MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 4533

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_018191	CATG	2	8	209241	209248	25 %	25 %	25 %	25 %	398356313
4502	NC_018191	CTA	2	6	209260	209265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356313
4503	NC_018191	TGC	2	6	209282	209287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356313
4504	NC_018191	CGA	2	6	209322	209327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356313
4505	NC_018191	TCG	2	6	209339	209344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356313
4506	NC_018191	TCA	2	6	209411	209416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356313
4507	NC_018191	CGG	2	6	209445	209450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356313
4508	NC_018191	CTC	2	6	209451	209456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356313
4509	NC_018191	TGA	2	6	209501	209506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356313
4510	NC_018191	GAT	2	6	209583	209588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356313
4511	NC_018191	TTC	2	6	209605	209610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356313
4512	NC_018191	AGGA	2	8	209624	209631	50 %	0 %	50 %	0 %	398356313
4513	NC_018191	TCG	2	6	209639	209644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356313
4514	NC_018191	TCG	2	6	209669	209674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356313
4515	NC_018191	CG	4	8	209732	209739	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4516	NC_018191	CCG	2	6	209770	209775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4517	NC_018191	ACT	2	6	209791	209796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4518	NC_018191	TC	3	6	209846	209851	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4519	NC_018191	GCA	2	6	209880	209885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4520	NC_018191	TGG	2	6	209935	209940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_018191	GCG	2	6	209966	209971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4522	NC_018191	CGT	2	6	209995	210000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_018191	CCG	2	6	210027	210032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4524	NC_018191	G	6	6	210287	210292	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_018191	CGC	2	6	210321	210326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4526	NC_018191	GC	3	6	210325	210330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4527	NC_018191	CGG	2	6	210332	210337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4528	NC_018191	GCT	2	6	210338	210343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4529	NC_018191	TCGC	2	8	210426	210433	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4530	NC_018191	TGCCGA	2	12	210530	210541	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4531	NC_018191	CGGC	3	12	210544	210555	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4532	NC_018191	GCC	2	6	210575	210580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4533	NC_018191	GC	3	6	210581	210586	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.