MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 2177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018179	CGG	2	6	70	75	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018179	TGC	2	6	326	331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752654
3	NC_018179	TCG	2	6	355	360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018179	GCT	2	6	378	383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018179	GGC	2	6	553	558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018179	TCG	3	9	566	574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018179	CCT	2	6	605	610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_018179	GAA	2	6	649	654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018179	TGA	2	6	664	669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018179	GCT	2	6	823	828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018179	AAG	2	6	989	994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018179	CGA	2	6	1204	1209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752655
13	NC_018179	CTT	2	6	1251	1256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400752655
14	NC_018179	GGA	2	6	1286	1291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400752655
15	NC_018179	GTC	2	6	1521	1526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752655
16	NC_018179	GAA	2	6	1569	1574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400752655
17	NC_018179	TTG	2	6	1609	1614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400752655
18	NC_018179	CGT	2	6	1776	1781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018179	CTC	2	6	2004	2009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	400752656
20	NC_018179	GCG	2	6	2105	2110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752656
21	NC_018179	GCG	2	6	2207	2212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018179	GAC	2	6	2221	2226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018179	GCA	2	6	2242	2247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018179	GAG	2	6	2466	2471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018179	GAT	2	6	2480	2485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400752657
26	NC_018179	TAG	2	6	2515	2520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400752657
27	NC_018179	CGA	2	6	2530	2535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752657
28	NC_018179	GAA	2	6	2681	2686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400752657
29	NC_018179	CCA	2	6	2708	2713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400752657
30	NC_018179	AGC	2	6	2908	2913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752657
31	NC_018179	GCC	2	6	2928	2933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752657
32	NC_018179	GTC	2	6	2945	2950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752657
33	NC_018179	ATG	2	6	3039	3044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400752657
34	NC_018179	CAT	2	6	3181	3186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752658
35	NC_018179	CGC	2	6	3279	3284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752658
36	NC_018179	ATC	2	6	3365	3370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752658
37	NC_018179	GAT	2	6	3383	3388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400752658
38	NC_018179	GAC	2	6	3413	3418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752658
39	NC_018179	GAG	2	6	3455	3460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400752658
40	NC_018179	GCG	2	6	3515	3520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752658
41	NC_018179	CGG	2	6	3680	3685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752658
42	NC_018179	CGA	2	6	3817	3822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_018179	CGG	2	6	3829	3834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_018179	CGA	2	6	3882	3887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018179	GCC	2	6	3975	3980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_018179	AGC	2	6	4062	4067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752659
47	NC_018179	CAG	2	6	4140	4145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752659
48	NC_018179	CGG	2	6	4656	4661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752660
49	NC_018179	GGC	2	6	4687	4692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752660
50	NC_018179	CGG	2	6	4769	4774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752660
51	NC_018179	CCA	2	6	4933	4938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400752660
52	NC_018179	GGT	2	6	4970	4975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	400752660
53	NC_018179	GAA	2	6	5005	5010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400752660
54	NC_018179	TTC	2	6	5012	5017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400752660
55	NC_018179	CTG	2	6	5180	5185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752660
56	NC_018179	CGT	2	6	5230	5235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752660
57	NC_018179	CGA	2	6	5278	5283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752660
58	NC_018179	GAG	2	6	5327	5332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400752660
59	NC_018179	TCG	2	6	5555	5560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752660
60	NC_018179	CAT	2	6	5588	5593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752660
61	NC_018179	TGC	2	6	5721	5726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752660
62	NC_018179	TGG	2	6	5743	5748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	400752660
63	NC_018179	CAG	2	6	5771	5776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752660
64	NC_018179	GCA	2	6	5797	5802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752660
65	NC_018179	AAC	2	6	5855	5860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_018179	GTG	2	6	5872	5877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018179	AAT	2	6	6007	6012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018179	CGC	2	6	6072	6077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752661
69	NC_018179	GCC	2	6	6167	6172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752661
70	NC_018179	GGC	2	6	6176	6181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752661
71	NC_018179	TCT	2	6	6185	6190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400752661
72	NC_018179	CTG	2	6	6210	6215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752661
73	NC_018179	CGA	2	6	6284	6289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752661
74	NC_018179	GTC	2	6	6297	6302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752661
75	NC_018179	ATA	2	6	6324	6329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400752661
76	NC_018179	TGA	2	6	6391	6396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400752662
77	NC_018179	CGG	3	9	6416	6424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752662
78	NC_018179	GGA	2	6	6517	6522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400752662
79	NC_018179	CGT	2	6	6601	6606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752662
80	NC_018179	TCT	2	6	6704	6709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_018179	GAG	2	6	6818	6823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018179	AGG	2	6	6887	6892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018179	GCC	2	6	6954	6959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_018179	GCG	2	6	6990	6995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018179	TGA	2	6	7004	7009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018179	GTT	2	6	7055	7060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018179	TGC	2	6	7200	7205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752663
88	NC_018179	CTT	2	6	7207	7212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400752663
89	NC_018179	ATG	2	6	7296	7301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400752663
90	NC_018179	TCC	2	6	7312	7317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	400752663
91	NC_018179	AAT	2	6	7341	7346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400752663
92	NC_018179	CCT	2	6	7352	7357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_018179	CGT	2	6	7444	7449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_018179	ATT	2	6	7458	7463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018179	CAG	2	6	7492	7497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018179	CGC	2	6	7563	7568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_018179	GGT	2	6	7577	7582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018179	CTG	2	6	7773	7778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752664
99	NC_018179	GCA	2	6	7787	7792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752664
100	NC_018179	GCC	2	6	7824	7829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752664
101	NC_018179	GAG	2	6	7878	7883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400752664
102	NC_018179	CGG	2	6	7991	7996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752664
103	NC_018179	GCG	2	6	8057	8062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752665
104	NC_018179	GGC	2	6	8092	8097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752665
105	NC_018179	CGT	2	6	8231	8236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752665
106	NC_018179	ATT	2	6	8266	8271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400752665
107	NC_018179	GGC	2	6	8320	8325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752665
108	NC_018179	GTG	2	6	8361	8366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	400752665
109	NC_018179	GCC	2	6	8408	8413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752665
110	NC_018179	CGG	2	6	8423	8428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752665
111	NC_018179	CTT	2	6	8488	8493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400752665
112	NC_018179	CCA	2	6	8505	8510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400752665
113	NC_018179	TCG	2	6	8516	8521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752665
114	NC_018179	GAT	2	6	8626	8631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400752665
115	NC_018179	CGA	2	6	8732	8737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752665
116	NC_018179	GCT	3	9	8933	8941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752666
117	NC_018179	GCC	2	6	8982	8987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752666
118	NC_018179	TCG	2	6	8992	8997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752666
119	NC_018179	CGA	2	6	9086	9091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752666
120	NC_018179	AGG	2	6	9289	9294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400752666
121	NC_018179	ATC	2	6	9350	9355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752667
122	NC_018179	TGC	2	6	9400	9405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752667
123	NC_018179	CGG	2	6	9415	9420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752667
124	NC_018179	TCA	2	6	9450	9455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752667
125	NC_018179	CGT	2	6	9502	9507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752667
126	NC_018179	TGT	2	6	9508	9513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400752667
127	NC_018179	ATC	2	6	9546	9551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752667
128	NC_018179	GCC	2	6	9664	9669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752668
129	NC_018179	AGG	2	6	9814	9819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400752669
130	NC_018179	CTT	2	6	9822	9827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400752669
131	NC_018179	CAA	2	6	9879	9884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400752669
132	NC_018179	CGA	2	6	9918	9923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752669
133	NC_018179	TCC	2	6	9926	9931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	400752669
134	NC_018179	GTT	2	6	10023	10028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018179	CAT	2	6	10041	10046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_018179	CCG	2	6	10052	10057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_018179	TCG	2	6	10185	10190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752670
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139	NC_018179	GGC	2	6	10403	10408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752671
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163	NC_018179	ATA	2	6	12187	12192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_018179	TCG	2	6	12386	12391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752673
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261	NC_018179	GCA	2	6	17360	17365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752676
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280	NC_018179	CGC	2	6	18524	18529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752677
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