MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 100

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018180	GC	3	6	101	106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_018180	GC	4	8	150	157	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_018180	GC	3	6	2194	2199	0 %	0 %	50 %	50 %	400752839
4	NC_018180	TC	3	6	2643	2648	0 %	50 %	0 %	50 %	400752840
5	NC_018180	CG	3	6	2712	2717	0 %	0 %	50 %	50 %	400752840
6	NC_018180	GC	3	6	3451	3456	0 %	0 %	50 %	50 %	400752842
7	NC_018180	GT	3	6	3730	3735	0 %	50 %	50 %	0 %	400752843
8	NC_018180	CG	3	6	3748	3753	0 %	0 %	50 %	50 %	400752843
9	NC_018180	GC	3	6	3911	3916	0 %	0 %	50 %	50 %	400752843
10	NC_018180	TC	3	6	4312	4317	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_018180	CG	3	6	4396	4401	0 %	0 %	50 %	50 %	400752845
12	NC_018180	GC	3	6	5044	5049	0 %	0 %	50 %	50 %	400752846
13	NC_018180	CG	3	6	5196	5201	0 %	0 %	50 %	50 %	400752846
14	NC_018180	TG	3	6	5456	5461	0 %	50 %	50 %	0 %	400752846
15	NC_018180	GC	3	6	6227	6232	0 %	0 %	50 %	50 %	400752846
16	NC_018180	CG	3	6	6263	6268	0 %	0 %	50 %	50 %	400752846
17	NC_018180	GC	3	6	6351	6356	0 %	0 %	50 %	50 %	400752846
18	NC_018180	CG	3	6	7004	7009	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_018180	GT	3	6	7264	7269	0 %	50 %	50 %	0 %	400752848
20	NC_018180	CG	3	6	8147	8152	0 %	0 %	50 %	50 %	400752848
21	NC_018180	GC	3	6	8190	8195	0 %	0 %	50 %	50 %	400752848
22	NC_018180	AG	3	6	8276	8281	50 %	0 %	50 %	0 %	400752848
23	NC_018180	CG	4	8	8340	8347	0 %	0 %	50 %	50 %	400752848
24	NC_018180	GA	3	6	8440	8445	50 %	0 %	50 %	0 %	400752848
25	NC_018180	CG	4	8	8684	8691	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_018180	GC	3	6	9053	9058	0 %	0 %	50 %	50 %	400752849
27	NC_018180	CG	3	6	9768	9773	0 %	0 %	50 %	50 %	400752849
28	NC_018180	GC	3	6	10100	10105	0 %	0 %	50 %	50 %	400752849
29	NC_018180	CG	3	6	10243	10248	0 %	0 %	50 %	50 %	400752849
30	NC_018180	GC	3	6	10605	10610	0 %	0 %	50 %	50 %	400752849
31	NC_018180	GC	4	8	10793	10800	0 %	0 %	50 %	50 %	400752849
32	NC_018180	GC	4	8	10858	10865	0 %	0 %	50 %	50 %	400752849
33	NC_018180	GC	3	6	11783	11788	0 %	0 %	50 %	50 %	400752849
34	NC_018180	GC	4	8	12128	12135	0 %	0 %	50 %	50 %	400752850
35	NC_018180	CG	3	6	12288	12293	0 %	0 %	50 %	50 %	400752850
36	NC_018180	CG	4	8	13010	13017	0 %	0 %	50 %	50 %	400752851
37	NC_018180	CG	3	6	13445	13450	0 %	0 %	50 %	50 %	400752851
38	NC_018180	GC	3	6	13535	13540	0 %	0 %	50 %	50 %	400752851
39	NC_018180	GC	3	6	13818	13823	0 %	0 %	50 %	50 %	400752851
40	NC_018180	GC	3	6	14151	14156	0 %	0 %	50 %	50 %	400752851
41	NC_018180	GC	3	6	14178	14183	0 %	0 %	50 %	50 %	400752851
42	NC_018180	CT	3	6	14617	14622	0 %	50 %	0 %	50 %	400752851
43	NC_018180	GC	3	6	14724	14729	0 %	0 %	50 %	50 %	400752851
44	NC_018180	CG	5	10	15275	15284	0 %	0 %	50 %	50 %	400752853
45	NC_018180	CG	3	6	17506	17511	0 %	0 %	50 %	50 %	400752856
46	NC_018180	GA	3	6	17972	17977	50 %	0 %	50 %	0 %	400752856
47	NC_018180	CG	3	6	18103	18108	0 %	0 %	50 %	50 %	400752856
48	NC_018180	AG	3	6	18245	18250	50 %	0 %	50 %	0 %	400752856
49	NC_018180	GA	3	6	18277	18282	50 %	0 %	50 %	0 %	400752856
50	NC_018180	GT	3	6	18683	18688	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018180	GC	3	6	19563	19568	0 %	0 %	50 %	50 %	400752857
52	NC_018180	CG	3	6	19927	19932	0 %	0 %	50 %	50 %	400752857
53	NC_018180	CG	3	6	20568	20573	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_018180	CG	3	6	20685	20690	0 %	0 %	50 %	50 %	400752858
55	NC_018180	CG	3	6	20702	20707	0 %	0 %	50 %	50 %	400752858
56	NC_018180	GA	3	6	21740	21745	50 %	0 %	50 %	0 %	400752860
57	NC_018180	CG	3	6	21751	21756	0 %	0 %	50 %	50 %	400752860
58	NC_018180	GC	3	6	22225	22230	0 %	0 %	50 %	50 %	400752861
59	NC_018180	AG	3	6	22626	22631	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018180	GA	3	6	23684	23689	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018180	GC	3	6	23817	23822	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_018180	CG	3	6	24064	24069	0 %	0 %	50 %	50 %	400752863
63	NC_018180	GC	3	6	24701	24706	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_018180	GC	3	6	25364	25369	0 %	0 %	50 %	50 %	400752865
65	NC_018180	GC	3	6	25768	25773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_018180	TC	3	6	26018	26023	0 %	50 %	0 %	50 %	400752866
67	NC_018180	CG	3	6	26242	26247	0 %	0 %	50 %	50 %	400752866
68	NC_018180	GC	4	8	26378	26385	0 %	0 %	50 %	50 %	400752866
69	NC_018180	AG	3	6	26699	26704	50 %	0 %	50 %	0 %	400752866
70	NC_018180	TG	3	6	26868	26873	0 %	50 %	50 %	0 %	400752866
71	NC_018180	CG	3	6	27519	27524	0 %	0 %	50 %	50 %	400752867
72	NC_018180	CG	3	6	27801	27806	0 %	0 %	50 %	50 %	400752867
73	NC_018180	GC	3	6	28144	28149	0 %	0 %	50 %	50 %	400752869
74	NC_018180	GC	3	6	28217	28222	0 %	0 %	50 %	50 %	400752869
75	NC_018180	GC	3	6	28257	28262	0 %	0 %	50 %	50 %	400752869
76	NC_018180	CT	3	6	28378	28383	0 %	50 %	0 %	50 %	400752869
77	NC_018180	GC	3	6	28475	28480	0 %	0 %	50 %	50 %	400752869
78	NC_018180	TG	3	6	28484	28489	0 %	50 %	50 %	0 %	400752869
79	NC_018180	CG	3	6	29039	29044	0 %	0 %	50 %	50 %	400752870
80	NC_018180	CG	3	6	29201	29206	0 %	0 %	50 %	50 %	400752870
81	NC_018180	GC	4	8	30812	30819	0 %	0 %	50 %	50 %	400752871
82	NC_018180	GC	3	6	30944	30949	0 %	0 %	50 %	50 %	400752872
83	NC_018180	GC	3	6	31696	31701	0 %	0 %	50 %	50 %	400752873
84	NC_018180	GC	3	6	32659	32664	0 %	0 %	50 %	50 %	400752874
85	NC_018180	TC	3	6	32903	32908	0 %	50 %	0 %	50 %	400752875
86	NC_018180	GA	3	6	33208	33213	50 %	0 %	50 %	0 %	400752875
87	NC_018180	GC	3	6	33487	33492	0 %	0 %	50 %	50 %	400752875
88	NC_018180	AG	3	6	33700	33705	50 %	0 %	50 %	0 %	400752875
89	NC_018180	CG	3	6	34021	34026	0 %	0 %	50 %	50 %	400752876
90	NC_018180	GC	3	6	34495	34500	0 %	0 %	50 %	50 %	400752877
91	NC_018180	TG	3	6	35899	35904	0 %	50 %	50 %	0 %	400752880
92	NC_018180	GT	3	6	36341	36346	0 %	50 %	50 %	0 %	400752880
93	NC_018180	GC	3	6	36496	36501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_018180	GA	3	6	36979	36984	50 %	0 %	50 %	0 %	400752882
95	NC_018180	CG	4	8	37114	37121	0 %	0 %	50 %	50 %	400752882
96	NC_018180	GC	3	6	37220	37225	0 %	0 %	50 %	50 %	400752882
97	NC_018180	CT	3	6	37351	37356	0 %	50 %	0 %	50 %	400752882
98	NC_018180	GA	3	6	37945	37950	50 %	0 %	50 %	0 %	400752882
99	NC_018180	GC	3	6	38061	38066	0 %	0 %	50 %	50 %	400752882
100	NC_018180	GC	5	10	38236	38245	0 %	0 %	50 %	50 %	400752882

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.