MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d

Total Repeats: 5679

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_018294	CCT	2	6	146629	146634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995170
3003	NC_018294	ATGC	2	8	146682	146689	25 %	25 %	25 %	25 %	399995170
3004	NC_018294	ACG	2	6	146691	146696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995170
3005	NC_018294	ATC	2	6	146736	146741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995170
3006	NC_018294	GCA	2	6	146775	146780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995171
3007	NC_018294	GCC	2	6	146840	146845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995171
3008	NC_018294	CGT	2	6	146880	146885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995171
3009	NC_018294	GCC	2	6	146909	146914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995171
3010	NC_018294	CG	4	8	146946	146953	0 %	0 %	50 %	50 %	399995171
3011	NC_018294	GAT	2	6	147019	147024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995171
3012	NC_018294	TCC	2	6	147050	147055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995171
3013	NC_018294	CCT	2	6	147057	147062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995171
3014	NC_018294	TCGCC	2	10	147069	147078	0 %	20 %	20 %	60 %	399995171
3015	NC_018294	GCG	2	6	147081	147086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995171
3016	NC_018294	CCG	2	6	147203	147208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995171
3017	NC_018294	CGT	2	6	147268	147273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995171
3018	NC_018294	CG	3	6	147306	147311	0 %	0 %	50 %	50 %	399995171
3019	NC_018294	CGA	2	6	147324	147329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995171
3020	NC_018294	GCC	2	6	147420	147425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995171
3021	NC_018294	TTG	2	6	147470	147475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995171
3022	NC_018294	TAG	2	6	147482	147487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995171
3023	NC_018294	TCG	2	6	147549	147554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995171
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3026	NC_018294	GCT	2	6	147609	147614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995171
3027	NC_018294	CTC	2	6	147643	147648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995171
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3030	NC_018294	CGGA	2	8	147837	147844	25 %	0 %	50 %	25 %	399995171
3031	NC_018294	CTT	2	6	147847	147852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995171
3032	NC_018294	TCG	2	6	147911	147916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995171
3033	NC_018294	ATC	2	6	147938	147943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995171
3034	NC_018294	GAC	2	6	147976	147981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995171
3035	NC_018294	TCG	2	6	148040	148045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995171
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3038	NC_018294	CATA	2	8	148084	148091	50 %	25 %	0 %	25 %	399995171
3039	NC_018294	AC	3	6	148114	148119	50 %	0 %	0 %	50 %	399995171
3040	NC_018294	CAT	2	6	148122	148127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995171
3041	NC_018294	TCG	2	6	148131	148136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995171
3042	NC_018294	ACC	2	6	148191	148196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995171
3043	NC_018294	CTTC	2	8	148198	148205	0 %	50 %	0 %	50 %	399995171
3044	NC_018294	TTC	2	6	148283	148288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3045	NC_018294	TCG	2	6	148298	148303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_018294	CAG	2	6	148316	148321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_018294	GGC	2	6	148426	148431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_018294	CCG	2	6	148442	148447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3049	NC_018294	GGC	2	6	148463	148468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_018294	GC	3	6	148504	148509	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3051	NC_018294	CCCG	2	8	148515	148522	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3052	NC_018294	CG	3	6	148532	148537	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3053	NC_018294	GCG	2	6	148614	148619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_018294	TCG	2	6	148666	148671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_018294	CT	3	6	148707	148712	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3056	NC_018294	TTC	2	6	148788	148793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995172
3057	NC_018294	CGC	2	6	148938	148943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995173
3058	NC_018294	TTA	2	6	148970	148975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	399995173
3059	NC_018294	GGT	2	6	149039	149044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995173
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3061	NC_018294	GC	3	6	149143	149148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3062	NC_018294	CAT	2	6	149204	149209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_018294	CG	3	6	149309	149314	0 %	0 %	50 %	50 %	399995174
3064	NC_018294	CGG	2	6	149421	149426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995174
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3068	NC_018294	CTG	2	6	149512	149517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995174
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3073	NC_018294	CAGCG	2	10	149683	149692	20 %	0 %	40 %	40 %	399995174
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3093	NC_018294	GTA	2	6	150594	150599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995175
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3102	NC_018294	CGC	2	6	150990	150995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3103	NC_018294	CCT	2	6	151002	151007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3104	NC_018294	CGG	2	6	151082	151087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_018294	GTT	2	6	151121	151126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_018294	GCT	2	6	151135	151140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_018294	CAA	2	6	151288	151293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995176
3108	NC_018294	TTC	2	6	151323	151328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995176
3109	NC_018294	CGGC	2	8	151365	151372	0 %	0 %	50 %	50 %	399995176
3110	NC_018294	GTC	3	9	151415	151423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995176
3111	NC_018294	TCG	2	6	151458	151463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995176
3112	NC_018294	CG	3	6	151486	151491	0 %	0 %	50 %	50 %	399995176
3113	NC_018294	AGC	2	6	151504	151509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995176
3114	NC_018294	TC	3	6	151625	151630	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3115	NC_018294	A	6	6	151647	151652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_018294	GAG	2	6	151830	151835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_018294	CGG	2	6	151879	151884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_018294	ACGG	2	8	152053	152060	25 %	0 %	50 %	25 %	399995177
3119	NC_018294	CGG	2	6	152075	152080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995177
3120	NC_018294	GAT	2	6	152130	152135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995177
3121	NC_018294	GC	3	6	152150	152155	0 %	0 %	50 %	50 %	399995177
3122	NC_018294	GCC	2	6	152208	152213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995177
3123	NC_018294	A	8	8	152241	152248	100 %	0 %	0 %	0 %	399995177
3124	NC_018294	AGCG	2	8	152250	152257	25 %	0 %	50 %	25 %	399995177
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3127	NC_018294	GACCT	2	10	152307	152316	20 %	20 %	20 %	40 %	399995177
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3129	NC_018294	TGTTA	2	10	152432	152441	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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3133	NC_018294	CGG	2	6	152607	152612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3134	NC_018294	CG	3	6	152613	152618	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3135	NC_018294	GCC	2	6	152686	152691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3402	NC_018294	CGC	2	6	164390	164395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995186
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3481	NC_018294	GT	3	6	168861	168866	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3483	NC_018294	CTGT	2	8	168968	168975	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3486	NC_018294	GGC	2	6	169031	169036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3487	NC_018294	T	6	6	169050	169055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3488	NC_018294	A	7	7	169082	169088	100 %	0 %	0 %	0 %	399995190
3489	NC_018294	CGA	2	6	169123	169128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995190
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