MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d

Total Repeats: 5679

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_018294	GCCGC	2	10	242539	242548	0 %	0 %	40 %	60 %	399995274
5002	NC_018294	CGA	2	6	242580	242585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995274
5003	NC_018294	GCA	2	6	242592	242597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995274
5004	NC_018294	CGC	2	6	242706	242711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995274
5005	NC_018294	GCC	2	6	242798	242803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995274
5006	NC_018294	CG	3	6	242814	242819	0 %	0 %	50 %	50 %	399995274
5007	NC_018294	GC	3	6	242829	242834	0 %	0 %	50 %	50 %	399995274
5008	NC_018294	AGT	2	6	242918	242923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995274
5009	NC_018294	TCA	2	6	242949	242954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995274
5010	NC_018294	CCAG	2	8	242976	242983	25 %	0 %	25 %	50 %	399995274
5011	NC_018294	CG	3	6	243007	243012	0 %	0 %	50 %	50 %	399995274
5012	NC_018294	GCA	2	6	243015	243020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995274
5013	NC_018294	AGC	2	6	243128	243133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995274
5014	NC_018294	CAG	2	6	243142	243147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995274
5015	NC_018294	CGG	2	6	243158	243163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995274
5016	NC_018294	CG	3	6	243178	243183	0 %	0 %	50 %	50 %	399995274
5017	NC_018294	GCC	2	6	243231	243236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995274
5018	NC_018294	TGA	2	6	243260	243265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995274
5019	NC_018294	GCA	2	6	243268	243273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995274
5020	NC_018294	TCG	2	6	243274	243279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995274
5021	NC_018294	CCA	2	6	243293	243298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995274
5022	NC_018294	CAC	2	6	243334	243339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995274
5023	NC_018294	TCC	2	6	243371	243376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995274
5024	NC_018294	CCG	2	6	243415	243420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5025	NC_018294	GC	3	6	243444	243449	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5026	NC_018294	TCGCCA	2	12	243450	243461	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5027	NC_018294	GGC	2	6	243485	243490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_018294	CTGG	2	8	243500	243507	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5029	NC_018294	AGC	2	6	243513	243518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_018294	CGG	2	6	243520	243525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_018294	GCAC	2	8	243610	243617	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5032	NC_018294	GGT	2	6	243623	243628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_018294	ACG	2	6	243651	243656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_018294	C	8	8	243667	243674	0 %	0 %	0 %	100 %	399995275
5035	NC_018294	GC	3	6	243698	243703	0 %	0 %	50 %	50 %	399995275
5036	NC_018294	GCT	2	6	243740	243745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995275
5037	NC_018294	GC	3	6	243768	243773	0 %	0 %	50 %	50 %	399995275
5038	NC_018294	GTCG	2	8	243870	243877	0 %	25 %	50 %	25 %	399995275
5039	NC_018294	GCC	2	6	243894	243899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995275
5040	NC_018294	CG	3	6	243919	243924	0 %	0 %	50 %	50 %	399995275
5041	NC_018294	GCCG	2	8	243969	243976	0 %	0 %	50 %	50 %	399995275
5042	NC_018294	TTC	2	6	244000	244005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995275
5043	NC_018294	CAC	2	6	244011	244016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995275
5044	NC_018294	GCC	2	6	244017	244022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995275
5045	NC_018294	CGCAG	2	10	244079	244088	20 %	0 %	40 %	40 %	399995275
5046	NC_018294	CTT	2	6	244091	244096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995275
5047	NC_018294	CGA	2	6	244097	244102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995275
5048	NC_018294	GCA	2	6	244189	244194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995275
5049	NC_018294	GTG	2	6	244195	244200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995275
5050	NC_018294	GCC	2	6	244206	244211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995275
5051	NC_018294	CAG	2	6	244212	244217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995275
5052	NC_018294	TCG	3	9	244267	244275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995275
5053	NC_018294	TGCGCT	2	12	244319	244330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995275
5054	NC_018294	CCG	2	6	244376	244381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995275
5055	NC_018294	CGG	2	6	244439	244444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995275
5056	NC_018294	GTC	2	6	244458	244463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995275
5057	NC_018294	GC	3	6	244575	244580	0 %	0 %	50 %	50 %	399995275
5058	NC_018294	CGA	2	6	244583	244588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995275
5059	NC_018294	GC	3	6	244590	244595	0 %	0 %	50 %	50 %	399995275
5060	NC_018294	CG	3	6	244637	244642	0 %	0 %	50 %	50 %	399995275
5061	NC_018294	TCG	2	6	244721	244726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995275
5062	NC_018294	GC	3	6	244743	244748	0 %	0 %	50 %	50 %	399995275
5063	NC_018294	GGC	2	6	244817	244822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995275
5064	NC_018294	CGC	2	6	244842	244847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995275
5065	NC_018294	ACC	2	6	244874	244879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995275
5066	NC_018294	TGC	2	6	244944	244949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995275
5067	NC_018294	TGGC	2	8	244984	244991	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5068	NC_018294	GCC	2	6	245027	245032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5069	NC_018294	GCA	2	6	245044	245049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_018294	AG	3	6	245069	245074	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_018294	GCT	2	6	245087	245092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_018294	CAT	2	6	245098	245103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5073	NC_018294	CG	3	6	245128	245133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5074	NC_018294	GTCG	2	8	245193	245200	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5075	NC_018294	GGA	2	6	245283	245288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_018294	GC	3	6	245534	245539	0 %	0 %	50 %	50 %	399995276
5077	NC_018294	AC	3	6	245557	245562	50 %	0 %	0 %	50 %	399995276
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5080	NC_018294	CTG	2	6	245904	245909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995276
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5082	NC_018294	CTGG	2	8	245960	245967	0 %	25 %	50 %	25 %	399995276
5083	NC_018294	CAC	2	6	245994	245999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995276
5084	NC_018294	CGA	2	6	246022	246027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995276
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5086	NC_018294	GCA	2	6	246150	246155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995276
5087	NC_018294	GAT	2	6	246158	246163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995276
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5089	NC_018294	GGC	2	6	246267	246272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995276
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5091	NC_018294	GGC	2	6	246317	246322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995276
5092	NC_018294	TGC	2	6	246364	246369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995276
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5094	NC_018294	ACG	2	6	246471	246476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995276
5095	NC_018294	CG	4	8	246491	246498	0 %	0 %	50 %	50 %	399995276
5096	NC_018294	AGG	2	6	246576	246581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_018294	CGG	2	6	246721	246726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_018294	CGT	2	6	246758	246763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5099	NC_018294	CCT	2	6	246776	246781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5100	NC_018294	ACG	2	6	246811	246816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_018294	CGGG	2	8	246828	246835	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5102	NC_018294	CTG	2	6	246849	246854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995277
5103	NC_018294	TGGA	2	8	246877	246884	25 %	25 %	50 %	0 %	399995277
5104	NC_018294	GAT	2	6	246918	246923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995277
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5107	NC_018294	GGC	2	6	246993	246998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995277
5108	NC_018294	CGC	2	6	247025	247030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995277
5109	NC_018294	GAA	2	6	247059	247064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995277
5110	NC_018294	GC	3	6	247141	247146	0 %	0 %	50 %	50 %	399995277
5111	NC_018294	GGC	2	6	247164	247169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995277
5112	NC_018294	CGGC	2	8	247202	247209	0 %	0 %	50 %	50 %	399995277
5113	NC_018294	GGC	2	6	247305	247310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995277
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5252	NC_018294	TCC	3	9	254090	254098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995285
5253	NC_018294	CTT	2	6	254134	254139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995285
5254	NC_018294	GATCC	2	10	254152	254161	20 %	20 %	20 %	40 %	399995285
5255	NC_018294	TTGT	2	8	254162	254169	0 %	75 %	25 %	0 %	399995285
5256	NC_018294	GGCC	2	8	254170	254177	0 %	0 %	50 %	50 %	399995285
5257	NC_018294	GCT	2	6	254276	254281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995285
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5259	NC_018294	CAT	2	6	254292	254297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995285
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5261	NC_018294	AATT	2	8	254332	254339	50 %	50 %	0 %	0 %	399995285
5262	NC_018294	CCT	2	6	254385	254390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995285
5263	NC_018294	CAT	2	6	254431	254436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995285
5264	NC_018294	CAGC	2	8	254456	254463	25 %	0 %	25 %	50 %	399995285
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5268	NC_018294	TGC	2	6	254697	254702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995285
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5271	NC_018294	TCA	2	6	254834	254839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995285
5272	NC_018294	CA	3	6	255108	255113	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5273	NC_018294	ACA	3	9	255111	255119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5274	NC_018294	AGCAT	2	10	255173	255182	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5275	NC_018294	ATA	2	6	255202	255207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5276	NC_018294	GCTGA	2	10	255225	255234	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5277	NC_018294	TTG	2	6	255280	255285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5278	NC_018294	CTC	2	6	255309	255314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5279	NC_018294	CAG	2	6	255320	255325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5280	NC_018294	CGT	2	6	255362	255367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5282	NC_018294	CGC	2	6	255556	255561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995286
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5284	NC_018294	AAG	2	6	255580	255585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995286
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5286	NC_018294	GCA	2	6	255692	255697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995286
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5289	NC_018294	ACGG	2	8	255892	255899	25 %	0 %	50 %	25 %	399995286
5290	NC_018294	CAT	2	6	255933	255938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995286
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5292	NC_018294	GCGA	2	8	256053	256060	25 %	0 %	50 %	25 %	399995286
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5302	NC_018294	AC	3	6	256627	256632	50 %	0 %	0 %	50 %	399995287
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5314	NC_018294	TGAC	2	8	257427	257434	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5315	NC_018294	CAG	2	6	257441	257446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5362	NC_018294	CGGT	2	8	259906	259913	0 %	25 %	50 %	25 %	399995290
5363	NC_018294	GAA	2	6	259928	259933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995290
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5365	NC_018294	GTC	2	6	260092	260097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5366	NC_018294	GTTG	2	8	260118	260125	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5367	NC_018294	AGTG	2	8	260139	260146	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5368	NC_018294	AC	3	6	260195	260200	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5369	NC_018294	TTC	2	6	260206	260211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5370	NC_018294	TCT	2	6	260223	260228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5371	NC_018294	ATTG	2	8	260254	260261	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5372	NC_018294	TGA	2	6	260324	260329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5373	NC_018294	CGG	2	6	260345	260350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5374	NC_018294	GCCA	2	8	260365	260372	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5375	NC_018294	GCC	2	6	260438	260443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995291
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5389	NC_018294	CGAC	2	8	261129	261136	25 %	0 %	25 %	50 %	399995292
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5449	NC_018294	TGC	2	6	264304	264309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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