MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 640

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018192	ACC	2	6	23695	23700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398356341
502	NC_018192	GAC	2	6	23757	23762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356341
503	NC_018192	GTCG	2	8	23808	23815	0 %	25 %	50 %	25 %	398356341
504	NC_018192	GGC	2	6	23854	23859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356341
505	NC_018192	TGG	2	6	23990	23995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398356341
506	NC_018192	ACG	2	6	23998	24003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356341
507	NC_018192	CGC	2	6	24007	24012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356341
508	NC_018192	GGA	2	6	24078	24083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356341
509	NC_018192	CGA	2	6	24089	24094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356341
510	NC_018192	CGG	2	6	24126	24131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356341
511	NC_018192	GC	3	6	24185	24190	0 %	0 %	50 %	50 %	398356341
512	NC_018192	TCG	2	6	24281	24286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356341
513	NC_018192	GCG	2	6	24290	24295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356341
514	NC_018192	GAA	2	6	24324	24329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356341
515	NC_018192	ATG	2	6	24334	24339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356341
516	NC_018192	GGC	2	6	24389	24394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356341
517	NC_018192	AGA	2	6	24398	24403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356341
518	NC_018192	CGG	2	6	24412	24417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356341
519	NC_018192	GAC	2	6	24501	24506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356342
520	NC_018192	ACC	2	6	24520	24525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398356342
521	NC_018192	CGA	3	9	24599	24607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356342
522	NC_018192	TCG	2	6	24628	24633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356342
523	NC_018192	GC	3	6	24644	24649	0 %	0 %	50 %	50 %	398356342
524	NC_018192	GGC	2	6	24654	24659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356342
525	NC_018192	TCGA	2	8	24745	24752	25 %	25 %	25 %	25 %	398356342
526	NC_018192	CG	3	6	24774	24779	0 %	0 %	50 %	50 %	398356342
527	NC_018192	CAT	2	6	24858	24863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356342
528	NC_018192	GCC	2	6	24912	24917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356343
529	NC_018192	AGA	2	6	24926	24931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356343
530	NC_018192	ATC	2	6	24966	24971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356343
531	NC_018192	CATCGT	2	12	24977	24988	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	398356343
532	NC_018192	TCG	2	6	24997	25002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356343
533	NC_018192	CGT	3	9	25004	25012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356343
534	NC_018192	CAA	2	6	25049	25054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398356343
535	NC_018192	GCG	2	6	25111	25116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356343
536	NC_018192	ATC	2	6	25128	25133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356343
537	NC_018192	CGCC	2	8	25168	25175	0 %	0 %	25 %	75 %	398356343
538	NC_018192	GTC	2	6	25206	25211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356343
539	NC_018192	CG	4	8	25239	25246	0 %	0 %	50 %	50 %	398356343
540	NC_018192	GGA	2	6	25256	25261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356343
541	NC_018192	GC	3	6	25272	25277	0 %	0 %	50 %	50 %	398356343
542	NC_018192	CAGCGG	2	12	25317	25328	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	398356343
543	NC_018192	GCA	2	6	25440	25445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356343
544	NC_018192	CAA	2	6	25448	25453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398356343
545	NC_018192	CGC	3	9	25469	25477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356343
546	NC_018192	AGG	2	6	25531	25536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356343
547	NC_018192	TTC	2	6	25539	25544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356343
548	NC_018192	TCG	2	6	25801	25806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356343
549	NC_018192	TGG	2	6	25882	25887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398356343
550	NC_018192	GAA	2	6	26077	26082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356344
551	NC_018192	CAA	2	6	26097	26102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398356344
552	NC_018192	CAT	2	6	26149	26154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356344
553	NC_018192	TCCG	2	8	26158	26165	0 %	25 %	25 %	50 %	398356344
554	NC_018192	GCG	2	6	26182	26187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356344
555	NC_018192	GATCT	2	10	26199	26208	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
556	NC_018192	GC	3	6	26228	26233	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
557	NC_018192	TG	3	6	26396	26401	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
558	NC_018192	CGG	2	6	26462	26467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356345
559	NC_018192	AAG	2	6	26470	26475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356345
560	NC_018192	GA	3	6	26480	26485	50 %	0 %	50 %	0 %	398356345
561	NC_018192	TCGC	2	8	26505	26512	0 %	25 %	25 %	50 %	398356345
562	NC_018192	CGG	2	6	26725	26730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356345
563	NC_018192	T	7	7	26735	26741	0 %	100 %	0 %	0 %	398356345
564	NC_018192	CCG	2	6	26747	26752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356345
565	NC_018192	CGG	2	6	26785	26790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356345
566	NC_018192	GCG	2	6	26825	26830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356345
567	NC_018192	GAT	2	6	26865	26870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356345
568	NC_018192	GGAAA	2	10	26889	26898	60 %	0 %	40 %	0 %	398356345
569	NC_018192	TGA	2	6	26947	26952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356345
570	NC_018192	GCG	2	6	26979	26984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356346
571	NC_018192	CGC	2	6	27016	27021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356346
572	NC_018192	GCA	2	6	27107	27112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356346
573	NC_018192	TTGCCA	2	12	27166	27177	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	398356346
574	NC_018192	TCG	2	6	27211	27216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356347
575	NC_018192	CTC	2	6	27264	27269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356347
576	NC_018192	GGA	2	6	27323	27328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356347
577	NC_018192	CCGGA	2	10	27329	27338	20 %	0 %	40 %	40 %	398356347
578	NC_018192	TCG	2	6	27349	27354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356347
579	NC_018192	GC	3	6	27358	27363	0 %	0 %	50 %	50 %	398356347
580	NC_018192	CTC	2	6	27369	27374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356347
581	NC_018192	CGG	2	6	27403	27408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356347
582	NC_018192	GC	3	6	27468	27473	0 %	0 %	50 %	50 %	398356347
583	NC_018192	TTCT	2	8	27474	27481	0 %	75 %	0 %	25 %	398356347
584	NC_018192	TCG	2	6	27490	27495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356347
585	NC_018192	TGATT	2	10	27536	27545	20 %	60 %	20 %	0 %	398356348
586	NC_018192	AGGCA	2	10	27616	27625	40 %	0 %	40 %	20 %	398356348
587	NC_018192	AAC	2	6	27649	27654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398356348
588	NC_018192	GCC	2	6	27680	27685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356348
589	NC_018192	GT	3	6	27717	27722	0 %	50 %	50 %	0 %	398356348
590	NC_018192	ACG	2	6	27725	27730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356348
591	NC_018192	CGCC	2	8	27775	27782	0 %	0 %	25 %	75 %	398356348
592	NC_018192	CAA	2	6	27839	27844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398356348
593	NC_018192	AGC	2	6	27851	27856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356348
594	NC_018192	TGA	2	6	27949	27954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356348
595	NC_018192	AAT	2	6	27981	27986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	398356348
596	NC_018192	GATGGT	2	12	28106	28117	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	398356348
597	NC_018192	TCC	2	6	28176	28181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356348
598	NC_018192	GGC	2	6	28231	28236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356348
599	NC_018192	CGA	2	6	28282	28287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356348
600	NC_018192	ATC	2	6	28308	28313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356348
601	NC_018192	GCG	2	6	28332	28337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356348
602	NC_018192	CGG	2	6	28343	28348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356349
603	NC_018192	CGC	2	6	28405	28410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356349
604	NC_018192	GAC	2	6	28488	28493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356349
605	NC_018192	TCA	2	6	28564	28569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356350
606	NC_018192	CGAG	2	8	28581	28588	25 %	0 %	50 %	25 %	398356350
607	NC_018192	GAA	2	6	28593	28598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356350
608	NC_018192	CTTT	2	8	28637	28644	0 %	75 %	0 %	25 %	398356350
609	NC_018192	ACG	2	6	28785	28790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356351
610	NC_018192	GGC	2	6	28797	28802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356351
611	NC_018192	CT	3	6	28807	28812	0 %	50 %	0 %	50 %	398356351
612	NC_018192	GGAC	2	8	28824	28831	25 %	0 %	50 %	25 %	398356351
613	NC_018192	TCGT	2	8	28874	28881	0 %	50 %	25 %	25 %	398356351
614	NC_018192	GAT	2	6	28889	28894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356351
615	NC_018192	GGC	2	6	28906	28911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356351
616	NC_018192	GGC	2	6	28940	28945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356351
617	NC_018192	GCC	2	6	28992	28997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356352
618	NC_018192	GTC	2	6	29030	29035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356352
619	NC_018192	GCC	2	6	29056	29061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356352
620	NC_018192	AGC	2	6	29079	29084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356352
621	NC_018192	CG	3	6	29103	29108	0 %	0 %	50 %	50 %	398356352
622	NC_018192	CGAT	2	8	29146	29153	25 %	25 %	25 %	25 %	398356352
623	NC_018192	ATC	4	12	29236	29247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356352
624	NC_018192	AGT	2	6	29290	29295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_018192	TGA	2	6	29301	29306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_018192	GC	3	6	29327	29332	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
627	NC_018192	TCG	2	6	29515	29520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356353
628	NC_018192	CAT	2	6	29620	29625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356353
629	NC_018192	CGA	2	6	29731	29736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356353
630	NC_018192	TG	3	6	29738	29743	0 %	50 %	50 %	0 %	398356353
631	NC_018192	AAG	2	6	29759	29764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356353
632	NC_018192	GCC	2	6	29823	29828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356353
633	NC_018192	GGC	2	6	29839	29844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356353
634	NC_018192	ATG	2	6	29922	29927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356353
635	NC_018192	AAT	2	6	29981	29986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	398356353
636	NC_018192	CCGAC	2	10	30008	30017	20 %	0 %	20 %	60 %	398356353
637	NC_018192	TCCA	2	8	30074	30081	25 %	25 %	0 %	50 %	398356353
638	NC_018192	CGC	2	6	30154	30159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356353
639	NC_018192	GT	3	6	30184	30189	0 %	50 %	50 %	0 %	398356353
640	NC_018192	CGC	2	6	30190	30195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356353

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