MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018182	GGCT	2	8	88	95	0 %	25 %	50 %	25 %	398356014
2	NC_018182	CTTA	2	8	216	223	25 %	50 %	0 %	25 %	398356014
3	NC_018182	TGGT	2	8	547	554	0 %	50 %	50 %	0 %	398356014
4	NC_018182	CGAG	2	8	559	566	25 %	0 %	50 %	25 %	398356014
5	NC_018182	TGAT	2	8	1126	1133	25 %	50 %	25 %	0 %	398356014
6	NC_018182	CGGC	2	8	1384	1391	0 %	0 %	50 %	50 %	398356014
7	NC_018182	CGGG	2	8	1520	1527	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8	NC_018182	CCGG	2	8	1726	1733	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_018182	TCAA	2	8	2314	2321	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_018182	GAAC	2	8	2880	2887	50 %	0 %	25 %	25 %	398356015
11	NC_018182	GCGG	2	8	3357	3364	0 %	0 %	75 %	25 %	398356015
12	NC_018182	CCTC	2	8	3917	3924	0 %	25 %	0 %	75 %	398356015
13	NC_018182	AAGG	2	8	4080	4087	50 %	0 %	50 %	0 %	398356016
14	NC_018182	GCCC	2	8	4309	4316	0 %	0 %	25 %	75 %	398356016
15	NC_018182	CTTC	2	8	4750	4757	0 %	50 %	0 %	50 %	398356016
16	NC_018182	TGGA	2	8	4944	4951	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018182	CGCA	2	8	4978	4985	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_018182	ACCC	2	8	6076	6083	25 %	0 %	0 %	75 %	398356019
19	NC_018182	CTCG	2	8	6190	6197	0 %	25 %	25 %	50 %	398356019
20	NC_018182	ACCA	2	8	6638	6645	50 %	0 %	0 %	50 %	398356019
21	NC_018182	CCAT	3	12	6897	6908	25 %	25 %	0 %	50 %	398356020
22	NC_018182	TTCA	2	8	6958	6965	25 %	50 %	0 %	25 %	398356021
23	NC_018182	CACG	2	8	7234	7241	25 %	0 %	25 %	50 %	398356021
24	NC_018182	TGGC	2	8	7574	7581	0 %	25 %	50 %	25 %	398356022
25	NC_018182	GCAA	2	8	8370	8377	50 %	0 %	25 %	25 %	398356022
26	NC_018182	ACGA	2	8	8552	8559	50 %	0 %	25 %	25 %	398356022
27	NC_018182	CGGC	2	8	8565	8572	0 %	0 %	50 %	50 %	398356022
28	NC_018182	CGCT	2	8	8734	8741	0 %	25 %	25 %	50 %	398356022
29	NC_018182	GCCG	2	8	8767	8774	0 %	0 %	50 %	50 %	398356022
30	NC_018182	CGGC	2	8	8919	8926	0 %	0 %	50 %	50 %	398356022
31	NC_018182	CCCG	2	8	9552	9559	0 %	0 %	25 %	75 %	398356023
32	NC_018182	GGCG	3	12	9610	9621	0 %	0 %	75 %	25 %	398356023
33	NC_018182	CGCC	2	8	9941	9948	0 %	0 %	25 %	75 %	398356023
34	NC_018182	ATCA	2	8	10071	10078	50 %	25 %	0 %	25 %	398356023
35	NC_018182	TCGT	2	8	10145	10152	0 %	50 %	25 %	25 %	398356023
36	NC_018182	TCCT	2	8	11234	11241	0 %	50 %	0 %	50 %	398356023
37	NC_018182	GGCC	2	8	11693	11700	0 %	0 %	50 %	50 %	398356024

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.