MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 4533

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018191	GATC	2	8	23062	23069	25 %	25 %	25 %	25 %	398356126
502	NC_018191	CATC	2	8	23140	23147	25 %	25 %	0 %	50 %	398356126
503	NC_018191	GAG	2	6	23155	23160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356126
504	NC_018191	CGTC	2	8	23206	23213	0 %	25 %	25 %	50 %	398356126
505	NC_018191	GC	3	6	23272	23277	0 %	0 %	50 %	50 %	398356126
506	NC_018191	TCC	2	6	23292	23297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356126
507	NC_018191	GC	3	6	23338	23343	0 %	0 %	50 %	50 %	398356126
508	NC_018191	TCC	2	6	23454	23459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356127
509	NC_018191	CGC	2	6	23522	23527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356127
510	NC_018191	GCC	2	6	23564	23569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356127
511	NC_018191	CGCC	2	8	23607	23614	0 %	0 %	25 %	75 %	398356128
512	NC_018191	GTC	2	6	23664	23669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356128
513	NC_018191	AGC	3	9	23736	23744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356128
514	NC_018191	CGT	2	6	23806	23811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356128
515	NC_018191	CG	4	8	23842	23849	0 %	0 %	50 %	50 %	398356128
516	NC_018191	AAT	2	6	23860	23865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	398356128
517	NC_018191	ACG	2	6	23961	23966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356128
518	NC_018191	CCG	2	6	24004	24009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356128
519	NC_018191	ATAA	2	8	24029	24036	75 %	25 %	0 %	0 %	398356128
520	NC_018191	GCC	2	6	24045	24050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356128
521	NC_018191	CGGC	2	8	24051	24058	0 %	0 %	50 %	50 %	398356128
522	NC_018191	TGA	2	6	24097	24102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356128
523	NC_018191	TCG	2	6	24252	24257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356128
524	NC_018191	CGA	2	6	24292	24297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356128
525	NC_018191	GTT	2	6	24311	24316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398356128
526	NC_018191	CGCGT	2	10	24346	24355	0 %	20 %	40 %	40 %	398356128
527	NC_018191	CGA	2	6	24358	24363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356128
528	NC_018191	TCC	2	6	24429	24434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356128
529	NC_018191	CGCGAT	2	12	24449	24460	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	398356128
530	NC_018191	TGC	2	6	24485	24490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356128
531	NC_018191	ACC	2	6	24519	24524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398356128
532	NC_018191	GC	3	6	24543	24548	0 %	0 %	50 %	50 %	398356128
533	NC_018191	TGG	2	6	24580	24585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398356128
534	NC_018191	CG	3	6	24607	24612	0 %	0 %	50 %	50 %	398356128
535	NC_018191	ATTG	2	8	24640	24647	25 %	50 %	25 %	0 %	398356128
536	NC_018191	TCG	2	6	24663	24668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356128
537	NC_018191	CCG	2	6	24669	24674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356128
538	NC_018191	GAT	2	6	24731	24736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356128
539	NC_018191	GCG	2	6	24783	24788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356128
540	NC_018191	CGA	2	6	24808	24813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356128
541	NC_018191	GAA	2	6	24833	24838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356128
542	NC_018191	CG	4	8	24863	24870	0 %	0 %	50 %	50 %	398356128
543	NC_018191	CGA	2	6	24901	24906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356128
544	NC_018191	GGA	2	6	24907	24912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356128
545	NC_018191	GC	3	6	24928	24933	0 %	0 %	50 %	50 %	398356128
546	NC_018191	GGC	2	6	24937	24942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356128
547	NC_018191	ACC	2	6	24972	24977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398356128
548	NC_018191	TCG	2	6	24999	25004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356128
549	NC_018191	GCCA	2	8	25007	25014	25 %	0 %	25 %	50 %	398356128
550	NC_018191	GCC	2	6	25085	25090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356128
551	NC_018191	ACAA	2	8	25137	25144	75 %	0 %	0 %	25 %	398356128
552	NC_018191	AGC	2	6	25161	25166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356128
553	NC_018191	CCG	2	6	25191	25196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356128
554	NC_018191	CGA	2	6	25255	25260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356128
555	NC_018191	CTT	2	6	25265	25270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356128
556	NC_018191	CTC	2	6	25274	25279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356128
557	NC_018191	GCT	2	6	25282	25287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356128
558	NC_018191	TCAA	2	8	25299	25306	50 %	25 %	0 %	25 %	398356128
559	NC_018191	ACG	2	6	25317	25322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356128
560	NC_018191	GCC	2	6	25347	25352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356128
561	NC_018191	AGCTG	2	10	25369	25378	20 %	20 %	40 %	20 %	398356128
562	NC_018191	CAA	2	6	25421	25426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398356128
563	NC_018191	CGA	2	6	25432	25437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356128
564	NC_018191	CGGC	2	8	25475	25482	0 %	0 %	50 %	50 %	398356128
565	NC_018191	TTCG	2	8	25490	25497	0 %	50 %	25 %	25 %	398356128
566	NC_018191	CG	3	6	25524	25529	0 %	0 %	50 %	50 %	398356129
567	NC_018191	GGC	2	6	25717	25722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356130
568	NC_018191	GAG	2	6	25790	25795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356130
569	NC_018191	GCC	2	6	25800	25805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356130
570	NC_018191	TG	3	6	25832	25837	0 %	50 %	50 %	0 %	398356130
571	NC_018191	TGC	2	6	25957	25962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356130
572	NC_018191	CAG	2	6	25987	25992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356130
573	NC_018191	CG	3	6	26001	26006	0 %	0 %	50 %	50 %	398356130
574	NC_018191	TCG	3	9	26070	26078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356130
575	NC_018191	ATC	2	6	26135	26140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356130
576	NC_018191	TGG	2	6	26163	26168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398356130
577	NC_018191	AGCCAT	2	12	26217	26228	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_018191	GA	3	6	26392	26397	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
579	NC_018191	CGA	2	6	26457	26462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_018191	GAT	2	6	26464	26469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_018191	AGC	2	6	26685	26690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_018191	TCG	2	6	26696	26701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_018191	CGT	2	6	26721	26726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_018191	GC	3	6	26742	26747	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
585	NC_018191	CGC	3	9	26760	26768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
586	NC_018191	TGC	2	6	26770	26775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_018191	AGGC	2	8	26811	26818	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
588	NC_018191	ACA	2	6	26924	26929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_018191	GGGC	2	8	27082	27089	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
590	NC_018191	GTG	2	6	27114	27119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
591	NC_018191	GC	3	6	27159	27164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
592	NC_018191	ATG	2	6	27194	27199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_018191	GCC	2	6	27215	27220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
594	NC_018191	GAC	2	6	27381	27386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_018191	CTT	2	6	27389	27394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_018191	GC	4	8	27426	27433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
597	NC_018191	TGG	2	6	27450	27455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
598	NC_018191	TGCG	2	8	27495	27502	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
599	NC_018191	CAG	2	6	27538	27543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_018191	CGT	2	6	27575	27580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_018191	TGC	2	6	27583	27588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_018191	GTT	2	6	27595	27600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_018191	ACCA	2	8	27606	27613	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
604	NC_018191	CG	3	6	27727	27732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
605	NC_018191	CTC	2	6	27743	27748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
606	NC_018191	AAGG	2	8	27752	27759	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
607	NC_018191	TCG	2	6	27772	27777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_018191	AGC	2	6	27871	27876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_018191	GCC	2	6	27909	27914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
610	NC_018191	TCG	2	6	27961	27966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356131
611	NC_018191	CCA	2	6	27991	27996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398356131
612	NC_018191	ACG	2	6	28150	28155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356131
613	NC_018191	CG	3	6	28154	28159	0 %	0 %	50 %	50 %	398356131
614	NC_018191	CAC	2	6	28249	28254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
615	NC_018191	AGA	2	6	28257	28262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_018191	TCT	2	6	28356	28361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356132
617	NC_018191	ATA	2	6	28504	28509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	398356132
618	NC_018191	TCC	2	6	28523	28528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356132
619	NC_018191	TCC	2	6	28532	28537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356132
620	NC_018191	TTC	2	6	28589	28594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356132
621	NC_018191	CGA	2	6	28644	28649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356132
622	NC_018191	CGGC	2	8	28740	28747	0 %	0 %	50 %	50 %	398356132
623	NC_018191	GCG	2	6	28777	28782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356132
624	NC_018191	CT	3	6	28810	28815	0 %	50 %	0 %	50 %	398356132
625	NC_018191	CTC	2	6	28879	28884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_018191	TGG	2	6	28893	28898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
627	NC_018191	CGC	2	6	28907	28912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_018191	CCGG	2	8	28922	28929	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
629	NC_018191	TGA	2	6	28937	28942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_018191	CGC	2	6	28981	28986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
631	NC_018191	CTT	2	6	29011	29016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_018191	GCC	2	6	29086	29091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356133
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763	NC_018191	GCA	2	6	35658	35663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356138
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772	NC_018191	CG	3	6	36156	36161	0 %	0 %	50 %	50 %	398356138
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777	NC_018191	GCC	2	6	36459	36464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356138
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883	NC_018191	A	6	6	41268	41273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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