MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 818

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018180	GCA	2	6	22467	22472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_018180	CTT	3	9	22567	22575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_018180	TCG	2	6	22578	22583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_018180	TCAG	2	8	22598	22605	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
505	NC_018180	AG	3	6	22626	22631	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
506	NC_018180	GCC	2	6	22643	22648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752862
507	NC_018180	ACC	2	6	22649	22654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400752862
508	NC_018180	TCG	2	6	22655	22660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752862
509	NC_018180	TGTC	2	8	22702	22709	0 %	50 %	25 %	25 %	400752862
510	NC_018180	TTG	2	6	22737	22742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400752862
511	NC_018180	CGG	2	6	22793	22798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752862
512	NC_018180	TGCC	2	8	22817	22824	0 %	25 %	25 %	50 %	400752862
513	NC_018180	CCA	2	6	22888	22893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400752862
514	NC_018180	CAG	2	6	22929	22934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752862
515	NC_018180	AGC	2	6	22951	22956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752862
516	NC_018180	GCCA	2	8	22975	22982	25 %	0 %	25 %	50 %	400752862
517	NC_018180	CAT	2	6	22998	23003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752862
518	NC_018180	GGC	2	6	23037	23042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752862
519	NC_018180	TCG	2	6	23083	23088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752862
520	NC_018180	GGCT	2	8	23206	23213	0 %	25 %	50 %	25 %	400752862
521	NC_018180	CCG	2	6	23223	23228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752862
522	NC_018180	CGC	2	6	23289	23294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752862
523	NC_018180	CCA	2	6	23312	23317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400752862
524	NC_018180	CGC	2	6	23355	23360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752862
525	NC_018180	CGA	2	6	23375	23380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752862
526	NC_018180	ATCCG	2	10	23438	23447	20 %	20 %	20 %	40 %	400752862
527	NC_018180	CTC	2	6	23476	23481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	400752862
528	NC_018180	GGCG	2	8	23509	23516	0 %	0 %	75 %	25 %	400752862
529	NC_018180	TTC	2	6	23529	23534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400752862
530	NC_018180	GCA	2	6	23566	23571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752862
531	NC_018180	CGG	2	6	23636	23641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_018180	GA	3	6	23684	23689	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
533	NC_018180	ATC	2	6	23727	23732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_018180	AGC	3	9	23751	23759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_018180	CGC	2	6	23813	23818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_018180	GC	3	6	23817	23822	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
537	NC_018180	GATC	2	8	23837	23844	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
538	NC_018180	TCC	2	6	23880	23885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
539	NC_018180	TCACC	2	10	23925	23934	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
540	NC_018180	ATC	2	6	23936	23941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_018180	CGAG	2	8	24006	24013	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
542	NC_018180	CG	3	6	24064	24069	0 %	0 %	50 %	50 %	400752863
543	NC_018180	GCC	2	6	24180	24185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752863
544	NC_018180	GCC	2	6	24253	24258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752863
545	NC_018180	TCA	2	6	24392	24397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752863
546	NC_018180	GCC	2	6	24445	24450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
547	NC_018180	CAG	2	6	24454	24459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_018180	GAG	2	6	24464	24469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
549	NC_018180	CCT	2	6	24602	24607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_018180	CCT	2	6	24630	24635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
551	NC_018180	GC	3	6	24701	24706	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
552	NC_018180	TCA	2	6	24736	24741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752864
553	NC_018180	TCT	2	6	24787	24792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400752864
554	NC_018180	CAA	2	6	24801	24806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400752864
555	NC_018180	TCT	2	6	24824	24829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400752864
556	NC_018180	GCG	2	6	24944	24949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_018180	TGGG	2	8	24973	24980	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
558	NC_018180	TGTCG	2	10	25062	25071	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
559	NC_018180	GCGG	2	8	25121	25128	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
560	NC_018180	GTCG	2	8	25210	25217	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
561	NC_018180	CCT	2	6	25342	25347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	400752865
562	NC_018180	GAA	2	6	25350	25355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400752865
563	NC_018180	GC	3	6	25364	25369	0 %	0 %	50 %	50 %	400752865
564	NC_018180	TTTGG	2	10	25451	25460	0 %	60 %	40 %	0 %	400752865
565	NC_018180	GCG	2	6	25509	25514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752865
566	NC_018180	CGC	2	6	25568	25573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752865
567	NC_018180	CGC	2	6	25585	25590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752865
568	NC_018180	CCA	2	6	25639	25644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400752865
569	NC_018180	TCC	2	6	25701	25706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
570	NC_018180	AGGC	2	8	25718	25725	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
571	NC_018180	AAT	2	6	25762	25767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_018180	GC	3	6	25768	25773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
573	NC_018180	GTA	2	6	25802	25807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_018180	TTG	2	6	25965	25970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_018180	TC	3	6	26018	26023	0 %	50 %	0 %	50 %	400752866
576	NC_018180	AGC	2	6	26089	26094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752866
577	NC_018180	ATC	2	6	26136	26141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752866
578	NC_018180	CG	3	6	26242	26247	0 %	0 %	50 %	50 %	400752866
579	NC_018180	GTT	2	6	26292	26297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400752866
580	NC_018180	GC	4	8	26378	26385	0 %	0 %	50 %	50 %	400752866
581	NC_018180	CAA	2	6	26410	26415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400752866
582	NC_018180	ACCT	2	8	26423	26430	25 %	25 %	0 %	50 %	400752866
583	NC_018180	ACT	2	6	26457	26462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752866
584	NC_018180	GCC	2	6	26513	26518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752866
585	NC_018180	AAG	2	6	26546	26551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400752866
586	NC_018180	TTC	2	6	26611	26616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400752866
587	NC_018180	GCC	2	6	26625	26630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752866
588	NC_018180	AG	3	6	26699	26704	50 %	0 %	50 %	0 %	400752866
589	NC_018180	TG	3	6	26868	26873	0 %	50 %	50 %	0 %	400752866
590	NC_018180	CGC	2	6	26894	26899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752866
591	NC_018180	TCT	2	6	26956	26961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400752866
592	NC_018180	TGCT	2	8	27009	27016	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
593	NC_018180	GCT	2	6	27042	27047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_018180	CTG	2	6	27057	27062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_018180	TGC	2	6	27102	27107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_018180	CATC	2	8	27129	27136	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
597	NC_018180	TGC	2	6	27155	27160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_018180	GTC	2	6	27199	27204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_018180	ATGCA	2	10	27271	27280	40 %	20 %	20 %	20 %	400752867
600	NC_018180	ACC	2	6	27283	27288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400752867
601	NC_018180	GCC	2	6	27403	27408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752867
602	NC_018180	TTC	2	6	27487	27492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400752867
603	NC_018180	CG	3	6	27519	27524	0 %	0 %	50 %	50 %	400752867
604	NC_018180	GCC	2	6	27556	27561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752867
605	NC_018180	CCA	2	6	27575	27580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400752867
606	NC_018180	CGT	2	6	27597	27602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752867
607	NC_018180	GCC	2	6	27608	27613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752867
608	NC_018180	GTC	2	6	27621	27626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752867
609	NC_018180	GGCG	2	8	27629	27636	0 %	0 %	75 %	25 %	400752867
610	NC_018180	CGT	2	6	27774	27779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752867
611	NC_018180	CAGC	2	8	27785	27792	25 %	0 %	25 %	50 %	400752867
612	NC_018180	CG	3	6	27801	27806	0 %	0 %	50 %	50 %	400752867
613	NC_018180	GGT	2	6	28087	28092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	400752868
614	NC_018180	GAT	2	6	28136	28141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400752869
615	NC_018180	GC	3	6	28144	28149	0 %	0 %	50 %	50 %	400752869
616	NC_018180	CGG	2	6	28152	28157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752869
617	NC_018180	TGA	2	6	28164	28169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400752869
618	NC_018180	ATC	2	6	28174	28179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752869
619	NC_018180	GC	3	6	28217	28222	0 %	0 %	50 %	50 %	400752869
620	NC_018180	TCG	2	6	28235	28240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752869
621	NC_018180	GC	3	6	28257	28262	0 %	0 %	50 %	50 %	400752869
622	NC_018180	CGA	2	6	28263	28268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752869
623	NC_018180	CGA	2	6	28302	28307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752869
624	NC_018180	CCG	2	6	28315	28320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752869
625	NC_018180	CT	3	6	28378	28383	0 %	50 %	0 %	50 %	400752869
626	NC_018180	ATG	2	6	28427	28432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400752869
627	NC_018180	GCG	2	6	28433	28438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752869
628	NC_018180	GC	3	6	28475	28480	0 %	0 %	50 %	50 %	400752869
629	NC_018180	TG	3	6	28484	28489	0 %	50 %	50 %	0 %	400752869
630	NC_018180	GCG	2	6	28500	28505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752869
631	NC_018180	GAC	2	6	28540	28545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752869
632	NC_018180	CGG	2	6	28547	28552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752869
633	NC_018180	ATGAA	2	10	28586	28595	60 %	20 %	20 %	0 %	400752869
634	NC_018180	GAA	2	6	28609	28614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
635	NC_018180	TCG	2	6	28619	28624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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644	NC_018180	GCCGTT	2	12	29253	29264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752870
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668	NC_018180	CGG	2	6	30755	30760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752871
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671	NC_018180	GC	4	8	30812	30819	0 %	0 %	50 %	50 %	400752871
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682	NC_018180	CGA	2	6	31322	31327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752873
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732	NC_018180	GCCC	2	8	34184	34191	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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