MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d

Total Repeats: 5679

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018294	TCT	3	9	23991	23999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995044
502	NC_018294	ACG	2	6	24029	24034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995045
503	NC_018294	AGG	2	6	24039	24044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995045
504	NC_018294	CCG	2	6	24117	24122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
505	NC_018294	CGC	2	6	24154	24159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
506	NC_018294	GCTG	2	8	24171	24178	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
507	NC_018294	GAA	2	6	24197	24202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_018294	CGA	2	6	24242	24247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_018294	A	6	6	24325	24330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_018294	GTTT	2	8	24355	24362	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
511	NC_018294	TCGG	2	8	24366	24373	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
512	NC_018294	GGA	2	6	24394	24399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
513	NC_018294	CG	3	6	24497	24502	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
514	NC_018294	TCT	2	6	24541	24546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995046
515	NC_018294	AGC	2	6	24582	24587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995046
516	NC_018294	CGG	2	6	24896	24901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995046
517	NC_018294	TTCG	2	8	25014	25021	0 %	50 %	25 %	25 %	399995046
518	NC_018294	CGC	2	6	25032	25037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995046
519	NC_018294	CTTG	2	8	25042	25049	0 %	50 %	25 %	25 %	399995046
520	NC_018294	GTG	3	9	25069	25077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995046
521	NC_018294	GCAA	2	8	25094	25101	50 %	0 %	25 %	25 %	399995046
522	NC_018294	TCA	2	6	25110	25115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995046
523	NC_018294	CGCA	2	8	25302	25309	25 %	0 %	25 %	50 %	399995047
524	NC_018294	CCA	2	6	25385	25390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995047
525	NC_018294	TTC	2	6	25429	25434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995047
526	NC_018294	GTA	2	6	25440	25445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995047
527	NC_018294	GTC	2	6	25573	25578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995047
528	NC_018294	CGC	2	6	25615	25620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995047
529	NC_018294	TTTCG	2	10	25650	25659	0 %	60 %	20 %	20 %	399995047
530	NC_018294	TCC	2	6	25717	25722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
531	NC_018294	GA	3	6	25873	25878	50 %	0 %	50 %	0 %	399995048
532	NC_018294	AGC	2	6	25883	25888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995048
533	NC_018294	TCG	2	6	25955	25960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995048
534	NC_018294	CGGG	2	8	25983	25990	0 %	0 %	75 %	25 %	399995048
535	NC_018294	GCCCT	2	10	26011	26020	0 %	20 %	20 %	60 %	399995048
536	NC_018294	GTC	2	6	26032	26037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995048
537	NC_018294	A	7	7	26050	26056	100 %	0 %	0 %	0 %	399995048
538	NC_018294	AAG	2	6	26058	26063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995048
539	NC_018294	CTG	2	6	26089	26094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995048
540	NC_018294	CTG	2	6	26143	26148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995048
541	NC_018294	TCG	2	6	26200	26205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995048
542	NC_018294	TCT	2	6	26262	26267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995048
543	NC_018294	AC	3	6	26283	26288	50 %	0 %	0 %	50 %	399995048
544	NC_018294	TTCTT	2	10	26435	26444	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
545	NC_018294	AGG	2	6	26451	26456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
546	NC_018294	CGG	2	6	26522	26527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_018294	GCT	2	6	26530	26535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_018294	GCT	2	6	26706	26711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_018294	TGC	2	6	26728	26733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_018294	GAT	3	9	26908	26916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995049
551	NC_018294	CCT	2	6	26960	26965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995049
552	NC_018294	CTG	2	6	27004	27009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995049
553	NC_018294	A	6	6	27148	27153	100 %	0 %	0 %	0 %	399995049
554	NC_018294	TCC	2	6	27226	27231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995049
555	NC_018294	GCT	2	6	27242	27247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995049
556	NC_018294	GCG	2	6	27302	27307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995049
557	NC_018294	TC	3	6	27345	27350	0 %	50 %	0 %	50 %	399995049
558	NC_018294	CAC	2	6	27419	27424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995049
559	NC_018294	GCA	2	6	27458	27463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995049
560	NC_018294	CGG	2	6	27476	27481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995049
561	NC_018294	CAC	2	6	27501	27506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995049
562	NC_018294	ATG	2	6	27598	27603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995049
563	NC_018294	GA	3	6	27604	27609	50 %	0 %	50 %	0 %	399995049
564	NC_018294	GCA	2	6	27617	27622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995049
565	NC_018294	TCG	2	6	27700	27705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995049
566	NC_018294	GGCT	2	8	27748	27755	0 %	25 %	50 %	25 %	399995049
567	NC_018294	TGC	2	6	27764	27769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995049
568	NC_018294	TCA	2	6	27797	27802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995049
569	NC_018294	GAG	2	6	27819	27824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995049
570	NC_018294	TTAA	2	8	27921	27928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_018294	CGCC	2	8	27962	27969	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
572	NC_018294	CCT	2	6	27982	27987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
573	NC_018294	GCC	2	6	28120	28125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995050
574	NC_018294	CGC	2	6	28148	28153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995050
575	NC_018294	GACGG	2	10	28156	28165	20 %	0 %	60 %	20 %	399995050
576	NC_018294	AGC	2	6	28168	28173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995050
577	NC_018294	A	6	6	28202	28207	100 %	0 %	0 %	0 %	399995050
578	NC_018294	AAAGAA	2	12	28256	28267	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	399995050
579	NC_018294	GTC	2	6	28312	28317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995050
580	NC_018294	GC	4	8	28325	28332	0 %	0 %	50 %	50 %	399995050
581	NC_018294	GAA	2	6	28333	28338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995050
582	NC_018294	TCG	2	6	28360	28365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995050
583	NC_018294	GGA	2	6	28408	28413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995050
584	NC_018294	GTC	2	6	28463	28468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995050
585	NC_018294	GCC	2	6	28482	28487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995050
586	NC_018294	CCA	2	6	28510	28515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995050
587	NC_018294	CT	3	6	28520	28525	0 %	50 %	0 %	50 %	399995050
588	NC_018294	TGCG	2	8	28539	28546	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
589	NC_018294	CATTT	2	10	28607	28616	20 %	60 %	0 %	20 %	399995051
590	NC_018294	GAT	2	6	28637	28642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995051
591	NC_018294	GA	3	6	28844	28849	50 %	0 %	50 %	0 %	399995051
592	NC_018294	AAC	2	6	28872	28877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995051
593	NC_018294	GTG	2	6	28911	28916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995051
594	NC_018294	GCC	2	6	28919	28924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995051
595	NC_018294	CCT	2	6	29017	29022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995051
596	NC_018294	CGA	2	6	29032	29037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995051
597	NC_018294	TCCA	2	8	29069	29076	25 %	25 %	0 %	50 %	399995051
598	NC_018294	ACA	2	6	29107	29112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995051
599	NC_018294	TTC	2	6	29121	29126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995051
600	NC_018294	CTC	2	6	29177	29182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995051
601	NC_018294	TTC	2	6	29184	29189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995051
602	NC_018294	CA	3	6	29190	29195	50 %	0 %	0 %	50 %	399995051
603	NC_018294	CGG	2	6	29242	29247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995051
604	NC_018294	TCGA	2	8	29277	29284	25 %	25 %	25 %	25 %	399995051
605	NC_018294	GATG	2	8	29285	29292	25 %	25 %	50 %	0 %	399995051
606	NC_018294	CCG	2	6	29368	29373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995051
607	NC_018294	ACA	2	6	29374	29379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995051
608	NC_018294	CTC	2	6	29393	29398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995051
609	NC_018294	GCC	2	6	29418	29423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995051
610	NC_018294	GCC	3	9	29475	29483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995051
611	NC_018294	GTATCC	2	12	29558	29569	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	399995051
612	NC_018294	GCG	2	6	29622	29627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995051
613	NC_018294	GCA	2	6	29689	29694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995051
614	NC_018294	GCG	2	6	29739	29744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995051
615	NC_018294	CG	3	6	29815	29820	0 %	0 %	50 %	50 %	399995051
616	NC_018294	TGA	2	6	29857	29862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995051
617	NC_018294	GTG	2	6	29866	29871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995051
618	NC_018294	ATTC	2	8	30113	30120	25 %	50 %	0 %	25 %	399995051
619	NC_018294	CTG	2	6	30146	30151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_018294	A	7	7	30165	30171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_018294	GT	3	6	30239	30244	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
622	NC_018294	CG	3	6	30297	30302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
623	NC_018294	GGTC	2	8	30318	30325	0 %	25 %	50 %	25 %	399995052
624	NC_018294	CGC	2	6	30354	30359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995052
625	NC_018294	CGGG	2	8	30382	30389	0 %	0 %	75 %	25 %	399995052
626	NC_018294	GCA	2	6	30457	30462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995052
627	NC_018294	CCGA	2	8	30494	30501	25 %	0 %	25 %	50 %	399995052
628	NC_018294	CAA	2	6	30537	30542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995052
629	NC_018294	CGA	2	6	30546	30551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995052
630	NC_018294	AGC	2	6	30575	30580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995052
631	NC_018294	GATGCA	2	12	30589	30600	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	399995052
632	NC_018294	GCT	2	6	30675	30680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995052
633	NC_018294	CAGCA	2	10	30721	30730	40 %	0 %	20 %	40 %	399995052
634	NC_018294	ACC	2	6	30751	30756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995052
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652	NC_018294	GCA	2	6	31905	31910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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