MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 3098

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_018179	CAGG	2	8	149905	149912	25 %	0 %	50 %	25 %	400752830
3002	NC_018179	A	6	6	149999	150004	100 %	0 %	0 %	0 %	400752830
3003	NC_018179	TCA	2	6	150128	150133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_018179	AGC	2	6	150169	150174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_018179	ATG	3	9	150208	150216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400752831
3006	NC_018179	GCC	2	6	150270	150275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752831
3007	NC_018179	GAG	2	6	150276	150281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400752831
3008	NC_018179	TTC	2	6	150282	150287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400752831
3009	NC_018179	GGA	2	6	150374	150379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400752831
3010	NC_018179	GCC	2	6	150405	150410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752831
3011	NC_018179	GC	4	8	150417	150424	0 %	0 %	50 %	50 %	400752831
3012	NC_018179	GC	3	6	150434	150439	0 %	0 %	50 %	50 %	400752831
3013	NC_018179	TCG	2	6	150459	150464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752831
3014	NC_018179	GCT	2	6	150516	150521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752831
3015	NC_018179	GAA	2	6	150549	150554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400752831
3016	NC_018179	GCG	2	6	150583	150588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752831
3017	NC_018179	TCA	2	6	150608	150613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752831
3018	NC_018179	AGT	2	6	150623	150628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400752831
3019	NC_018179	TAA	2	6	150670	150675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_018179	GTG	2	6	150689	150694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_018179	CCG	2	6	150908	150913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3022	NC_018179	G	6	6	150915	150920	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_018179	TCG	2	6	150921	150926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_018179	CTG	2	6	150929	150934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_018179	GCCG	2	8	150936	150943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3026	NC_018179	TCG	2	6	150960	150965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_018179	TC	3	6	150971	150976	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3028	NC_018179	CGC	2	6	150980	150985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3029	NC_018179	CGT	2	6	150991	150996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_018179	TGAA	2	8	151027	151034	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_018179	AG	3	6	151069	151074	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_018179	GAA	2	6	151088	151093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_018179	ATGC	2	8	151162	151169	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3034	NC_018179	GAC	2	6	151190	151195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_018179	CAT	2	6	151231	151236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_018179	AGGC	2	8	151337	151344	25 %	0 %	50 %	25 %	400752832
3037	NC_018179	ACA	2	6	151414	151419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400752832
3038	NC_018179	AAG	2	6	151479	151484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400752832
3039	NC_018179	CG	3	6	151516	151521	0 %	0 %	50 %	50 %	400752832
3040	NC_018179	GCC	2	6	151614	151619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752832
3041	NC_018179	CGC	2	6	151622	151627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752832
3042	NC_018179	TTG	2	6	151639	151644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400752832
3043	NC_018179	TTG	2	6	151648	151653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400752832
3044	NC_018179	T	7	7	151671	151677	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_018179	AG	3	6	151711	151716	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_018179	ATC	2	6	151730	151735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_018179	CAA	2	6	151811	151816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400752833
3048	NC_018179	CGT	2	6	151835	151840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752833
3049	NC_018179	TCG	2	6	151915	151920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752833
3050	NC_018179	ACC	2	6	152068	152073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400752833
3051	NC_018179	CGA	3	9	152199	152207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752833
3052	NC_018179	TCT	2	6	152229	152234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400752833
3053	NC_018179	CCG	2	6	152258	152263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752833
3054	NC_018179	CAG	2	6	152301	152306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752833
3055	NC_018179	CG	3	6	152334	152339	0 %	0 %	50 %	50 %	400752833
3056	NC_018179	GAT	2	6	152352	152357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400752833
3057	NC_018179	TCGC	2	8	152382	152389	0 %	25 %	25 %	50 %	400752833
3058	NC_018179	CAT	2	6	152440	152445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752833
3059	NC_018179	CGT	2	6	152461	152466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752833
3060	NC_018179	TGC	2	6	152508	152513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752833
3061	NC_018179	CCG	2	6	152527	152532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752833
3062	NC_018179	CAGG	2	8	152538	152545	25 %	0 %	50 %	25 %	400752833
3063	NC_018179	CAAA	2	8	152666	152673	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3064	NC_018179	GGCT	2	8	152811	152818	0 %	25 %	50 %	25 %	400752834
3065	NC_018179	CG	3	6	152867	152872	0 %	0 %	50 %	50 %	400752834
3066	NC_018179	GAT	2	6	152930	152935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400752834
3067	NC_018179	CTTA	2	8	152939	152946	25 %	50 %	0 %	25 %	400752834
3068	NC_018179	CCT	2	6	153028	153033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	400752834
3069	NC_018179	CA	3	6	153139	153144	50 %	0 %	0 %	50 %	400752834
3070	NC_018179	CAT	2	6	153148	153153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752834
3071	NC_018179	GCG	2	6	153264	153269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752834
3072	NC_018179	TGGT	2	8	153270	153277	0 %	50 %	50 %	0 %	400752834
3073	NC_018179	CGAG	2	8	153282	153289	25 %	0 %	50 %	25 %	400752834
3074	NC_018179	ACT	2	6	153375	153380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752834
3075	NC_018179	ACG	2	6	153410	153415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752834
3076	NC_018179	GCC	2	6	153416	153421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752834
3077	NC_018179	GAA	2	6	153548	153553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400752834
3078	NC_018179	TCA	2	6	153570	153575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752834
3079	NC_018179	GC	3	6	153620	153625	0 %	0 %	50 %	50 %	400752834
3080	NC_018179	ACG	2	6	153686	153691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752834
3081	NC_018179	TGAT	2	8	153849	153856	25 %	50 %	25 %	0 %	400752834
3082	NC_018179	AGCCC	2	10	153872	153881	20 %	0 %	20 %	60 %	400752834
3083	NC_018179	GCT	2	6	153933	153938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752834
3084	NC_018179	CGGC	2	8	154107	154114	0 %	0 %	50 %	50 %	400752834
3085	NC_018179	GAA	2	6	154181	154186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400752834
3086	NC_018179	CGGG	2	8	154243	154250	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3087	NC_018179	GCC	2	6	154270	154275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3088	NC_018179	CG	3	6	154303	154308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3089	NC_018179	TGC	2	6	154313	154318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3090	NC_018179	GAAGA	2	10	154337	154346	60 %	0 %	40 %	0 %	400752835
3091	NC_018179	GAC	2	6	154420	154425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752835
3092	NC_018179	CCGG	2	8	154449	154456	0 %	0 %	50 %	50 %	400752835
3093	NC_018179	GAA	2	6	154467	154472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400752835
3094	NC_018179	GC	3	6	154663	154668	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3095	NC_018179	CGG	2	6	154698	154703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3096	NC_018179	GGT	2	6	154760	154765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_018179	CGG	2	6	154819	154824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3098	NC_018179	GT	3	6	154916	154921	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

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