MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 25

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018180	TTCGC	2	10	4115	4124	0 %	40 %	20 %	40 %	400752844
2	NC_018180	ACCCG	2	10	5989	5998	20 %	0 %	20 %	60 %	400752846
3	NC_018180	GCCGC	2	10	10731	10740	0 %	0 %	40 %	60 %	400752849
4	NC_018180	GCGCC	2	10	11896	11905	0 %	0 %	40 %	60 %	400752849
5	NC_018180	GCAGG	2	10	14739	14748	20 %	0 %	60 %	20 %	400752851
6	NC_018180	TGTCC	2	10	15463	15472	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_018180	AGCGA	2	10	15777	15786	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_018180	GGAAG	2	10	17466	17475	40 %	0 %	60 %	0 %	400752856
9	NC_018180	ATGGG	2	10	17925	17934	20 %	20 %	60 %	0 %	400752856
10	NC_018180	TGAGC	2	10	18144	18153	20 %	20 %	40 %	20 %	400752856
11	NC_018180	TCGCG	2	10	19956	19965	0 %	20 %	40 %	40 %	400752857
12	NC_018180	CGAGA	2	10	20156	20165	40 %	0 %	40 %	20 %	400752857
13	NC_018180	ATCCG	2	10	23438	23447	20 %	20 %	20 %	40 %	400752862
14	NC_018180	TCACC	2	10	23925	23934	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
15	NC_018180	TGTCG	2	10	25062	25071	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_018180	TTTGG	2	10	25451	25460	0 %	60 %	40 %	0 %	400752865
17	NC_018180	ATGCA	2	10	27271	27280	40 %	20 %	20 %	20 %	400752867
18	NC_018180	ATGAA	2	10	28586	28595	60 %	20 %	20 %	0 %	400752869
19	NC_018180	CTTCG	2	10	28847	28856	0 %	40 %	20 %	40 %	400752870
20	NC_018180	ACGGC	2	10	29070	29079	20 %	0 %	40 %	40 %	400752870
21	NC_018180	TCGGC	2	10	30230	30239	0 %	20 %	40 %	40 %	400752871
22	NC_018180	TGATC	2	10	34730	34739	20 %	40 %	20 %	20 %	400752878
23	NC_018180	CGAAC	2	10	35306	35315	40 %	0 %	20 %	40 %	400752879
24	NC_018180	CCGAC	2	10	36169	36178	20 %	0 %	20 %	60 %	400752880
25	NC_018180	GCGCA	2	10	38459	38468	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.