MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018194	CG	3	6	124	129	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_018194	AT	3	6	758	763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018194	AG	3	6	879	884	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018194	AG	3	6	927	932	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018194	GC	3	6	1296	1301	0 %	0 %	50 %	50 %	398356371
6	NC_018194	AG	3	6	1887	1892	50 %	0 %	50 %	0 %	398356371
7	NC_018194	GC	3	6	2158	2163	0 %	0 %	50 %	50 %	398356372
8	NC_018194	GC	3	6	2676	2681	0 %	0 %	50 %	50 %	398356372
9	NC_018194	CA	3	6	3821	3826	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_018194	TC	3	6	4169	4174	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_018194	GC	3	6	4324	4329	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_018194	AC	3	6	5341	5346	50 %	0 %	0 %	50 %	398356374
13	NC_018194	CG	3	6	5675	5680	0 %	0 %	50 %	50 %	398356374
14	NC_018194	GT	3	6	5699	5704	0 %	50 %	50 %	0 %	398356374
15	NC_018194	GC	3	6	5733	5738	0 %	0 %	50 %	50 %	398356374
16	NC_018194	CG	4	8	5743	5750	0 %	0 %	50 %	50 %	398356374
17	NC_018194	GC	4	8	7281	7288	0 %	0 %	50 %	50 %	398356376
18	NC_018194	TA	3	6	7388	7393	50 %	50 %	0 %	0 %	398356376
19	NC_018194	AC	3	6	8909	8914	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_018194	GC	3	6	10184	10189	0 %	0 %	50 %	50 %	398356380

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.