MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 4533

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_018191	TTG	2	6	116753	116758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398356223
2502	NC_018191	GC	4	8	116764	116771	0 %	0 %	50 %	50 %	398356223
2503	NC_018191	ATG	2	6	116794	116799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356223
2504	NC_018191	CCG	2	6	117176	117181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356223
2505	NC_018191	GCC	2	6	117214	117219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356223
2506	NC_018191	CG	3	6	117236	117241	0 %	0 %	50 %	50 %	398356223
2507	NC_018191	GAC	2	6	117253	117258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356223
2508	NC_018191	TCG	2	6	117266	117271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356223
2509	NC_018191	TGC	2	6	117303	117308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356223
2510	NC_018191	CGAT	2	8	117413	117420	25 %	25 %	25 %	25 %	398356223
2511	NC_018191	CTC	3	9	117427	117435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356223
2512	NC_018191	CG	3	6	117456	117461	0 %	0 %	50 %	50 %	398356223
2513	NC_018191	CGGC	2	8	117522	117529	0 %	0 %	50 %	50 %	398356223
2514	NC_018191	TCG	2	6	117536	117541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356223
2515	NC_018191	GCAA	2	8	117597	117604	50 %	0 %	25 %	25 %	398356223
2516	NC_018191	CA	3	6	117616	117621	50 %	0 %	0 %	50 %	398356223
2517	NC_018191	CGA	2	6	117651	117656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356223
2518	NC_018191	CGG	2	6	117668	117673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356223
2519	NC_018191	GGT	2	6	117714	117719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398356223
2520	NC_018191	GAA	2	6	117727	117732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356223
2521	NC_018191	TCG	2	6	117860	117865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356223
2522	NC_018191	ATG	2	6	117887	117892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356223
2523	NC_018191	TCA	2	6	117974	117979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356223
2524	NC_018191	CGA	2	6	117981	117986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356223
2525	NC_018191	TGC	2	6	118077	118082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356223
2526	NC_018191	CTG	3	9	118087	118095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356223
2527	NC_018191	CTG	2	6	118099	118104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356223
2528	NC_018191	CTT	2	6	118132	118137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356223
2529	NC_018191	CGA	2	6	118215	118220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356223
2530	NC_018191	CG	3	6	118228	118233	0 %	0 %	50 %	50 %	398356223
2531	NC_018191	GCCG	2	8	118238	118245	0 %	0 %	50 %	50 %	398356223
2532	NC_018191	CTG	2	6	118336	118341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356223
2533	NC_018191	CTG	3	9	118375	118383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356223
2534	NC_018191	TTG	2	6	118384	118389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398356223
2535	NC_018191	CGC	2	6	118515	118520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356223
2536	NC_018191	GCT	2	6	118569	118574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356223
2537	NC_018191	TGC	2	6	118586	118591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356223
2538	NC_018191	TCT	2	6	118610	118615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356223
2539	NC_018191	GCA	2	6	118646	118651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356223
2540	NC_018191	CCG	2	6	118655	118660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356223
2541	NC_018191	GC	3	6	118665	118670	0 %	0 %	50 %	50 %	398356223
2542	NC_018191	CAC	2	6	118684	118689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2543	NC_018191	CGA	2	6	118721	118726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356224
2544	NC_018191	TGT	2	6	118727	118732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398356224
2545	NC_018191	CCG	2	6	118733	118738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356224
2546	NC_018191	CATC	2	8	118748	118755	25 %	25 %	0 %	50 %	398356224
2547	NC_018191	CGT	2	6	118778	118783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356224
2548	NC_018191	CCAG	2	8	118877	118884	25 %	0 %	25 %	50 %	398356224
2549	NC_018191	CTCG	2	8	118908	118915	0 %	25 %	25 %	50 %	398356224
2550	NC_018191	GCC	2	6	118918	118923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356224
2551	NC_018191	TCC	2	6	118977	118982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356224
2552	NC_018191	GC	3	6	118984	118989	0 %	0 %	50 %	50 %	398356224
2553	NC_018191	AG	3	6	119061	119066	50 %	0 %	50 %	0 %	398356224
2554	NC_018191	CAG	2	6	119232	119237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356224
2555	NC_018191	CGC	2	6	119294	119299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356224
2556	NC_018191	TTC	2	6	119301	119306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356224
2557	NC_018191	GCA	3	9	119363	119371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356224
2558	NC_018191	TCG	2	6	119383	119388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356224
2559	NC_018191	TCG	2	6	119395	119400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356224
2560	NC_018191	CAG	2	6	119460	119465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356224
2561	NC_018191	CGG	2	6	119711	119716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356224
2562	NC_018191	CGG	2	6	119732	119737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356224
2563	NC_018191	TGA	2	6	119761	119766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356224
2564	NC_018191	GCC	2	6	119838	119843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356224
2565	NC_018191	AAC	2	6	119860	119865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398356224
2566	NC_018191	GCC	2	6	119866	119871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356224
2567	NC_018191	TCG	2	6	119911	119916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356224
2568	NC_018191	GAAA	2	8	119925	119932	75 %	0 %	25 %	0 %	398356224
2569	NC_018191	CCG	2	6	119958	119963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356224
2570	NC_018191	CCT	2	6	120008	120013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356224
2571	NC_018191	CCG	2	6	120038	120043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356224
2572	NC_018191	CGCT	2	8	120072	120079	0 %	25 %	25 %	50 %	398356224
2573	NC_018191	GAT	2	6	120132	120137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356224
2574	NC_018191	CACG	2	8	120155	120162	25 %	0 %	25 %	50 %	398356224
2575	NC_018191	GC	3	6	120167	120172	0 %	0 %	50 %	50 %	398356224
2576	NC_018191	CGA	2	6	120182	120187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356224
2577	NC_018191	TCG	2	6	120283	120288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2578	NC_018191	GAT	2	6	120305	120310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2579	NC_018191	TGA	2	6	120335	120340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2580	NC_018191	GGA	2	6	120392	120397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356225
2581	NC_018191	TCT	2	6	120442	120447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356225
2582	NC_018191	GGT	2	6	120451	120456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398356225
2583	NC_018191	CGC	2	6	120495	120500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356225
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2585	NC_018191	GAA	2	6	120614	120619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356225
2586	NC_018191	TTCC	2	8	120645	120652	0 %	50 %	0 %	50 %	398356225
2587	NC_018191	CCT	2	6	120658	120663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356225
2588	NC_018191	ATC	2	6	120761	120766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356225
2589	NC_018191	TTC	2	6	120791	120796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356225
2590	NC_018191	TCG	2	6	120816	120821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356225
2591	NC_018191	CGG	2	6	120853	120858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356225
2592	NC_018191	TGG	2	6	120861	120866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398356225
2593	NC_018191	CG	3	6	120875	120880	0 %	0 %	50 %	50 %	398356225
2594	NC_018191	CA	3	6	120920	120925	50 %	0 %	0 %	50 %	398356225
2595	NC_018191	GTT	2	6	120932	120937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398356225
2596	NC_018191	CGC	2	6	120997	121002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356225
2597	NC_018191	CGA	2	6	121035	121040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356225
2598	NC_018191	GCC	2	6	121055	121060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356225
2599	NC_018191	CGT	2	6	121090	121095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356225
2600	NC_018191	GAA	2	6	121138	121143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356225
2601	NC_018191	TCG	2	6	121152	121157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356225
2602	NC_018191	TC	3	6	121172	121177	0 %	50 %	0 %	50 %	398356225
2603	NC_018191	GCG	2	6	121247	121252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2604	NC_018191	GCG	2	6	121352	121357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2605	NC_018191	GA	3	6	121378	121383	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_018191	TGAG	2	8	121390	121397	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2607	NC_018191	GAA	2	6	121467	121472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356226
2608	NC_018191	GCG	2	6	121495	121500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356226
2609	NC_018191	GCGA	2	8	121516	121523	25 %	0 %	50 %	25 %	398356226
2610	NC_018191	CGA	2	6	121592	121597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356226
2611	NC_018191	CCG	3	9	121633	121641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356226
2612	NC_018191	TAT	2	6	121712	121717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	398356226
2613	NC_018191	TCA	2	6	121730	121735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356226
2614	NC_018191	AAG	2	6	121782	121787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356226
2615	NC_018191	TCG	2	6	121825	121830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356226
2616	NC_018191	TCA	2	6	121850	121855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356226
2617	NC_018191	CAC	2	6	121862	121867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398356226
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2619	NC_018191	GAT	2	6	121893	121898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356226
2620	NC_018191	CG	3	6	121922	121927	0 %	0 %	50 %	50 %	398356226
2621	NC_018191	GAC	2	6	121941	121946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356226
2622	NC_018191	ACG	2	6	121969	121974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356226
2623	NC_018191	GCT	2	6	121975	121980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356226
2624	NC_018191	CTC	2	6	122010	122015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356226
2625	NC_018191	CGA	2	6	122058	122063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356226
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2630	NC_018191	AAATG	2	10	122139	122148	60 %	20 %	20 %	0 %	398356226
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2633	NC_018191	GCC	3	9	122356	122364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356226
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2641	NC_018191	CGGC	2	8	122871	122878	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2642	NC_018191	GC	3	6	122881	122886	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2643	NC_018191	TGAA	2	8	122935	122942	50 %	25 %	25 %	0 %	398356227
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2652	NC_018191	TGA	2	6	123606	123611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2655	NC_018191	CCT	2	6	123941	123946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356228
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2708	NC_018191	GGC	2	6	126212	126217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2730	NC_018191	GA	4	8	127246	127253	50 %	0 %	50 %	0 %	398356229
2731	NC_018191	CAG	2	6	127254	127259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2739	NC_018191	GGC	2	6	127596	127601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356230
2740	NC_018191	GCT	2	6	127613	127618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356230
2741	NC_018191	CCGC	2	8	127630	127637	0 %	0 %	25 %	75 %	398356230
2742	NC_018191	CTT	2	6	127665	127670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356230
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2744	NC_018191	GTA	2	6	127714	127719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356230
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2749	NC_018191	GC	3	6	128053	128058	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2985	NC_018191	TCA	2	6	138051	138056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356242
2986	NC_018191	TGC	2	6	138130	138135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356242
2987	NC_018191	CGC	2	6	138152	138157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356242
2988	NC_018191	CCAA	2	8	138182	138189	50 %	0 %	0 %	50 %	398356242
2989	NC_018191	GTC	3	9	138196	138204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356242
2990	NC_018191	GCA	2	6	138248	138253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356242
2991	NC_018191	CTT	2	6	138289	138294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356242
2992	NC_018191	ATG	2	6	138299	138304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356242
2993	NC_018191	GCATC	2	10	138315	138324	20 %	20 %	20 %	40 %	398356242
2994	NC_018191	GCA	2	6	138343	138348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356243
2995	NC_018191	GGC	2	6	138393	138398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356243
2996	NC_018191	CCT	2	6	138443	138448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356243
2997	NC_018191	CGC	2	6	138473	138478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2998	NC_018191	GA	3	6	138519	138524	50 %	0 %	50 %	0 %	398356244
2999	NC_018191	CCGT	2	8	138552	138559	0 %	25 %	25 %	50 %	398356244
3000	NC_018191	CGC	2	6	138620	138625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356244

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