MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018193	CGGC	2	8	84	91	0 %	0 %	50 %	50 %	398356355
2	NC_018193	TCGG	2	8	797	804	0 %	25 %	50 %	25 %	398356355
3	NC_018193	GATG	2	8	1625	1632	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018193	TTGC	2	8	2598	2605	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_018193	ATTT	2	8	3047	3054	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018193	AAAG	2	8	3151	3158	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018193	GCAC	2	8	4806	4813	25 %	0 %	25 %	50 %	398356361
8	NC_018193	ATGG	2	8	5698	5705	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018193	CTTT	2	8	6478	6485	0 %	75 %	0 %	25 %	398356363
10	NC_018193	CCGG	2	8	7245	7252	0 %	0 %	50 %	50 %	398356364
11	NC_018193	CAGG	2	8	7710	7717	25 %	0 %	50 %	25 %	398356364
12	NC_018193	TTTC	2	8	7997	8004	0 %	75 %	0 %	25 %	398356365
13	NC_018193	GCTC	2	8	8558	8565	0 %	25 %	25 %	50 %	398356365
14	NC_018193	CTTC	2	8	8711	8718	0 %	50 %	0 %	50 %	398356365
15	NC_018193	GGCA	2	8	9362	9369	25 %	0 %	50 %	25 %	398356366
16	NC_018193	AGGC	2	8	9540	9547	25 %	0 %	50 %	25 %	398356366
17	NC_018193	CTCA	2	8	9681	9688	25 %	25 %	0 %	50 %	398356367
18	NC_018193	CAGC	2	8	9973	9980	25 %	0 %	25 %	50 %	398356368
19	NC_018193	CGCT	2	8	10013	10020	0 %	25 %	25 %	50 %	398356368
20	NC_018193	GCCC	2	8	10205	10212	0 %	0 %	25 %	75 %	398356368
21	NC_018193	ATCG	2	8	10260	10267	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_018193	GGCC	2	8	10382	10389	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_018193	CTGG	2	8	10585	10592	0 %	25 %	50 %	25 %	398356369
24	NC_018193	TGTT	2	8	10921	10928	0 %	75 %	25 %	0 %	398356369

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.