MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 4533

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_018191	GGA	2	6	93159	93164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356203
2002	NC_018191	GC	3	6	93197	93202	0 %	0 %	50 %	50 %	398356203
2003	NC_018191	CGA	2	6	93210	93215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356203
2004	NC_018191	CCG	2	6	93244	93249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356203
2005	NC_018191	GCAA	2	8	93269	93276	50 %	0 %	25 %	25 %	398356203
2006	NC_018191	GTGC	2	8	93289	93296	0 %	25 %	50 %	25 %	398356203
2007	NC_018191	ATC	2	6	93301	93306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356203
2008	NC_018191	CGG	2	6	93400	93405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2009	NC_018191	CGA	2	6	93420	93425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2010	NC_018191	GAG	2	6	93429	93434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2011	NC_018191	GTG	2	6	93438	93443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398356204
2012	NC_018191	GC	3	6	93474	93479	0 %	0 %	50 %	50 %	398356204
2013	NC_018191	GTG	3	9	93561	93569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398356204
2014	NC_018191	GGC	2	6	93618	93623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356204
2015	NC_018191	TGG	2	6	93638	93643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398356204
2016	NC_018191	GC	3	6	93762	93767	0 %	0 %	50 %	50 %	398356204
2017	NC_018191	CGG	2	6	93878	93883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356204
2018	NC_018191	AGC	3	9	93886	93894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356204
2019	NC_018191	ACG	2	6	94029	94034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356204
2020	NC_018191	TCG	2	6	94105	94110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356204
2021	NC_018191	CGC	2	6	94124	94129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356204
2022	NC_018191	GC	3	6	94133	94138	0 %	0 %	50 %	50 %	398356204
2023	NC_018191	ATG	2	6	94163	94168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356205
2024	NC_018191	TCA	2	6	94263	94268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356205
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2029	NC_018191	CCGAC	2	10	94548	94557	20 %	0 %	20 %	60 %	398356205
2030	NC_018191	CGA	2	6	94564	94569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356205
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2035	NC_018191	ATGG	2	8	94750	94757	25 %	25 %	50 %	0 %	398356205
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2039	NC_018191	CTG	2	6	94820	94825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356205
2040	NC_018191	CCG	2	6	94852	94857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356205
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2042	NC_018191	TCGCCG	2	12	94989	95000	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	398356205
2043	NC_018191	GCCCCG	2	12	95232	95243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356205
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2055	NC_018191	CAT	2	6	95719	95724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356205
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2057	NC_018191	TCC	2	6	95788	95793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356205
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2083	NC_018191	GC	3	6	96988	96993	0 %	0 %	50 %	50 %	398356206
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2112	NC_018191	CGGA	2	8	98403	98410	25 %	0 %	50 %	25 %	398356207
2113	NC_018191	GCA	2	6	98447	98452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356207
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2119	NC_018191	GAC	2	6	98820	98825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356207
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2121	NC_018191	CGAT	2	8	98849	98856	25 %	25 %	25 %	25 %	398356207
2122	NC_018191	CAT	2	6	98904	98909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356207
2123	NC_018191	ATC	2	6	98941	98946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356207
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2125	NC_018191	GCT	2	6	98971	98976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356207
2126	NC_018191	GAC	2	6	98992	98997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356207
2127	NC_018191	TTCGAT	2	12	99037	99048	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	398356207
2128	NC_018191	GCA	2	6	99131	99136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2129	NC_018191	TCG	2	6	99197	99202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356208
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2138	NC_018191	ACCGC	2	10	99525	99534	20 %	0 %	20 %	60 %	398356208
2139	NC_018191	CGT	2	6	99571	99576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356208
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2144	NC_018191	CG	3	6	99810	99815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2145	NC_018191	CTT	2	6	99823	99828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356209
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2166	NC_018191	TCGT	2	8	100731	100738	0 %	50 %	25 %	25 %	398356209
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2180	NC_018191	CTG	2	6	101559	101564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2233	NC_018191	ATG	2	6	104064	104069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356212
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2235	NC_018191	CG	3	6	104098	104103	0 %	0 %	50 %	50 %	398356212
2236	NC_018191	GCA	2	6	104128	104133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356212
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2239	NC_018191	TCCT	2	8	104219	104226	0 %	50 %	0 %	50 %	398356212
2240	NC_018191	GTC	2	6	104264	104269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356212
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2242	NC_018191	AC	3	6	104327	104332	50 %	0 %	0 %	50 %	398356213
2243	NC_018191	GCT	2	6	104333	104338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356213
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2246	NC_018191	CGT	3	9	104393	104401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356213
2247	NC_018191	CAT	2	6	104430	104435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356213
2248	NC_018191	ATG	2	6	104438	104443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356213
2249	NC_018191	CGG	2	6	104520	104525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356214
2250	NC_018191	TCTT	2	8	104527	104534	0 %	75 %	0 %	25 %	398356214
2251	NC_018191	TCGAAG	2	12	104616	104627	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	398356214
2252	NC_018191	TGC	2	6	104634	104639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356214
2253	NC_018191	CTT	2	6	104683	104688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356214
2254	NC_018191	GT	3	6	104709	104714	0 %	50 %	50 %	0 %	398356214
2255	NC_018191	CGC	2	6	104768	104773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356214
2256	NC_018191	TCG	2	6	104779	104784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356214
2257	NC_018191	AGC	2	6	104826	104831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356214
2258	NC_018191	GATGA	2	10	104849	104858	40 %	20 %	40 %	0 %	398356214
2259	NC_018191	CTG	2	6	104859	104864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356214
2260	NC_018191	CTT	2	6	104882	104887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356214
2261	NC_018191	GAG	2	6	104903	104908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356214
2262	NC_018191	CTG	3	9	104924	104932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356214
2263	NC_018191	GA	3	6	104939	104944	50 %	0 %	50 %	0 %	398356214
2264	NC_018191	TTG	2	6	104967	104972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398356214
2265	NC_018191	CGG	2	6	105058	105063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356214
2266	NC_018191	ATC	2	6	105065	105070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356214
2267	NC_018191	GCA	2	6	105074	105079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356214
2268	NC_018191	CGC	2	6	105083	105088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356214
2269	NC_018191	CTG	2	6	105122	105127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356214
2270	NC_018191	CGA	2	6	105136	105141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356214
2271	NC_018191	CTCG	2	8	105164	105171	0 %	25 %	25 %	50 %	398356214
2272	NC_018191	ATC	2	6	105234	105239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356215
2273	NC_018191	AGC	2	6	105313	105318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356215
2274	NC_018191	TCT	2	6	105365	105370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356215
2275	NC_018191	CCA	2	6	105373	105378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398356215
2276	NC_018191	ACACAG	2	12	105449	105460	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	398356215
2277	NC_018191	GTC	2	6	105522	105527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356215
2278	NC_018191	GGC	2	6	105578	105583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356215
2279	NC_018191	TGG	2	6	105631	105636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398356215
2280	NC_018191	CCT	2	6	105661	105666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356215
2281	NC_018191	GGC	2	6	105674	105679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356215
2282	NC_018191	CTAC	2	8	105782	105789	25 %	25 %	0 %	50 %	398356215
2283	NC_018191	GCG	2	6	105800	105805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356215
2284	NC_018191	CAT	2	6	105806	105811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356215
2285	NC_018191	GTC	2	6	105825	105830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356215
2286	NC_018191	GCC	2	6	105898	105903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356215
2287	NC_018191	GAG	3	9	105951	105959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356215
2288	NC_018191	CGG	2	6	106001	106006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356215
2289	NC_018191	CAA	2	6	106022	106027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398356215
2290	NC_018191	CTG	2	6	106029	106034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356215
2291	NC_018191	GAT	2	6	106058	106063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356215
2292	NC_018191	GGC	3	9	106115	106123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356215
2293	NC_018191	CGA	2	6	106124	106129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356215
2294	NC_018191	TCGG	2	8	106162	106169	0 %	25 %	50 %	25 %	398356215
2295	NC_018191	TCG	2	6	106192	106197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356215
2296	NC_018191	GCA	2	6	106282	106287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356215
2297	NC_018191	CCT	2	6	106328	106333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356215
2298	NC_018191	CG	4	8	106349	106356	0 %	0 %	50 %	50 %	398356215
2299	NC_018191	GCC	2	6	106375	106380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356215
2300	NC_018191	CTT	2	6	106526	106531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356215
2301	NC_018191	CAC	2	6	106532	106537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398356215
2302	NC_018191	GAGC	2	8	106639	106646	25 %	0 %	50 %	25 %	398356215
2303	NC_018191	GAG	2	6	106672	106677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356215
2304	NC_018191	GTC	2	6	106755	106760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356215
2305	NC_018191	TC	4	8	106879	106886	0 %	50 %	0 %	50 %	398356215
2306	NC_018191	GGC	2	6	106911	106916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356215
2307	NC_018191	CGA	2	6	106925	106930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356215
2308	NC_018191	GGC	2	6	107015	107020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356215
2309	NC_018191	AG	3	6	107052	107057	50 %	0 %	50 %	0 %	398356215
2310	NC_018191	GCT	2	6	107078	107083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356215
2311	NC_018191	CCT	2	6	107134	107139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356216
2312	NC_018191	CCT	2	6	107179	107184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356216
2313	NC_018191	CAG	3	9	107257	107265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356216
2314	NC_018191	GTC	2	6	107351	107356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356216
2315	NC_018191	CGGCC	2	10	107378	107387	0 %	0 %	40 %	60 %	398356216
2316	NC_018191	AGA	2	6	107397	107402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356216
2317	NC_018191	CAG	2	6	107497	107502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356216
2318	NC_018191	CGG	2	6	107591	107596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356216
2319	NC_018191	TTG	2	6	107666	107671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398356216
2320	NC_018191	CGT	2	6	107805	107810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356216
2321	NC_018191	GAA	3	9	107820	107828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356216
2322	NC_018191	TC	3	6	107867	107872	0 %	50 %	0 %	50 %	398356216
2323	NC_018191	CGA	2	6	108021	108026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356216
2324	NC_018191	CGC	2	6	108084	108089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356216
2325	NC_018191	CGA	2	6	108103	108108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356216
2326	NC_018191	ATC	2	6	108164	108169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356216
2327	NC_018191	CAC	2	6	108342	108347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398356216
2328	NC_018191	TCG	2	6	108365	108370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356216
2329	NC_018191	GCCT	2	8	108374	108381	0 %	25 %	25 %	50 %	398356216
2330	NC_018191	CGC	2	6	108382	108387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356216
2331	NC_018191	GAC	3	9	108502	108510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356216
2332	NC_018191	AAAT	2	8	108659	108666	75 %	25 %	0 %	0 %	398356216
2333	NC_018191	CCG	2	6	108683	108688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356216
2334	NC_018191	GAGG	2	8	108694	108701	25 %	0 %	75 %	0 %	398356216
2335	NC_018191	TGC	2	6	108762	108767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356216
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2337	NC_018191	GC	3	6	108823	108828	0 %	0 %	50 %	50 %	398356216
2338	NC_018191	CG	3	6	108833	108838	0 %	0 %	50 %	50 %	398356216
2339	NC_018191	TGA	2	6	108849	108854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356216
2340	NC_018191	ATCG	2	8	108913	108920	25 %	25 %	25 %	25 %	398356216
2341	NC_018191	GAA	2	6	108930	108935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356216
2342	NC_018191	GAA	2	6	108946	108951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356216
2343	NC_018191	CG	4	8	109011	109018	0 %	0 %	50 %	50 %	398356216
2344	NC_018191	CCG	2	6	109047	109052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356216
2345	NC_018191	ACG	3	9	109094	109102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356216
2346	NC_018191	ATG	2	6	109259	109264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356216
2347	NC_018191	CGG	2	6	109269	109274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356216
2348	NC_018191	GC	3	6	109403	109408	0 %	0 %	50 %	50 %	398356216
2349	NC_018191	CACC	2	8	109488	109495	25 %	0 %	0 %	75 %	398356216
2350	NC_018191	CT	3	6	109580	109585	0 %	50 %	0 %	50 %	398356216
2351	NC_018191	CG	4	8	109626	109633	0 %	0 %	50 %	50 %	398356216
2352	NC_018191	GCT	2	6	109639	109644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356216
2353	NC_018191	ATCAG	2	10	109676	109685	40 %	20 %	20 %	20 %	398356216
2354	NC_018191	GGC	2	6	109693	109698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356216
2355	NC_018191	CTC	2	6	109713	109718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356216
2356	NC_018191	TGG	2	6	109887	109892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2357	NC_018191	TCA	2	6	109933	109938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356217
2358	NC_018191	ATC	2	6	110006	110011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356217
2359	NC_018191	GGC	2	6	110023	110028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356217
2360	NC_018191	ACG	2	6	110067	110072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356217
2361	NC_018191	GCT	2	6	110088	110093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356217
2362	NC_018191	TTG	2	6	110136	110141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398356217
2363	NC_018191	CG	3	6	110196	110201	0 %	0 %	50 %	50 %	398356217
2364	NC_018191	GGT	2	6	110206	110211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398356217
2365	NC_018191	CGG	2	6	110217	110222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356217
2366	NC_018191	TGC	2	6	110263	110268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356217
2367	NC_018191	CAT	2	6	110287	110292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356217
2368	NC_018191	ACA	2	6	110433	110438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398356217
2369	NC_018191	TC	3	6	110462	110467	0 %	50 %	0 %	50 %	398356217
2370	NC_018191	CTG	2	6	110507	110512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356217
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2375	NC_018191	CGACG	2	10	110761	110770	20 %	0 %	40 %	40 %	398356217
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2471	NC_018191	GC	3	6	114971	114976	0 %	0 %	50 %	50 %	398356221
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2476	NC_018191	CCT	2	6	115157	115162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2477	NC_018191	AGGA	2	8	115283	115290	50 %	0 %	50 %	0 %	398356222
2478	NC_018191	AC	3	6	115435	115440	50 %	0 %	0 %	50 %	398356222
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2480	NC_018191	AAG	2	6	115517	115522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356222
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2482	NC_018191	GGCAT	2	10	115758	115767	20 %	20 %	40 %	20 %	398356222
2483	NC_018191	AG	3	6	115769	115774	50 %	0 %	50 %	0 %	398356222
2484	NC_018191	GAGC	2	8	115886	115893	25 %	0 %	50 %	25 %	398356222
2485	NC_018191	CGG	2	6	115917	115922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356222
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2488	NC_018191	CCT	2	6	116123	116128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356223
2489	NC_018191	CTG	2	6	116179	116184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356223
2490	NC_018191	TC	3	6	116200	116205	0 %	50 %	0 %	50 %	398356223
2491	NC_018191	CAT	2	6	116262	116267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356223
2492	NC_018191	GCC	2	6	116299	116304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356223
2493	NC_018191	GGCG	2	8	116412	116419	0 %	0 %	75 %	25 %	398356223
2494	NC_018191	GCCG	2	8	116427	116434	0 %	0 %	50 %	50 %	398356223
2495	NC_018191	TCCGG	2	10	116512	116521	0 %	20 %	40 %	40 %	398356223
2496	NC_018191	GCT	2	6	116527	116532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356223
2497	NC_018191	CGT	3	9	116598	116606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356223
2498	NC_018191	GCC	2	6	116641	116646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356223
2499	NC_018191	TGA	2	6	116681	116686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356223
2500	NC_018191	TCG	2	6	116723	116728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356223

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