MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 4533

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_018191	CGA	2	6	162225	162230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356272
3502	NC_018191	TGC	2	6	162232	162237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356272
3503	NC_018191	CG	3	6	162252	162257	0 %	0 %	50 %	50 %	398356272
3504	NC_018191	GCTC	2	8	162383	162390	0 %	25 %	25 %	50 %	398356272
3505	NC_018191	GCC	2	6	162416	162421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356272
3506	NC_018191	GCG	2	6	162425	162430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356272
3507	NC_018191	GC	4	8	162506	162513	0 %	0 %	50 %	50 %	398356272
3508	NC_018191	CGG	2	6	162569	162574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356273
3509	NC_018191	AGA	2	6	162643	162648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356273
3510	NC_018191	GCCA	2	8	162711	162718	25 %	0 %	25 %	50 %	398356273
3511	NC_018191	TCG	2	6	162735	162740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356273
3512	NC_018191	AGG	2	6	162764	162769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356273
3513	NC_018191	GCC	2	6	162824	162829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356273
3514	NC_018191	GC	3	6	162851	162856	0 %	0 %	50 %	50 %	398356273
3515	NC_018191	GCG	2	6	162864	162869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356273
3516	NC_018191	TCG	2	6	162915	162920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356273
3517	NC_018191	CCAG	2	8	162925	162932	25 %	0 %	25 %	50 %	398356273
3518	NC_018191	CGC	2	6	162980	162985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356273
3519	NC_018191	CAT	2	6	163031	163036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356273
3520	NC_018191	CCG	2	6	163060	163065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356273
3521	NC_018191	GCC	3	9	163070	163078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356273
3522	NC_018191	GCG	2	6	163112	163117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356273
3523	NC_018191	GC	3	6	163173	163178	0 %	0 %	50 %	50 %	398356273
3524	NC_018191	CAG	2	6	163292	163297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356273
3525	NC_018191	CGA	2	6	163324	163329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356273
3526	NC_018191	TCG	2	6	163332	163337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356273
3527	NC_018191	GCC	2	6	163353	163358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356273
3528	NC_018191	TCA	2	6	163389	163394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356273
3529	NC_018191	GA	3	6	163410	163415	50 %	0 %	50 %	0 %	398356273
3530	NC_018191	CGCGT	2	10	163450	163459	0 %	20 %	40 %	40 %	398356273
3531	NC_018191	GTG	2	6	163467	163472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398356273
3532	NC_018191	CTT	2	6	163508	163513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356273
3533	NC_018191	GTCCTC	2	12	163529	163540	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	398356273
3534	NC_018191	CG	3	6	163604	163609	0 %	0 %	50 %	50 %	398356273
3535	NC_018191	CGA	2	6	163660	163665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356273
3536	NC_018191	CTC	2	6	163679	163684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356273
3537	NC_018191	TTC	2	6	163694	163699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356273
3538	NC_018191	CGC	2	6	163708	163713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356273
3539	NC_018191	TCG	3	9	163722	163730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356273
3540	NC_018191	CGG	3	9	163750	163758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356273
3541	NC_018191	CTT	2	6	163780	163785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356273
3542	NC_018191	CGT	2	6	163834	163839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356273
3543	NC_018191	CGA	2	6	163885	163890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356273
3544	NC_018191	ACATG	2	10	163978	163987	40 %	20 %	20 %	20 %	398356273
3545	NC_018191	TCGACG	2	12	164001	164012	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	398356273
3546	NC_018191	CTC	2	6	164048	164053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356273
3547	NC_018191	TCT	2	6	164062	164067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356273
3548	NC_018191	CGG	2	6	164101	164106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356273
3549	NC_018191	CGA	2	6	164143	164148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356273
3550	NC_018191	CAG	2	6	164171	164176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356273
3551	NC_018191	GCCG	2	8	164209	164216	0 %	0 %	50 %	50 %	398356273
3552	NC_018191	TGG	2	6	164217	164222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398356273
3553	NC_018191	AGGC	2	8	164241	164248	25 %	0 %	50 %	25 %	398356273
3554	NC_018191	CGG	2	6	164251	164256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356273
3555	NC_018191	TCC	2	6	164316	164321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356273
3556	NC_018191	CAT	2	6	164539	164544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356273
3557	NC_018191	GTCGAG	2	12	164546	164557	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	398356273
3558	NC_018191	GC	3	6	164590	164595	0 %	0 %	50 %	50 %	398356273
3559	NC_018191	TCG	2	6	164646	164651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356273
3560	NC_018191	GA	3	6	164706	164711	50 %	0 %	50 %	0 %	398356273
3561	NC_018191	CGG	2	6	164721	164726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356273
3562	NC_018191	CTG	2	6	164728	164733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356273
3563	NC_018191	CCGC	2	8	164737	164744	0 %	0 %	25 %	75 %	398356273
3564	NC_018191	CGCT	2	8	164784	164791	0 %	25 %	25 %	50 %	398356273
3565	NC_018191	TCG	2	6	164811	164816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356273
3566	NC_018191	CGT	2	6	164833	164838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356273
3567	NC_018191	ATG	2	6	164892	164897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356273
3568	NC_018191	TCA	2	6	164922	164927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356273
3569	NC_018191	CCGA	2	8	164928	164935	25 %	0 %	25 %	50 %	398356273
3570	NC_018191	GAG	2	6	164958	164963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356273
3571	NC_018191	GC	3	6	165024	165029	0 %	0 %	50 %	50 %	398356273
3572	NC_018191	GC	3	6	165053	165058	0 %	0 %	50 %	50 %	398356273
3573	NC_018191	CGA	2	6	165059	165064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356273
3574	NC_018191	CGA	2	6	165124	165129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356273
3575	NC_018191	TCG	2	6	165135	165140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356273
3576	NC_018191	GC	3	6	165206	165211	0 %	0 %	50 %	50 %	398356273
3577	NC_018191	CGA	2	6	165218	165223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356273
3578	NC_018191	CGGTT	2	10	165272	165281	0 %	40 %	40 %	20 %	398356273
3579	NC_018191	TGC	2	6	165303	165308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356273
3580	NC_018191	GTC	2	6	165314	165319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356273
3581	NC_018191	CCA	2	6	165347	165352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398356273
3582	NC_018191	TCG	2	6	165493	165498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356273
3583	NC_018191	TCG	2	6	165507	165512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356273
3584	NC_018191	TTC	2	6	165521	165526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356273
3585	NC_018191	CGAA	2	8	165585	165592	50 %	0 %	25 %	25 %	398356273
3586	NC_018191	GTC	2	6	165662	165667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356273
3587	NC_018191	GCC	2	6	165723	165728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356273
3588	NC_018191	GCG	2	6	165729	165734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356273
3589	NC_018191	GGC	2	6	165803	165808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356273
3590	NC_018191	GC	3	6	165807	165812	0 %	0 %	50 %	50 %	398356273
3591	NC_018191	CGA	2	6	165836	165841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356273
3592	NC_018191	CGC	2	6	165974	165979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356273
3593	NC_018191	CGGTCG	2	12	166015	166026	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	398356273
3594	NC_018191	CCT	2	6	166070	166075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356274
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3596	NC_018191	GGTT	2	8	166139	166146	0 %	50 %	50 %	0 %	398356274
3597	NC_018191	TCC	2	6	166162	166167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356274
3598	NC_018191	ACG	2	6	166172	166177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356274
3599	NC_018191	CAG	2	6	166302	166307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356274
3600	NC_018191	CAG	2	6	166323	166328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356274
3601	NC_018191	TTG	2	6	166405	166410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398356274
3602	NC_018191	GTC	2	6	166476	166481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356274
3603	NC_018191	GGC	2	6	166520	166525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356274
3604	NC_018191	GGC	2	6	166638	166643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356274
3605	NC_018191	GTCG	2	8	166688	166695	0 %	25 %	50 %	25 %	398356274
3606	NC_018191	CGAA	2	8	166701	166708	50 %	0 %	25 %	25 %	398356274
3607	NC_018191	TCA	2	6	166723	166728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356274
3608	NC_018191	TCG	2	6	166735	166740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356274
3609	NC_018191	GCC	2	6	166743	166748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356274
3610	NC_018191	GGC	2	6	166797	166802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356274
3611	NC_018191	ACC	2	6	166808	166813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398356274
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3613	NC_018191	AGC	2	6	166927	166932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356275
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3615	NC_018191	TCG	2	6	167036	167041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356275
3616	NC_018191	GAA	2	6	167064	167069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356275
3617	NC_018191	ACG	2	6	167152	167157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356275
3618	NC_018191	GGCG	2	8	167168	167175	0 %	0 %	75 %	25 %	398356275
3619	NC_018191	GCAT	2	8	167251	167258	25 %	25 %	25 %	25 %	398356275
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3621	NC_018191	CGC	2	6	167304	167309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356275
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3858	NC_018191	ATC	2	6	180291	180296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3860	NC_018191	GTC	2	6	180416	180421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3861	NC_018191	TTGC	2	8	180423	180430	0 %	50 %	25 %	25 %	398356284
3862	NC_018191	ATCGG	2	10	180468	180477	20 %	20 %	40 %	20 %	398356284
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3980	NC_018191	TGCAA	2	10	185691	185700	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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3985	NC_018191	GCAG	2	8	185838	185845	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3986	NC_018191	CCT	2	6	185921	185926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3987	NC_018191	CG	3	6	185928	185933	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3988	NC_018191	AGA	2	6	186171	186176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356291
3989	NC_018191	CTT	2	6	186187	186192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356291
3990	NC_018191	CTT	3	9	186217	186225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356291
3991	NC_018191	GAATT	2	10	186284	186293	40 %	40 %	20 %	0 %	398356291
3992	NC_018191	TA	3	6	186315	186320	50 %	50 %	0 %	0 %	398356291
3993	NC_018191	GC	3	6	186453	186458	0 %	0 %	50 %	50 %	398356291
3994	NC_018191	GATCTT	2	12	186472	186483	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	398356291
3995	NC_018191	CGA	2	6	186501	186506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356291
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3998	NC_018191	GT	3	6	186580	186585	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3999	NC_018191	TGG	2	6	186689	186694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398356292
4000	NC_018191	GC	4	8	186730	186737	0 %	0 %	50 %	50 %	398356292

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