10591	0 %	0 %	50 %	50 %	399995025
27	NC_018294	GC	3	6	11365	11370	0 %	0 %	50 %	50 %	399995027
28	NC_018294	CG	3	6	11403	11408	0 %	0 %	50 %	50 %	399995027
29	NC_018294	CG	3	6	11735	11740	0 %	0 %	50 %	50 %	399995027
30	NC_018294	TC	3	6	12310	12315	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_018294	GA	3	6	12429	12434	50 %	0 %	50 %	0 %	399995028
32	NC_018294	AG	3	6	12453	12458	50 %	0 %	50 %	0 %	399995028
33	NC_018294	CG	3	6	13292	13297	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_018294	CG	3	6	14678	14683	0 %	0 %	50 %	50 %	399995031
35	NC_018294	GC	3	6	15480	15485	0 %	0 %	50 %	50 %	399995032
36	NC_018294	CG	3	6	15813	15818	0 %	0 %	50 %	50 %	399995032
37	NC_018294	GC	3	6	15851	15856	0 %	0 %	50 %	50 %	399995032
38	NC_018294	CG	3	6	16825	16830	0 %	0 %	50 %	50 %	399995035
39	NC_018294	GC	3	6	17025	17030	0 %	0 %	50 %	50 %	399995035
40	NC_018294	GC	3	6	17740	17745	0 %	0 %	50 %	50 %	399995036
41	NC_018294	CG	3	6	18094	18099	0 %	0 %	50 %	50 %	399995036
42	NC_018294	GC	3	6	19367	19372	0 %	0 %	50 %	50 %	399995038
43	NC_018294	CG	3	6	19682	19687	0 %	0 %	50 %	50 %	399995038
44	NC_018294	CT	3	6	20410	20415	0 %	50 %	0 %	50 %	399995039
45	NC_018294	TC	3	6	22069	22074	0 %	50 %	0 %	50 %	399995041
46	NC_018294	TC	3	6	22583	22588	0 %	50 %	0 %	50 %	399995043
47	NC_018294	GC	3	6	22617	22622	0 %	0 %	50 %	50 %	399995043
48	NC_018294	GC	3	6	23016	23021	0 %	0 %	50 %	50 %	399995043
49	NC_018294	CG	3	6	23075	23080	0 %	0 %	50 %	50 %	399995043
50	NC_018294	GC	3	6	23160	23165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_018294	CG	3	6	24497	24502	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_018294	GA	3	6	25873	25878	50 %	0 %	50 %	0 %	399995048
53	NC_018294	AC	3	6	26283	26288	50 %	0 %	0 %	50 %	399995048
54	NC_018294	TC	3	6	27345	27350	0 %	50 %	0 %	50 %	399995049
55	NC_018294	GA	3	6	27604	27609	50 %	0 %	50 %	0 %	399995049
56	NC_018294	GC	4	8	28325	28332	0 %	0 %	50 %	50 %	399995050
57	NC_018294	CT	3	6	28520	28525	0 %	50 %	0 %	50 %	399995050
58	NC_018294	GA	3	6	28844	28849	50 %	0 %	50 %	0 %	399995051
59	NC_018294	CA	3	6	29190	29195	50 %	0 %	0 %	50 %	399995051
60	NC_018294	CG	3	6	29815	29820	0 %	0 %	50 %	50 %	399995051
61	NC_018294	GT	3	6	30239	30244	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018294	CG	3	6	30297	30302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_018294	CT	3	6	31929	31934	0 %	50 %	0 %	50 %	399995053
64	NC_018294	GT	3	6	32286	32291	0 %	50 %	50 %	0 %	399995053
65	NC_018294	GC	3	6	32581	32586	0 %	0 %	50 %	50 %	399995053
66	NC_018294	GC	3	6	32937	32942	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_018294	AG	3	6	33643	33648	50 %	0 %	50 %	0 %	399995054
68	NC_018294	GA	3	6	34116	34121	50 %	0 %	50 %	0 %	399995054
69	NC_018294	TC	3	6	34149	34154	0 %	50 %	0 %	50 %	399995054
70	NC_018294	AT	3	6	34527	34532	50 %	50 %	0 %	0 %	399995055
71	NC_018294	CG	3	6	35927	35932	0 %	0 %	50 %	50 %	399995057
72	NC_018294	GC	3	6	35985	35990	0 %	0 %	50 %	50 %	399995057
73	NC_018294	AG	3	6	37180	37185	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018294	CG	3	6	38423	38428	0 %	0 %	50 %	50 %	399995059
75	NC_018294	CG	4	8	38755	38762	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_018294	TG	3	6	38995	39000	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018294	GC	4	8	39138	39145	0 %	0 %	50 %	50 %	399995060
78	NC_018294	CG	3	6	39260	39265	0 %	0 %	50 %	50 %	399995060
79	NC_018294	CG	3	6	39535	39540	0 %	0 %	50 %	50 %	399995060
80	NC_018294	CG	3	6	40178	40183	0 %	0 %	50 %	50 %	399995061
81	NC_018294	CT	3	6	40263	40268	0 %	50 %	0 %	50 %	399995061
82	NC_018294	CG	3	6	40479	40484	0 %	0 %	50 %	50 %	399995061
83	NC_018294	CG	3	6	40690	40695	0 %	0 %	50 %	50 %	399995062
84	NC_018294	CG	3	6	40869	40874	0 %	0 %	50 %	50 %	399995062
85	NC_018294	GT	3	6	40942	40947	0 %	50 %	50 %	0 %	399995062
86	NC_018294	TA	3	6	41058	41063	50 %	50 %	0 %	0 %	399995062
87	NC_018294	CG	3	6	41163	41168	0 %	0 %	50 %	50 %	399995062
88	NC_018294	CG	3	6	41256	41261	0 %	0 %	50 %	50 %	399995062
89	NC_018294	CG	4	8	41953	41960	0 %	0 %	50 %	50 %	399995063
90	NC_018294	GT	3	6	42428	42433	0 %	50 %	50 %	0 %	399995063
91	NC_018294	GC	3	6	42901	42906	0 %	0 %	50 %	50 %	399995064
92	NC_018294	GC	3	6	43020	43025	0 %	0 %	50 %	50 %	399995064
93	NC_018294	CG	5	10	43035	43044	0 %	0 %	50 %	50 %	399995064
94	NC_018294	GC	3	6	43109	43114	0 %	0 %	50 %	50 %	399995064
95	NC_018294	GC	3	6	43191	43196	0 %	0 %	50 %	50 %	399995064
96	NC_018294	GC	3	6	43412	43417	0 %	0 %	50 %	50 %	399995064
97	NC_018294	CG	4	8	43546	43553	0 %	0 %	50 %	50 %	399995064
98	NC_018294	CG	3	6	43860	43865	0 %	0 %	50 %	50 %	399995064
99	NC_018294	GC	3	6	44017	44022	0 %	0 %	50 %	50 %	399995064
100	NC_018294	CG	3	6	44051	44056	0 %	0 %	50 %	50 %	399995064
101	NC_018294	GC	3	6	44212	44217	0 %	0 %	50 %	50 %	399995064
102	NC_018294	CG	3	6	44515	44520	0 %	0 %	50 %	50 %	399995064
103	NC_018294	CG	3	6	45334	45339	0 %	0 %	50 %	50 %	399995065
104	NC_018294	AT	3	6	48154	48159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018294	GT	3	6	48867	48872	0 %	50 %	50 %	0 %	399995069
106	NC_018294	CG	3	6	50962	50967	0 %	0 %	50 %	50 %	399995073
107	NC_018294	CT	3	6	51139	51144	0 %	50 %	0 %	50 %	399995073
108	NC_018294	GC	3	6	51181	51186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_018294	GA	3	6	51340	51345	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018294	GC	4	8	51484	51491	0 %	0 %	50 %	50 %	399995074
111	NC_018294	TC	3	6	51751	51756	0 %	50 %	0 %	50 %	399995074
112	NC_018294	CG	3	6	51975	51980	0 %	0 %	50 %	50 %	399995074
113	NC_018294	CG	3	6	52362	52367	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_018294	GC	3	6	52556	52561	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_018294	CG	3	6	53324	53329	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_018294	GC	3	6	53609	53614	0 %	0 %	50 %	50 %	399995077
117	NC_018294	GC	3	6	54320	54325	0 %	0 %	50 %	50 %	399995077
118	NC_018294	CG	4	8	54968	54975	0 %	0 %	50 %	50 %	399995078
119	NC_018294	GC	3	6	55581	55586	0 %	0 %	50 %	50 %	399995078
120	NC_018294	GT	3	6	55904	55909	0 %	50 %	50 %	0 %	399995078
121	NC_018294	CG	3	6	55926	55931	0 %	0 %	50 %	50 %	399995078
122	NC_018294	GA	3	6	56200	56205	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018294	GA	3	6	56319	56324	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018294	GC	3	6	56691	56696	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_018294	GC	3	6	57243	57248	0 %	0 %	50 %	50 %	399995079
126	NC_018294	GC	3	6	59121	59126	0 %	0 %	50 %	50 %	399995080
127	NC_018294	TC	3	6	59851	59856	0 %	50 %	0 %	50 %	399995081
128	NC_018294	GA	3	6	60251	60256	50 %	0 %	50 %	0 %	399995081
129	NC_018294	CG	3	6	61230	61235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_018294	CT	3	6	61637	61642	0 %	50 %	0 %	50 %	399995082
131	NC_018294	CG	3	6	62256	62261	0 %	0 %	50 %	50 %	399995083
132	NC_018294	TC	3	6	62395	62400	0 %	50 %	0 %	50 %	399995083
133	NC_018294	AC	3	6	62461	62466	50 %	0 %	0 %	50 %	399995083
134	NC_018294	GA	4	8	64323	64330	50 %	0 %	50 %	0 %	399995084
135	NC_018294	CG	3	6	64566	64571	0 %	0 %	50 %	50 %	399995084
136	NC_018294	GC	3	6	64608	64613	0 %	0 %	50 %	50 %	399995084
137	NC_018294	AT	3	6	64849	64854	50 %	50 %	0 %	0 %	399995085
138	NC_018294	GC	3	6	65398	65403	0 %	0 %	50 %	50 %	399995085
139	NC_018294	CG	3	6	65973	65978	0 %	0 %	50 %	50 %	399995087
140	NC_018294	GC	3	6	66040	66045	0 %	0 %	50 %	50 %	399995087
141	NC_018294	CG	3	6	66936	66941	0 %	0 %	50 %	50 %	399995088
142	NC_018294	GC	3	6	66975	66980	0 %	0 %	50 %	50 %	399995088
143	NC_018294	GA	3	6	67251	67256	50 %	0 %	50 %	0 %	399995088
144	NC_018294	GC	3	6	67641	67646	0 %	0 %	50 %	50 %	399995089
145	NC_018294	GC	3	6	67751	67756	0 %	0 %	50 %	50 %	399995089
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