MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018293	CTGT	2	8	258	265	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_018293	CGGC	2	8	897	904	0 %	0 %	50 %	50 %	399994763
3	NC_018293	GGCG	2	8	1089	1096	0 %	0 %	75 %	25 %	399994763
4	NC_018293	CAAT	2	8	1175	1182	50 %	25 %	0 %	25 %	399994763
5	NC_018293	TGCC	2	8	1496	1503	0 %	25 %	25 %	50 %	399994764
6	NC_018293	ACCG	2	8	2013	2020	25 %	0 %	25 %	50 %	399994765
7	NC_018293	CTGC	2	8	2075	2082	0 %	25 %	25 %	50 %	399994765
8	NC_018293	GCGA	2	8	2131	2138	25 %	0 %	50 %	25 %	399994765
9	NC_018293	GATT	2	8	2274	2281	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018293	GTCG	2	8	2489	2496	0 %	25 %	50 %	25 %	399994766
11	NC_018293	ATTG	2	8	3079	3086	25 %	50 %	25 %	0 %	399994766
12	NC_018293	ATCG	2	8	3371	3378	25 %	25 %	25 %	25 %	399994766
13	NC_018293	GACG	2	8	3669	3676	25 %	0 %	50 %	25 %	399994766
14	NC_018293	ATCG	2	8	4080	4087	25 %	25 %	25 %	25 %	399994766
15	NC_018293	CGGT	2	8	4754	4761	0 %	25 %	50 %	25 %	399994768
16	NC_018293	TCCG	2	8	4843	4850	0 %	25 %	25 %	50 %	399994768
17	NC_018293	CCGA	2	8	5831	5838	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_018293	GTCG	2	8	6319	6326	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_018293	GCCG	2	8	6544	6551	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.