MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d

Total Repeats: 5679

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_018294	ATCCA	2	10	218549	218558	40 %	20 %	0 %	40 %	399995247
4502	NC_018294	CTC	2	6	218584	218589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4503	NC_018294	TGC	2	6	218593	218598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_018294	CAT	2	6	218613	218618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995248
4505	NC_018294	CCG	2	6	218627	218632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995248
4506	NC_018294	CAT	2	6	218648	218653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995248
4507	NC_018294	CGA	2	6	218836	218841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4508	NC_018294	ACG	2	6	218846	218851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_018294	CCG	2	6	218852	218857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4510	NC_018294	TCCG	2	8	218886	218893	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4511	NC_018294	CT	4	8	218901	218908	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4512	NC_018294	CGG	2	6	218973	218978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4513	NC_018294	GCG	2	6	219120	219125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4514	NC_018294	TCC	2	6	219150	219155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4515	NC_018294	AGAC	2	8	219228	219235	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4516	NC_018294	GCT	2	6	219304	219309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4517	NC_018294	AAG	2	6	219329	219334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_018294	TTC	2	6	219337	219342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4519	NC_018294	ATC	2	6	219454	219459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4520	NC_018294	GC	3	6	219497	219502	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4521	NC_018294	GCA	2	6	219519	219524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4522	NC_018294	CGG	2	6	219555	219560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_018294	ACG	2	6	219562	219567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4524	NC_018294	CCG	2	6	219584	219589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4525	NC_018294	GCTT	2	8	219642	219649	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4526	NC_018294	TCT	2	6	219656	219661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4527	NC_018294	AT	3	6	219728	219733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_018294	AGG	2	6	219739	219744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_018294	TTC	2	6	219886	219891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995249
4530	NC_018294	GCA	2	6	219962	219967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995249
4531	NC_018294	CAT	2	6	219976	219981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995249
4532	NC_018294	GCG	2	6	219993	219998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995249
4533	NC_018294	GAA	2	6	220025	220030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995249
4534	NC_018294	ATG	2	6	220091	220096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995249
4535	NC_018294	TCA	3	9	220167	220175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995249
4536	NC_018294	GGGC	2	8	220176	220183	0 %	0 %	75 %	25 %	399995249
4537	NC_018294	CGG	2	6	220261	220266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995249
4538	NC_018294	GCAC	2	8	220273	220280	25 %	0 %	25 %	50 %	399995249
4539	NC_018294	TTC	2	6	220358	220363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995249
4540	NC_018294	CGA	2	6	220381	220386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995249
4541	NC_018294	AG	3	6	220471	220476	50 %	0 %	50 %	0 %	399995249
4542	NC_018294	GAA	2	6	220517	220522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995249
4543	NC_018294	CGG	2	6	220548	220553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995249
4544	NC_018294	G	6	6	220555	220560	0 %	0 %	100 %	0 %	399995249
4545	NC_018294	CAC	2	6	220564	220569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995249
4546	NC_018294	GGT	2	6	220615	220620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995249
4547	NC_018294	GTT	2	6	220703	220708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995249
4548	NC_018294	GGGT	2	8	220725	220732	0 %	25 %	75 %	0 %	399995249
4549	NC_018294	CGACCG	2	12	220951	220962	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	399995249
4550	NC_018294	AC	3	6	220971	220976	50 %	0 %	0 %	50 %	399995249
4551	NC_018294	CGT	2	6	221031	221036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995249
4552	NC_018294	CTA	2	6	221087	221092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995249
4553	NC_018294	GCT	2	6	221120	221125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995249
4554	NC_018294	TGA	3	9	221158	221166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995249
4555	NC_018294	TTA	2	6	221184	221189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	399995249
4556	NC_018294	TCG	2	6	221190	221195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995249
4557	NC_018294	TACGA	2	10	221204	221213	40 %	20 %	20 %	20 %	399995249
4558	NC_018294	GAT	2	6	221279	221284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995249
4559	NC_018294	TTC	2	6	221330	221335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995249
4560	NC_018294	AT	4	8	221472	221479	50 %	50 %	0 %	0 %	399995249
4561	NC_018294	CAA	2	6	221501	221506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995249
4562	NC_018294	CAG	2	6	221513	221518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995249
4563	NC_018294	ATT	2	6	221604	221609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	399995249
4564	NC_018294	AGG	2	6	221622	221627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995249
4565	NC_018294	CTT	2	6	221736	221741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995249
4566	NC_018294	CGG	2	6	221746	221751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995250
4567	NC_018294	CCG	2	6	221776	221781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995250
4568	NC_018294	CGG	2	6	221796	221801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995250
4569	NC_018294	CCT	2	6	221844	221849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995250
4570	NC_018294	GCCA	2	8	221850	221857	25 %	0 %	25 %	50 %	399995250
4571	NC_018294	CCGG	2	8	221951	221958	0 %	0 %	50 %	50 %	399995250
4572	NC_018294	GTCC	2	8	222035	222042	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4573	NC_018294	CCG	2	6	222090	222095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4574	NC_018294	CGA	2	6	222247	222252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4575	NC_018294	CGGC	2	8	222318	222325	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4576	NC_018294	GAC	2	6	222391	222396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4577	NC_018294	GCC	2	6	222456	222461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4578	NC_018294	TGC	2	6	222477	222482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4579	NC_018294	CAG	2	6	222490	222495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4580	NC_018294	GCC	2	6	222545	222550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4581	NC_018294	GCC	2	6	222580	222585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4582	NC_018294	CAG	2	6	222589	222594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995251
4583	NC_018294	AGC	2	6	222695	222700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995251
4584	NC_018294	GTC	2	6	222765	222770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995251
4585	NC_018294	ACG	3	9	222784	222792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995251
4586	NC_018294	CG	3	6	222797	222802	0 %	0 %	50 %	50 %	399995251
4587	NC_018294	TCG	2	6	222805	222810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995251
4588	NC_018294	ACG	2	6	222832	222837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995251
4589	NC_018294	CGG	2	6	222962	222967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4590	NC_018294	GCT	2	6	223096	223101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995252
4591	NC_018294	TGC	2	6	223103	223108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995252
4592	NC_018294	GCA	2	6	223119	223124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995252
4593	NC_018294	TCG	2	6	223210	223215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995252
4594	NC_018294	AGC	2	6	223236	223241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995252
4595	NC_018294	GGC	2	6	223251	223256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995252
4596	NC_018294	TCCT	2	8	223356	223363	0 %	50 %	0 %	50 %	399995252
4597	NC_018294	GCAT	2	8	223371	223378	25 %	25 %	25 %	25 %	399995252
4598	NC_018294	CGA	2	6	223450	223455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995252
4599	NC_018294	CGG	2	6	223500	223505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995252
4600	NC_018294	GTT	2	6	223514	223519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995252
4601	NC_018294	CAG	2	6	223549	223554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995252
4602	NC_018294	TTC	2	6	223562	223567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995252
4603	NC_018294	GGT	2	6	223624	223629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995252
4604	NC_018294	CGTT	2	8	223642	223649	0 %	50 %	25 %	25 %	399995252
4605	NC_018294	GCG	2	6	223686	223691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995252
4606	NC_018294	CGC	2	6	223838	223843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995252
4607	NC_018294	GCG	2	6	223866	223871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995252
4608	NC_018294	GCG	2	6	223909	223914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995252
4609	NC_018294	CGT	2	6	223927	223932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995252
4610	NC_018294	TGA	2	6	223962	223967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995252
4611	NC_018294	GGC	2	6	224001	224006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995252
4612	NC_018294	TCA	2	6	224073	224078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995253
4613	NC_018294	CAA	2	6	224125	224130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995253
4614	NC_018294	TCC	2	6	224146	224151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995253
4615	NC_018294	CGCC	2	8	224164	224171	0 %	0 %	25 %	75 %	399995253
4616	NC_018294	CGC	2	6	224251	224256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4617	NC_018294	ATC	2	6	224268	224273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995254
4618	NC_018294	CCCG	2	8	224307	224314	0 %	0 %	25 %	75 %	399995254
4619	NC_018294	CTG	2	6	224319	224324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995254
4620	NC_018294	TGC	2	6	224336	224341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995254
4621	NC_018294	ACC	2	6	224352	224357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995254
4622	NC_018294	CAT	3	9	224366	224374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995254
4623	NC_018294	GGA	2	6	224396	224401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995254
4624	NC_018294	CAG	2	6	224479	224484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995254
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4995	NC_018294	AGCA	2	8	242368	242375	50 %	0 %	25 %	25 %	399995274
4996	NC_018294	GCA	3	9	242373	242381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995274
4997	NC_018294	TCG	2	6	242420	242425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995274
4998	NC_018294	GC	3	6	242467	242472	0 %	0 %	50 %	50 %	399995274
4999	NC_018294	GC	5	10	242478	242487	0 %	0 %	50 %	50 %	399995274
5000	NC_018294	GCG	2	6	242531	242536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995274

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