MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d

Total Repeats: 5679

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_018294	TCA	2	6	169921	169926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_018294	TGC	2	6	170015	170020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_018294	CAG	2	6	170103	170108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_018294	AAC	2	6	170227	170232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_018294	GTT	2	6	170235	170240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_018294	CGG	2	6	170377	170382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995192
3507	NC_018294	GCGG	2	8	170406	170413	0 %	0 %	75 %	25 %	399995192
3508	NC_018294	ACC	2	6	170431	170436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995192
3509	NC_018294	CG	3	6	170455	170460	0 %	0 %	50 %	50 %	399995192
3510	NC_018294	CAC	2	6	170549	170554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995192
3511	NC_018294	CG	3	6	170594	170599	0 %	0 %	50 %	50 %	399995192
3512	NC_018294	AC	3	6	170688	170693	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3513	NC_018294	ATC	2	6	170876	170881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_018294	CGA	2	6	170908	170913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_018294	GCC	2	6	170949	170954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995193
3516	NC_018294	TG	3	6	170959	170964	0 %	50 %	50 %	0 %	399995193
3517	NC_018294	CTT	2	6	170992	170997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995193
3518	NC_018294	GTTG	2	8	171006	171013	0 %	50 %	50 %	0 %	399995193
3519	NC_018294	TGGT	2	8	171017	171024	0 %	50 %	50 %	0 %	399995193
3520	NC_018294	AG	3	6	171071	171076	50 %	0 %	50 %	0 %	399995193
3521	NC_018294	CAAG	2	8	171102	171109	50 %	0 %	25 %	25 %	399995193
3522	NC_018294	ATC	2	6	171178	171183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995193
3523	NC_018294	ACC	2	6	171230	171235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995193
3524	NC_018294	GGC	2	6	171238	171243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995193
3525	NC_018294	GCCC	2	8	171266	171273	0 %	0 %	25 %	75 %	399995193
3526	NC_018294	CG	3	6	171319	171324	0 %	0 %	50 %	50 %	399995193
3527	NC_018294	GACC	2	8	171333	171340	25 %	0 %	25 %	50 %	399995193
3528	NC_018294	CG	4	8	171554	171561	0 %	0 %	50 %	50 %	399995193
3529	NC_018294	GGC	2	6	171586	171591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995193
3530	NC_018294	TTGCC	2	10	171613	171622	0 %	40 %	20 %	40 %	399995193
3531	NC_018294	CGC	2	6	171655	171660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995193
3532	NC_018294	TGA	2	6	171669	171674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995193
3533	NC_018294	CGCA	2	8	171687	171694	25 %	0 %	25 %	50 %	399995193
3534	NC_018294	GTC	2	6	171772	171777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995193
3535	NC_018294	CG	3	6	171800	171805	0 %	0 %	50 %	50 %	399995193
3536	NC_018294	CTC	2	6	171912	171917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995193
3537	NC_018294	CAC	3	9	171971	171979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995194
3538	NC_018294	CCTG	2	8	172011	172018	0 %	25 %	25 %	50 %	399995194
3539	NC_018294	TAT	2	6	172149	172154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	399995194
3540	NC_018294	CGC	2	6	172185	172190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995194
3541	NC_018294	TCG	2	6	172229	172234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995194
3542	NC_018294	GCT	2	6	172242	172247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995194
3543	NC_018294	CGA	2	6	172331	172336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995194
3544	NC_018294	CTG	2	6	172375	172380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995194
3545	NC_018294	CGA	2	6	172416	172421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995194
3546	NC_018294	CGGG	2	8	172560	172567	0 %	0 %	75 %	25 %	399995194
3547	NC_018294	GGA	2	6	172593	172598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995194
3548	NC_018294	GTC	2	6	172615	172620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995194
3549	NC_018294	TTTCC	2	10	172623	172632	0 %	60 %	0 %	40 %	399995194
3550	NC_018294	GAC	2	6	172633	172638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995194
3551	NC_018294	TGG	2	6	172673	172678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995194
3552	NC_018294	CGG	2	6	172683	172688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995194
3553	NC_018294	CTG	2	6	172714	172719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995194
3554	NC_018294	CGG	2	6	172746	172751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995194
3555	NC_018294	TA	3	6	172846	172851	50 %	50 %	0 %	0 %	399995194
3556	NC_018294	TCG	3	9	173094	173102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995195
3557	NC_018294	GAT	2	6	173258	173263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995195
3558	NC_018294	AGC	2	6	173289	173294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995195
3559	NC_018294	CA	3	6	173319	173324	50 %	0 %	0 %	50 %	399995195
3560	NC_018294	GAC	2	6	173345	173350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995195
3561	NC_018294	GCG	2	6	173426	173431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995195
3562	NC_018294	GAC	2	6	173452	173457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995195
3563	NC_018294	TGC	2	6	173479	173484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995195
3564	NC_018294	CCT	2	6	173569	173574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995195
3565	NC_018294	TCA	2	6	173661	173666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995195
3566	NC_018294	GGC	2	6	173710	173715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995195
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3568	NC_018294	CAA	2	6	173761	173766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995195
3569	NC_018294	ACC	2	6	173856	173861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995195
3570	NC_018294	GCG	2	6	173906	173911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995195
3571	NC_018294	CAA	2	6	173995	174000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995195
3572	NC_018294	GGCGA	2	10	174053	174062	20 %	0 %	60 %	20 %	399995195
3573	NC_018294	CGC	2	6	174064	174069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995195
3574	NC_018294	TC	3	6	174106	174111	0 %	50 %	0 %	50 %	399995195
3575	NC_018294	GCCC	2	8	174175	174182	0 %	0 %	25 %	75 %	399995195
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3578	NC_018294	TTA	2	6	174309	174314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	399995195
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3580	NC_018294	GGC	2	6	174455	174460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3581	NC_018294	GCA	2	6	174477	174482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3582	NC_018294	GTT	2	6	174517	174522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_018294	TGAA	2	8	174545	174552	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_018294	GGAT	2	8	174576	174583	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_018294	AG	3	6	174618	174623	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_018294	ATTG	2	8	174631	174638	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_018294	GGC	2	6	174769	174774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3588	NC_018294	ACG	2	6	174806	174811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3589	NC_018294	CAGC	2	8	174936	174943	25 %	0 %	25 %	50 %	399995196
3590	NC_018294	GCG	2	6	174997	175002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995196
3591	NC_018294	TCG	2	6	175011	175016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995196
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3594	NC_018294	TGC	2	6	175093	175098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995196
3595	NC_018294	ATAG	2	8	175109	175116	50 %	25 %	25 %	0 %	399995196
3596	NC_018294	TCG	2	6	175119	175124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995196
3597	NC_018294	CCA	2	6	175296	175301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995196
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3599	NC_018294	AACC	2	8	175455	175462	50 %	0 %	0 %	50 %	399995196
3600	NC_018294	CTC	2	6	175565	175570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995196
3601	NC_018294	TTC	2	6	175598	175603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995196
3602	NC_018294	A	6	6	175636	175641	100 %	0 %	0 %	0 %	399995196
3603	NC_018294	TC	3	6	175734	175739	0 %	50 %	0 %	50 %	399995196
3604	NC_018294	GC	3	6	175741	175746	0 %	0 %	50 %	50 %	399995196
3605	NC_018294	CGA	2	6	175786	175791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995196
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3607	NC_018294	GGC	2	6	175865	175870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995196
3608	NC_018294	CCA	2	6	175908	175913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995196
3609	NC_018294	CGG	2	6	175929	175934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995196
3610	NC_018294	TAT	2	6	175964	175969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	399995196
3611	NC_018294	CT	3	6	175986	175991	0 %	50 %	0 %	50 %	399995196
3612	NC_018294	GCC	2	6	175996	176001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995196
3613	NC_018294	CCG	2	6	176161	176166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995196
3614	NC_018294	CG	3	6	176179	176184	0 %	0 %	50 %	50 %	399995196
3615	NC_018294	TTC	2	6	176236	176241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995196
3616	NC_018294	CGGT	2	8	176328	176335	0 %	25 %	50 %	25 %	399995196
3617	NC_018294	TCA	2	6	176400	176405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995196
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3619	NC_018294	GC	3	6	176569	176574	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3620	NC_018294	CAC	2	6	176929	176934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995197
3621	NC_018294	GTGTC	2	10	177032	177041	0 %	40 %	40 %	20 %	399995197
3622	NC_018294	CCA	2	6	177218	177223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995197
3623	NC_018294	CGA	2	6	177249	177254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995197
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3998	NC_018294	CGA	2	6	196517	196522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995221
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